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PulseNet China,a model for future laboratory-based bacterial infectious disease surveillance in China 被引量:7
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作者 Wei Li Shan Lu +7 位作者 Zhigang Cui Jinghua Cui Haijian Zhou Yiqing Wang Zhujun Shao Changyun Ye Biao Kan Jianguo Xu 《Frontiers of Medicine》 SCIE CSCD 2012年第4期366-375,共10页
Surveillance is critical for the prevention and control of infectious disease.China’s real-time web-based infectious disease reporting system is a distinguished achievement.However,many aspects of the current China I... Surveillance is critical for the prevention and control of infectious disease.China’s real-time web-based infectious disease reporting system is a distinguished achievement.However,many aspects of the current China Infectious Disease Surveillance System do not yet meet the demand for timely outbreak detection and identification of emerging infectious disease.PulseNet,the national molecular typing network for foodborne disease surveillance was first established by the Centers for Disease Control and Prevention of the United States in 1995 and has proven valuable in the early detection of outbreaks and tracing the pathogen source.Since 2001,the China CDC laboratory for bacterial pathogen analysis has been a member of the PulseNet International family;and has been adapting the idea and methodology of PulseNet to develop a model for a future national laboratory-based surveillance system for all bacterial infectious disease.We summarized the development progress for the PulseNet China system and discussed it as a model for the future of China’s national laboratory-based surveillance system. 展开更多
关键词 infectious disease laboratory-based infectious disease surveillance pulse field gel electrophoresis multilocus sequencing typing pulsenet china
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一起基于国家致病菌识别网的志贺菌病暴发事件实验室分析 被引量:6
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作者 张萍 李颖 +6 位作者 甄博珺 高翔 江南 郑燃燃 张扬 邹林 王建国 《疾病监测》 CAS 2020年第8期729-734,共6页
目的对基于国家致病菌识别网监测体系的志贺菌病暴发事件进行实验室分析。方法对2019年北京市通州区志贺菌病暴发疫情菌株进行分离和鉴定,结合2015—2019年北京市通州区监测和暴发疫情菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型和药敏试验比对分... 目的对基于国家致病菌识别网监测体系的志贺菌病暴发事件进行实验室分析。方法对2019年北京市通州区志贺菌病暴发疫情菌株进行分离和鉴定,结合2015—2019年北京市通州区监测和暴发疫情菌株进行脉冲场凝胶电泳分子分型和药敏试验比对分析。结果28株志贺菌中27株带型相似度≥92.0%,疫情相关菌株带型相似度≥97.1%,说明本地区存在一组亲缘关系接近的志贺菌并以低流行态势存在。所有菌株均为多重耐药菌,2019年宋内志贺菌分离株对庆大霉素耐药与2015—2018年比较差异有统计学意义(χ2=49.907,P<0.001),提示庆大霉素在志贺菌病治疗中应慎重使用。全部菌株对环丙沙星、氯霉素、头孢西丁和亚胺培南均敏感,提示该类药物对志贺菌感染具有较好的治疗效果。结论近年来,通州区流行的痢疾菌株主要为宋内志贺菌,菌株同源性较高,多重耐药情况严重,应利用国家致病菌识别网监测体系加强志贺菌的日常监测和耐药监测。 展开更多
关键词 志贺菌病 暴发 脉冲场凝胶电泳 耐药 国家致病菌识别网
