针对香菇育种过程中表型性状考察困难、人工测量费时费力的问题,提出一种适用于Jetson Orin Nano平台部署的香菇菌棒表型测量方法。使用手机和工业相机对3种不同数据来源的香菇菌棒进行图像采集,标注香菇菌落数据集并进行增强;比较了Bis...针对香菇育种过程中表型性状考察困难、人工测量费时费力的问题,提出一种适用于Jetson Orin Nano平台部署的香菇菌棒表型测量方法。使用手机和工业相机对3种不同数据来源的香菇菌棒进行图像采集,标注香菇菌落数据集并进行增强;比较了Bisenet、Stdcseg、U-net、Deeplabv3p、PP-liteseg 5个分割模型在Test-A、Test-B和Test-C测试集上的分割效果,结果表明PP-liteseg的普适性优于其他网络,PP-liteseg分割模型在3个测试集上的平均交并比超过97.53%,平均像素准确率高于99.49%,推理单幅图像耗时660 ms;为进一步平衡模型准确性和实时性,采用量化蒸馏方式对PP-liteseg模型进行压缩,并部署到Jetson Orin Nano平台上,压缩后的模型在Test-B测试集上的平均交并比和平均像素准确率分别为97.50%和99.51%,推理单幅图像耗时43.63 ms,比压缩前缩短近64%;采用PP-liteseg分割香菇菌棒图像,提取菌落表型,再根据菌落径向长度和轴向宽度得到菌丝生长长度,与人工测量值相比,菌丝生长长度平均绝对百分比误差、均方根误差和决定系数分别为1.874%、0.148 cm、0.918;采用该方法测量了6个菌株在连续4 d内的菌丝生长长度,结果表明,6个菌株的菌丝生长速度无论在单日还是在整个培养期内均有差异,其中49号和168号菌株差异最大。研究表明,本文方法适用于香菇菌棒表型测量,并能够以良好的准确性和实时性在Jetson Orin Nano平台上运行。展开更多
为确定蛋白磷酸酶-1和-2A(protein phosphatase-1 and phosphatase-2A,PP-1,PP-2A)在水生低等脊椎动物眼球不同组织/细胞中的表达模式,提取金鱼眼球中4种组织视网膜、晶体上皮细胞、晶体纤维和角膜的RNA和蛋白,利用RT-PCR和Western印迹...为确定蛋白磷酸酶-1和-2A(protein phosphatase-1 and phosphatase-2A,PP-1,PP-2A)在水生低等脊椎动物眼球不同组织/细胞中的表达模式,提取金鱼眼球中4种组织视网膜、晶体上皮细胞、晶体纤维和角膜的RNA和蛋白,利用RT-PCR和Western印迹技术进行检测.同时运用荧光免疫组织化学技术进行了定位表达研究.结果表明:1)在mRNA水平上,PP-1催化亚基α和PP-2A催化亚基β在金鱼视网膜、晶体上皮和角膜中表达强烈,与其在高等哺乳类脊椎动物如小鼠中的表达形成鲜明的对比;2)在蛋白水平上,PP-1和PP-2A催化亚基在金鱼视网膜和晶体上皮细胞中的表达较高,而在角膜中的表达最低.这与它们在小鼠眼球视网膜和角膜中同时具备高表达的模式形成对比;3)在金鱼发育48h的眼球中,PP-1和PP-2A催化亚基定位于视网膜的色素视网膜和神经视网膜细胞中,晶体上皮和纤维细胞中及角膜上皮细胞中,而在性成熟金鱼眼球中,此二酶催化亚基主要定位于视网膜的色素视网膜,神经视网膜及晶体上皮细胞中.这些结果为探讨PP-1和PP-2A在金鱼眼球不同组织中的功能打下了重要基础。展开更多
文摘针对香菇育种过程中表型性状考察困难、人工测量费时费力的问题,提出一种适用于Jetson Orin Nano平台部署的香菇菌棒表型测量方法。使用手机和工业相机对3种不同数据来源的香菇菌棒进行图像采集,标注香菇菌落数据集并进行增强;比较了Bisenet、Stdcseg、U-net、Deeplabv3p、PP-liteseg 5个分割模型在Test-A、Test-B和Test-C测试集上的分割效果,结果表明PP-liteseg的普适性优于其他网络,PP-liteseg分割模型在3个测试集上的平均交并比超过97.53%,平均像素准确率高于99.49%,推理单幅图像耗时660 ms;为进一步平衡模型准确性和实时性,采用量化蒸馏方式对PP-liteseg模型进行压缩,并部署到Jetson Orin Nano平台上,压缩后的模型在Test-B测试集上的平均交并比和平均像素准确率分别为97.50%和99.51%,推理单幅图像耗时43.63 ms,比压缩前缩短近64%;采用PP-liteseg分割香菇菌棒图像,提取菌落表型,再根据菌落径向长度和轴向宽度得到菌丝生长长度,与人工测量值相比,菌丝生长长度平均绝对百分比误差、均方根误差和决定系数分别为1.874%、0.148 cm、0.918;采用该方法测量了6个菌株在连续4 d内的菌丝生长长度,结果表明,6个菌株的菌丝生长速度无论在单日还是在整个培养期内均有差异,其中49号和168号菌株差异最大。研究表明,本文方法适用于香菇菌棒表型测量,并能够以良好的准确性和实时性在Jetson Orin Nano平台上运行。
文摘为确定蛋白磷酸酶-1和-2A(protein phosphatase-1 and phosphatase-2A,PP-1,PP-2A)在水生低等脊椎动物眼球不同组织/细胞中的表达模式,提取金鱼眼球中4种组织视网膜、晶体上皮细胞、晶体纤维和角膜的RNA和蛋白,利用RT-PCR和Western印迹技术进行检测.同时运用荧光免疫组织化学技术进行了定位表达研究.结果表明:1)在mRNA水平上,PP-1催化亚基α和PP-2A催化亚基β在金鱼视网膜、晶体上皮和角膜中表达强烈,与其在高等哺乳类脊椎动物如小鼠中的表达形成鲜明的对比;2)在蛋白水平上,PP-1和PP-2A催化亚基在金鱼视网膜和晶体上皮细胞中的表达较高,而在角膜中的表达最低.这与它们在小鼠眼球视网膜和角膜中同时具备高表达的模式形成对比;3)在金鱼发育48h的眼球中,PP-1和PP-2A催化亚基定位于视网膜的色素视网膜和神经视网膜细胞中,晶体上皮和纤维细胞中及角膜上皮细胞中,而在性成熟金鱼眼球中,此二酶催化亚基主要定位于视网膜的色素视网膜,神经视网膜及晶体上皮细胞中.这些结果为探讨PP-1和PP-2A在金鱼眼球不同组织中的功能打下了重要基础。
