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基于Kaplan-Meier plotter数据库分析CD_(44)基因表达状态对卵巢癌生存结局的影响 被引量:3
1
作者 郑建清 黄碧芬 《吉林医学》 CAS 2022年第1期5-7,共3页
目的:探讨不同CD_(44)基因表达状态与卵巢癌生存结局的关系。方法:通过Kaplan-Meier plotter数据库检索CD_(44)基因的表达结果与生存数据,分析CD_(44)基因在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表达差异,同时分析不同CD_(44)基因表达分组的总... 目的:探讨不同CD_(44)基因表达状态与卵巢癌生存结局的关系。方法:通过Kaplan-Meier plotter数据库检索CD_(44)基因的表达结果与生存数据,分析CD_(44)基因在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表达差异,同时分析不同CD_(44)基因表达分组的总生存差别。结果:Kaplan-Meier plotter数据库包含了1653个样本,其中5个样本为正常卵巢组织,1648个样本是卵巢癌组织。正常卵巢组织CD_(44)基因表达量为174(91-276),而卵巢癌组织为231(4-4204),但差异无统计学意义(P=0.262)。数据库共记录了655例卵巢癌患者的总生存数据,以表达量172为阈值,低表达组卵巢癌中位总生存时间为35.0个月,而高表达组为47.8个月;差异具有显著统计学意义[风险比HR=0.76,95%CI(0.61-0.93),P=0.0089]。结论:卵巢癌组织中CD_(44)基因的表达与正常卵巢组织相当,但卵巢癌CD_(44)基因高表达提示预后良好,可以提高患者总生存率。 展开更多
关键词 卵巢癌 Kaplan-Meier plotter数据库 CD_(44)基因 基因表达 预后因素
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应用Kaplan-Meier Plotter数据库探索EGFR表达在非小细胞肺癌中的预后意义
2
作者 赵中华 王振波 +1 位作者 郭琛 贾瑞 《中国继续医学教育》 2020年第20期182-184,共3页
Kaplan-Meier Plotter数据库是一个恶性肿瘤预后相关的在线分析数据库,可以评估54 000多个基因表达对21种癌症类型预后的影响。在医学教学及科研中,可应用此数据库探索目标基因表达同相关肿瘤预后的关系,应用方便、高效。非小细胞肺癌(n... Kaplan-Meier Plotter数据库是一个恶性肿瘤预后相关的在线分析数据库,可以评估54 000多个基因表达对21种癌症类型预后的影响。在医学教学及科研中,可应用此数据库探索目标基因表达同相关肿瘤预后的关系,应用方便、高效。非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)治疗已进入精准治疗时代,根据驱动基因突变或扩增情况选择相应的靶向治疗药物是晚期肺腺癌患者的标准一线治疗。表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是一种跨膜受体酪氨酸激酶,该区域的激活对细胞增殖、生长的相关信号传递具有重要意义。文章以表皮生长因子受体在非小细胞肺癌中的预后意义探索为例,应用Kaplan-Meier Plotter数据库,探索肿瘤组织中EGFR mRNA表达高低在非小细胞肺癌中的预后意义。 展开更多
关键词 Kaplan-Meier plotter数据库 医学教学 科学研究 EGFR 非小细胞肺癌 预后
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基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库分析GPX2在非小细胞肺癌组织中的表达和临床意义 被引量:1
3
作者 高华 张贝贝 +1 位作者 庞俊芳 王黎 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第19期3390-3395,共6页