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阿贡纳沙门菌引起的聚集性腹泻病例监测及分析 被引量:5
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作者 曲梅 张新 +6 位作者 王小莉 黄瑛 钱海坤 刘桂荣 李伟 阚飙 王全意 《疾病监测》 CAS 2013年第3期193-196,共4页
目的应用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分子分型技术分析时间上高度集中的散发腹泻病例,发现可能的聚集性,并进行流行病学调查和追溯。方法利用已建立的北京市肠道多病原分子分型监测系统,采集腹泻病例粪便标... 目的应用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分子分型技术分析时间上高度集中的散发腹泻病例,发现可能的聚集性,并进行流行病学调查和追溯。方法利用已建立的北京市肠道多病原分子分型监测系统,采集腹泻病例粪便标本进行病原菌分离培养、生化鉴定、血清凝集、药敏试验及PFGE分子分型。结果2012年5月2-7日连续一周内,从北京市某区(县)肠道门诊采集的22份腹泻病例粪便标本中分离到9株沙门菌,血清学鉴定为阿贡纳沙门菌。XbaⅠ酶切的PFGE带型一致,与中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络(PulseNet China)中心数据库及各地区网络实验室数据比对分析后,确认该带型为一新的图谱带型,编码为JABX01.CN0072。结论 9例阿贡纳沙门菌感染病例的发病时间和地理分布高度集中,且PFGE带型聚集成簇,提示感染菌株具有同一克隆来源。随后的流行病学调查和感染来源分析,虽并未发现共同暴露因素,但说明PFGE技术的应用可以提高监测的敏感性,应长期持续的进行病原菌分子分型监测,进一步完善PulseNet网络和运行机制。 展开更多
关键词 脉冲场凝胶电泳 阿贡纳沙门菌 监测 中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络
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PulseNetChina数据库在安徽省4起霍乱疫情溯源中的应用 被引量:2
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作者 胡守奎 郑田利 +6 位作者 胡万富 王建军 李伟 崔志刚 周海健 逄波 阚飙 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1003-1005,共3页
目的通过PulseNetChina数据库对安徽省2012年4起霍乱疫情进行溯源分析。方法应用PCR扩增霍乱弧菌CT和TCP毒力基因,并利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对其进行分型,使用BioNumericsV4.0软件对电泳结果进行聚类分析,并与PulseNetChina数... 目的通过PulseNetChina数据库对安徽省2012年4起霍乱疫情进行溯源分析。方法应用PCR扩增霍乱弧菌CT和TCP毒力基因,并利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对其进行分型,使用BioNumericsV4.0软件对电泳结果进行聚类分析,并与PulseNetChina数据库进行比对。结果16株菌经PCR扩增,CT和TCP基因均出现目的条带。菌株经NotI和踊I酶切,PFGE聚类分析显示,13株菌的同源性〉98%。其中2株菌与PulseNetChina数据库中湖南、四川、浙江、上海、湖北5省(市)同年霍乱疫情菌株同源性达100%。结论安徽省2012年4起霍乱疫情均源自食用霍乱弧菌感染甲鱼。PulseNetChina数据库能有效、快速地对霍乱疫情溯源和预警。 展开更多
关键词 中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络 霍乱 预警
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中国嗜肺军团菌分离株脉冲场凝胶电泳分型分析以及数据库的建立 被引量:7
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作者 秦天 任红宇 +3 位作者 周海健 朱兵清 崔志刚 邵祝军 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期285-289,共5页
目的 对分离的262株嗜肺军团菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,初步建立中国嗜肺军团菌的PFGE分型数据库.方法 采用PFGE技术,对2004-2009年中国11个省(市)分离的嗜肺军团菌用AscⅠ酶切,BioNumerics软件分析PFGE图谱,并建立分子分型... 目的 对分离的262株嗜肺军团菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,初步建立中国嗜肺军团菌的PFGE分型数据库.方法 采用PFGE技术,对2004-2009年中国11个省(市)分离的嗜肺军团菌用AscⅠ酶切,BioNumerics软件分析PFGE图谱,并建立分子分型数据库.结果 262株嗜肺军团菌的PFGE图谱共分为108种不同的PFGE带型,相似性系数在16%~100%之间,通过聚类分析,可以分为差异明显的不同簇.不同省份、年份和血清型的菌株之间有交叉带型.结论 中国环境分离的嗜肺军团菌菌株基因组变异较大,同时也具有克隆化特征,且可能有多个克隆系存在. 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 脉冲场凝胶电泳 监测网络 中国病原细菌实验室
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