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小麦条锈菌(CYR34)全基因组剪接体PRP8家族基因的鉴定及表达分析
1
作者
陈诗雯
韩宏
+4 位作者
杨成德
邹一萍
王增艳
王丽婷
陶飞
《西北农业学报》
北大核心
2025年第4期617-627,共11页
PRP8(precursor RNA processing8)作为高度保守的剪接体蛋白之一,在剪接体的催化过程中占据中心位置,且在病原菌生长、发育及致病性中起重要的作用,研究小麦条锈菌主流小种CYR34中PRP8基因家族在应对全球气候变暖及致病性方面的作用,可...
PRP8(precursor RNA processing8)作为高度保守的剪接体蛋白之一,在剪接体的催化过程中占据中心位置,且在病原菌生长、发育及致病性中起重要的作用,研究小麦条锈菌主流小种CYR34中PRP8基因家族在应对全球气候变暖及致病性方面的作用,可为小麦条锈病的“绿色防控”成为潜在的药物靶点提供理论依据。利用TBtools软件和CYR34基因组注释文件(GFF文件)绘制染色体定位图、蛋白结构域、基因共线性和作用元件分析;通过Q-PCR分析PRP8基因家族受温度胁迫及侵染寄主过程中的组织学变化及时序表达模式。CYR34小种中PRP8基因家族编码的蛋白长度为366~2384氨基酸,其中,PRP801编码的氨基酸有25个外显子,PRP802和PRP803外显子数目都为7个;4个PRP8都具有典型的PRP8superfamily结构域,且位置相似;4个PRP8基因分别分布在CM045847.1、CM045850.1、CM045852.1和CM045862.1染色体上,且PRP802和PRP803为一对共线性基因;4个PRP8基因的启动子上均含有常见的顺式作用元件(CAAT-box、NON-box、CGTCA-motif、TATA-box和CAAT-box);条锈菌CYR34小种中PRP802和PRP803和条锈菌Ps93XT-03和Ps93-210-02小种中的亲缘关系较近;在温度胁迫、侵染寄主过程中PRP801、PRP802和PRP803基因在6h或12h与对照有显著差异(P<0.05),且组织学观察发现菌丝长度和次生菌丝分枝数在侵染前12h增速较快,分别为2h时的2.62和3.31倍(P<0.05)。小麦条锈菌CYR34小种中PRP8基因家族存在4个PRP8基因,且以某种剪接模式在温度胁迫及侵染寄主过程发挥重要作用。
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关键词
小麦条锈菌
prp8
表达模式
生物和非生物胁迫
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职称材料
拟南芥隐花色素CRY2调控因子PRP8基因的功能分析
被引量：
2
2
作者
郭亚蓉
王艳艳
+1 位作者
刘军
裴雁曦
《生物技术进展》
2019年第2期169-177,共9页
植物通过光受体感受外界环境的光信号来调节自身的生长发育。隐花色素CRY1和CRY2是拟南芥(Arabidopsis)中主要的蓝光受体,其中CRY2在蓝光条件下发生降解,但其分子机制尚不清楚。通过筛选EMS诱变的突变体库,获得了一个早花突变体。该突...
植物通过光受体感受外界环境的光信号来调节自身的生长发育。隐花色素CRY1和CRY2是拟南芥(Arabidopsis)中主要的蓝光受体,其中CRY2在蓝光条件下发生降解,但其分子机制尚不清楚。通过筛选EMS诱变的突变体库,获得了一个早花突变体。该突变体中CRY2蛋白大量积累但CRY1蛋白水平不受影响,因此将它命名为mac1(more abundant of cry2 1)。图位克隆与CRISPR-Cas9敲除实验表明,MAC1是PRP8基因的等位基因,该突变体被命名为prp8-11。定量PCR结果显示,CRY2 mRNA表达量在prp8-11突变体中低于野生型中的表达量。这说明CRY2蛋白降解变慢不是由于基因表达增多引起的。研究结果为进一步了解PRP8基因的功能及其在光信号网络系统中的作用提供了依据。
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关键词
蓝光受体
蛋白降解
开花时间
下胚轴
prp8
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职称材料
Prp8蛋白在前体mRNA剪接中的作用
3
作者
洪敬欣
姚智
杨洁
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2007年第3期253-256,共4页
前体mRNA的剪接是基因表达的关键一步,发生在蛋白质的转录之后与合成之前。在前体mR- NA剪接加工过程中需要将转录本中的内含子切除,因为它会干扰基因的转录。前体mRNA的剪接发生在细胞核中,是在一个大的RNA与蛋白质的复合物即剪接体的...