目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶2(glutathione peroxidase 2,GPX2)在非小细胞肺癌组织中的表达及预后意义。方法:基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库,收集关于GPX2表达的相关数据集,深入挖掘GPX2在非小细胞肺癌组织与正常组织中的... 目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶2(glutathione peroxidase 2,GPX2)在非小细胞肺癌组织中的表达及预后意义。方法:基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库,收集关于GPX2表达的相关数据集,深入挖掘GPX2在非小细胞肺癌组织与正常组织中的差异表达情况。采用Kaplan-Meier法进行预后分析,并绘制生存曲线。此外,通过单/多因素COX回归进一步评估GPX2在不同临床特征中的预后评估价值。结果:与正常组织相比,GPX2在非小细胞肺癌组织中高表达(P<0.001)。GPX2高表达非小细胞肺癌患者的总体生存率(HR=1.42,95%CI:1.25~1.61,P=5.6E-08)和肺腺癌患者的总体生存率(HR=1.35,95%CI:1.07~1.71,P=0.011)均差于低表达组。但GPX2表达水平对鳞癌患者预后无显著影响(HR=1.06,95%CI:0.84~1.35,P=0.61)。此外,本研究也发现GPX2的表达对同一临床特征(如男性、临床分期、吸烟/不吸烟、经化疗方式治疗)的患者的预后有预测评估价值。多因素分析结果显示临床分期和GPX2的表达是非小细胞肺癌患者预后的独立影响因素。结论:检测非小细胞肺癌组织中GPX2的表达有助于患者预后评估。 展开更多
关键词 NSCLC GPX2 Oncomine数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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基于KM-plotter分析STAT家族基因表达对乳腺癌预后价值
4
作者 胡剑 王伟 周娟 《安徽卫生职业技术学院学报》 2020年第4期84-86,共3页
目的:研究信号传导及转录激活蛋白(STAT)家族基因表达对乳腺癌预后价值。方法:使用公开的在线生存分析网站KM-plotter数据库,对乳腺癌患者的总生存期(OS)与7个STAT基因的表达水平的相关性进行研究。结果:在所有乳腺癌患者中STAT3/4/5A/5... 目的:研究信号传导及转录激活蛋白(STAT)家族基因表达对乳腺癌预后价值。方法:使用公开的在线生存分析网站KM-plotter数据库,对乳腺癌患者的总生存期(OS)与7个STAT基因的表达水平的相关性进行研究。结果:在所有乳腺癌患者中STAT3/4/5A/5B/6的高转录水平预示着更好的总生存期。结论:结合近年来国内外文献报道结果,认为STAT1/4/5A/5B/6可能是乳腺癌良好预后的生物标志物。 展开更多
关键词 信号传导及转录激活蛋白 乳腺癌 预后 KM-plotter 总生存期
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FOXP3和FOXO4基因在口腔鳞状细胞癌中的预后分析
5
作者 毛家奇 赵力如 +5 位作者 杨冬茹 魏梓轩 齐霞 李雅 梁向阳 李淑娟 《现代口腔医学杂志》 2025年第2期125-129,共5页
目的探索FOXP3和FOX04基因在口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)中的预后分析。方法通过UALCAN、Kaplan-MeierPlotter和cBioPortal在线数据库,分析FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达差异、癌症分期、病理分级及预后... 目的探索FOXP3和FOX04基因在口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)中的预后分析。方法通过UALCAN、Kaplan-MeierPlotter和cBioPortal在线数据库,分析FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达差异、癌症分期、病理分级及预后分析。real-timePCR检测人口腔角质细胞(HumanOral Keratinocytes,HOK)和CAL27人舌鳞状细胞癌细胞(CAL27 Human Tongue Squamous Cell Carcinoma,CAL27)中FOXP3和FOXO4的mRNA表达。结果①FOXP3和FOXO4在OSCC患者中的mRNA表达均出现明显差异性变化。②FOXP3和FOXO4的mRNA表达与OSCC患者的癌症分期、肿瘤分级和预后显著相关。③FOXP3和FOXO4的基因改变可能会显著影响OSCC患者的预后。④与HOK细胞相比,CAL27细胞中FOXP3和FOXO4的mRNA表达明显降低(P<0.05)。结论①FOXP3和FOXO4是口腔鳞状细胞癌OS的独立生存因素。②FOXP3和FOXO4可以作为口腔鳞状细胞癌患者生存的预后标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 FOXP3 FOXO4 口腔鳞状细胞癌 UALCAN Kaplan-Meier plotter
