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基于网络药理学、分子对接与PRM靶向蛋白验证探讨苁蓉舒痉颗粒治疗帕金森病的作用机制 被引量:3
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作者 刘海鑫 倪慧心 +6 位作者 周美 范自立 高正涛 吴方真 林瑶 许茜 蔡晶 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第2期365-372,共8页
目的结合网络药理学、分子对接与PRM蛋白相对定量分析探索苁蓉舒痉颗粒(Congrong Shujing granules,CSGs)治疗帕金森病(Parkinson’s disease,PD)的作用机制。方法通过数据库获取CSGs的有效成分和PD的靶点。取药物与疾病的交集靶点,进... 目的结合网络药理学、分子对接与PRM蛋白相对定量分析探索苁蓉舒痉颗粒(Congrong Shujing granules,CSGs)治疗帕金森病(Parkinson’s disease,PD)的作用机制。方法通过数据库获取CSGs的有效成分和PD的靶点。取药物与疾病的交集靶点,进行“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络的构建与分析,将交集靶点基因导入David数据库进行GO和KEGG富集分析,并将主要成分与关键靶点进行分子对接。将27只SD大鼠随机分为正常组9只、模型组9只和治疗组9只,于疗程d 1、7、14采用PRM蛋白相对定量分析法检测大鼠黑质纹状体关键靶蛋白特异性肽段表达量的变化情况。结果CSGs主要成分为丹参醛、黄芩素、槲皮素和山柰酚等;治疗PD最为关键的靶点为TP53、AKT1、EGFR、HSP90AA1和STAT3;KEGG分析主要富集:MAPK、PI3K-Akt和神经营养因子等信号通路。核心成分与核心靶点的分子对接表明,药物与靶点的结合具有较好活性。PRM分析发现ASK1、JNK1,JNK3目标肽段表达量各组间存在差异(P<0.05)。结论CSGs可通过ASK1-JNK信号通路,缓解内质网应激,抑制细胞凋亡,发挥神经保护作用。 展开更多
关键词 帕金森病 苁蓉舒痉颗粒 网络药理学 分子对接 prm ASK1-JNK信号通路
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Sperm RNA quantity and PRM1, PRM2, and TH2B transcript levels reflect sperm characteristics and early embryonic development
2
作者 Bilge Ozsait-Selcuk Sibel Bulgurcuoglu-Kuran +3 位作者 Dilek Sever-Kaya Neslihan Coban Gulsen Aktan Ates Kadioglu 《Asian Journal of Andrology》 2025年第1期76-83,共8页
Spermatozoa have a highly complex RNA profile.Several of these transcripts are suggested as biomarkers for male infertility and contribute to early development.To analyze the differences between sperm RNA quantity and... Spermatozoa have a highly complex RNA profile.Several of these transcripts are suggested as biomarkers for male infertility and contribute to early development.To analyze the differences between sperm RNA quantity and expression of protamine(PRM1 and PRM2)and testis-specific histone 2B(TH2B)genes,spermatozoa from 33 patients who enrolled in assisted reproduction treatment(ART)program were analyzed.Sperm RNA of teratozoospermic(T),oligoteratozoospermic(OT),and normozoospermic(N)samples was extracted,and the differences in transcript levels among the study groups were analyzed by quantitative real-time polymerase chain reaction(qRT-PCR).The