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健脾益气方干预PTPN1对肝癌细胞增殖侵袭的影响
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作者 孙姗姗 洪静 +3 位作者 宋树蕃 孙宗喜 王超 卓少元 《中国实验方剂学杂志》 北大核心 2025年第3期80-88,共9页
目的:基于网络药理学方法探讨健脾益气方治疗肝细胞癌(HCC)的核心靶点,并结合生物信息学分析和CRISPR/Cas9技术,研究该方干预潜在核心靶点蛋白酪氨酸磷酸酶N1(PTPN1)对肝癌细胞增殖侵袭的影响。方法:采用中药系统药理数据分析平台(TCMSP... 目的:基于网络药理学方法探讨健脾益气方治疗肝细胞癌(HCC)的核心靶点,并结合生物信息学分析和CRISPR/Cas9技术,研究该方干预潜在核心靶点蛋白酪氨酸磷酸酶N1(PTPN1)对肝癌细胞增殖侵袭的影响。方法:采用中药系统药理数据分析平台(TCMSP)、SwissTargetPrediction、GeneCards、NCBI和CTD等数据库获得健脾益气方治疗HCC的潜在作用靶点,并筛选出与PTPN1作用的健脾益气方有效成分,使用Autodock 4.0评估其对接水平。采用UALCAN、HPA和LinkedOmics等数据库分析PTPN1在肝癌组织中的表达情况及与HCC患者总体生存期(OS)的关系。采用CRISPR/Cas9技术敲减HepG2细胞及SK-hep-1细胞的PTPN1基因,并通过测序、实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)和蛋白免疫印迹法(Western blot)确认敲减效果。将HepG2细胞分为对照组、健脾益气方低、中、高剂量组(5.25、10.5、21 g·kg^(-1))和PTPN1敲减组,采用Real-time PCR和Western blot检测健脾益气方干预前后肝癌细胞PTPN1表达水平,并采用细胞增殖与活性检测(CCK-8)、Transwell和Annexin V-FITC/PI法分别检测PTPN1基因敲减及健脾益气方干预对肝癌细胞增殖、侵袭、凋亡的影响。结果:健脾益气方靶向PTPN1的有效成分最多,其中分子对接结合能<-5.0 kcal·mol^(-1)的活性成分有31个。肝癌组织PTPN1 mRNA和蛋白水平均显著高于正常组织(P<0.01)。与正常组织比较,肝癌组织PTPN1 mRNA在病理分期Ⅰ~Ⅲ期及病理分级G_(1)-G_(3)级中表达水平均显著升高(P<0.01),Ⅳ期和G_(4)级表达水平差异无统计学意义;与TP53未突变肝癌组织相比,TP53突变肝癌组织PTPN1 mRNA表达水平显著升高(P<0.01);PTPN1 mRNA高表达的肝癌患者OS显著降低(P<0.01)。HepG2细胞PTPN1敲减及健脾益气方含药血清干预后,细胞的增殖侵袭能力均出现显著下降(P<0.01)、凋亡能力显著升高(P<0.01)。结论:PTPN1可能是健脾益气方治疗HCC的核心靶点之一,其在肝癌组织和肝癌细胞中高表达,并与患者临床预后差相关。PTPN1在TP53突变患者肝癌组织表达水平明显升高,但TP53突变或缺失不会影响其在肝癌细胞中的表达。健脾益气方可能通过下调PTPN1表达显著抑制肝癌细胞增殖侵袭能力、诱导细胞凋亡。 展开更多
关键词 健脾益气方 蛋白酪氨酸磷酸酶N1 CRISPR/Cas9 肝癌细胞 增殖侵袭
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PTPN1基因siRNA表达载体的构建和鉴定 被引量:1
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作者 宋慧文 凌文革 李大志 《海南医学》 CAS 2011年第5期4-6,共3页
目的构建可沉默PTPN1基因的siRNA(siRNA)表达载体,并鉴定它对大鼠心肌细胞PTPN1基因的沉默率。方法合成3对发夹siRNA模版寡核苷酸链,退火形成双链后插入pSilencer载体,构建成可沉默PTPN1基因的siRNA表达载体,通过酶切和测序鉴定构建的si... 目的构建可沉默PTPN1基因的siRNA(siRNA)表达载体,并鉴定它对大鼠心肌细胞PTPN1基因的沉默率。方法合成3对发夹siRNA模版寡核苷酸链,退火形成双链后插入pSilencer载体,构建成可沉默PTPN1基因的siRNA表达载体,通过酶切和测序鉴定构建的siRNA表达载体,并导入培养的大鼠心肌细胞,通过实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应和免疫印迹分析导入了siRNA表达载体的大鼠心肌细胞PTP1B的表达水平。结果酶切鉴定和测序结果证实构建的3个siRNA表达载体构建正确。实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应检测显示构建的3个siRNA表达载体的干扰率分别为73.2%、84.7%及32.5%。它们的干扰效果被免疫印迹分析所证实。结论干扰率为84.7%的表达载体为构建成功的siRNA表达载体,可用于心肌细胞PTPN1基因的功能研究。 展开更多
