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题名游动双孢菌线型质粒pPR2的全序列测定及分析
被引量：1
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作者
杨勇
覃重军
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机构
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
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出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1295-1300,共6页
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基金
国家自然科学基金(30325003
30770045)
+1 种基金
"863计划"(2007AA021503)
中国科学院知识创新工程项目(KSCX2-YW-G-014)~~
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文摘
【目的】获得游动双孢菌线型质粒pPR2的全序列,并揭示新型的端粒复制蛋白和可能的中间复制位点。【方法】用分段克隆的方法和序列拼接获得pPR2的全序列,利用软件分析端粒DNA的二级结构和可能的端粒复制蛋白,利用链霉菌原生质体转化的方法检测可能的中间复制的位点。【结果】pPR2全长为15520bp,(G+C)含量为68.1%。其端粒末端反向重复序列的长度为329bp,不能像多数链霉菌的线型质粒那样能形成保守的"折返"的二级结构。pPR2虽然没有参与链霉菌端粒复制的保守的tap/tpg基因,但是pPR2.3c基因编码了一个双结构域蛋白,分别同链霉菌的端粒复制相关蛋白Tap和嗜血杆菌的解旋酶具有相似性。pPR2缺少典型的链霉菌重复序列-复制基因(iteron-rep)区段,将几乎覆盖全长pPR2的两段DNA进行克隆后,不能转化变铅青链霉菌。此外,pPR2基因还编码可能参与线型DNA复制的调控的单链结合蛋白(SSB)和与放线菌质粒接合转移相关的主要蛋白(Tra)。【结论】pPR2是链霉菌之外的放线菌中最小的线型质粒,其序列在游动双孢菌属的线型质粒中是首次报道。pPR2可能具有新型的端粒复制的机制,其中pPR2.2c和pPR2.3c编码可能的端粒复制蛋白。
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关键词
游动双孢菌
线型质粒
全序列
端粒
复制
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Keywords
planobispora
linear plasmid
complete nucleotide sequence
telomere
replication
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分类号
Q933
[生物学—微生物学]
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