correlations of total RNA per spermatozoon and the expression of the transcripts were evaluated in relation to sperm characteristics and preimplantation embryo development.The mean(±standard deviation)RNA amount per spermatozoon was 28.48(±23.03)femtogram in the overall group and was significantly higher in the OT group than that in N and T groups.Total sperm RNA and gene expression of PRM1 and PRM2 genes were related to preimplantation embryo development and developmental arrest.Specific sperm characteristics were correlated with the expressions of PRM1,PRM2,or TH2B genes.We conclude that the sperm RNA amount and composition are important factors and might influence early embryonic development and also differ in different cases of male infertility. 展开更多
关键词 embryonic development prm1 prm2 RNA SPERMATOZOA TH2B
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基于改进PRM算法和事件触发机制的无人船动态避碰轨迹规划
3
作者 王子铭 陈顺怀 郑龙 《船舶力学》 北大核心 2025年第8期1239-1249,共11页
无人船的轨迹规划是无人船自主航行的重要环节。本文基于改进PRM算法和事件触发机制提出一种无人船动态避碰的轨迹规划方法。首先,将PRM和A^(*)结合得到PRM-A^(*)算法,并基于PRM-A^(*)算法建立无人船轨迹规划模型。根据当前时刻的环境... 无人船的轨迹规划是无人船自主航行的重要环节。本文基于改进PRM算法和事件触发机制提出一种无人船动态避碰的轨迹规划方法。首先,将PRM和A^(*)结合得到PRM-A^(*)算法,并基于PRM-A^(*)算法建立无人船轨迹规划模型。根据当前时刻的环境态势建立栅格地图,通过PRM-A^(*)算法规划无人船的避碰路径,并建立该避碰路径的S-T栅格图。通过PRM-A^(*)算法对S-T栅格图规划无人船航速,从而得到当前时刻的无人船避碰轨迹。其次,基于事件触发机制建立无人船的动态避碰模型。根据无人船的TCPA和DCPA建立无人船碰撞危险度评估模型,并以此为基础设置事件触发条件;事件触发后,根据当前时间窗的环境态势规划无人船避碰轨迹。最后,分别进行开阔水域和限制水域的无人船轨迹规划仿真试验。结果显示,本算法可使无人船能有效地避开局部水域中静态障碍物和移动障碍物,并节省计算资源,提升计算性能。 展开更多
关键词 无人船 轨迹规划 prm-A^(*)算法 事件触发机制 TCPA DCPA
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基于PRM的颗粒破碎数值模拟方法研究进展
4
作者 孙义豪 刘金艳 +2 位作者 左蔚然 黄岚 周子浩 《金属矿山》 北大核心 2025年第9期98-106,共9页
颗粒破碎是矿业、化工、建材等领域的关键环节,其能量耗散与破碎行为关乎工程设计和设备性能优化。传统实验方法在捕捉动态破碎过程与微观机制方面存在局限,且成本较高。基于颗粒替换法(particle replacement method,PRM)的数值模拟方... 颗粒破碎是矿业、化工、建材等领域的关键环节,其能量耗散与破碎行为关乎工程设计和设备性能优化。传统实验方法在捕捉动态破碎过程与微观机制方面存在局限,且成本较高。基于颗粒替换法(particle replacement method,PRM)的数值模拟方法为研究颗粒破碎提供了有效手段。该方法通过预设颗粒替代模式和破碎准则来模拟颗粒的破碎过程。通过文献调研与对比分析,系统综述了基于接触力、应力张量和能量的三类破碎准则的适用性与局限性,并探讨了子代数量确定、质量守恒实现及非球形建模等替换模式的关键问题。结果表明,PRM在预测破碎后颗粒分布与形态方面具有较好潜力,但仍存在准则缺乏统一性、替换模式依赖经验等问题。未来应致力于构建普适性破碎准则、发展多物理场耦合模型,并结合机器学习与实验数据提升模拟精度与工程适用性。 展开更多
关键词 颗粒破碎 数值模拟 prm 破碎准则 替换模式
