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中国荷斯坦牛PRKACA基因对产奶性状的遗传效应分析 被引量:2
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作者 宋雨 许令娜 +1 位作者 韩博 孙东晓 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期131-136,共6页
前期研究发现蛋白激酶cAMP-激活的催化亚基α(Protein Kinase cAMP-Activated Catalytic Subunit Alpha,PRKACA)基因在中国荷斯坦牛干奶期、泌乳初期和泌乳高峰期的肝脏组织中差异表达且与脂质代谢相关,参与胰高血糖素、胰岛素信号通路... 前期研究发现蛋白激酶cAMP-激活的催化亚基α(Protein Kinase cAMP-Activated Catalytic Subunit Alpha,PRKACA)基因在中国荷斯坦牛干奶期、泌乳初期和泌乳高峰期的肝脏组织中差异表达且与脂质代谢相关,参与胰高血糖素、胰岛素信号通路和脂肪细胞中脂解调节等通路。因此,该基因被认为是奶牛产奶性状关键的候选基因。本研究进一步验证PRKACA基因对中国荷斯坦牛产奶性状是否具有显著的遗传效应。利用45头公牛的混池基因组DNA对PRKACA基因的全部编码区以及上、下游调控区各2 000 bp区段进行重测序,在其5’调控区发现1个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点g.11592189C>T。利用靶向测序基因型检测技术(Genotyping by Target Sequencing,GBTS)对北京地区926头中国荷斯坦母牛进行个体基因型检测。基于混合动物模型,利用SAS 9.4软件将该SNP位点与5个产奶性状进行关联分析。结果显示,在第1泌乳期,g.11592189C>T位点与产奶量、乳脂量和乳蛋白量呈极显著关联;在第2泌乳期,该位点与乳脂量和乳脂率呈极显著关联。利用JASPER网站预测该位点改变了转录因子KLF15、KLF2、ZNF692、HIC2和NFIX的结合位点。本研究结果表明PRKACA基因对中国荷斯坦牛产奶量、乳脂量、乳蛋白量等产奶性状具有较大遗传效应,可以为奶牛基因组选择提供可参考的遗传标记信息。 展开更多
关键词 prkaca基因 产奶性状 中国荷斯坦牛 单核苷酸多态性 关联分析
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新橙皮苷治疗骨质疏松症的靶点及对骨髓间充质干细胞成骨分化的作用
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作者 章镇宇 梁秋健 +4 位作者 杨军 韦相宇 蒋捷 黄林科 谭桢 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第7期1437-1447,共11页
背景:前期研究发现新橙皮苷可以延缓去卵巢小鼠的骨丢失,具有治疗骨质疏松症的潜力,但其具体作用机制仍有待探究。目的:基于生物信息学和体外细胞实验探索新橙皮苷治疗骨质疏松症的关键靶点与可能机制。方法:从GEO数据库获得骨质疏松症... 背景:前期研究发现新橙皮苷可以延缓去卵巢小鼠的骨丢失,具有治疗骨质疏松症的潜力,但其具体作用机制仍有待探究。目的:基于生物信息学和体外细胞实验探索新橙皮苷治疗骨质疏松症的关键靶点与可能机制。方法:从GEO数据库获得骨质疏松症相关的基因表达数据集,通过R语言筛选和分析差异表达基因,从GeneCards和DisGeNET数据库筛选骨质疏松症的相关靶点,从ChEMBL和PubChem数据库筛选新橙皮苷的相关靶点,三者取交集获得共同靶点,使用String数据库构建交集基因的PPI网络,筛选关键目标靶点,使用DAVID数据库进行GO、KEGG富集分析,运用AutoDock软件对新橙皮苷与目标靶点蛋白进行分子对接验证。检测新橙皮苷对C57小鼠骨髓间充质干细胞成骨分化的影响,以完全培养基为空白对照组、成骨诱导液为对照组,含不同浓度(25,50μmol/L)新橙皮苷的成骨诱导液为实验组,在相应时间检测细胞成骨分化过程中碱性磷酸酶的表达、矿化程度、成骨相关基因及目标靶点基因的表达。结果与结论:(1)筛选出差异表达基因9253个,骨质疏松症相关靶点2161个,新橙皮苷相关靶点326个,三者共同靶点53个,53个基因在骨质疏松症样本中皆上调。PPI网络筛选出具有研究意义的目标靶点基因PRKACA。GO功能与KEGG通路富集分析表明,新橙皮苷通过PRKACA靶点治疗骨质疏松症主要依靠蛋白质磷酸化和蛋白质自身磷酸化等生物过程,作用于内分泌抵抗、癌症中的蛋白聚糖、雌激素信号通路等发挥治疗作用。分子对接结果表明,新橙皮苷与目标靶点PRKACA对应的蛋白有一定的结合能力。(2)碱性磷酸酶染色显示新橙皮苷可以促进间充质干细胞成骨分化早期碱性磷酸酶的表达,茜素红染色显示新橙皮苷可以促进间充质干细胞成骨分化的矿化。RT-qPCR检测结果显示,新橙皮苷可以促进碱性磷酸酶、PRKACA、骨钙素mRNA的表达。(3)结果表明,新橙皮苷可能通过雌激素信号通路上的PRKACA靶点促进成骨分化,从而防治骨质疏松症。 展开更多
关键词 生物信息学 骨质疏松症 新橙皮苷 骨髓间充质干细胞 prkaca基因
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冠心病细胞焦亡基因的生物信息学筛选及临床验证
