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条斑紫菜PyHDAC1的鉴定及互作蛋白筛选
1
作者
张晓倩
钱慧娟
+4 位作者
孙琪然
管晓伟
殷吉强
王欣然
王冬梅
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第4期162-172,共11页
组蛋白去乙酰化酶(HDAC)通过催化组蛋白上赖氨酸残基的去乙酰化影响基因转录活性,在条斑紫菜(Pyropia yezoensis)中参与调控损伤诱导下单孢子的形成。我们在条斑紫菜中鉴定到一个编码HDAC的基因PyHDAC1。为探究PyHDAC1在损伤诱导单孢子...
组蛋白去乙酰化酶(HDAC)通过催化组蛋白上赖氨酸残基的去乙酰化影响基因转录活性,在条斑紫菜(Pyropia yezoensis)中参与调控损伤诱导下单孢子的形成。我们在条斑紫菜中鉴定到一个编码HDAC的基因PyHDAC1。为探究PyHDAC1在损伤诱导单孢子的形成中的生物学功能,本研究通过生物信息学的方法对PyHDAC1的结构、启动子顺式作用元件、系统发育及损伤诱导后的转录表达水平进行了分析;同时利用酵母双杂交技术筛选了PyHDAC1的互作蛋白并分析互作蛋白在损伤后的转录表达谱。研究显示,PyHDAC1含有保守的HDAC结构域,在红藻类群中具有高度保守性,其启动子上含有多种抗逆相关的顺式作用元件,且在损伤后的转录表达量呈上调趋势;此外,共筛选并验证得到10个PyHDAC1的互作蛋白。本文对PyHDAC1进行了鉴定、转录表达分析及互作蛋白筛选,为进一步探究其在损伤诱导单孢子形成中的调控机制提供重要信息。
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关键词
条斑紫菜
组蛋白去乙酰化酶
pyhdac1
互作蛋白
酵母双杂
损伤胁迫
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职称材料
题名
条斑紫菜PyHDAC1的鉴定及互作蛋白筛选
1
作者
张晓倩
钱慧娟
孙琪然
管晓伟
殷吉强
王欣然
王冬梅
机构
中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室
出处
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025年第4期162-172,共11页
基金
中央高校基本科研业务费项目(202262001)
国家资助博士后研究人员计划(GZC20232494)资助。
文摘
组蛋白去乙酰化酶(HDAC)通过催化组蛋白上赖氨酸残基的去乙酰化影响基因转录活性,在条斑紫菜(Pyropia yezoensis)中参与调控损伤诱导下单孢子的形成。我们在条斑紫菜中鉴定到一个编码HDAC的基因PyHDAC1。为探究PyHDAC1在损伤诱导单孢子的形成中的生物学功能,本研究通过生物信息学的方法对PyHDAC1的结构、启动子顺式作用元件、系统发育及损伤诱导后的转录表达水平进行了分析;同时利用酵母双杂交技术筛选了PyHDAC1的互作蛋白并分析互作蛋白在损伤后的转录表达谱。研究显示,PyHDAC1含有保守的HDAC结构域,在红藻类群中具有高度保守性,其启动子上含有多种抗逆相关的顺式作用元件,且在损伤后的转录表达量呈上调趋势;此外,共筛选并验证得到10个PyHDAC1的互作蛋白。本文对PyHDAC1进行了鉴定、转录表达分析及互作蛋白筛选,为进一步探究其在损伤诱导单孢子形成中的调控机制提供重要信息。
关键词
条斑紫菜
组蛋白去乙酰化酶
pyhdac1
互作蛋白
酵母双杂
损伤胁迫
Keywords
Pyropia yezoensis
histone deacetylase
pyhdac1
interaction protein
yeast two-hybrid
wound stress
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
条斑紫菜PyHDAC1的鉴定及互作蛋白筛选
张晓倩
钱慧娟
孙琪然
管晓伟
殷吉强
王欣然
王冬梅
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
北大核心
2025
0
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