目的:探索上皮性卵巢癌(EOC)中lncRNA PVT1调控上皮-间皮质转化(EMT)的关键通路和枢纽基因。方法:收集EOC相关基因,通过疾病富集分析验证其可靠性。然后,通过通路富集分析,发现EOC显著富集的通路,筛选出与EMT过程相关的通路。通过整合Me...目的:探索上皮性卵巢癌(EOC)中lncRNA PVT1调控上皮-间皮质转化(EMT)的关键通路和枢纽基因。方法:收集EOC相关基因,通过疾病富集分析验证其可靠性。然后,通过通路富集分析,发现EOC显著富集的通路,筛选出与EMT过程相关的通路。通过整合MetaCore数据库中四种算法构建的子网络,得到lncRNA PVT1的调控网络。最后,通过构建EOC相关EMT通路-基因网络,综合分析EMT通路和lncRNA PVT1调控网络,确定上皮性卵巢癌EMT过程中lncRNA PVT1调控的关键信号通路和核心节点。结果:共收集到EOC相关基因1138个。获得了77条与EOC相关的显著富集通路,其中6条通路与EMT过程相关。lncRNA PVT1的调控网络包含377个节点和1182条边。关键信号通路,如“Some pathways of EMT in cancer cells”、“Development_Regulation of epithelial-to-mesenchymal transition(EMT)”和核心节点,如TNF-α和STAT3,可能受lncRNA PVT1直接调控并参与上皮性卵巢癌EMT过程。结论:通过生物信息学方法发现LncRNA PVT1与上皮性卵巢癌EMT过程存在调控关系。展开更多
文摘目的:探索上皮性卵巢癌(EOC)中lncRNA PVT1调控上皮-间皮质转化(EMT)的关键通路和枢纽基因。方法:收集EOC相关基因,通过疾病富集分析验证其可靠性。然后,通过通路富集分析,发现EOC显著富集的通路,筛选出与EMT过程相关的通路。通过整合MetaCore数据库中四种算法构建的子网络,得到lncRNA PVT1的调控网络。最后,通过构建EOC相关EMT通路-基因网络,综合分析EMT通路和lncRNA PVT1调控网络,确定上皮性卵巢癌EMT过程中lncRNA PVT1调控的关键信号通路和核心节点。结果:共收集到EOC相关基因1138个。获得了77条与EOC相关的显著富集通路,其中6条通路与EMT过程相关。lncRNA PVT1的调控网络包含377个节点和1182条边。关键信号通路,如“Some pathways of EMT in cancer cells”、“Development_Regulation of epithelial-to-mesenchymal transition(EMT)”和核心节点,如TNF-α和STAT3,可能受lncRNA PVT1直接调控并参与上皮性卵巢癌EMT过程。结论:通过生物信息学方法发现LncRNA PVT1与上皮性卵巢癌EMT过程存在调控关系。