前体mRNA的剪接是基因表达的关键一步,发生在蛋白质的转录之后与合成之前。在前体mR- NA剪接加工过程中需要将转录本中的内含子切除,因为它会干扰基因的转录。前体mRNA的剪接发生在细胞核中,是在一个大的RNA与蛋白质的复合物即剪接体的催化下完成的。Prp8(precursor mRNA process- ing)是参与前体mRNA剪接的最大的蛋白,其序列从酵母到人类是高度保守的。Prp8同时也是细胞核内一个最重要的剪接因子。在剪接过程中,Prp8组成剪接体的催化中心。有人推断Prp8是剪接体的支架蛋白,很可能在催化中心起到锚定RNA的作用,同时也调节着激活剪接体所必需的构象变化。Prp8还与色素性视网膜炎的发生密切相关。
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关键词
prp8
蛋白
前体MRNA
支架蛋白
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职称材料
题名
小麦条锈菌(CYR34)全基因组剪接体PRP8家族基因的鉴定及表达分析
1
作者
陈诗雯
韩宏
杨成德
邹一萍
王增艳
王丽婷
陶飞
机构
甘肃农业大学植物保护学院
甘肃省临夏回族自治州农业科学院
南京农业大学生命科学学院
出处
《西北农业学报》
北大核心
2025年第4期617-627,共11页
基金
国家自然基金地区科学基金(32060595)
甘肃省青年基金(20JR10RA549)
甘肃农业大学人才专项(GAU-KYQD-2018-37)。
文摘
PRP8(precursor RNA processing8)作为高度保守的剪接体蛋白之一,在剪接体的催化过程中占据中心位置,且在病原菌生长、发育及致病性中起重要的作用,研究小麦条锈菌主流小种CYR34中PRP8基因家族在应对全球气候变暖及致病性方面的作用,可为小麦条锈病的“绿色防控”成为潜在的药物靶点提供理论依据。利用TBtools软件和CYR34基因组注释文件(GFF文件)绘制染色体定位图、蛋白结构域、基因共线性和作用元件分析;通过Q-PCR分析PRP8基因家族受温度胁迫及侵染寄主过程中的组织学变化及时序表达模式。CYR34小种中PRP8基因家族编码的蛋白长度为366~2384氨基酸,其中,PRP801编码的氨基酸有25个外显子,PRP802和PRP803外显子数目都为7个;4个PRP8都具有典型的PRP8superfamily结构域,且位置相似;4个PRP8基因分别分布在CM045847.1、CM045850.1、CM045852.1和CM045862.1染色体上,且PRP802和PRP803为一对共线性基因;4个PRP8基因的启动子上均含有常见的顺式作用元件(CAAT-box、NON-box、CGTCA-motif、TATA-box和CAAT-box);条锈菌CYR34小种中PRP802和PRP803和条锈菌Ps93XT-03和Ps93-210-02小种中的亲缘关系较近;在温度胁迫、侵染寄主过程中PRP801、PRP802和PRP803基因在6h或12h与对照有显著差异(P<0.05),且组织学观察发现菌丝长度和次生菌丝分枝数在侵染前12h增速较快,分别为2h时的2.62和3.31倍(P<0.05)。小麦条锈菌CYR34小种中PRP8基因家族存在4个PRP8基因,且以某种剪接模式在温度胁迫及侵染寄主过程发挥重要作用。
关键词
小麦条锈菌
prp8
表达模式
生物和非生物胁迫
Keywords
Puccinia striiformis f.sp.tritici
prp8
Gene expression
Biological and abiotic stress
分类号
S435.121 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
拟南芥隐花色素CRY2调控因子PRP8基因的功能分析
被引量：
2
2
作者
郭亚蓉
王艳艳
刘军
裴雁曦
机构
山西大学生命科学学院
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《生物技术进展》
