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PTPN1基因siRNA表达载体的构建和鉴定
被引量:
1
1
作者
宋慧文
凌文革
李大志
《海南医学》
CAS
2011年第5期4-6,共3页
目的构建可沉默PTPN1基因的siRNA(siRNA)表达载体,并鉴定它对大鼠心肌细胞PTPN1基因的沉默率。方法合成3对发夹siRNA模版寡核苷酸链,退火形成双链后插入pSilencer载体,构建成可沉默PTPN1基因的siRNA表达载体,通过酶切和测序鉴定构建的si...
目的构建可沉默PTPN1基因的siRNA(siRNA)表达载体,并鉴定它对大鼠心肌细胞PTPN1基因的沉默率。方法合成3对发夹siRNA模版寡核苷酸链,退火形成双链后插入pSilencer载体,构建成可沉默PTPN1基因的siRNA表达载体,通过酶切和测序鉴定构建的siRNA表达载体,并导入培养的大鼠心肌细胞,通过实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应和免疫印迹分析导入了siRNA表达载体的大鼠心肌细胞PTP1B的表达水平。结果酶切鉴定和测序结果证实构建的3个siRNA表达载体构建正确。实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应检测显示构建的3个siRNA表达载体的干扰率分别为73.2%、84.7%及32.5%。它们的干扰效果被免疫印迹分析所证实。结论干扰率为84.7%的表达载体为构建成功的siRNA表达载体,可用于心肌细胞PTPN1基因的功能研究。
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关键词
ptpn1
基因
SIRNA
载体
暂未订购
PTPN1基因多态性与妊娠期糖尿病发生风险的关联性
2
作者
邬惟为
周梦
+5 位作者
李宇琳
杨海澜
王素萍
张亚玮
刘师伟
冯永亮
《中华健康管理学杂志》
北大核心
2025年第10期794-799,共6页
目的探讨蛋白酪氨酸磷酸酶非受体1型(PTPN1)基因多态性与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的相关性。方法本研究为病例对照研究,连续收集2012年3月至2014年7月在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇4835例,其中789例被诊断为GDM,采用简单随机...
目的探讨蛋白酪氨酸磷酸酶非受体1型(PTPN1)基因多态性与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的相关性。方法本研究为病例对照研究,连续收集2012年3月至2014年7月在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇4835例,其中789例被诊断为GDM,采用简单随机抽样法随机选取334例GDM孕妇作为GDM组,按年龄、妊娠时间及居住地1∶1匹配334例健康孕妇作为对照组。对两组孕妇进行DNA基因分型,剔除基因分型缺失率10%者,最终纳入322例病例和317例对照。在共显性、显性、隐性和等位基因遗传模型下,通过非条件logistic回归分析PTPN1基因的13个候选单核苷酸多态性(SNP)位点和GDM发生风险的关系,并采用HaploView分析单倍型与GDM的关系,采用FDR法调整多重比较。结果纳入分析的639例孕妇年龄(30.28±4.32)岁,GDM组孕前体重指数≥24.0 kg/m^(2)、糖尿病家族史比例均高于对照组(29.19%比16.72%、13.04%比6.31%)(均P0.05)。rs6096644位点在共显性(GG比AA,OR=2.76,95%CI:1.18~6.44)、隐性(GG比AA+AG,OR=2.78,95%CI:1.20~6.46)遗传模型下与GDM发生风险升高均呈正相关(均q?0.2);rs6096655位点在共显性(AA比GG,OR=5.90,95%CI:1.27~27.36)、隐性(AA比GG+GA,OR=5.50,95%CI:1.19~25.38)和等位基因(A比G,OR=1.51,95%CI:1.09~2.08)遗传模型下与GDM发生风险升高均呈正相关(均q?0.2);rs6013317位点在等位基因(A比G,OR=1.74,95%CI:1.15~2.63)遗传模型下与GDM发生风险升高呈正相关(q?0.2)。PTPN1基因内单倍型区块1(rs4811262、rs6096646、rs6096655、rs6013317)的GAGG单倍型和GGAG单倍型、单倍型区块2(rs6068018、rs6123105、rs6013324、rs2869621)的GGGA单倍型均与GDM发生风险升高呈正相关(均P?0.05)。结论PTPN1基因多态性与GDM发生风险可能有关,且基因内存在单倍型的复杂遗传形式影响GDM发生风险。
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关键词
ptpn1
基因
基因多态性
单倍型
妊娠期糖尿病
原文传递
题名
PTPN1基因siRNA表达载体的构建和鉴定
被引量:
1
1
作者
