目的探究PTTG1基因表达与肝细胞癌的相关性。方法基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlsa,TCGA)数据库分析PTTG1基因的mRNA表达水平及其与肝细胞癌患者临床病理特征的相关性;基于Kaplan-Meier Plotter数据库研究PTTG1基因表达与肝...目的探究PTTG1基因表达与肝细胞癌的相关性。方法基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlsa,TCGA)数据库分析PTTG1基因的mRNA表达水平及其与肝细胞癌患者临床病理特征的相关性;基于Kaplan-Meier Plotter数据库研究PTTG1基因表达与肝细胞癌患者生存之间的关系;借助STRING数据库构建PTTG1及其相互作用因子交互网络;基于LinkedOmics平台挖掘PTTG1在肝细胞癌中的共表达网络,并进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析;利用c-BioPortal平台结合TCGA数据库分析PTTG1在肝细胞癌中的基因变异情况。采用R 4.4.1软件进行统计分析与数据可视化。结果PTTG1基因在肝细胞癌组织中的表达水平显著升高,且存在变异,其表达水平与肝细胞癌患者的总体生存期相关(P<0.05)。在PTTG1相互作用网络节点中,ESPL1和PTTG2的节点度更高。在肝细胞癌中,PTTG1主要参与调控细胞周期的转换、物质代谢等。结论PTTG1基因的表达、变异及其调控机制可能与肝细胞癌的发生发展及其预后具有一定的关联性,可为深入探究PTTG1基因在肝细胞癌中的功能角色提供参考。展开更多
文摘目的探究PTTG1基因表达与肝细胞癌的相关性。方法基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlsa,TCGA)数据库分析PTTG1基因的mRNA表达水平及其与肝细胞癌患者临床病理特征的相关性;基于Kaplan-Meier Plotter数据库研究PTTG1基因表达与肝细胞癌患者生存之间的关系;借助STRING数据库构建PTTG1及其相互作用因子交互网络;基于LinkedOmics平台挖掘PTTG1在肝细胞癌中的共表达网络,并进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析;利用c-BioPortal平台结合TCGA数据库分析PTTG1在肝细胞癌中的基因变异情况。采用R 4.4.1软件进行统计分析与数据可视化。结果PTTG1基因在肝细胞癌组织中的表达水平显著升高,且存在变异,其表达水平与肝细胞癌患者的总体生存期相关(P<0.05)。在PTTG1相互作用网络节点中,ESPL1和PTTG2的节点度更高。在肝细胞癌中,PTTG1主要参与调控细胞周期的转换、物质代谢等。结论PTTG1基因的表达、变异及其调控机制可能与肝细胞癌的发生发展及其预后具有一定的关联性,可为深入探究PTTG1基因在肝细胞癌中的功能角色提供参考。
