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刺五加PsbP基因的鉴定、适应性进化及分子动力学模拟
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作者 焦孟赢 李畅 +5 位作者 赵雪颖 马嘉程 崔亚奇 刘鹏 刘颖硕 邢朝斌 《中草药》 北大核心 2025年第1期248-258,共11页
目的筛选刺五加Eleutherococcus senticosus中的PsbP基因(EsPsbP基因),分析其进化特征,研究EsPsbP蛋白与PsbQ蛋白的结合方式,探究其在不同光照下的表达量。方法根据刺五加基因组数据筛选得到EsPsbP基因,并对其进行生物信息学、适应性进... 目的筛选刺五加Eleutherococcus senticosus中的PsbP基因(EsPsbP基因),分析其进化特征,研究EsPsbP蛋白与PsbQ蛋白的结合方式,探究其在不同光照下的表达量。方法根据刺五加基因组数据筛选得到EsPsbP基因,并对其进行生物信息学、适应性进化分析和分子动力学模拟,根据转录组测序结果探究EsPsbP在不同光照下的表达量。结果共筛选得到了16个EsPsbP基因并将其分为了A~I共9组。在刺五加种内与刺五加和龙牙楤木Aralia elata间共得到了21对共线性基因对,并且基因对的Ka/Ks均小于1。EsPsbP基因没有正选择位点。EsPsbP基因启动子中存在大量光响应元件、激素响应元件和干旱响应元件。分子动力学模拟发现PsbQ蛋白优先与A组的EsPsbP蛋白进行结合。转录组数据显示,不同光质照射后,有9个EsPsbP产生了差异表达。结论刺五加的16条EsPsbP基因在进化中主要受到纯净选择,这有助于维持基因的稳定性。基因结构特征的分化可能导致EsPsbP与PsbQ蛋白结合能力及对光质变化反应的差异,这些特性可能与刺五加的生理适应及药材品质形成相关,为进一步研究其功能奠定了基础。 展开更多
关键词 刺五加 psbp基因 适应性进化 分子对接 分子动力学模拟
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雄激素对大鼠前列腺甾体结合蛋白(PSBP)基因转录的调控
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作者 张永莲 《自然科学进展(国家重点实验室通讯)》 1995年第3期258-266,共9页
生命的一些基本过程,如胚胎发育、细胞分化、激素调节及一些紊乱过程(肿瘤、代谢病和遗传病等)的中心问题,就是基因在不同的时相上、空间里的及各种物理和化学因素影响下不同表达的结果。对这一精细的调控机制的了解,不仅为了解生命的... 生命的一些基本过程,如胚胎发育、细胞分化、激素调节及一些紊乱过程(肿瘤、代谢病和遗传病等)的中心问题,就是基因在不同的时相上、空间里的及各种物理和化学因素影响下不同表达的结果。对这一精细的调控机制的了解,不仅为了解生命的奥秘提供分子基础,且为征服自然,改造自然开阔了新路。60年代初,甾体激素受体的发现,为了解激素作用之谜打开了大门。70年代中,开始明确了甾体激素与其受体结合后,是通过调控一些靶基因的表达而引起细胞功能的改变的,至此。 展开更多
关键词 雄激素 大鼠 前列腺 psbp基因 转录调控
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Interaction between Rice stripe virus Disease- Specific Protein and Host PsbP Enhances Virus Symptoms 被引量:24
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作者 Lingfang Kong Jianxiang Wu Lina Lu Yi Xu Xueping Zhou 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2014年第4期691-708,共18页
Rice stripe virus (RSV) causes severe diseases in Oryza sativa (rice) in many Eastern Asian countries. Diseasespecific protein (SP) of RSV is a non-structural protein and its accumulation level in rice plant was... Rice stripe virus (RSV) causes severe diseases in Oryza sativa (rice) in many Eastern Asian countries. Diseasespecific protein (SP) of RSV is a non-structural protein and its accumulation level in rice plant was shown to determine the severity of RSV symptoms. Here, we present evidence that expression of RSV SP alone in rice or Nicotiana benthamiana did not produce visible symptoms. Expression of SP in these two plants, however, enhanced RSV- or Potato virus X (PVX)- induced symptoms. Through yeast two-hybrid screening, GST pull-down, and bimolecular fluorescence complementation assays, we demonstrated that RSV SP interacted with PsbP, a 23-kDa oxygen-evolving complex protein, in both rice and N. benthamiana. Furthermore, our investigation showed that silencing of PsbP expression in both plants increased disease symptom severity and virus accumulation. Confocal microscopy using N, benthamiana protoplast showed that PsbP accu- mulated predominantly in chloroplast in wild-type N. benthamiana cells. In the presence of RSV SP, most PsbP was recruited into cytoplasm of the assayed cells. In addition, accumulation of SP during RSV infection resulted in alterations of chloroplast structure and function. Our findings shed light on the molecular mechanism underlying RSV disease symptom development. 展开更多
关键词 Rice stripe virus disease-specific protein INTERACTION psbp symptom.
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棉花杜松烯合成酶基因的克隆及其表达分析 被引量:2
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作者 周婷 郭三堆 张锐 《生物技术进展》 2011年第3期207-213,共7页
杜松烯合成酶是棉酚合成途径中的关键酶,催化(E,E)-法呢基焦磷酸(FPP)环化形成(+)-δ-杜松烯。从陆地棉Y18R中克隆分离了杜松烯合成酶基因(GhCdn),该基因的基因组序列为2700bp,具有6个内含子,剪切后其ORF为1665bp,编码554个氨基酸,该基... 杜松烯合成酶是棉酚合成途径中的关键酶,催化(E,E)-法呢基焦磷酸(FPP)环化形成(+)-δ-杜松烯。从陆地棉Y18R中克隆分离了杜松烯合成酶基因(GhCdn),该基因的基因组序列为2700bp,具有6个内含子,剪切后其ORF为1665bp,编码554个氨基酸,该基因属于杜松烯合成酶C亚家族。应用Overlap PCR方法将其上的2个HindⅢ酶切位点钝化后,将GhCdn基因连接到表达载体pBI121上,构建出分别由组成型启动子CaMV 35S和绿色组织高效启动子Psbp驱动的2个植物表达载体pGBI-CaMV 35S-GhCdn和pGBI-Psbp-GhCdn。通过农杆菌介导法转化棉花下胚轴并进行组织培养,获得了9个35S转基因阳性愈伤系和2个P转基因阳性愈伤系。经检测,阳性愈伤组织中GhCdn基因的mRNA表达量和棉酚含量均有所增加,但35S系普遍高于P系。本研究为通过基因工程手段提高棉花组织器官中的棉酚含量提供了依据。 展开更多
关键词 杜松烯合成酶基因 表达载体 CaMV 35S启动子 psbp启动子 棉酚
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