关键词 ptpn1基因 SIRNA 载体
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酪氨酸磷酸酶基因ptpn11对乳腺肿瘤生长的影响
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作者 田莹普 张智英 《动物医学进展》 北大核心 2015年第3期83-87,共5页
乳腺癌是威胁妇女健康和生命的头号恶性肿瘤,但其发生发展的机制及诊疗仍然没有长足的进展。蛋白酪氨酸磷酸酶11(PTPN11)是一个易于突变的基因,参与乳腺肿瘤的发生,但目前关于PTPN11调控乳腺癌的体内证据仍然缺乏。为了明确PTPN11在体... 乳腺癌是威胁妇女健康和生命的头号恶性肿瘤,但其发生发展的机制及诊疗仍然没有长足的进展。蛋白酪氨酸磷酸酶11(PTPN11)是一个易于突变的基因,参与乳腺肿瘤的发生,但目前关于PTPN11调控乳腺癌的体内证据仍然缺乏。为了明确PTPN11在体内对乳腺癌发生发展的调控作用,利用大鼠乳腺肿瘤的动物模型,用PTPN11蛋白酶活性抑制剂Phps1处理,然后观察乳腺肿瘤发生的情况。结果发现Phps1处理后可延长DMBA诱导的大鼠乳腺肿瘤的潜伏期,延迟肿瘤的发生,并显著降低了DMBA诱发肿瘤的比率(P<0.05),但对肿瘤生长的抑制作用不显著。证明了PTPN11参与调控体内乳腺肿瘤的发生,为理解和诊治乳腺癌提供了一个可能新的靶点。 展开更多
关键词 蛋白酪氨酸磷酸酶11(ptpn11) 乳腺肿瘤动物模型 二甲基苯蒽(DMBA) ptpn11蛋白酶活性抑制剂
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PTPN1基因和2型糖尿病相关(Diabetes,2004,53:3013-3019)
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《国外医学(内分泌学分册)》 2005年第1期73-73,共1页
胰岛素抵抗动脉粥样硬化研究(IRAS)发现,一种变异基因PTPN1(编码蛋白质酪氨酸磷酸酶-1β)和胰岛素敏感性及血糖控制相关。Bowden等在动物实验的基础上,评估了811名西班牙受试者删基因变异和血糖控制的相关性。结果发现,PTPN1 DNA特... 胰岛素抵抗动脉粥样硬化研究(IRAS)发现,一种变异基因PTPN1(编码蛋白质酪氨酸磷酸酶-1β)和胰岛素敏感性及血糖控制相关。Bowden等在动物实验的基础上,评估了811名西班牙受试者删基因变异和血糖控制的相关性。结果发现,PTPN1 DNA特异序列上的20种变异均与胰岛素敏感性显著相关,另外22种位于该基因其他区域的变异和空腹血糖水平显著相关。 展开更多
关键词 ptpn1基因 2型糖尿病 胰岛素抵抗 动脉粥样硬化
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PTPN1基因多态性与妊娠期糖尿病发生风险的关联性
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作者 邬惟为 周梦 +5 位作者 李宇琳 杨海澜 王素萍 张亚玮 刘师伟 冯永亮 《中华健康管理学杂志》 北大核心 2025年第10期794-799,共6页
目的探讨蛋白酪氨酸磷酸酶非受体1型(PTPN1)基因多态性与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的相关性。方法本研究为病例对照研究,连续收集2012年3月至2014年7月在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇4835例,其中789例被诊断为GDM,采用简单随机... 目的探讨蛋白酪氨酸磷酸酶非受体1型(PTPN1)基因多态性与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的相关性。方法本研究为病例对照研究,连续收集2012年3月至2014年7月在山西医科大学第一医院产科分娩的孕妇4835例,其中789例被诊断为GDM,采用简单随机抽样法随机选取334例GDM孕妇作为GDM组,按年龄、妊娠时间及居住地1∶1匹配334例健康孕妇作为对照组。对两组孕妇进行DNA基因分型,剔除基因分型缺失率10%者,最终纳入322例病例和317例对照。在共显性、显性、隐性和等位基因遗传模型下,通过非条件logistic回归分析PTPN1基因的13个候选单核苷酸多态性(SNP)位点和GDM发生风险的关系,并采用HaploView分析单倍型与GDM的关系,采用FDR法调整多重比较。结果纳入分析的639例孕妇年龄(30.28±4.32)岁,GDM组孕前体重指数≥24.0 kg/m^(2)、糖尿病家族史比例均高于对照组(29.19%比16.72%、13.04%比6.31%)(均P0.05)。