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CEACAM8与胃癌患者生存关系的生物信息学分析
6
作者 孙烨煜 姜艳芳 +2 位作者 李娜 李浩 贺延新 《临床医学进展》 2025年第1期49-54,共6页
胃癌在世界范围内直接影响着人类的生活质量,癌胚抗原相关细胞粘附分子(CEACAM)亚家族的一些成员在肿瘤中不受调控。对于CEACAM8在胃癌中的功能知之甚少。为了解决这一问题,本研究使用UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、metascape数据库研... 胃癌在世界范围内直接影响着人类的生活质量,癌胚抗原相关细胞粘附分子(CEACAM)亚家族的一些成员在肿瘤中不受调控。对于CEACAM8在胃癌中的功能知之甚少。为了解决这一问题,本研究使用UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、metascape数据库研究了CEACAM8在胃癌预后中的作用。发现CEACAM8的过表达与胃癌患者的临床肿瘤分期和病理肿瘤分级显著相关。此外,CEACAM8 mRNA的高表达与胃癌患者较短的总生存期(OS)显著相关。总的来说,CEACAM8可能是胃癌患者生存的预后生物标志物。Gastric cancer directly affects human quality of life worldwide, and some members of the carcinoembryonic antigen-associated cell adhesion molecule (CEACAM) subfamily are not regulated in tumors. Little is known about the function of CEACAM8 in gastric cancer. In order to solve this problem, this study used UALCAN, Kaplan-Meier Plotter and metascape databases to study the role of CEACAM8 in the prognosis of gastric cancer. It was found that the overexpression of CEACAM8 was significantly correlated with the clinical tumor stage and pathological tumor grade of gastric cancer patients. In addition, high expression of CEACAM8 mRNA was significantly associated with shorter overall survival (OS) in patients with gastric cancer. Overall, CEACAM8 may be a prognostic biomarker for survival in patients with gastric cancer. 展开更多
关键词 胃癌 CEACAM8 预后 UALCAN Kaplan-Meier plotter
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CCNB1在卵巢癌中的表达及意义 被引量:11
7
作者 李莉 熊国平 +1 位作者 颜琳 张庆华 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2016年第11期818-820,824,共4页
目的:探讨CCNB1在卵巢癌诊断和预后判断的作用。方法:通过Oncomine数据库分析并提取组织RNA,Real-time PCR法检测CCNB1在卵巢癌组织中的表达。通过在线数据库及分析工具"the Kaplan Meier plotter"(KM plotter)数据库的应用发... 目的:探讨CCNB1在卵巢癌诊断和预后判断的作用。方法:通过Oncomine数据库分析并提取组织RNA,Real-time PCR法检测CCNB1在卵巢癌组织中的表达。通过在线数据库及分析工具"the Kaplan Meier plotter"(KM plotter)数据库的应用发掘CCNB1的预后价值。结果:Oncomine数据库中共有18个研究结果涉及正常卵巢组织和卵巢癌组织中的CCNB1的表达情况,全部显示CCNB1在卵巢癌中表达增高。本研究对9对配对的卵巢癌及其癌旁组织进行Real-time PCR,得到相同结果。在KM plotter数据库中的分析显示:无论是无进展生存期(PFS)或总生存期(OS),CCNB1 mRNA水平越高,卵巢癌患者的预后越差(HR>1,P<0.05)。且CCNB1 mRNA高水平在早于2期(包括2期)卵巢癌患者中提示预后较差,在晚于3期(包括3期)患者中CCNB1 mRNA水平与预后无明显相关性。结论:CCNB1在卵巢癌组织中表达升高,可作为提示预后差的卵巢癌的分子标记物。 展开更多