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日本脑炎病毒prM蛋白单克隆抗体的制备及其B细胞表位的鉴定
5
作者 杨笑笑 杨兴淼 +1 位作者 刘亚林 曹瑞兵 《南京农业大学学报》 北大核心 2025年第3期591-603,共13页
[目的]本文旨在制备日本脑炎病毒(JEV)prM蛋白的单克隆抗体,为进一步了解prM的结构和功能、建立特异性检测方法以及研究JEV prM蛋白功能奠定基础。[方法]将prm基因克隆至原核表达载体pET-32a,诱导表达并纯化prM蛋白,随后将其免疫小鼠,... [目的]本文旨在制备日本脑炎病毒(JEV)prM蛋白的单克隆抗体,为进一步了解prM的结构和功能、建立特异性检测方法以及研究JEV prM蛋白功能奠定基础。[方法]将prm基因克隆至原核表达载体pET-32a,诱导表达并纯化prM蛋白,随后将其免疫小鼠,通过细胞融合和亚克隆得到分泌抗prM单克隆抗体的杂交瘤细胞株,制备腹水并进行效价测定,通过Western blot和IFA验证其特异性,并进行空斑中和试验测定其中和活性,利用原核表达多段截短体蛋白确定单克隆抗体抗原表位并进行保守性分析,将其初步应用于感染检测及亚细胞定位分析。[结果]经细胞融合和3次亚克隆后成功获得1株能稳定分泌抗prM单克隆抗体(mAb)的细胞株,命名为4H6,所制备的腹水效价可达到1∶1 638 400,经鉴定,该prM mAb重链属于IgG2b,轻链为κ型。Western blot以及IFA试验均证明该抗体具有良好的特异性。空斑减少中和试验显示prM 4H6分泌的mAb不具备中和活性。通过表达截短蛋白鉴定出prM 4H6分泌的mAb所识别的抗原表位位于^(30)GENRCWVRAIDVGYMC^(45),结合生物信息学分析发现,该表位位于prM蛋白表面且在JEV不同毒株之间高度保守。成功将prM 4H6分泌mAb初步应用于JEV感染检测及prM蛋白的亚细胞定位分析。[结论]成功制备1株高效分泌抗JEV prM蛋白单克隆抗体细胞株,其分泌的特异性mAb的B细胞表位识别区位于pr表面,为分析prM蛋白在病毒复制过程中的生物学功能以及与其他病毒蛋白(如E蛋白或宿主分子)之间的相互作用提供有效工具。 展开更多
关键词 日本脑炎病毒 prm蛋白 原核表达 单克隆抗体 B细胞表位
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一种改进的场景自适应PRM路径规划算法
6
作者 杨景照 王超 张煜 《指挥控制与仿真》 2025年第3期34-39,共6页
针对动态复杂环境下的地面无人装备路径规划时存在的精细度、动态性与规划实时性之间的矛盾,提出一种基于风险融合代价地图和自适应PRM的地面无人装备路径规划算法。首先,基于多要素环境场景建立风险融合代价地图,通过高斯卷积自适应采... 针对动态复杂环境下的地面无人装备路径规划时存在的精细度、动态性与规划实时性之间的矛盾,提出一种基于风险融合代价地图和自适应PRM的地面无人装备路径规划算法。首先,基于多要素环境场景建立风险融合代价地图,通过高斯卷积自适应采样、非线性概率提升和二次采样策略等机制构建场景自适应PRM概率路图,并利用局部规划器对概率路图权值的动态更新,从而实现全局低风险代价路径的优化搜索。仿真结果表明,该方法能较好实现动态复杂环境下的精细度、动态性与规划实时性的平衡。 展开更多
关键词 prm 自适应采样 高斯卷积
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鸭坦布苏病毒prM蛋白单克隆抗体的制备及其抗原表位鉴定 被引量:2
7
作者 刘亚林 梁真洁 +1 位作者 杨兴淼 曹瑞兵 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期98-106,共9页
为制备鸭坦布苏病毒(DTMUV)膜前体蛋白(prM)的单克隆抗体,将原核表达的重组prM蛋白配伍佐剂免疫6周龄雌性BALB/c小鼠,3次免疫后分离小鼠脾细胞并将其与SP2/0细胞进行融合,通过间接ELISA筛选,获得2株能稳定分泌抗DTMUV prM蛋白单克隆抗... 为制备鸭坦布苏病毒(DTMUV)膜前体蛋白(prM)的单克隆抗体,将原核表达的重组prM蛋白配伍佐剂免疫6周龄雌性BALB/c小鼠,3次免疫后分离小鼠脾细胞并将其与SP2/0细胞进行融合,通过间接ELISA筛选,获得2株能稳定分泌抗DTMUV prM蛋白单克隆抗体的杂交瘤细胞株,命名为3H4和5C10。2株杂交瘤细胞均能稳定分泌抗体,制备的腹水抗体效价分别为1∶51200和1∶102400。亚型鉴定结果显示,3H4和5C10单克隆抗体的重链均属于IgG2b,轻链均为Kappa型。Western blot和间接免疫荧光试验结果显示,这2株单克隆抗体均能与BHK-21细胞中感染的DTMUV发生特异性反应,而与同属的日本脑炎病毒无交叉反应。微量病毒空斑减少中和试验结果表明,这2株单克隆抗体均具有中和活性。进一步原核表达prM蛋白不同截短体,发现2株单抗针对不同表位,均位于prM蛋白的pr片段上。本研究制备的单克隆抗体3H4和5C10为快速检测DTMUV感染和研究prM蛋白的结构与功能奠定了基础。 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒 prm蛋白 原核表达 单克隆抗体 B细胞表位
