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秀珍菇原基形成相关基因PpFBD1的克隆与表达研究 被引量：4
1
作者 王伟科 宋吉玲 +3 位作者 陆娜 袁卫东 闫静 陈观平 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期93-97,共5页
前期研究中通过对秀珍菇经低温诱导后不同发育阶段样本进行转录组测序及差异表达基因分析发现,ID为Cluster-6377.64510的基因(命名为PpFBD 1)在原基形成前期的样本中高表达。为进一步了解分析其表达特性及功能,根据转录组测序结果设计... 前期研究中通过对秀珍菇经低温诱导后不同发育阶段样本进行转录组测序及差异表达基因分析发现,ID为Cluster-6377.64510的基因(命名为PpFBD 1)在原基形成前期的样本中高表达。为进一步了解分析其表达特性及功能,根据转录组测序结果设计特异性引物,利用RT-PCR技术从秀珍菇中克隆获得了该基因的cDNA全长。该基因由342个核苷酸组成,编码一个由113个氨基酸组成的蛋白,蛋白相对分子质量约11 ku。进化树分析显示,PpFBD 1编码蛋白与糙皮侧耳hydrophobin 1编码的疏水蛋白亲缘关系最近。Gene Ontology功能分析表明,PpFBD 1主要参与真菌类细胞壁的合成。荧光定量RT-PCR检测显示,该基因在菌丝体经低温诱导后恢复至室温阶段(原基形成前期)表达量最高,这表明其可能参与调控秀珍菇原基形成过程。本研究结果为阐明秀珍菇原基形成机制提供参考。 展开更多
关键词 秀珍菇 ppfbd 1 基因克隆 序列分析 表达分析
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