宋慧文
凌文革
李大志
机构
深圳市宝安区人民医院心内科
出处
《海南医学》
CAS
2011年第5期4-6,共3页
文摘
目的构建可沉默PTPN1基因的siRNA(siRNA)表达载体,并鉴定它对大鼠心肌细胞PTPN1基因的沉默率。方法合成3对发夹siRNA模版寡核苷酸链,退火形成双链后插入pSilencer载体,构建成可沉默PTPN1基因的siRNA表达载体,通过酶切和测序鉴定构建的siRNA表达载体,并导入培养的大鼠心肌细胞,通过实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应和免疫印迹分析导入了siRNA表达载体的大鼠心肌细胞PTP1B的表达水平。结果酶切鉴定和测序结果证实构建的3个siRNA表达载体构建正确。实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应检测显示构建的3个siRNA表达载体的干扰率分别为73.2%、84.7%及32.5%。它们的干扰效果被免疫印迹分析所证实。结论干扰率为84.7%的表达载体为构建成功的siRNA表达载体,可用于心肌细胞PTPN1基因的功能研究。
关键词
ptpn1
基因
SIRNA
载体
Keywords
ptpn1 gene
siRNA
Vector
分类号
R329.26 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
暂未订购
题名
PTPN1基因多态性与妊娠期糖尿病发生风险的关联性
2
作者
邬惟为
周梦
李宇琳
杨海澜
王素萍
张亚玮
刘师伟
冯永亮
机构
山西医科大学公共卫生学院流行病学教研室
山西医科大学第一医院妇产科
国家癌症中心
山西白求恩医院内分泌科
出处
《中华健康管理学杂志》
北大核心
2025年第10期794-799,共6页
基金
国家自然科学基金(82373677)
山西省回国留学人员科研项目(2023-099)。
文摘
目的探讨蛋白酪氨酸磷酸酶非受体1型(PTPN1)基因多态性与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的相关性。方法本研究为病例对照研究,连续收集2012年3月至2014年7月在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇4835例,其中789例被诊断为GDM,采用简单随机抽样法随机选取334例GDM孕妇作为GDM组,按年龄、妊娠时间及居住地1∶1匹配334例健康孕妇作为对照组。对两组孕妇进行DNA基因分型,剔除基因分型缺失率10%者,最终纳入322例病例和317例对照。在共显性、显性、隐性和等位基因遗传模型下,通过非条件logistic回归分析PTPN1基因的13个候选单核苷酸多态性(SNP)位点和GDM发生风险的关系,并采用HaploView分析单倍型与GDM的关系,采用FDR法调整多重比较。结果纳入分析的639例孕妇年龄(30.28±4.32)岁,GDM组孕前体重指数≥24.0 kg/m^(2)、糖尿病家族史比例均高于对照组(29.19%比16.72%、13.04%比6.31%)(均P0.05)。rs6096644位点在共显性(GG比AA,OR=2.76,95%CI:1.18~6.44)、隐性(GG比AA+AG,OR=2.78,95%CI:1.20~6.46)遗传模型下与GDM发生风险升高均呈正相关(均q?0.2);rs6096655位点在共显性(AA比GG,OR=5.90,95%CI:1.27~27.36)、隐性(AA比GG+GA,OR=5.50,95%CI:1.19~25.38)和等位基因(A比G,OR=1.51,95%CI:1.09~2.08)遗传模型下与GDM发生风险升高均呈正相关(均q?0.2);rs6013317位点在等位基因(A比G,OR=1.74,95%CI:1.15~2.63)遗传模型下与GDM发生风险升高呈正相关(q?0.2)。PTPN1基因内单倍型区块1(rs4811262、rs6096646、rs6096655、rs6013317)的GAGG单倍型和GGAG单倍型、单倍型区块2(rs6068018、rs6123105、rs6013324、rs2869621)的GGGA单倍型均与GDM发生风险升高呈正相关(均P?0.05)。结论PTPN1基因多态性与GDM发生风险可能有关,且基因内存在单倍型的复杂遗传形式影响GDM发生风险。
关键词
ptpn1
基因
基因多态性
单倍型
妊娠期糖尿病
Keywords
ptpn1 gene
gene
polymorphism
Haplotype
Gestational diabetes mellitus
分类号
R714.256 [医药卫生—妇产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PTPN1基因siRNA表达载体的构建和鉴定
宋慧文
凌文革
李大志
《海南医学》
CAS
2011
1
暂未订购
2
PTPN1基因多态性与妊娠期糖尿病发生风险的关联性
邬惟为
周梦
李宇琳
杨海澜
王素萍
张亚玮
刘师伟
冯永亮
《中华健康管理学杂志》
北大核心
2025
0
原文传递
已选择
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