rs6096644位点在共显性(GG比AA,OR=2.76,95%CI:1.18~6.44)、隐性(GG比AA+AG,OR=2.78,95%CI:1.20~6.46)遗传模型下与GDM发生风险升高均呈正相关(均q?0.2);rs6096655位点在共显性(AA比GG,OR=5.90,95%CI:1.27~27.36)、隐性(AA比GG+GA,OR=5.50,95%CI:1.19~25.38)和等位基因(A比G,OR=1.51,95%CI:1.09~2.08)遗传模型下与GDM发生风险升高均呈正相关(均q?0.2);rs6013317位点在等位基因(A比G,OR=1.74,95%CI:1.15~2.63)遗传模型下与GDM发生风险升高呈正相关(q?0.2)。PTPN1基因内单倍型区块1(rs4811262、rs6096646、rs6096655、rs6013317)的GAGG单倍型和GGAG单倍型、单倍型区块2(rs6068018、rs6123105、rs6013324、rs2869621)的GGGA单倍型均与GDM发生风险升高呈正相关(均P?0.05)。结论PTPN1基因多态性与GDM发生风险可能有关,且基因内存在单倍型的复杂遗传形式影响GDM发生风险。 展开更多
关键词 ptpn1基因 基因多态性 单倍型 妊娠期糖尿病
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基于生物信息学探究ESCRT相关基因对骨肉瘤预后的评估价值
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作者 马彬斌 张少雄 高永丽 《昆明医科大学学报》 2025年第4期36-45,共10页
目的基于生物信息学探究内吞体运输必需分选复合物(endosomal sorting complex required for transport,ESCRT)相关基因对骨肉瘤(osteosarcoma,OS)预后的价值评估。方法对基于TARGET数据库下载的88份骨肉瘤测序样本(死亡结局29例)数据及... 目的基于生物信息学探究内吞体运输必需分选复合物(endosomal sorting complex required for transport,ESCRT)相关基因对骨肉瘤(osteosarcoma,OS)预后的价值评估。方法对基于TARGET数据库下载的88份骨肉瘤测序样本(死亡结局29例)数据及257份患者临床信息进行预处理;并使用Survival包构建Cox比例风险模型,筛选与生存相关的ESCRT基因。使用STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并基于PPI筛选出核心基因;对筛选出的节点数5个以上的核心基因进行KEGG富集分析。运用Lasso回归分析技术,识别与骨肉瘤患者预后更为紧密相关的ESCRT相关基因。结果筛选到与ESCRT相关基因1486个;与生存相关的ESCRT基因164个。CLTC、MYC、INSR、PTPN1、TNFRSF1A可作为骨肉瘤患者预后相关的核心基因。将OS患者随机分为训练集(n=44)和验证集(n=44),在训练集中,被归为高风险组的骨肉瘤患者的总生存期明显短于被归为低风险组的患者(P<0.05),验证集同样得到相似结果(P<0.01)。ROC(receiver operating characteristic curve,ROC)曲线显示,在训练集中,AUC为0.846;在验证集中,AUC为0.877。对核心基因的预后生存分析与差异分析结果显示:在验证集中,MYC在高低风险组间无统计学差异;在训练集中INSR无统计学差异。在总的数据集中,所有预后核心基因均有统计学差异(P<0.05)。采用R包Survival对核心基因进行生存分析显示,除MYC基因生存率没有差异外(P>0.05),其他4个基因CLTC、INSR、PTPN1、TNFRSF1A生存率均存在明显统计学差异(P<0.05)。经单因素独立预后分析,发现存在3个基因(TNFRSF1A、PTPN1、MYC)与骨肉瘤患者的生存存在相关性。经多因素独立预后分析并最终得到2个关键基因(TNFRSF1A、PTPN1)是影响骨肉瘤生存预后的独立因子,与骨肉瘤患者的生存预后密切相关。结论应用生物信息学成功构建了基于TNFRSF1A、PTPN12个关键基因表达的骨肉瘤生存预后风险评分模型,可为骨肉瘤的临床治疗及生存预后评估提供更多的选择。 展开更多
关键词 骨肉瘤 ESCRT TNFRSF1A ptpn1 预后
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替莫唑胺对U373胶质瘤细胞增殖、侵袭能力的抑制作用及其分子调控机制的研究
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作者 赵海康 王凤鹿 +5 位作者 杨磊 袁致海 陈明生 赵瑛 解杨 张亮 《临床神经外科杂志》 CAS 2020年第6期638-644,共7页