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基于知识和改进PRM算法的钣金折弯机器人路径自动规划与优化
8
作者 纪广东 游有鹏 +1 位作者 王鹏宇 钱爽 《机械与电子》 2024年第6期38-44,49,共8页
针对钣金折弯机器人离线编程仿真过程中的任务单元间运动规划问题,提出了一种基于经验知识的初始路径节点生成方法。基于初始路径节点作为体心来构建采样模型,通过获取模型顶点和体心作为采样点来改进原始PRM算法采样方式。通过多次迭... 针对钣金折弯机器人离线编程仿真过程中的任务单元间运动规划问题,提出了一种基于经验知识的初始路径节点生成方法。基于初始路径节点作为体心来构建采样模型,通过获取模型顶点和体心作为采样点来改进原始PRM算法采样方式。通过多次迭代构建采样模型,使得该算法路径具有了渐进最优性,从而实现了钣金折弯机器人路径自动规划与优化。最后,通过钣金折弯机器人的仿真实验,验证了该算法的可行性与高效性。 展开更多
关键词 折弯机器人 路径规划 经验知识 prm算法
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基于改进PRM算法的体育运动路径避障控制系统 被引量:1
9
作者 樊丽 杨宏 《信息技术》 2024年第4期44-51,58,共9页
为提升体育运动的训练效果,解决现有体育机器人路径避障控制效果不佳的问题,利用改进PRM算法完成路径避障控制系统设计。首先调整测距传感器和倾角传感器的内部结构和分布方式,优化机器人的运动驱动和通信网络模块。通过实时运动信号的... 为提升体育运动的训练效果,解决现有体育机器人路径避障控制效果不佳的问题,利用改进PRM算法完成路径避障控制系统设计。首先调整测距传感器和倾角传感器的内部结构和分布方式,优化机器人的运动驱动和通信网络模块。通过实时运动信号的采集与融合,确定当前机器人的位姿及障碍物位置信息,利用改进PRM算法规划机器人避障路径,实现系统的体育机器人运动路径避障控制功能。通过系统测试实验得出结论:所提系统体育机器人的实际运动路径更接近理想路径,且碰撞事故更少,即设计系统在控制效果方面具有明显优势。 展开更多
关键词 改进prm算法 体育机器人 运动路径 避障控制系统 运动驱动
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DIA-based proteome profiling with PRM verification reveals the involvement of ER-associated protein processing in pollen abortion in Ogura CMS cabbage
10
作者 Peiwen Wang Lin Zhu +5 位作者 Ziheng Li Mozhen Cheng Xiuling Chen Aoxue Wang Chao Wang Xiaoxuan Zhang 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2024年第3期755-770,共16页
Ogura cytoplasmic male sterility(Ogura CMS)is extensively applied in hybrid seed production in cruciferous crops.However,the posttranscriptional molecular basis of Ogura CMS in cruciferous crops remains elusive.Here,a... Ogura cytoplasmic male sterility(Ogura CMS)is extensively applied in hybrid seed production in cruciferous crops.However,the posttranscriptional molecular basis of Ogura CMS in cruciferous crops remains elusive.Here,a data-independent acquisition-based proteomic approach coupled with a parallel reaction monitoring-based targeted proteomic assay was used to analyze the proteome dynamics of Ogura CMS cabbage line RM and its maintainer line RF during floral bud development to obtain insights into the mechanism underlying Ogura CMS in cruciferous crops.A