关键词 卵巢癌 预后 CCNB1 KM plotter
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KCNK5双孔钾通道蛋白在甲状腺乳头状癌中的表达及临床意义 被引量:3
8
作者 薛刚 孙新民 +1 位作者 林旭 吴靖芳 《山东大学耳鼻喉眼学报》 CAS 2021年第4期64-69,共6页
目的检测KCNK5在甲状腺乳头状癌(PTC)组织中的表达,探讨其与临床病理特征及患者预后的相关性。方法应用免疫组织化学和Western bloting方法检测PTC组织及癌旁正常组织中KCNK5表达,分析其与PTC临床病理特征的关系,KM Plotter数据库分析KC... 目的检测KCNK5在甲状腺乳头状癌(PTC)组织中的表达,探讨其与临床病理特征及患者预后的相关性。方法应用免疫组织化学和Western bloting方法检测PTC组织及癌旁正常组织中KCNK5表达,分析其与PTC临床病理特征的关系,KM Plotter数据库分析KCNK5与PTC预后的关系。结果免疫组化结果显示KCNK5表达于PTC细胞的胞膜、核膜和胞质,癌旁正常组织阴性或弱阳性;Western blot和免疫组化半定量积分显示PTC组织中的KCNK5水平显著高于癌旁正常组织(P<0.05)。KCNK5表达与PTC患者的TNM分期、淋巴结转移密切相关(均P<0.05);多因素Logistic回归分析进一步证实KCNK5与淋巴结转移密切相关(P<0.05)。Kaplan-Meier分析显示KCNK5高表达患者生存率明显低于KCNK5低表达患者(P<0.01)。结论KCNK5与PTC患者淋巴结转移和预后密切相关,有望成为PTC评估预后的指标。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 双孔钾通道 KCNK5 免疫组织化学 Western bloting方法 KM plotter数据库
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PIK3R1基因对乳腺癌侵袭转移及预后的影响机制初探 被引量:3
9
作者 郑建清 廖小文 +1 位作者 苏菁菁 黄碧芬 《吉林医学》 CAS 2019年第12期2765-2766,共2页
目的:探讨乳腺癌组织磷脂酰肌醇3-激酶(PIK3R1)基因的表达差异,并分析其表达状态与乳腺癌预后的关系,初步探索PIK3R1影响乳腺癌侵袭转移能力的机制。方法:利用Kaplan Meier plotter数据库分析乳腺癌组织和正常组织中PIK3R1基因表达的差... 目的:探讨乳腺癌组织磷脂酰肌醇3-激酶(PIK3R1)基因的表达差异,并分析其表达状态与乳腺癌预后的关系,初步探索PIK3R1影响乳腺癌侵袭转移能力的机制。方法:利用Kaplan Meier plotter数据库分析乳腺癌组织和正常组织中PIK3R1基因表达的差异,并分析不同PIK3R1基因表达状态下乳腺癌的总生存差异,探索PIK3R1基因表达的预后价值。结果:Kaplan Meier plotter数据库包含了6623份表达样本,其中正常组织76份,乳腺癌组织6547份。数据分析结果显示乳腺癌组织PIK3R1基因表达显著低于正常组织,差异具有统计学意义(P<0.001)。具有完整随访资料的患者1402例,其中433例为低表达,969例患者为高表达。低表达组乳腺癌中位总生存时间为69.7个月,高表达组为120个月;差异具有显著统计学意义[风险比HR=0.71,95%CI(0.57~0.89),P=0.0025]。结论:PIK3R1基因是重要抑癌基因,其在乳腺癌组织表达水平低于正常组织,高表达患者预后良好,提高患者生存期。 展开更多
关键词 乳腺癌 PIK3R1 The KAPLAN Meier plotter数据库 生存分析 预后因素
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FN1在胃癌组织和细胞中的表达及意义 被引量:6
10
作者 姚远 李胜昔 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第16期2831-2835,共5页
