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糜子PmDEP1和PmEP3基因的克隆与表达特征分析
1
作者
许圆梦
毛娇
+7 位作者
王梦瑶
王数
任江陵
刘宇涵
刘思辰
乔治军
王瑞云
曹晓宁
《生物技术通报》
北大核心
2025年第2期150-162,共13页
【目的】穗型是影响作物产量和机械化收割的重要因素,DEP1(Dense Erect Panicles 1)和EP3(Erect Panicle 3)基因是控制穗型形成的关键基因。旨在探究糜子(Panicum miliaceum L.)PmDEP1和PmEP3基因的结构与表达特征。【方法】以散穗型糜...
【目的】穗型是影响作物产量和机械化收割的重要因素,DEP1(Dense Erect Panicles 1)和EP3(Erect Panicle 3)基因是控制穗型形成的关键基因。旨在探究糜子(Panicum miliaceum L.)PmDEP1和PmEP3基因的结构与表达特征。【方法】以散穗型糜子笤帚糜子(ZM)、密穗型糜子M278和侧穗型糜子M350为材料,克隆获得PmDEP1和PmEP3,并对其开展生物信息学分析。采用RT-qPCR检测不同穗型糜子PmDEP1和PmEP3的表达模式。【结果】序列结果分析显示,PmDEP1 cDNA全长为1044 bp,编码347个氨基酸,蛋白结构域预测为PAT1,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构与水稻DEP1蛋白高度相似,预测定位于细胞核,与柳枝稷具有较高的同源性,拥有28个磷酸化位点,不具有跨膜结构和信号肽。PmEP3 cDNA全长1215 bp,编码358个氨基酸,编码的蛋白属于F-box家族,二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,三级结构与水稻Os02g0260200蛋白高度相似,预测定位于细胞质,与柳枝稷具有较高的同源性,不含信号肽,拥有32个磷酸化位点,具有少量的跨膜结构。RT-PCR结果显示,PmDEP1和PmEP3在不同时期的不同部位中表达,PmDEP1在拔节期的根中表达量最高,在抽穗期的笤帚糜子和M278中的叶部表达量最高,在M350中的茎部表达量最高。PmEP3在拔节期的叶中表达量最高,在笤帚糜子和M278抽穗期的叶部表达量最高,在M350的穗部表达量最高。【结论】PmDEP1和PmEP3为穗型基因,可能参与调控糜子穗型形成。
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关键词
糜子
穗型基因
PmDEP1
pmep3
基因克隆
表达分析
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职称材料
题名
糜子PmDEP1和PmEP3基因的克隆与表达特征分析
1
作者
许圆梦
毛娇
王梦瑶
王数
任江陵
刘宇涵
刘思辰
乔治军
王瑞云
曹晓宁
机构
山西农业大学农学院
山西农业大学农业基因资源研究中心
农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室
出处
《生物技术通报》
北大核心
2025年第2期150-162,共13页
基金
山西省重点研发项目(2022ZDYF110)
中央引导地方科技发展资金(YDZJSX2022A044)
+1 种基金
谷子高粱产业技术体系谷子糜子生理岗位(CARS-06-14.5-A16)
山西省现代农业杂粮产业技术体系(2024CYJSTX03-23)。
文摘
【目的】穗型是影响作物产量和机械化收割的重要因素,DEP1(Dense Erect Panicles 1)和EP3(Erect Panicle 3)基因是控制穗型形成的关键基因。旨在探究糜子(Panicum miliaceum L.)PmDEP1和PmEP3基因的结构与表达特征。【方法】以散穗型糜子笤帚糜子(ZM)、密穗型糜子M278和侧穗型糜子M350为材料,克隆获得PmDEP1和PmEP3,并对其开展生物信息学分析。采用RT-qPCR检测不同穗型糜子PmDEP1和PmEP3的表达模式。【结果】序列结果分析显示,PmDEP1 cDNA全长为1044 bp,编码347个氨基酸,蛋白结构域预测为PAT1,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构与水稻DEP1蛋白高度相似,预测定位于细胞核,与柳枝稷具有较高的同源性,拥有28个磷酸化位点,不具有跨膜结构和信号肽。PmEP3 cDNA全长1215 bp,编码358个氨基酸,编码的蛋白属于F-box家族,二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,三级结构与水稻Os02g0260200蛋白高度相似,预测定位于细胞质,与柳枝稷具有较高的同源性,不含信号肽,拥有32个磷酸化位点,具有少量的跨膜结构。RT-PCR结果显示,PmDEP1和PmEP3在不同时期的不同部位中表达,PmDEP1在拔节期的根中表达量最高,在抽穗期的笤帚糜子和M278中的叶部表达量最高,在M350中的茎部表达量最高。PmEP3在拔节期的叶中表达量最高,在笤帚糜子和M278抽穗期的叶部表达量最高,在M350的穗部表达量最高。【结论】PmDEP1和PmEP3为穗型基因,可能参与调控糜子穗型形成。
关键词
糜子
穗型基因
PmDEP1
pmep3
基因克隆
表达分析
Keywords
Panicum miliaceum L.
spike type gene
PmDEP1
pmep3
gene cloning
expression analysis
分类号
S516 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
糜子PmDEP1和PmEP3基因的克隆与表达特征分析
许圆梦
毛娇
王梦瑶
王数
任江陵
刘宇涵
刘思辰
乔治军
王瑞云
曹晓宁
《生物技术通报》
北大核心
2025
0
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