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牡丹PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1的克隆与生物信息学分析
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作者 雷炀 高靖姗 +2 位作者 南琼琼 郭丽丽 侯小改 《河南农业科学》 北大核心 2025年第3期120-128,共9页
基于前期对牡丹早花品种凤丹、凤丹早花突变植株和晚花品种连鹤转录组、miRNA和降解组联合分析,挖掘到调控牡丹花期的PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1。为探究牡丹PomiR2592bj和PoSDR1的生物学特性及功能,克隆得到了113 bp的PomiR2592bj和1... 基于前期对牡丹早花品种凤丹、凤丹早花突变植株和晚花品种连鹤转录组、miRNA和降解组联合分析,挖掘到调控牡丹花期的PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1。为探究牡丹PomiR2592bj和PoSDR1的生物学特性及功能,克隆得到了113 bp的PomiR2592bj和1 380 bp的PoSDR1序列,二级结构分析表明,PomiR2592bj的前体序列可形成稳定的茎环结构,成熟序列分布在其3'臂端;多序列比对表明,PomiR2592bj成熟序列具有保守性;系统进化树分析显示,miR2592家族分为了10个分支,且具有同源性。PoSDR1基因编码的蛋白质含296个氨基酸,具有亲水性,不存在跨膜结构域,不存在信号肽,Ser位点有19个被磷酸化,Thr位点有11个被磷酸化,Tyr位点有2个被磷酸化,具有NADB_Rossmann超家族保守域。PomiR2592bj经预测与PoSDR1具有靶向关系。 展开更多
关键词 牡丹 PomiR2592bj posdr1 克隆 生物信息学
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