目的研究替莫唑胺对U373胶质瘤细胞增殖和侵袭能力的抑制作用及其分子调控机制。方法将U373胶质瘤细胞分别用0μmol/L、100μmol/L、200μmol/L和400μmol/L替莫唑胺处理,培养48 h。用control siRNA、siPTPN1、pcDNA3.1空载体及pcDNA3.1... 目的研究替莫唑胺对U373胶质瘤细胞增殖和侵袭能力的抑制作用及其分子调控机制。方法将U373胶质瘤细胞分别用0μmol/L、100μmol/L、200μmol/L和400μmol/L替莫唑胺处理,培养48 h。用control siRNA、siPTPN1、pcDNA3.1空载体及pcDNA3.1/PTPN1,分别转染用400μmol/L替莫唑胺处理的细胞。用CCK-8法和Transwell实验检测替莫唑胺对U373细胞增殖、侵袭能力的影响。用Western blot检测各组细胞的PTPN1、C-myc、Cyclin D1、PI3K、p-mTOR和p-AKT蛋白的表达水平。结果与空白对照组相比,各替莫唑胺处理组U373细胞的增殖和侵袭能力均显著下降(P<0.05~0.01),PTPN1的表达水平显著降低(P<0.05~0.01);其中以400μmol/L替莫唑胺处理组细胞的增殖、侵袭能力及PTPN1表达水平最低(均P<0.01)。与pcDNA3.1空载体转染组相比,过表达PTPN1组U373细胞的PTPN1蛋白表达水平,以及增殖和侵袭能力均显著增高(均P<0.01)。与control siRNA转染组相比,siPTPN1转染组U373细胞的PTPN1蛋白表达水平及增殖和侵袭能力均显著下降(均P<0.01)。替莫唑胺处理细胞的C-myc、Cyclin D1、PI3K、p-mTOR和p-AKT表达水平均显著降低(P<0.05~0.01)。PTPN1过表达细胞的C-myc、Cyclin D1、PI3K、p-mTOR和p-AKT表达水平显著升高(均P<0.01);而PTPN1表达沉默细胞的C-myc、Cyclin D1、PI3K、p-mTOR和p-AKT的表达水平则明显降低(均P<0.05)。结论替莫唑胺可通过下调胶质瘤细胞的PTPN1表达影响mTOR信号通路,抑制胶质瘤细胞的增殖和侵袭能力。 展开更多
关键词 胶质瘤 替莫唑胺 U373 ptpn1
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松油烯-4-醇抑制神经胶质瘤U87和U251细胞增殖、迁移与侵袭并促进其凋亡 被引量:6
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作者 詹琪 曾智锐 +6 位作者 任长城 凌园果 曾茜 刘孟涛 徐卡娅 出良钊 刘健 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期1021-1028,共8页
目的探讨松油烯-4-醇(Terpinen-4-ol;T4O)对神经胶质瘤U87和U251细胞恶性生物学行为的影响及机制。方法以不同浓度(0、1、2和4μmol·L^(-1))的T4O处理U87和U251细胞后,采用CCK-8、克隆平板、流式细胞术、划痕和Transwell实验检测... 目的探讨松油烯-4-醇(Terpinen-4-ol;T4O)对神经胶质瘤U87和U251细胞恶性生物学行为的影响及机制。方法以不同浓度(0、1、2和4μmol·L^(-1))的T4O处理U87和U251细胞后,采用CCK-8、克隆平板、流式细胞术、划痕和Transwell实验检测各组细胞增殖、克隆形成、凋亡、迁移和侵袭的变化;利用生物信息学挖掘T4O的靶点及分析靶点与神经胶质瘤进展的关系;采用免疫印迹检测各组细胞中PTPN1、PTPN2、Bcl-2、Bax、pro-caspase-3、cleaved caspase-3、MMP-2与MMP-9的表达水平。结果T4O显著抑制U87和U251细胞增殖、克隆形成、迁移与侵袭,并促进凋亡(P均<0.05);T4O有37个作用靶点,其中,靶点PTPN1和PTPN2的表达量与神经胶质瘤患者的总体生存率呈负相关;T4O明显减少U87和U251细胞中PTPN1、PTPN2、Bcl-2、MMP-2与MMP-9的表达以及增加Bax与cleaved caspase-3的表达(P均<0.05)。结论T4O抑制神经胶质瘤U87和U251细胞的增殖、迁移和侵袭能力并促进其凋亡,其作用机制可能与减少PTPN1和PTPN2的表达量相关。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 松油烯-4-醇 侵袭 凋亡 ptpn1 PTPN2
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miRNA-451 regulates rhesus choroid-retinal endothelial cell function and proteome profile
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作者 Hong-Lian Wu Yan Shao +3 位作者 Zhen-Na Chen Hui Zhang Xiao-Min Zhang Xiao-Rong Li 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2022年第6期894-904,共11页