total of 9162 proteins corresponding to 61464 peptides were identified in RM and RF floral buds.The proteomic fluctuation of RM was weaker than that of RF.Differences in protein expression between RM and RF gradually enlarged with floral bud development.Fifteen continually up-regulated and eight continually down-regulated proteins were found in RM relative to RF throughout floral bud development.Differentially expressed proteins between RM and RF during floral bud development were implicated in the endoplasmic reticulum(ER)-associated protein processing pathway,in which most of them exhibited down-regulated expression in RM.These data suggest that ER-associated protein processing may be involved in pollen abortion in Ogura CMS cabbage by inhibiting the expression of critical factors.Our findings not only deepen the understanding of the molecular mechanisms of Ogura CMS in cruciferous crops but also provide better guidance for applying Ogura CMS in the hybrid breeding of cruciferous crops. 展开更多
关键词 Ogura cytoplasmic male sterility(Ogura CMS) CABBAGE Data-independent acquisition(DIA) Parallel reaction monitoring(prm) Pollen development
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改进PRM在特定复杂环境下的路径规划
11
作者 杨振舰 张国良 《天津城建大学学报》 CAS 2024年第5期346-353,共8页
针对传统概率路线图法(probabilistic roadmap methods,PRM)在特定复杂场景(场景中存在十字形的窄通道连通区域,且最终规划出来的路径必定会经过十字形的窄通道连通区域)下路径规划成功率低的问题,提出了一种改进的PRM方法.在学习阶段,... 针对传统概率路线图法(probabilistic roadmap methods,PRM)在特定复杂场景(场景中存在十字形的窄通道连通区域,且最终规划出来的路径必定会经过十字形的窄通道连通区域)下路径规划成功率低的问题,提出了一种改进的PRM方法.在学习阶段,首先使用Fast(features from accelerated segment test)角点检测算法来检测给定地图环境的角点;然后根据检测出来的角点计算地图的主要连接区域(十字形的窄通道连通区域中心的矩形),通过对这些主要连通区域额外随机采样一个点,从而增加了主要连通区域的采样点数量,提高了窄通道和自由区域的连通性.仿真结果表明,优化PRM路径规划的成功率比传统PRM的成功率高出70%,路径规划时间缩短了1.2 s,因此改进的方法大大提高了PRM算法的效率. 展开更多
关键词 路径规划 prm算法 Fast算法 特定复杂环境 主要连通区域
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登革病毒2型prM蛋白的表达及其抗体的ADE作用研究 被引量:3
12
作者 冯俊杰 罗雅艳 +4 位作者 周俊梅 方丹云 曾谷城 晏辉钧 江丽芳 《热带医学杂志》 CAS 2013年第4期377-381,411,共6页
