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贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
孙岩岩
罗卫星
+3 位作者
谢海强
宋桃伟
刘彬
蔡惠芬
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期110-113,I0001,共5页
为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT启动子区SNP位点对肉质品质的影响。通过构建DNA池筛选出SNP位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子...
为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT启动子区SNP位点对肉质品质的影响。通过构建DNA池筛选出SNP位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG岛及转录因子。结果表明,POLRMT基因启动子区存在2个SNP位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT基因核心启动子范围发生改变,SNP位点导致部分转录因子结合位点消失,MethPrimer预测到CpG岛增加1个。
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关键词
polrmt
基因
启动子
SNP
贵州本地山羊
大理石纹性状
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职称材料
miR-208b-3p通过抑制线粒体基因表达加重心力衰竭小鼠能量代谢障碍
被引量:
1
2
作者
周双珊
刘源
+2 位作者
银萍
石毓君
苏立
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第16期1857-1866,共10页
目的探究miR-208b-3p对主动脉弓缩窄(transverse aortic constriction,TAC)诱导的心力衰竭小鼠能量代谢的作用及机制。方法将24只小鼠按照随机数字表法分为假手术组(Sham组,n=6)和手术组(n=18)。手术组采用TAC建立心力衰竭模型;假手术...
目的探究miR-208b-3p对主动脉弓缩窄(transverse aortic constriction,TAC)诱导的心力衰竭小鼠能量代谢的作用及机制。方法将24只小鼠按照随机数字表法分为假手术组(Sham组,n=6)和手术组(n=18)。手术组采用TAC建立心力衰竭模型;假手术组采用TAC相同手术方式,但不结扎主动脉弓。于TAC术后第2周再随机分为Antagomir组(n=6)、Antagomir-NC组(n=6)及TAC组(n=6),Antagomir组、Antagomir-NC组尾静脉分别注射miR-208b-3p antagomir(800μg)及miR-208b-3p antagomir阴性对照(800μg)试剂,每周2次,连续4周。术后第6周行超声心动图评估各组小鼠心功能。HE染色及天狼星红染色观察小鼠心肌组织病理学形态。ATP检测试剂盒检测各组小鼠心肌组织ATP水平。RT-qPCR检测小鼠心肌组织miR-208b-3p、线粒体基因(ND1、ND2、ND3、ND4、ND4L、ND5、ND6、CO1、CO2、CO3、CYTB、ATP6、ATP8)及POLRMT、12SrRNA的表达。双荧光素酶报告基因实验检测miR-208b-3p与潜在靶基因POLRMT的相互结合作用。Western blot检测心肌组织POLRMT及ND1、CO2、CYTB、ATP8蛋白表达水平。结果与Sham组相比,TAC组小鼠心肌miR-208b-3p表达显著增加(P<0.05)。超声检测结果显示,Antagomir组小鼠心脏的射血分数、收缩与舒张功能较TAC组明显改善(P<0.05)。组织切片染色提示,Antagomir组小鼠的心肌细胞肥大、排列紊乱、心肌间质炎细胞浸润等有明显改善(P<0.05)。与TAC组相比,Antagomir组ATP水平明显升高(P<0.05);POLRMT及线粒体基因转录产物(12SrRNA和13个线粒体基因编码多肽)表达量均显著升高(P<0.05),但SDHA、SDHB无变化。双荧光素酶报告基因实验显示miR-208b-3p与POLRMT的CDS区有结合作用。Antagomir组小鼠心肌组织POLRMT、ND1、CO2、CYTB、ATP8蛋白水平表达较TAC组显著增加(P<0.05)。结论miR-208b-3p可通过靶向POLRMT抑制线粒体基因的表达,加剧线粒体能量代谢障碍,并加重心力衰竭小鼠心功能不全及心室重塑。
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关键词
miR-208b
心力衰竭
能量代谢
线粒体基因
polrmt
原文传递
线粒体DNA的转录机制
3
作者
罗德艳
《基层医学论坛》
2016年第2期225-229,共5页
真核生物的基因由核基因和线粒体基因(mt DNA)共同组成,mt DNA的生物合成是一个非常复杂的过程,需要核基因和mt DNA共同协同调节完成,大多线粒体蛋白在由核基因编码好后经特殊通道输送到线粒体内参与线粒体的各项生物合成。线粒体DNA转...
