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牡丹DNA甲基结合域蛋白基因PsMBD5的克隆和表达特性分析
被引量：
1
1
作者
司福会
张玉喜
+3 位作者
刘春英
盖伟玲
战新梅
盖树鹏
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2017年第2期66-70,共5页
前期通过转录组结合表达谱分析发现一类MBD片段在低温解除牡丹花芽内休眠中的差异表达,为了进一步研究MBD基因特征及其在牡丹休眠解除中的作用,利用RACE扩增获得1204bpPsMBD5全长cDNA,其中编码框1056bp,推测编码351个氨基酸。生物信息...
前期通过转录组结合表达谱分析发现一类MBD片段在低温解除牡丹花芽内休眠中的差异表达,为了进一步研究MBD基因特征及其在牡丹休眠解除中的作用,利用RACE扩增获得1204bpPsMBD5全长cDNA,其中编码框1056bp,推测编码351个氨基酸。生物信息学分析结果显示,PsMBD5蛋白分子量约为38.1274kDa,等电点为5.14,不稳定系数为44.27,推测该蛋白为不稳定蛋白。同源性分析表明,牡丹PsMBD5与梅PmMBD5的同源性最高,为38.1%,与亚麻荠CsMBD5的同源性最低,为25.8%,与13种拟南芥MBD蛋白同源性最高的是AtMBD5。实时荧光定量PCR分析表明,PsMBD5基因在牡丹不同组织中均有表达,在初花期牡丹的根中转录水平最高,在花瓣、心皮和萼片中次之,在雄蕊中最低;PsMBD5基因在牡丹花芽中受低温诱导,且转录水平在低温处理14d时达到最大值,之后维持较高的转录水平。研究结果为进一步解析PsMBD5基因对牡丹花芽的休眠解除的调控机制奠定基础。
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关键词
psmbd
RACE
生物信息学分析
表达特性
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职称材料
题名
牡丹DNA甲基结合域蛋白基因PsMBD5的克隆和表达特性分析
被引量：
1
1
作者
司福会
张玉喜
刘春英
盖伟玲
战新梅
盖树鹏
机构
青岛农业大学生命科学学院
青岛农业大学农学与植保学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2017年第2期66-70,共5页
基金
国家自然基金面上项目(31471908
31372104)
文摘
前期通过转录组结合表达谱分析发现一类MBD片段在低温解除牡丹花芽内休眠中的差异表达,为了进一步研究MBD基因特征及其在牡丹休眠解除中的作用,利用RACE扩增获得1204bpPsMBD5全长cDNA,其中编码框1056bp,推测编码351个氨基酸。生物信息学分析结果显示,PsMBD5蛋白分子量约为38.1274kDa,等电点为5.14,不稳定系数为44.27,推测该蛋白为不稳定蛋白。同源性分析表明,牡丹PsMBD5与梅PmMBD5的同源性最高,为38.1%,与亚麻荠CsMBD5的同源性最低,为25.8%,与13种拟南芥MBD蛋白同源性最高的是AtMBD5。实时荧光定量PCR分析表明,PsMBD5基因在牡丹不同组织中均有表达,在初花期牡丹的根中转录水平最高,在花瓣、心皮和萼片中次之,在雄蕊中最低;PsMBD5基因在牡丹花芽中受低温诱导,且转录水平在低温处理14d时达到最大值,之后维持较高的转录水平。研究结果为进一步解析PsMBD5基因对牡丹花芽的休眠解除的调控机制奠定基础。
关键词
psmbd
RACE
生物信息学分析
表达特性
Keywords
psmbd
RACE
psmbd
RACE
Bioinformatics analysis
Expression pattern
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S685.03 [农业科学—观赏园艺]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牡丹DNA甲基结合域蛋白基因PsMBD5的克隆和表达特性分析
司福会
张玉喜
刘春英
盖伟玲
战新梅
盖树鹏
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2017
1
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