AIM:To evaluate the effect of miRNA-451 on rhesus macaque choroid-retinal endothelial(RF/6A)cell function and proteome profile.METHODS:The RF/6A cells were transfected with miRNA-451 mimic and inhibitor.The role of mi... AIM:To evaluate the effect of miRNA-451 on rhesus macaque choroid-retinal endothelial(RF/6A)cell function and proteome profile.METHODS:The RF/6A cells were transfected with miRNA-451 mimic and inhibitor.The role of miRNA-451 on proliferation ability was evaluated by CCK-8 assay.Furthermore,iTRAQ quantitative proteomic analysis was applied to comprehensively illuminate the change of cellular proteins and biological function between different groups.RESULTS:In miRNA-451 overexpression group,cell proliferation of RF/6A decreased both at 24 h and 48 h;while in miRNA-451 inhibition group,on the contrary,RF/6A cell proliferation was increased at 48 h.Based on iTRAQ quantitative proteomic analysis,23 differentially expressed proteins(DEPs)were detected in the comparison of miRNA-451 mimic and mimic control-transfected RF/6A cells,and 30 DEPs were identified in the comparison of RF/6A cells transfected with miRNA-451 inhibitor and inhibitor control.DEPs such as GORASP2,KRT1,SLC7 A2,RIC8 A,DDX42,CAP1,PCBP2 might be closely related to the inhibitory effect of miRNA-451 on RF/6A cell proliferation,while PCYT1 A,MGAT1,TUBB,MCU,SIL1,BID,MSH6 might account for the positive effect of miRNA-451 inhibitor on RF/6A cell growth.PTPN1,as the only protein exhibiting an opposite trend between miRNA-451 mimic and inhibitortransfected cells,was most likely accountable for the inhibition of miRNA-451 mimic on RF/6A cell growth,and the promotion of miRNA-451 inhibitor on RF/6A cell proliferation.CONCLUSION:miRNA-451 overexpression can suppress the growth of RF/6A cells while knockdown of miRNA-451 can promote RF/6A cell viability.Among all DEPs,increased PTPN1 is most likely to account for the negative regulation of miRNA-451 on RF/6A proliferation.miRNA-451 can be a protective factor for neovascular disease of fundus via regulating choroid retinal endothelial cell function. 展开更多
关键词 miRNA-451 RF/6A retinal endothelial cells iTRAQ quantitative proteomics proteins ptpn1
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