真核生物的基因由核基因和线粒体基因(mt DNA)共同组成,mt DNA的生物合成是一个非常复杂的过程,需要核基因和mt DNA共同协同调节完成,大多线粒体蛋白在由核基因编码好后经特殊通道输送到线粒体内参与线粒体的各项生物合成。线粒体DNA转录需要核基因编码的几种蛋白,包括一个线粒体RNA聚合酶(POLRMT),线粒体转录因子A(TFAM),线粒体转录因子B1(TFB1M)或者线粒体转录因子B2(TFB2M)两者之一。本文对哺乳动物线粒体转录各因子的功能、各因子间的相互作用以及线粒体转录的调节进行了综述。
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关键词
线粒体转录
TFAM
TFB1M
TFB2M
polrmt
暂未订购
题名
贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
孙岩岩
罗卫星
谢海强
宋桃伟
刘彬
蔡惠芬
机构
贵州大学动物科学学院
贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第12期110-113,I0001,共5页
基金
教育部促进与美大地区科研合作与高层次人才培养项目(教外司美[2013]1741号)
贵州省农业科技攻关项目(黔科合NY字[2012]3006号)
文摘
为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT启动子区SNP位点对肉质品质的影响。通过构建DNA池筛选出SNP位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG岛及转录因子。结果表明,POLRMT基因启动子区存在2个SNP位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT基因核心启动子范围发生改变,SNP位点导致部分转录因子结合位点消失,MethPrimer预测到CpG岛增加1个。
关键词
polrmt
基因
启动子
SNP
贵州本地山羊
大理石纹性状
Keywords
polrmt
gene
promoter
SNP
Guizhou local goats marbling performance
分类号
S826 [农业科学—畜牧学]
Q346.5 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
miR-208b-3p通过抑制线粒体基因表达加重心力衰竭小鼠能量代谢障碍
被引量:
1
2
作者
周双珊
刘源
银萍
石毓君
苏立
机构
重庆医科大学附属第二医院心血管内科
四川大学华西医院病理研究室
出处
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第16期1857-1866,共10页
基金
重庆市自然科学基金面上项目(cstc2021jcyj-msxmX0208)。
文摘
目的探究miR-208b-3p对主动脉弓缩窄(transverse aortic constriction,TAC)诱导的心力衰竭小鼠能量代谢的作用及机制。方法将24只小鼠按照随机数字表法分为假手术组(Sham组,n=6)和手术组(n=18)。手术组采用TAC建立心力衰竭模型;假手术组采用TAC相同手术方式,但不结扎主动脉弓。于TAC术后第2周再随机分为Antagomir组(n=6)、Antagomir-NC组(n=6)及TAC组(n=6),Antagomir组、Antagomir-NC组尾静脉分别注射miR-208b-3p antagomir(800μg)及miR-208b-3p antagomir阴性对照(800μg)试剂,每周2次,连续4周。术后第6周行超声心动图评估各组小鼠心功能。HE染色及天狼星红染色观察小鼠心肌组织病理学形态。ATP检测试剂盒检测各组小鼠心肌组织ATP水平。RT-qPCR检测小鼠心肌组织miR-208b-3p、线粒体基因(ND1、ND2、ND3、ND4、ND4L、ND5、ND6、CO1、CO2、CO3、CYTB、ATP6、ATP8)及POLRMT、12SrRNA的表达。双荧光素酶报告基因实验检测miR-208b-3p与潜在靶基因POLRMT的相互结合作用。Western blot检测心肌组织POLRMT及ND1、CO2、CYTB、ATP8蛋白表达水平。结果与Sham组相比,TAC组小鼠心肌miR-208b-3p表达显著增加(P<0.05)。超声检测结果显示,Antagomir组小鼠心脏的射血分数、收缩与舒张功能较TAC组明显改善(P<0.05)。组织切片染色提示,Antagomir组小鼠的心肌细胞肥大、排列紊乱、心肌间质炎细胞浸润等有明显改善(P<0.05)。与TAC组相比,Antagomir组ATP水平明显升高(P<0.05);POLRMT及线粒体基因转录产物(12SrRNA和13个线粒体基因编码多肽)表达量均显著升高(P<0.05),但SDHA、SDHB无变化。双荧光素酶报告基因实验显示miR-208b-3p与POLRMT的CDS区有结合作用。Antagomir组小鼠心肌组织POLRMT、ND1、CO2、CYTB、ATP8蛋白水平表达较TAC组显著增加(P<0.05)。结论miR-208b-3p可通过靶向POLRMT抑制线粒体基因的表达,加剧线粒体能量代谢障碍,并加重心力衰竭小鼠心功能不全及心室重塑。
关键词
miR-208b
心力衰竭
能量代谢
线粒体基因
polrmt
Keywords
miR-208b
heart failure
energy metabolism
mitochondrial gene
polrmt
分类号
R341 [医药卫生—基础医学]
R394.1 [医药卫生—医学遗传学]
R541.602 [医药卫生—心血管疾病]
原文传递
题名
线粒体DNA的转录机制
3
作者
罗德艳
机构
川北医学院第二临床医学院、南充市中心医院
出处
《基层医学论坛》
2016年第2期225-229,共5页
文摘
真核生物的基因由核基因和线粒体基因(mt DNA)共同组成,mt DNA的生物合成是一个非常复杂的过程,需要核基因和mt DNA共同协同调节完成,大多线粒体蛋白在由核基因编码好后经特殊通道输送到线粒体内参与线粒体的各项生物合成。线粒体DNA转录需要核基因编码的几种蛋白,包括一个线粒体RNA聚合酶(POLRMT),线粒体转录因子A(TFAM),线粒体转录因子B1(TFB1M)或者线粒体转录因子B2(TFB2M)两者之一。本文对哺乳动物线粒体转录各因子的功能、各因子间的相互作用以及线粒体转录的调节进行了综述。
关键词
线粒体转录
TFAM
TFB1M
TFB2M
polrmt
Keywords
Mitochondrialtranscription TFAM TFB1M TFB2M
polrmt
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
贵州本地山羊POLRMT基因启动子区SNP的生物信息学分析
孙岩岩
罗卫星
谢海强
宋桃伟
刘彬
蔡惠芬
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
miR-208b-3p通过抑制线粒体基因表达加重心力衰竭小鼠能量代谢障碍
周双珊
刘源
银萍
石毓君
苏立
《陆军军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
原文传递
3
线粒体DNA的转录机制
罗德艳
《基层医学论坛》
2016
0
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