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牡丹PsPME基因家族鉴定及其在落叶过程中的表达模式分析
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作者 丁均杰 王馨怡 +3 位作者 朱柳玲 王千千 朱向涛 陈霞 《北方园艺》 北大核心 2026年第5期10-20,共11页
以牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.)为试材,采用生物信息学方法,研究了PsPME基因家族的理化性质、基因结构、保守结构域、染色体定位、二级结构、启动子特征及落叶期表达模式,以期为利用牡丹落叶基因进行耐热品种分子育种提供参考依据... 以牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.)为试材,采用生物信息学方法,研究了PsPME基因家族的理化性质、基因结构、保守结构域、染色体定位、二级结构、启动子特征及落叶期表达模式,以期为利用牡丹落叶基因进行耐热品种分子育种提供参考依据。结果表明:共鉴定到40个PsPME基因,其染色体定位不均,广泛分布于5条染色体上。按照聚类关系,大致将PsPME分为3组;PsPME基因家族成员分子量在12015.85~65720.35,等电点在4.77~10.00,脂肪系数在56.07~102.19,碱性蛋白有24个,不稳定蛋白有6个,大部分为亲水性蛋白;亚细胞定位分析可得PsPME基因家族成员可能定位在细胞壁、内质网、叶绿体、细胞质、细胞核等细胞器;保守基序和保守结构域分析表明40个家族成员均含有保守结构域pectinesterase;共线性分析表明牡丹与拟南芥间存在6对直系同源基因;在25%的PsPME蛋白预测到了信号肽;牡丹PsPME家族启动子区含有大量与激素、低温、厌氧诱导、光响应元件等相关的顺式作用元件;在对叶柄离层形成前后转录组测序分析发现,有14个PsPME基因的表达量存在显著差异,PsPME18、PsPME21和PsPME30的表达在叶柄离层形成后显著上调,这3个PsPME基因家族成员可能参与牡丹落叶过程的调控。 展开更多
关键词 牡丹 pspme 果胶甲酯酶 落叶
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