2019年第2期169-177,共9页
基金
国家转基因新品种培育重大专项(2018ZX0800925B)
国家自然科学基金项目(31771758)
中国农业科学院创新工程资助
文摘
植物通过光受体感受外界环境的光信号来调节自身的生长发育。隐花色素CRY1和CRY2是拟南芥(Arabidopsis)中主要的蓝光受体,其中CRY2在蓝光条件下发生降解,但其分子机制尚不清楚。通过筛选EMS诱变的突变体库,获得了一个早花突变体。该突变体中CRY2蛋白大量积累但CRY1蛋白水平不受影响,因此将它命名为mac1(more abundant of cry2 1)。图位克隆与CRISPR-Cas9敲除实验表明,MAC1是PRP8基因的等位基因,该突变体被命名为prp8-11。定量PCR结果显示,CRY2 mRNA表达量在prp8-11突变体中低于野生型中的表达量。这说明CRY2蛋白降解变慢不是由于基因表达增多引起的。研究结果为进一步了解PRP8基因的功能及其在光信号网络系统中的作用提供了依据。
关键词
蓝光受体
蛋白降解
开花时间
下胚轴
prp8
Keywords
cryptochrome
protein degradation
flowering time
hypocotyls
prp8
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
Prp8蛋白在前体mRNA剪接中的作用
3
作者
洪敬欣
姚智
杨洁
机构
天津医科大学免疫学教研室
出处
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2007年第3期253-256,共4页
基金
国家自然科学基金(No.30670441
30300070)
+2 种基金
天津市科委应用基础研究重点项目(No.043802811)
国家教育部新世纪人才支持计划(No.NCET-04-0245)
高等学校博士学科点转项基金(No.20040062003)~~
文摘
前体mRNA的剪接是基因表达的关键一步,发生在蛋白质的转录之后与合成之前。在前体mR- NA剪接加工过程中需要将转录本中的内含子切除,因为它会干扰基因的转录。前体mRNA的剪接发生在细胞核中,是在一个大的RNA与蛋白质的复合物即剪接体的催化下完成的。Prp8(precursor mRNA process- ing)是参与前体mRNA剪接的最大的蛋白,其序列从酵母到人类是高度保守的。Prp8同时也是细胞核内一个最重要的剪接因子。在剪接过程中,Prp8组成剪接体的催化中心。有人推断Prp8是剪接体的支架蛋白,很可能在催化中心起到锚定RNA的作用,同时也调节着激活剪接体所必需的构象变化。Prp8还与色素性视网膜炎的发生密切相关。
关键词
prp8
蛋白
前体MRNA
支架蛋白
Keywords
prp8
, pre-mRNA, scaffold protein
分类号
Q522.2 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦条锈菌(CYR34)全基因组剪接体PRP8家族基因的鉴定及表达分析
陈诗雯
韩宏
杨成德
邹一萍
王增艳
王丽婷
陶飞
《西北农业学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
拟南芥隐花色素CRY2调控因子PRP8基因的功能分析
郭亚蓉
王艳艳
刘军
裴雁曦
《生物技术进展》
2019
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
Prp8蛋白在前体mRNA剪接中的作用
洪敬欣
姚智
杨洁
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2007
0
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职称材料
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