目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析... 目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin-1,FN1)在胃癌组织和细胞中的表达,探讨其与预后的关系。方法:利用Oncomine数据库挖掘FN1在胃癌组织中的表达;实时荧光定量聚合酶链反应检测FN1在人胃癌细胞系中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析FN1表达水平与胃癌预后的关系。结果:Oncomine数据库分析FN1在多种肿瘤组织中表达增加,与胃正常组织相比,FN1在胃癌组织中表达增加,并具有统计学差异(P=1.41E-5)。FN1 mRNA在人胃癌细胞系SGC7901中表达水平增高,在胃癌组织中FN1蛋白表达增加。KM Plotter数据库分析结果显示FN1表达量与胃癌患者总体生存率存在相关性,即高表达FN1的患者总体生存率较差。结论:FN1在胃癌组织和细胞中的表达高于正常组织和细胞,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 Oncomine数据库 KMplotter数据库 纤维连接蛋白1 预后
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胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析 被引量:6
11
作者 姚远 李胜昔 《解剖科学进展》 2019年第5期525-527,531,共4页
目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采... 目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 预后 KM plotter数据库 COL1A2 FN1 COL6A3
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GVZ-3型静电场描绘仪改进设计
12
作者 李双成 陈兴媚 《装备机械》 2025年第2期11-19,共9页
介绍了GVZ-3型静电场描绘仪的工作原理,针对GVZ-3型静电场描绘仪在使用中存在的四点不足,分别进行改进,并进行三维造型设计和工作过程仿真。改进后GVZ-3型静电场描绘仪能够满足静电场描绘要求,提高试验工作效率,并使静电场的描绘精度得... 介绍了GVZ-3型静电场描绘仪的工作原理,针对GVZ-3型静电场描绘仪在使用中存在的四点不足,分别进行改进,并进行三维造型设计和工作过程仿真。改进后GVZ-3型静电场描绘仪能够满足静电场描绘要求,提高试验工作效率,并使静电场的描绘精度得到大幅提高。 展开更多
关键词 静电场 描绘仪 改进 设计
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联合生物信息学分析S1PR1在肺癌组织中的表达及临床意义 被引量:1
13
作者 徐鑫鑫 蔡花 +1 位作者 彭静静 褚福营 《标记免疫分析与临床》 CAS 2020年第6期1006-1010,共5页
目的探讨肺癌组织中1-磷酸神经鞘氨醇受体1 (S1PR1)的表达及临床意义。方法收集南通市肿瘤医院52例肺癌患者组织标本,采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法检测肺癌组织及癌旁组织中S1PR1的表达水平,通过Oncomine数据库对S1PR1表达结果进行佐... 目的探讨肺癌组织中1-磷酸神经鞘氨醇受体1 (S1PR1)的表达及临床意义。方法收集南通市肿瘤医院52例肺癌患者组织标本,采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法检测肺癌组织及癌旁组织中S1PR1的表达水平,通过Oncomine数据库对S1PR1表达结果进行佐证,并分析其与临床病理参数之间的关系;利用ROC曲线,评价其表达水平对肺癌的诊断价值;Kaplan-Meier Plotter数据库分析其与肺癌预后的关系。结果肺癌组织中S1PR1的表达水平明显低于癌旁组织(P<0.01),Oncomine数据库共检索出9项符合筛选条件的研究,S1PR1在所有研究中都呈低表达(P<0.01)。S1PR1的表达与肿瘤大小和淋巴结转移有关(P<0.05),而与性别、年龄、吸烟情况、病理类型及TNM分期无明显相关性(P>0.05)。根据S1PR1表达水平绘制ROC曲线,曲线下面积(AUC)为0.711(95%CI:0.610~0.813),临界值取1.127时,S1PR1诊断肺癌的灵敏度和特异性均为71.2%。Kaplan-Meier生存分析发现低表达S1PR1的患者5年总生存期显著低于高表达患者(P<0.01)。结论肺癌组织中S1PR1表达水平下调,且低表达S1PR1的患者预后较差,S1PR1有望成为肺癌诊断和预后的分子标志物。 展开更多
关键词 S1PR1 肺癌 Oncomine数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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CCNE1基因表达状态在卵巢癌中的预后价值 被引量:1
14
作者 黄春珍 郑建清 黄碧芬 《中外医学研究》 2019年第6期1-2,共2页
