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乳腺癌中POLR2J的表达情况及作用机制研究
1
作者 李理想 杨文灿 +1 位作者 郝绪文 刘岩岩 《肿瘤预防与治疗》 2025年第1期1-10,共10页
目的:分析乳腺癌(breast cancer, BRCA)中RNA聚合酶ⅡJ亚基(RNA polymeraseⅡsubunit J,POLR2J)的表达和临床意义,并探究其在BRCA中发挥的生物学作用。方法:在多个数据库中分析POLR2J在细胞和组织层面的表达。使用免疫印迹分析POLR2J在B... 目的:分析乳腺癌(breast cancer, BRCA)中RNA聚合酶ⅡJ亚基(RNA polymeraseⅡsubunit J,POLR2J)的表达和临床意义,并探究其在BRCA中发挥的生物学作用。方法:在多个数据库中分析POLR2J在细胞和组织层面的表达。使用免疫印迹分析POLR2J在BRCA细胞系中的表达。在多个数据库中分析POLR2J对BRCA预后和临床特征的影响。使用cibersort函数分析POLR2J对BRCA免疫浸润的影响。使用maftools包分析POLR2J在BRCA中的突变景观。使用limma包获取POLR2J差异表达基因,使用cor.test函数鉴定POLR2J相关基因,对交集基因进行蛋白质-蛋白质互作网络的绘制和功能富集分析。然后选取2021年1月至2023年12月在本院手术治疗的BRCA患者71例,收集患者病理组织标本,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)以及免疫组织化学染色法检测POLR2J的癌组织和癌旁组织表达水平及与患者临床病理参数关系。结果:POLR2J在BRCA中高表达,且与BRCA的不良预后正相关。POLR2J的高表达预示着BRCA中雌激素受体、孕激素受体和HER2的阴性表达。POLR2J高表达与POLR2J低表达的BRCA具有明显不同的免疫微环境。通路富集分析显示,POLR2J与BRCA的氧化磷酸化,线粒体基因表达和电子传递链等功能相关。POLR2J高表达的BRCA具有更高的TP53突变率。POLR2J的高表达预示着更高的TNM分期和Grade分级。与癌旁组织相比,BRCA组织中POLR2J mRNA和蛋白水平显著升高。结论:POLR2J或许是预测BRCA预后的生物标志物,并影响BRCA的氧化磷酸化、免疫微环境和基因突变。 展开更多
关键词 polr2j 乳腺癌 免疫浸润 氧化磷酸化
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POLR2J作为低级别胶质瘤预后标志物的可能性及其作用机制的生物信息学分析 被引量：1
2
作者 孙梦捷 任敏 +1 位作者 刘广平 张向前 《延安大学学报（医学科学版）》 2024年第2期8-19,共12页
目的 通过生物信息学方法分析POLR2J(RNA polymeraseⅡsubunit J,POLR2J)基因的表达水平与低级别胶质瘤(lower-grade glioma,LGG)患者预后之间的关系,并预测其作用机制。方法 利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因... 目的 通过生物信息学方法分析POLR2J(RNA polymeraseⅡsubunit J,POLR2J)基因的表达水平与低级别胶质瘤(lower-grade glioma,LGG)患者预后之间的关系,并预测其作用机制。方法 利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因型组织表达(Genotypic Tissue Expression,GTEX)、中国胶质瘤基因组图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)、人类蛋白质和图谱(Human Proteins And Atlas,HPA)、临床蛋白质组学肿瘤分析协会(Clinical Proteomics Tumor Analysis Association,CPTAC)、肿瘤免疫单细胞中心(Tumor Immune Single Cell Center,TISCH2)等数据库分析POLR2J在泛癌、泛细胞、单细胞层面的基因表达和蛋白水平,使用免疫印迹分析POLR2J基因在LGG癌细胞系中的表达情况;GSE68848验证POLR2J在LGG中的表达量;使用R语言分析POLR2J与临床指标和生存预后的关系;使用TIP数据库分析POLR2J与肿瘤免疫微环境之间的关系,使用0Metascape进行功能注释分析,应用sparkle数据库分析POLR2J对LGG免疫治疗的预测效果。结果 POLR2J在LGG中高表达,POLR2J的表达量与LGG患者的不良预后正相关,受试者工作特征曲线(receiver operating characteristics curve,ROC)和COX回归分析证明POLR2J是LGG的独立预后因子;POLR2J高表达的LGG患者免疫浸润更复杂,免疫通路的激活程度也更高,也拥有更高的肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)和基因组拷贝数变异;通路富集分析显示,POLR2J高表达的LGG患者的蛋白质代谢、氧化应激、缺氧调控、细胞迁徙等通路被显著激活。POLR2J高表达的LGG患者能够更好地响应免疫治疗。结论 LGG中高表达的POLR2J是患者预后生存的危险因素,其表达与缺氧和免疫浸润密切正相关。 展开更多
关键词 polr2j 低级别胶质瘤 预后因子 免疫浸润 缺氧
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