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作者 杨玉静 吴振敏 +5 位作者 李晖 赵越 钟笑凌 王子霞 张鑫强 邓倩昀 《中国实验诊断学》 2025年第8期954-962,共9页
目的 通过整合生物信息学分析与临床验证,筛选冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)细胞焦亡关键基因,并评估其作为生物标志物的诊断价值。方法 基于GEO数据库GSE113079数据集筛选差异表达基因,结合LASSO回归与随机森林算法确定关键基因。纳入... 目的 通过整合生物信息学分析与临床验证,筛选冠状动脉粥样硬化性心脏病(CHD)细胞焦亡关键基因,并评估其作为生物标志物的诊断价值。方法 基于GEO数据库GSE113079数据集筛选差异表达基因,结合LASSO回归与随机森林算法确定关键基因。纳入2023年5月至2024年8月在广东省人民医院就诊的CHD患者630例及健康体检对照246例,采用实时定量PCR检测外周血样本目标基因表达水平,分析其与临床分型、血管病变支数及Gensini评分的相关性。结果 筛选出5个关键基因(PRKACA、CHMP6、GZMB、APIP、GZMA)。其中PRKACA、GZMB、GZMA在CHD患者中显著下调(均P<0.001),ROC曲线下面积(AUC)分别为0.862(95%CI,0.835~0.888)、0.943(95%CI,0.927~0.959)、0.777(95%CI,0.744~0.810)。亚组分析显示,GZMB与GZMA在急性冠脉综合征亚组中表达差异显著(P<0.05),随着Gensini评分的增加,GZMB、GZMA表达量呈下降趋势。结论 外周血PRKACA、GZMB、GZMA可作为CHD诊断的生物标志物,其表达水平与疾病严重程度相关,为早期诊断和个体化治疗提供了新思路。 展开更多
关键词 冠心病 细胞焦亡 生物标志物 prkaca GZMB GZMA
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酵母双杂交技术筛选与Fbxl16相互作用的蛋白质
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作者 成祖伟 罗卓荆 《第四军医大学学报》 北大核心 2008年第16期1448-1450,共3页
目的:寻找体内能够与Fbxl16相互作用的蛋白质,用以揭示该蛋白的功能及其在脊髓损伤修复过程中的作用.方法:通过RT-PCR技术克隆scirr1基因编码区序列,将其克隆入pSos载体以构建质粒pSos-scirr1.把该重组质粒表达的融合蛋白hSos-Fbxl16作... 目的:寻找体内能够与Fbxl16相互作用的蛋白质,用以揭示该蛋白的功能及其在脊髓损伤修复过程中的作用.方法:通过RT-PCR技术克隆scirr1基因编码区序列,将其克隆入pSos载体以构建质粒pSos-scirr1.把该重组质粒表达的融合蛋白hSos-Fbxl16作为诱饵蛋白,用改良的酵母双杂交技术筛选大鼠脑cDNA文库中能与Fbxl16相互作用的蛋白质,最后用酵母双杂交回转实验对获得的相互作用的可靠性加以验证.结果:成功构建了融合蛋白表达质粒pSos-scirr1之后,筛选出了14个与Fbxl16阳性相互作用的蛋白质;通过回转实验验证,确定其中两个蛋白能与Fbxl16相互作用,分别是cAMP依赖蛋白激酶α型催化亚基(protein kinase,cAMP-de-pendent,catalytic,alpha,Prkaca)和衣被蛋白复合物ζ亚基(coatomer protein complex,subunit zeta1,Copz1).结论:Fbxl16和Prkaca的相互作用为解释cAMP通路与脊髓损伤的关系提供了新思路,提示Fbxl16与细胞内物质转运有关. 展开更多
关键词 脊髓损伤 Fbxl16 蛋白质相互作用 prkaca Copzl
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Carney综合征研究现状与进展 被引量:2
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作者 于长江 阿不都沙拉木阿不都拉 +2 位作者 艾米热拉依马木 阿曼江艾尔肯 范瑞新 《岭南心血管病杂志》 2020年第1期110-114,共5页
Carney综合征是以皮肤、黏膜的斑点样色素沉着以及多系统肿瘤为主要临床表现的罕见疾病,属于常染色体显性遗传,多数是由PRKAR1A基因的失活性突变或大片段缺失所致,近年的研究发现其也可能与PRKACA基因及PRKACB基因有关。本文将从临床表... Carney综合征是以皮肤、黏膜的斑点样色素沉着以及多系统肿瘤为主要临床表现的罕见疾病,属于常染色体显性遗传,多数是由PRKAR1A基因的失活性突变或大片段缺失所致,近年的研究发现其也可能与PRKACA基因及PRKACB基因有关。本文将从临床表现、诊断、治疗以及分子生物学研究进展等方面对Carney综合征予以综述。 展开更多
关键词 Carney综合征 心脏黏液瘤 PRKAR1A prkaca PRKACB
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广东省医学会泌尿外科疑难病例多学科会诊(第22期)——ACTH非依赖性双侧肾上腺增生
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作者 黄展森 徐锦斌 +2 位作者 黄群雄 李腾成 狄金明 《中华腔镜泌尿外科杂志(电子版)》 2025年第3期384-389,共6页
