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糜子PmDEP1和PmEP3基因的克隆与表达特征分析
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作者 许圆梦 毛娇 +7 位作者 王梦瑶 王数 任江陵 刘宇涵 刘思辰 乔治军 王瑞云 曹晓宁 《生物技术通报》 北大核心 2025年第2期150-162,共13页
【目的】穗型是影响作物产量和机械化收割的重要因素,DEP1(Dense Erect Panicles 1)和EP3(Erect Panicle 3)基因是控制穗型形成的关键基因。旨在探究糜子(Panicum miliaceum L.)PmDEP1和PmEP3基因的结构与表达特征。【方法】以散穗型糜... 【目的】穗型是影响作物产量和机械化收割的重要因素,DEP1(Dense Erect Panicles 1)和EP3(Erect Panicle 3)基因是控制穗型形成的关键基因。旨在探究糜子(Panicum miliaceum L.)PmDEP1和PmEP3基因的结构与表达特征。【方法】以散穗型糜子笤帚糜子(ZM)、密穗型糜子M278和侧穗型糜子M350为材料,克隆获得PmDEP1和PmEP3,并对其开展生物信息学分析。采用RT-qPCR检测不同穗型糜子PmDEP1和PmEP3的表达模式。【结果】序列结果分析显示,PmDEP1 cDNA全长为1044 bp,编码347个氨基酸,蛋白结构域预测为PAT1,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构与水稻DEP1蛋白高度相似,预测定位于细胞核,与柳枝稷具有较高的同源性,拥有28个磷酸化位点,不具有跨膜结构和信号肽。PmEP3 cDNA全长1215 bp,编码358个氨基酸,编码的蛋白属于F-box家族,二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,三级结构与水稻Os02g0260200蛋白高度相似,预测定位于细胞质,与柳枝稷具有较高的同源性,不含信号肽,拥有32个磷酸化位点,具有少量的跨膜结构。RT-PCR结果显示,PmDEP1和PmEP3在不同时期的不同部位中表达,PmDEP1在拔节期的根中表达量最高,在抽穗期的笤帚糜子和M278中的叶部表达量最高,在M350中的茎部表达量最高。PmEP3在拔节期的叶中表达量最高,在笤帚糜子和M278抽穗期的叶部表达量最高,在M350的穗部表达量最高。【结论】PmDEP1和PmEP3为穗型基因,可能参与调控糜子穗型形成。 展开更多
关键词 糜子 穗型基因 PmDEP1 pmep3 基因克隆 表达分析
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