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题名番茄SlPP2C51基因的克隆及生物信息学分析
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作者
王家兴
贺亚男
尚尔森
田伟
张少丽
朱路英
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机构
鲁东大学农学院
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出处
《分子植物育种》
北大核心
2025年第24期8182-8189,共8页
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基金
山东省自然科学基金项目(ZR2022MC138)
山东省重点研发计划项目(2019GSF110015)共同资助。
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文摘
为了探讨番茄(Solanum lycopersicum)蛋白磷酸酶(protein phosphatase, PP) 2C家族基因SlPP2C51的结构信息和生物学功能,本研究克隆了Sl PP2C51基因,对其编码蛋白和启动子进行了生物信息学分析,以及响应盐胁迫的表达分析。结果显示,该基因编码蛋白含有397个氨基酸,是一个亲水性的不稳定蛋白,无跨膜区。编码蛋白的C端含有丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶PP2C家族保守结构域,亚细胞定位预测在细胞核中。该蛋白的氨基酸序列与马铃薯(Solanum tuberosum) StPP2C51的相似性较高,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtPP2C2也具有一定的序列相似性。蛋白互作预测结果显示,类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶2E(SRK2E-like)可能与SlPP2C51互作。对Sl PP2C51基因启动子分析发现,该基因启动子区含有多个脱落酸、茉莉酸甲酯和赤霉素响应元件。RT-qPCR结果显示,SlPP2C51基因的表达受到盐胁迫的诱导。这些结果为进一步研究番茄SlPP2C51基因的生物学功能、丰富番茄PP2C家族基因信息提供数据参考。
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关键词
番茄
pp2c51
基因克隆
生物信息学分析
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Keywords
Tomato
pp2c51
Gene cloning
Bioinformatics analysis
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分类号
S641.2
[农业科学—蔬菜学]
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