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题名沙地云杉PmSYP81基因克隆与表达分析
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作者
曹佳露
闫艳秋
白玉娥
代金玲
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机构
内蒙古农业大学林学院
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出处
《防护林科技》
2025年第6期39-44,48,共7页
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基金
国家自然科学基金项目“沙地云杉侧根发育单细胞图谱绘制及关键调控基因功能研究”(32360402)
内蒙古自然科学基金项目“转录因子LBD20介导生长素信号途径调控沙地云杉侧根发育的分子机理”(2022MS03037)
内蒙古自然科学基金项目“基于转录组和代谢组的沙地云杉体细胞胚胎发生机制研究”(2025MS03073)。
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文摘
为探究沙地云杉PmSYP81基因的分子结构特征及其在不同组织中的相对表达量,以沙地云杉(Picea mongolica)为材料,通过提取总核糖核酸(RNA),利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术扩增得到PmSYP81基因的互补脱氧核糖核酸(cDNA)序列,将该序列克隆至pMD19-T载体,经测序验证后,对其进行生物信息学分析,包括氨基酸序列推导、蛋白质理化性质分析、二级和三级结构预测以及同源性比对等。结果显示:PmSYP81基因的全长为942 bp,编码314个氨基酸。该蛋白具有1个N端结构域和1个可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体(soluble N-eEthylmaleimide-sensitive factor attachment protein receptor,SNARE)超家族结构域,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、向日葵(Helianthus annuus)和紫金舌唇兰(Platanthera zijinensis)等7种植物具有较高的同源性。PmSYP81蛋白存在一个跨膜结构,属于亲水性蛋白,丝氨酸和苏氨酸位点比例较高。成功克隆了PmSYP81基因,并对其进行了多方面分析,为深入研究该基因在沙地云杉中的生物学功能奠定了基础。
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关键词
pmsyp81
基因克隆
生物信息学分析
沙地云杉
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Keywords
pmsyp81
gene cloning:bioinformatics analysis
Picea mongolica in sandy land
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分类号
Q37
[生物学—遗传学]
S791.18
[农业科学—林木遗传育种]
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