目的:探讨CCNE1基因表达状态对卵巢癌总生存结果的影响及预后价值。方法:利用The Kaplan Meier plotter数据库中的卵巢癌患者生存资料及CCNE1基因表达资料,分析不同CCNE1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索CCNE1基因表达的预后价值... 目的:探讨CCNE1基因表达状态对卵巢癌总生存结果的影响及预后价值。方法:利用The Kaplan Meier plotter数据库中的卵巢癌患者生存资料及CCNE1基因表达资料,分析不同CCNE1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索CCNE1基因表达的预后价值。结果:共检出1 656例卵巢癌患者用于最终的生存分析,根据CCNE1基因表达状态,分为低表达组(1 171例)和高表达组(485例),低表达组卵巢癌中位总生存时间为48.0个月,高表达组为37.4个月,差异有统计学意义(P=0.001),风险比HR=1.26,95%CI(1.10,1.44)。结论:CCNE1基因高表达降低卵巢癌总生存,是不良预后因子。 展开更多
关键词 CCNE1 生存分析 预后因素 The KAPLAN Meier plotter数据库
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基于Oncomine数据库探讨TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后分析 被引量:2
15
作者 李萍 《生物技术》 CAS 2021年第1期65-70,9,共7页
[目的]揭示TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后相关性。[方法]收集Oncomine和CCLE数据库中TMC5相关资料,对其表达情况进行二次分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析预后。[结果]Oncomine数据库有关TMC5在不同类型肿瘤中的研究共362项(... [目的]揭示TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后相关性。[方法]收集Oncomine和CCLE数据库中TMC5相关资料,对其表达情况进行二次分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析预后。[结果]Oncomine数据库有关TMC5在不同类型肿瘤中的研究共362项(高表达16项、低表达8项)。胰腺癌相关研究7项,共计187例样本。TMC5在胰腺癌组织中的表达明显高于正常组织(P <0.05)。分析CCLE数据库发现,与多种癌细胞系相比,胰腺癌细胞系中TMC5高表达,其mRNA表达水平排名第一。Kaplan-Meier Plotter数据库阐明胰腺癌患者的总生存与TMC5表达水平无关(HR=1.56,95%CI:0.93~2.61,P=0.09),但低表达组患者的无复发生存(RFS)明显优于高表达组(HR=5.37,95%CI:1.26~22.99,P=0.011)。[结论]通过Oncomine和CCLE数据库我们发现胰腺癌中TMC5表达水平升高,高表达患者RFS缩短,因此,检测TMC5表达及靶向该基因的药物有望成为胰腺癌诊疗的重要手段之一。 展开更多
关键词 胰腺癌 TMC5 Oncomine数据库 CCLE数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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基于Oncomine数据库探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及意义 被引量:1
16
作者 李萍 《生物技术》 CAS 2022年第6期715-720,736,共7页
[目的]探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及临床意义。[方法]收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL1A1的信息,对目前数据库中资料再次进行分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,使用Kaplan-Meier Plotte... [目的]探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及临床意义。[方法]收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL1A1的信息,对目前数据库中资料再次进行分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,使用Kaplan-Meier Plotter在线数据库分析该基因是否与胰腺癌患者的预后相关。