目的建立登革病毒2型(DENV-2)前膜蛋白(prM)的原核稳定表达系统,并制备prM多克隆抗体,研究登革病毒特异性prM抗体的中和作用及抗体依赖性感染增强作用(ADE)。方法应用大肠杆菌表达系统表达全长DENV-2 prM蛋白,经电洗脱法纯化重组蛋白,... 目的建立登革病毒2型(DENV-2)前膜蛋白(prM)的原核稳定表达系统,并制备prM多克隆抗体,研究登革病毒特异性prM抗体的中和作用及抗体依赖性感染增强作用(ADE)。方法应用大肠杆菌表达系统表达全长DENV-2 prM蛋白,经电洗脱法纯化重组蛋白,免疫家兔,制备兔抗prM蛋白多抗;应用空斑减数中和试验(PRNT)和流式细胞术(FCM)分别检测prM兔多克隆抗体的中和作用和ADE效应。结果重组prM蛋白在原核系统可获得高效表达,prM蛋白的表达量占大肠杆菌全菌蛋白的15%左右;其免疫血清经Western blotting法证实为登革病毒特异性prM多克隆抗体,用ELISA法检测效价为1:800 000。PRNT表明,prM抗体对成熟和不成熟DENV-2感染C6/36细胞中和作用有限,最大中和程度分别为49.84%和50.22%;FCM结果表明,prM抗体能在较大的抗体稀释度范围(10-2~10-6)增强成熟和不成熟DENV-2感染,且在10-3稀释度时达到最高峰。结论重组DENV-2 prM蛋白有很强的免疫原性,其诱生的prM抗体对登革病毒仅有较弱的中和活性,但却呈现出较强的ADE作用,揭示prM抗体是一种感染增强性抗体。 展开更多
关键词 登革病毒2型 prm蛋白 prm多克隆抗体 中和作用 抗体依赖性感染增强作用(ADE)
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PRM标量平流方案在GRAPES全球预报系统中的应用 被引量:12
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作者 苏勇 沈学顺 +4 位作者 彭新东 李兴良 伍湘君 张爽 陈贤 《大气科学》 CSCD 北大核心 2013年第6期1309-1325,共17页
如何更好地模拟水物质的分布,对于数值天气预报效果的改进,特别是对于更好地模拟降水过程,具有重要的意义。半拉格朗日模式中的标量平流计算要求做到高精度、守恒、正定和保形,但GRAPES_GFS(Global-Regional Assimilation and PrEdictio... 如何更好地模拟水物质的分布,对于数值天气预报效果的改进,特别是对于更好地模拟降水过程,具有重要的意义。半拉格朗日模式中的标量平流计算要求做到高精度、守恒、正定和保形,但GRAPES_GFS(Global-Regional Assimilation and PrEdiction System,Global Forecast System)中采用的QMSL(Quasi-Monotone Semi-Lagrangian)平流方案在水汽的强梯度、不连续区域计算精度较低,且不能做到严格守恒。本研究借鉴计算流体力学领域的研究进展,将一个基于分段有理函数的物质平流方案PRM(Piecewise Rational Method)引入GRAPES_GFS中,按照通量形式求解水汽方程,并对极区进行了混合等技术处理。通过一系列理想试验对两种平流方案进行了对比,证明了PRM方案精度较高,特别是在水汽梯度大的区域优势明显,频散、耗散误差较小,守恒、保形性也要好于QMSL方案。通过对GRAPES_GFS中批量预报试验效果的检验,验证了PRM方案可以有效地改进模式对水物质分布的模拟,提高了降水的预报效果,对模式综合预报性能的提升也有明显作用。 展开更多
关键词 prm方案 标量平流 GRAPES全球预报系统 半拉格朗日 质量守恒
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基于PRMS准则的煤层气资源/储量划分与评估 被引量:9
14
作者 法贵方 衣艳静 +2 位作者 刘娅昭 原瑞娥 王忠生 《石油实验地质》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期665-670,共6页
介绍了基于国际通用准则"石油资源管理系统"(PRMS)的各级煤层气资源/储量的定义及分类要求,从资产所有权、政府监管与项目审批条件、井控程度、测试程度、基础设施和销售市场、开发与生产时间以及经济参数这7个方面详细分析... 介绍了基于国际通用准则"石油资源管理系统"(PRMS)的各级煤层气资源/储量的定义及分类要求,从资产所有权、政府监管与项目审批条件、井控程度、测试程度、基础设施和销售市场、开发与生产时间以及经济参数这7个方面详细分析煤层气各级储量的划分依据。结合煤层气地质条件和工程条件、现行经济条件、操作条件以及政府相关政策等,初步制定了煤层气3P储量和条件储量的确定原则并进行实例分析,为合理评估煤层气储量提供重要参考。 展开更多
关键词 3P储量 条件储量 储量评估 分类体系 分类原则 prmS准则 煤层气
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乙型脑炎病毒XJ/08/01株的分离鉴定及PrM/E基因的遗传进化分析 被引量:11
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作者 刘昊 金宁一 +8 位作者 段纲 尹革芬 鲁会军 屈勇刚 于长勇 张丹 李霄 金扩世 关莎莎 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期565-569,共5页
