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石榴GST基因家族全基因组鉴定及表达分析
被引量:
4
1
作者
刘龙博
宋运贤
+4 位作者
张慧君
余如刚
朱乾智
郑珂
郑洁
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第16期5307-5317,共11页
谷胱甘肽硫-转移酶(glutathione-S-transferase, GST)是一类重要的多功能蛋白酶(EC 2.5.1.18),可参与解毒作用、抵御生物与非生物胁迫以及次级代谢物质运输。本研究以石榴(Punica granatum)为材料,在其全基因组中共鉴定到44个Pg GSTs基...
谷胱甘肽硫-转移酶(glutathione-S-transferase, GST)是一类重要的多功能蛋白酶(EC 2.5.1.18),可参与解毒作用、抵御生物与非生物胁迫以及次级代谢物质运输。本研究以石榴(Punica granatum)为材料,在其全基因组中共鉴定到44个Pg GSTs基因家族成员。44个成员编码蛋白氨基酸长度为103~417 aa,分子量为11.87~47.42 kD,理论等电点在4.96~9.34,大部分成员定位于细胞质。进化分析显示,Pg GSTs可以划分为8个亚家族,石榴U型和F型亚家族成员居多数。其中43个基因家族成员均含有GSTN保守基序motif 1和motif 2。染色体定位与共线性分析显示,44个成员在8条染色体不均匀分布,存在10处串联重复,并与苹果MdGSTs具有更近的基因进化起源关系。上游2 kb区域顺式作用元件分析表明,该基因家族成员能够响应非生物胁迫、植物激素等刺激。转录组表达分析显示Pg GST有一定的组织表达特异性,其中PgGSTF3可能参与了成熟花和果实外种皮花青苷转运积累过程。本研究可为深入研究石榴GST基因家族生物学功能提供理论基础。
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关键词
石榴(Punica
granatum)
谷胱甘肽S-转移酶(GST)
全基因组鉴定
表达分析
pggstf3
原文传递
题名
石榴GST基因家族全基因组鉴定及表达分析
被引量:
4
1
作者
刘龙博
宋运贤
张慧君
余如刚
朱乾智
郑珂
郑洁
机构
淮北师范大学生命科学学院
河南省农业广播电视学校夏邑分校
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第16期5307-5317,共11页
基金
安徽省自然科学青年基金(1908085QC108)
国家级和省级大学生创新创业训练计划项目(201910373038,201810373112)共同资助。
文摘
谷胱甘肽硫-转移酶(glutathione-S-transferase, GST)是一类重要的多功能蛋白酶(EC 2.5.1.18),可参与解毒作用、抵御生物与非生物胁迫以及次级代谢物质运输。本研究以石榴(Punica granatum)为材料,在其全基因组中共鉴定到44个Pg GSTs基因家族成员。44个成员编码蛋白氨基酸长度为103~417 aa,分子量为11.87~47.42 kD,理论等电点在4.96~9.34,大部分成员定位于细胞质。进化分析显示,Pg GSTs可以划分为8个亚家族,石榴U型和F型亚家族成员居多数。其中43个基因家族成员均含有GSTN保守基序motif 1和motif 2。染色体定位与共线性分析显示,44个成员在8条染色体不均匀分布,存在10处串联重复,并与苹果MdGSTs具有更近的基因进化起源关系。上游2 kb区域顺式作用元件分析表明,该基因家族成员能够响应非生物胁迫、植物激素等刺激。转录组表达分析显示Pg GST有一定的组织表达特异性,其中PgGSTF3可能参与了成熟花和果实外种皮花青苷转运积累过程。本研究可为深入研究石榴GST基因家族生物学功能提供理论基础。
关键词
石榴(Punica
granatum)
谷胱甘肽S-转移酶(GST)
全基因组鉴定
表达分析
pggstf3
Keywords
Pomegranate(Punica granatum)
Glutathione S-transferase(GST)
Genome-wide identification
Expression analysis
PgGST3
分类号
S665.4 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
石榴GST基因家族全基因组鉴定及表达分析
刘龙博
宋运贤
张慧君
余如刚
朱乾智
郑珂
郑洁
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
4
原文传递
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参考文献
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