[结果]Oncomine数据库中共收集了400项不同类型的研究。其中COL1A1高表达有86项研究,低表达有6项研究。共有8项研究涉及COL1A1在胰腺癌组织与正常组织中的表达,包括209例样本,与正常组织相比,COL1A1在胰腺癌组织中高表达(P<0.05)。NCBI/GEO Profiles数据库分析发现TGF-β处理48 h后COL1A1表达升高。Kaplan-Meier Plotter数据库分析表明COL1A1高、低表达组胰腺癌患者的总体生存率(OS)无统计学差异(HR=1.4,95%CI:0.92~2.12,P=0.11),但高表达组胰腺癌患者的无复发生存(RFS)明显差于低表达组(HR=5.05,95%CI:1.48~17.24,P=0.0044)。[结论]COL1A1基因在胰腺癌组织中的表达明显高于正常组织,低表达患者的RFS延长。可见靶向COL1A1的药物有望改善胰腺癌患者的预后。 展开更多
关键词 胰腺癌 COL1A1 Oncomine数据库 NCBI/GEO Profiles数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
原文传递
MMPs基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义 被引量:2
17
作者 李珂 王娴 王小琦 《现代医药卫生》 2020年第16期2512-2517,共6页
目的研究基质金属蛋白酶(MMPs)基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义。方法检索Oncomine,GEPIA及cBioPortal数据库中有关肺腺癌MMPs(MMP-1/9/11/12/14)的数据集,对数据集进行挖掘并结合文献资料进行荟萃分析。结果Oncomine数据库收集9项... 目的研究基质金属蛋白酶(MMPs)基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义。方法检索Oncomine,GEPIA及cBioPortal数据库中有关肺腺癌MMPs(MMP-1/9/11/12/14)的数据集,对数据集进行挖掘并结合文献资料进行荟萃分析。结果Oncomine数据库收集9项研究,943例样本;GEPIA数据库收集830例样本。综合分析发现,肺腺癌组织中MMPs的表达显著高于正常肺组织,差异有统计学意义(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter生存分析表明,MMPs高表达的肺腺癌患者总体病死率高,预后较差,差异有统计学意义(P<0.05)。cBioPortal数据库显示,MMPs在肺腺癌中的突变发生率达39%,且互为正相关。结论MMPs在肺腺癌组织中呈高表达,并与肺腺癌的预后密切相关,有望成为肺腺癌治疗的重要靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 MMPs基因 Oncomine数据库 GEPIA数据库 cBioPortal数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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干扰素刺激基因15在原发性肝癌中的表达及与患者预后的关系 被引量:1
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作者 汪蔷华 李祥 《内科》 2020年第6期676-679,共4页
目的通过对肿瘤芯片数据库(Oncomine)和生存分析数据库(Kaplan-Meier Plotter)和蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)进行数据挖掘,探讨干扰素刺激基因15(ISG15)在原发性肝癌中的表达情况及其与患者预后的关系。方法分别对Oncomine数据库、... 目的通过对肿瘤芯片数据库(Oncomine)和生存分析数据库(Kaplan-Meier Plotter)和蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)进行数据挖掘,探讨干扰素刺激基因15(ISG15)在原发性肝癌中的表达情况及其与患者预后的关系。方法分别对Oncomine数据库、Kaplan-Meier Plotter数据库和STRING数据库进行肝癌中ISG15基因表达的相关研究检索,探讨ISG15基因在肝癌组织和对应正常组织中的表达情况,绘制ISG15基因表达与肝癌患者总体生存时间的生存曲线。构建ISG15相互作用蛋白网络树状图,并对ISG15及其相关蛋白基因进行功能富集分析。结果通过检索Oncomine数据库发现,有5个研究结果显示肝癌组织中ISG15呈高表达(包括细胞系),有2项研究结果显示ISG15在肝癌组织中的表达水平显著高于正常肝组织(P<0.05)。通过对Kaplan-Meier Plotter数据库进行检索分析发现,在病毒性肝炎、饮酒的肝癌患者中,ISG15高表达患者的总体生存时间明显短于ISG15低表达患者(P<0.05)。通过STRING数据库搜索ISG15基因相关蛋白发现,ISG15基因相互作用蛋白有10种;生物过程富集分析结果显示,上述蛋白主要富集在病毒防御和病毒基因组复制的负调控通路。结论ISG15在肝癌组织中高表达,且可能与病毒性肝炎、酒精性肝癌患者的预后密切相关。 展开更多
