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毛果杨PtrWRKY 21基因的克隆及生物信息学分析
1
作者 许雪梅 李成浩 《分子植物育种》 北大核心 2026年第1期62-68,共7页
WRKY转录因子在植物代谢及抗逆过程中起着重要的作用。本研究为探明PtWRKY 21基因在毛果杨中的功能,克隆了PtrWRKY 21基因,并对其进行了生物信息学分析。结果如下:提取了毛果杨叶片中的总RNA,并反转录成cDNA,经过PCR克隆技术得到了与毛... WRKY转录因子在植物代谢及抗逆过程中起着重要的作用。本研究为探明PtWRKY 21基因在毛果杨中的功能,克隆了PtrWRKY 21基因,并对其进行了生物信息学分析。结果如下:提取了毛果杨叶片中的总RNA,并反转录成cDNA,经过PCR克隆技术得到了与毛果杨基因组数据库中公布的一致的基因序列。对该基因进行了生物信息学分析,确定了PtrWRKY 21基因所编码的蛋白质氨基酸等电点为9.64,氨基酸数量为347个,分子量为38556.76Da,是一种亲水性稳定蛋白质。其二级结构由24.78%α-螺旋,61.38%无规卷曲,9.80%延伸链,4.03%β-折叠组成。三级结构基本与二级结构一致。另外,该基因与小垫柳亲缘关系较近。本研究开展了对PtrWRKY 21的克隆及生物信息学分析研究,为阐明PtrWRKY 21基因的功能提供参考。 展开更多
关键词 毛果杨 ptrwrky 21 克隆 生物信息学分析
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毛果杨转录因子PtrWRKY25的克隆及功能验证 被引量：4
2
作者 尹佳 周党卫 《生物学杂志》 CAS CSCD 2015年第6期1-5,共5页
通过RT-PCR的方法获得毛果杨(Populus trichocarpa)PtrWRKY25(Potri.007G078200.1)。经氨基酸比对分析,毛果杨PtrWRKY25蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtWRKY12、葡萄(Vitis vinifera)VvWRKY2以及苜蓿(Medicago truncatula)MtSTP的... 通过RT-PCR的方法获得毛果杨(Populus trichocarpa)PtrWRKY25(Potri.007G078200.1)。经氨基酸比对分析,毛果杨PtrWRKY25蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtWRKY12、葡萄(Vitis vinifera)VvWRKY2以及苜蓿(Medicago truncatula)MtSTP的WRKY结构域有较高同源性。利用荧光定量及半定量检测PtrWRKY25组织表达量发现该基因在茎中表达量最高,其次为韧皮部和木质部。植物组织切片间苯三酚染色发现PtrWRKY25转基因株系次生壁较野生型也有减少的趋势。检测农杆菌介导在毛白杨中超量表达的PtrWRKY25转基因株系木质素含量发现,相较于与野生型,转基因植株中木质素含量减少约1倍,表明PtrWRKY25可能主要在木质素合成途径中发挥作用。 展开更多
关键词 毛果杨 ptrwrky25 木质素
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PtrWRKY51基因的克隆及抗旱表达特性分析
3
作者 黄安瀛 夏德安 +3 位作者 张洋 那冬晨 燕青 魏志刚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1005-1013,共9页
为明确毛果杨WRKY家族成员PtrWRKY51基因功能,以Nisqually-1株系毛果杨为模板,克隆得到PtrWRKY51基因CDS序列。通过生物信息学分析,结合酵母自激活验证、亚细胞定位及模拟干旱胁迫下的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对PtrWRKY51基因功能进行... 为明确毛果杨WRKY家族成员PtrWRKY51基因功能,以Nisqually-1株系毛果杨为模板,克隆得到PtrWRKY51基因CDS序列。通过生物信息学分析,结合酵母自激活验证、亚细胞定位及模拟干旱胁迫下的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对PtrWRKY51基因功能进行初步研究。结果表明:PtrWRKY51全长579 bp,编码192 aa。生物信息学分析及亚细胞定位试验结果表明,PtrWRKY51蛋白为非跨膜碱性不稳定亲水蛋白,定位于细胞核,含有WRKY家族特有的保守结构域,是第IIc类WRKY转录因子;酵母自激活验证试验表明PtrWRKY51基因具有自激活活性;qRT-PCR分析表明,8%PEG6000模拟干旱胁迫下,该基因在胁迫12 h后茎部与叶部相对表达量达到最大值,根部则出现在24 h,研究可为PtrWRKY51抗逆及生物学功能进一步研究提供参考。 展开更多
关键词 毛果杨 ptrwrky51 生物信息学 酵母自激活 亚细胞定位 抗旱表达分析
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毛果杨WRKY40基因克隆及转基因拟南芥抗旱性分析
4
作者 黄珊 陈雪冰 +1 位作者 刘关君 魏志刚 《分子植物育种》 北大核心 2026年第4期1057-1063,共7页
PtrWRKY40基因从毛果杨(Populus trichocarpa)中克隆得到,其CDS全长957 bp,编码318个氨基酸,分子量为35.13 kD,理论等电点为8.96。生物信息学分析结果表明:PtrWRKY40蛋白的二级结构主要是由无规卷曲(57.23%)、延伸链(10.69%)、α-螺旋(2... PtrWRKY40基因从毛果杨(Populus trichocarpa)中克隆得到,其CDS全长957 bp,编码318个氨基酸,分子量为35.13 kD,理论等电点为8.96。生物信息学分析结果表明:PtrWRKY40蛋白的二级结构主要是由无规卷曲(57.23%)、延伸链(10.69%)、α-螺旋(29.87%)、β-折叠(2.20%)组成,是碱性亲水的不稳定蛋白;系统进化树的构建及基序分析发现,毛果杨与白杨的亲缘关系最近;亚细胞定位试验表明PtrWRKY40定位于细胞核。4%PEG-6000模拟干旱胁迫结果表明,胁迫后的野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana)种子萌发率比转基因型拟南芥种子萌发率高。综上所述,推测该基因可能响应干旱胁迫。 展开更多
关键词 毛果杨 ptrwrky40基因 生物信息学 亚细胞定位
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