本文报道一例复杂儿童肾上腺皮质增生病例。患儿男,5岁,因“咳嗽、发热伴抽搐”入院,查体示典型库欣样体征:满月脸、皮肤粗糙、颜面多毛,血压高达149/99 mmHg。实验室检查提示严重电解质紊乱、皮质醇显著升高。影像学显示双侧肾上腺弥... 本文报道一例复杂儿童肾上腺皮质增生病例。患儿男,5岁,因“咳嗽、发热伴抽搐”入院,查体示典型库欣样体征:满月脸、皮肤粗糙、颜面多毛,血压高达149/99 mmHg。实验室检查提示严重电解质紊乱、皮质醇显著升高。影像学显示双侧肾上腺弥漫增粗伴左侧结节。经广东省医学会泌尿外科疑难病例学科会诊(MDT),儿科专家排除原发性醛固酮增多症,放射科专家明确肾上腺增生合并腺瘤特征,泌尿外科专家强调手术的必要性、术中需动脉血压监测及术后皮质醇替代治疗。根据MDT讨论意见,进一步行全外显子测序发现19p13.2~p13.11区3.6 Mb拷贝数重复,涵盖PRKACA等关键基因,符合PPNAD4分子特征。告知患方MDT讨论意见,经充分沟通并取得知情同意后,行经腹腹腔镜左肾上腺切除,术后病理确诊皮质腺瘤。术后血压控制可,降压药用量有所减少,皮质醇2周内恢复正常。本案例提示:染色体19p拷贝数变异通过PRKACA基因组成性激活导致ACTH非依赖性库欣综合征;儿童肾上腺手术需个体化选择术式(优先切除严重侧),并警惕术后肾上腺危象;多模态评估(基因-影像-病理)对复杂双侧肾上腺增生诊疗具有核心价值。 展开更多
关键词 肾上腺增生 prkaca基因突变 库欣综合征 腹腔镜 肾上腺切除术 多学科协作
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Fibrolamellar hepatocellular carcinoma:Exploring molecular mechanisms and differentiation pathways to better understand disease outcomes and prognosis
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作者 Cassandra A.Kersten Elise N.Sloey +3 位作者 Eric Zhou Ying Peng Michael S.Torbenson Yi Guo 《Liver Research》 2017年第4期187-192,共6页
Fibrolamellar hepatocellular carcinoma(FLC)is a rare but aggressive liver cancer of children that occurs predominantly in teenagers without a history of liver disease.Surgical resection remains the only therapeutic op... Fibrolamellar hepatocellular carcinoma(FLC)is a rare but aggressive liver cancer of children that occurs predominantly in teenagers without a history of liver disease.Surgical resection remains the only therapeutic option,and the recurrence rate is extremely high(>50%within 3 years).A newly discovered chromosomal deletion that occurs in the majority of FLCs generates a novel kinase fusion between DnaJ heat shock protein family member B1(DNAJB1)and protein kinase cAMP-activated catalytic subunit alpha(PRKACA)(DNAJB1-PRKACA).Despite its high penetrance and apparent specificity for FLC,the oncogenic role of this fusion event remains unclear.In this review article,we discuss the histology,presentation and diagnosis,current treatment,and roles of the DNAJB1-PRKACA as well as research models contributing to our understanding of this disease. 展开更多
关键词 Fibrolamellar hepatocellular carcinoma(FLC) DnaJ heat shock protein family member B1 (DNAJB1) Protein kinase cAMP-activated catalytic subunit alpha(prkaca)Pediatric cancer Liver cancer
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