从新疆维吾尔自治区石河子地区某猪场采集了150份猪脑组织样品,利用RT-PCR方法进行流行性乙型脑炎病毒(JEV)NS1基因扩增,结果有32份组织样品扩增出了430 bp的特异性目的条带。用检测的阳性样品研磨液接种乳鼠进行JEV的分离,经3次乳鼠传... 从新疆维吾尔自治区石河子地区某猪场采集了150份猪脑组织样品,利用RT-PCR方法进行流行性乙型脑炎病毒(JEV)NS1基因扩增,结果有32份组织样品扩增出了430 bp的特异性目的条带。用检测的阳性样品研磨液接种乳鼠进行JEV的分离,经3次乳鼠传代后获得了1株JEV,命名为XJ/08/01。在此基础上,设计引物从接毒乳鼠脑组织样品中扩增JEV的主要抗原基因PrM/E并进行序列分析,结果表明,该分离毒株与JEV疫苗株SA14-14-2的同源性为99.6%,根据基因分型法确定该分离株属于基因Ⅲ型JEV。 展开更多
关键词 流行性乙型脑炎病毒 prm/E基因 核酸序列
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表达乙脑病毒PrM基因重组伪狂犬病病毒的构建 被引量:8
16
作者 李自力 陈焕春 +4 位作者 徐高原 方六荣 肖少波 王祥 何启盖 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期53-58,共6页
本研究以乙型脑炎病毒SA14-14-2疫苗株基因组RNA为模板,采用RT-PCR一步法扩增了PrM基因的全长cDNA(558 bp),用BamHI和EcoRI双酶切PrM基因的扩增产物,回收目的基因后将其克隆至经同样酶切的伪狂犬病病毒通用转移载体pPgG-uni中,获得了转... 本研究以乙型脑炎病毒SA14-14-2疫苗株基因组RNA为模板,采用RT-PCR一步法扩增了PrM基因的全长cDNA(558 bp),用BamHI和EcoRI双酶切PrM基因的扩增产物,回收目的基因后将其克隆至经同样酶切的伪狂犬病病毒通用转移载体pPgG-uni中,获得了转移载体pPgG-PrM,并对其外源片段进行了测序。序列分析结果表明:与已报道的乙型脑炎病毒SA14强毒株和SA14-14-2疫苗株的核苷酸序列比较,PrM基因的同源性为100%。以伪狂犬病病毒Ea株TK-/gG-/LacZ+突变株为载体构建了一株表达乙型脑炎病毒PrM基因的重组伪狂犬病病毒TK-/gG-/PrM+,为进一步开展猪乙型脑炎与伪狂犬病二价基因工程疫苗的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 乙型脑炎病毒 prm基因 重组伪狂犬病病毒
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建国后首次登革热暴发分离的2株登革4型病毒prM和E基因序列测定及其系统发生分析 被引量:5
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作者 刘志文 俞永新 +2 位作者 贾丽丽 董关木 王志伟 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期678-682,686,共6页
目的对建国后1978年广东佛山首次暴发登革热流行时从患者急性期血液中分离到的两株登革4型病毒(78-42、78-56)进行其分子特征研究并了解其可能来源。方法用Vero细胞培养1978年分离自广东佛山登革热病人的78-42、78-56两病毒株,RNA抽提后... 目的对建国后1978年广东佛山首次暴发登革热流行时从患者急性期血液中分离到的两株登革4型病毒(78-42、78-56)进行其分子特征研究并了解其可能来源。方法用Vero细胞培养1978年分离自广东佛山登革热病人的78-42、78-56两病毒株,RNA抽提后RT-PCR法扩增prM、E区基因,克隆至pGEM-TEasy载体后测序;利用DNASTAR软件预测其氨基酸序列并与其他国内外登革4型病毒株序列比较;运用CLUSTALX1.83和MEGA3.1软件绘制系统发生树。结果78-42、78-56两株高度同源,prM、E基因序列和氨基酸序列与其他登革4型病毒同源性很高并证实为登革4型毒株,与印度尼西亚和马来西亚分离株同属基因IIA亚型,核苷酸同源性与印尼ID1973株最高。结论78-42、78-56两新分离病毒株为建国后首次分离到的登革4型毒株,其来源最可能来自印度尼西亚。 展开更多
关键词 登革4型病毒 prm基因 E基因 序列分析 系统发生树
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PRM1基因SNP位点-190C->A多态性对精子畸形率的影响 被引量:10
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作者 余庆锋 杨学习 +3 位作者 李粉霞 叶禄伟 吴英松 毛向明 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2012年第4期314-317,共4页
