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利用TCGA数据集分析PTPN5在肝癌中表达及其作用机制
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作者 张燕明 韩涛 +3 位作者 张跃 李高 李婉君 郑振东 《临床军医杂志》 CAS 2020年第3期260-263,共4页
目的分析PTPN5在肝癌组织中表达及其可能的作用机制。方法从TCGA数据集中收集肝癌及癌旁组织中的基因表达数据,提取癌及癌旁组织PTPN5分子表达水平,分析表达差异。联合患者临床信息分析PTPN5与临床指标相关性。利用GSEA分析PTPN5可能的... 目的分析PTPN5在肝癌组织中表达及其可能的作用机制。方法从TCGA数据集中收集肝癌及癌旁组织中的基因表达数据,提取癌及癌旁组织PTPN5分子表达水平,分析表达差异。联合患者临床信息分析PTPN5与临床指标相关性。利用GSEA分析PTPN5可能的作用机制。结果癌组织PTPN5分子表达水平显著高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。PTPN5表达水平与患者5年存活期及有无微血管侵犯相关(P<0.05)。GSEA分析结果显示,PTPN5高表达的组织样本富集了细胞粘附因子、黏着斑激酶、MAPK、WNT信号传导通道等功能集团基因。结论在肝癌组织中,PTPN5特异性表达,可能通过细胞粘附因子、黏着斑激酶、MAPK、WNT信号传导通道等功能集团发挥作用,其可能成为预测肝癌患者存活期的一项指标。 展开更多
关键词 肝癌 ptpn5 TCGA数据集
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