关键词 原发性肝癌 干扰素刺激基因15 Oncomine Kaplan-Meier plotter STRING
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ESPL1基因在卵巢癌中的表达及意义 被引量:1
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作者 饶玉梅 《医药论坛杂志》 2023年第9期25-30,共6页
目的 探讨分离酶(ESPL1)基因在卵巢癌中的表达及意义。方法 利用GEPIA数据库,对比相应正常组织,分析ESPL1在泛癌及卵巢癌中的表达。运用The Human Protein Atlas数据库,分析ESPL1蛋白在卵巢及卵巢癌组织中表达及定位;应用String数据库绘... 目的 探讨分离酶(ESPL1)基因在卵巢癌中的表达及意义。方法 利用GEPIA数据库,对比相应正常组织,分析ESPL1在泛癌及卵巢癌中的表达。运用The Human Protein Atlas数据库,分析ESPL1蛋白在卵巢及卵巢癌组织中表达及定位;应用String数据库绘制ESPL1基因的相关蛋白网络图,并进行基因功能富集分析。使用Kaplan-Meier Plotter网站,对ESPL1表达影响不同临床特征患者预后指标及化疗药物疗效进行分析。结果 ESPL1在14种恶性肿瘤中表达明显上调,而在食管癌中表达量下调;与正常卵巢组织相比,在卵巢癌中ESPL1基因在mRNA及蛋白质水平的表达显著升高,在卵巢癌中表达定位于细胞膜或浆及核中。与ESPL1基因相互作用蛋白有SMC3、KIF11、PTTG1等10个,主要富集在细胞周期、卵母细胞减数分裂等信号通路。Kaplan-Meier生存分析显示,ESPL1高表达的卵巢癌患者总生存时间明显短于ESPL1低表达者,且临床I+II期患者总生存期较短(P<0.05),其它期别及病理分级的患者预后无差异;应用多西他赛单药组中,ESPL1高表达组较低表达组总生存期下降,有显著差异(P<0.05),而在铂类、紫杉醇、泰素、吉西他滨、拓扑替康单药治疗的患者中,两组间无显著性差异。结论 ESPL1基因在多种肿瘤组织及卵巢癌组织中高表达;其相互作用的网络蛋白主要富集在细胞周期信号通路;高表达ESPL1基因的卵巢癌患者预后差,特别是早期卵巢癌患者,化疗药物不宜选择多西他赛。该基因也许可作为卵巢癌预后及一线化疗药物选择潜在参考指标。 展开更多
关键词 ESPL1 卵巢癌 GEPIA Kaplan-Meier plotter
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核转运蛋白基因2的表达在皮肤恶性黑素瘤临床预后中的作用 被引量:5
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作者 宋毓平 张庆华 +3 位作者 李瑞 李贺梅 曾真 田训 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期141-144,共4页
目的:探讨核转运蛋白基因(karyopherin, KPNA)2在皮肤恶性黑素瘤临床预后中的作用。方法:应用GEO数据库数据分析,比较KPNA2 mRNA在正常皮肤组织、恶性黑素瘤中表达的差异,并进一步利用两种在线数据库进行生存分析,分析KPNA2 mRNA与皮肤... 目的:探讨核转运蛋白基因(karyopherin, KPNA)2在皮肤恶性黑素瘤临床预后中的作用。方法:应用GEO数据库数据分析,比较KPNA2 mRNA在正常皮肤组织、恶性黑素瘤中表达的差异,并进一步利用两种在线数据库进行生存分析,分析KPNA2 mRNA与皮肤恶性黑素瘤的预后之间的关系。结果:KPNA2 mRNA水平在正常皮损组织中明显要低于恶性黑素瘤组织,差异有统计学意义(P<0.05);同时生存分析显示KPNA2 mRNA表达水平与皮肤恶性黑素瘤的预后具有的显著相关性,其表达水平高则预后差(P<0.05)。结论:KPNA2与皮肤恶性黑素瘤临床预后密切相关,为皮肤恶性黑素瘤治疗提供潜在靶点。 展开更多
关键词 KPNA2基因 预后 皮肤恶性黑素瘤 KM plotter 生物标志物
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