目的:探讨鱼精蛋白基因1(protamine 1,PRM1)单核苷酸多态性(SNP)与畸形精子症的关系。方法:收集畸形精子症不育患者(病例组,n=157)和精子形态正常男性(对照组,n=37)精液样本,进行形态学分析并提取基因组DNA,应用Sequenom MassARRAY SNP... 目的:探讨鱼精蛋白基因1(protamine 1,PRM1)单核苷酸多态性(SNP)与畸形精子症的关系。方法:收集畸形精子症不育患者(病例组,n=157)和精子形态正常男性(对照组,n=37)精液样本,进行形态学分析并提取基因组DNA,应用Sequenom MassARRAY SNP分型技术对PRM1基因-190C->A SNP位点(rs2301365)进行基因分型,比较病例组与对照组基因型的分布差异及病例组不同基因型间精子形态参数的差异。结果:病例组中,基因型CC、CA、AA的分布频率及个体数分别为38.9%(61)、44.6%(70)、16.6%(26),对照组为45.9%(17)、51.4%(19)、2.7%(1),病例组AA基因型分布频率显著高于对照组(P<0.05)。病例组等位基因C、A的分布频率分别为57.6%、42.4%,对照组为71.6%、28.4%,病例组等位基因A的频率与对照组差异无显著性(P>0.05)。病例组基因型CC与CA、AA、CA+AA在精子形态学参数的比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:PRM1基因SNP位点-190C->A可能与中国汉族畸形精子症男性不育存在相关,该位点可能导致精子形态异常,但所致形态异常并无部位上的特异性。 展开更多
关键词 男性不育 畸形精子症 prm1基因 多态性 汉族人群
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基于启发式节点增强策略的PRM路径规划方法 被引量:9
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作者 阙嘉岚 丁贵涛 黄亚楼 《机器人》 EI CSCD 北大核心 2003年第6期544-547,553,共5页
针对一般的PRM方法用于移动机器人对复杂地形路径搜索存在的缺陷 ,本文对PRM方法进行了改进 ,提出了一套基于启发式的节点增强的策略 ,提高了PRM方法节点增强阶段对环境的适应性 .此外 。
关键词 prm 启发式 路径规划 移动机器人
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基于TMT和PRM技术筛选番茄响应盐胁迫差异表达蛋白 被引量:3
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作者 王强 刘会芳 +6 位作者 韩宏伟 庄红梅 王柏柯 王娟 杨涛 王浩 秦勇 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1418-1428,共11页
【目的】盐胁迫是造成番茄产量损失和品质严重下降的关键非生物胁迫之一,研究番茄耐盐的分子机制,为认识番茄幼苗应答盐胁迫分子调控机制奠定基础。【方法】研究利用番茄耐盐渐渗系IL-7-5-5和番茄盐敏感M82为试材,采用同位素相对标记与... 【目的】盐胁迫是造成番茄产量损失和品质严重下降的关键非生物胁迫之一,研究番茄耐盐的分子机制,为认识番茄幼苗应答盐胁迫分子调控机制奠定基础。【方法】研究利用番茄耐盐渐渗系IL-7-5-5和番茄盐敏感M82为试材,采用同位素相对标记与绝对定量(TMT)技术结合定量蛋白质组平行反应监测(PRM)技术,对200 mM盐胁迫12 h的番茄幼苗叶片进行蛋白质组学研究,筛选出盐胁迫响应显著的潜在靶标蛋白。【结果】(1)共鉴定出286个差异显著表达蛋白(DEPs)。盐胁迫下IL-7-5-5鉴定到191个DEPs,其中119个表达上调,72个表达下调。在M82中鉴定出157个DEPs,其中84个表达上调,73个表达下调。维恩图分析显示,有129和95个差异蛋白分别特异于IL-7-5-5和M82。有62个显著差异蛋白共表达,其中28个在IL-7-5-5和M82中均上调,15个均为下调,表现出对盐胁迫的一致响应。19个显著差异蛋白在表达相反,有5个蛋白质在ST中下调,在SS中上调,14个差异蛋白在ST中上调,在SS中下调;(2)番茄盐反应蛋白种类诱导能力强,主要与代谢过程、单组织过程以及细胞过程有关,细胞组成主要涉及细胞、细胞器、分子复合物和膜,基因本体分子功能显示,这些差异性蛋白主要参与催化活性、绑定和分子功能调控。(3)选择11个显著差异蛋白PRM验证结果与TMT定量表现出相同的趋势。差异蛋白包括A0A3Q7E8T9、A0A3Q7EK65、A0A3Q7FY19、A0A3Q7G430、A0A3Q7ITH0、A0A3Q7J1Y7、P05116、Q43779、A0A3Q7F8W6、A0A3Q7GKU3、A0A3Q7J0Z4,可能是番茄幼苗耐盐的潜在靶标蛋白。【结论】研究采用TMT结合PRM技术,筛选出番茄幼苗响应盐胁迫差异表达蛋白。 展开更多
关键词 番茄 盐胁迫 蛋白质组学 TMT prm
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