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PMA-ddPCR法检测活的非可培养状态高产乙醇肺炎克雷伯菌
1
作者
赵硕
窦晨镤
+1 位作者
张建
袁静
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期998-1003,共6页
目的建立活的非可培养(VBNC)状态高产乙醇肺炎克雷伯菌的绝对定量方法。方法诱导高产乙醇肺炎克雷伯菌进入VBNC状态,评价乙醇产量。建立PMA-ddPCR方法通过单拷贝基因来计数高产乙醇肺炎克雷伯菌VBNC状态的活细胞基因拷贝数。进一步在VBN...
目的建立活的非可培养(VBNC)状态高产乙醇肺炎克雷伯菌的绝对定量方法。方法诱导高产乙醇肺炎克雷伯菌进入VBNC状态,评价乙醇产量。建立PMA-ddPCR方法通过单拷贝基因来计数高产乙醇肺炎克雷伯菌VBNC状态的活细胞基因拷贝数。进一步在VBNC状态粪便模拟中,评价ddPCR对低浓度样品检测的灵敏度和适应性。结果对高产乙醇肺炎克雷伯菌梯度稀释液进行定量时ddPCR的检测下限是qPCR的10倍。在低温、低营养状态,高产乙醇肺炎克雷伯菌第45天进入VBNC状态,通过PMA-ddPCR对VBNC状态细胞进行定量结果为(5.46±0.05)log10 DNA 拷贝数/ml。VBNC状态的乙醇产量为<2.2 mmol/L,复苏后恢复产乙醇能力。VBNC状态粪便模拟样品中ddPCR最低检测下限为3.2 log10 DNA拷贝数/ml。结论建立VBNC状态高产乙醇肺炎克雷伯菌的ddPCR检测方法灵敏度和适应性良好,可用于临床样品中VBNC状态细胞的检测。
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关键词
叠氮溴化丙锭-微液滴数字聚合酶链反应
活的非可培养状态
高产乙醇肺炎克雷伯菌
原文传递
PMA结合ddPCR检测食品中金黄色葡萄球菌的研究
被引量:
16
2
作者
赵丽青
王静
+4 位作者
秦燕
贾俊涛
姜英辉
唐静
张健
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2017年第1期105-109,共5页
研究了将叠氮溴化丙锭(PMA)与微滴式数字PCR(ddPCR)技术相结合,用于金黄色葡萄球菌活菌的检测。结果表明,强烈光照15 min,可以使PMA与死菌DNA共价交联,同时钝化游离的PMA;可以有效抑制金黄色葡萄球菌死菌DNAPCR扩增的PMA终浓度为2.0μg/...
研究了将叠氮溴化丙锭(PMA)与微滴式数字PCR(ddPCR)技术相结合,用于金黄色葡萄球菌活菌的检测。结果表明,强烈光照15 min,可以使PMA与死菌DNA共价交联,同时钝化游离的PMA;可以有效抑制金黄色葡萄球菌死菌DNAPCR扩增的PMA终浓度为2.0μg/m L;不抑制活菌DNA扩增的PMA最高浓度是5.0μg/m L。在不同死、活菌比例下,PMA-ddPCR可以定量检测活菌,避免了死菌DNA的干扰,本方法的检出限为10 copy/20μL。利用PMA-ddPCR检测人工污染鸡肉样品,最低可检出102cfu/m L的金黄色葡萄球菌。表明PMA-ddPCR方法的灵敏度高。
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关键词
叠氮溴化丙锭
微滴式数字PCR
金黄色葡萄球菌
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职称材料
水产品中副溶血性弧菌PMA-dd PCR活菌定量检测方法的研究
被引量:
8
3
作者
翁文川
管锦绣
+4 位作者
谢会
凌莉
陈文锐
冼钰茵
许喜林
《现代食品科技》
EI
CAS
北大核心
2019年第6期273-279,190,共8页
本研究旨在针对水产品中活的副溶血性弧菌建立一种快速定量的PCR检测方法。基于叠氮溴化丙锭(PMA)在一定光照条件下能抑制死亡菌DNA扩增,以及微滴式数字PCR技术能将检测精度扩展至单分子目标基因,并实现绝对定量的特点,以副溶血性弧菌tl...
本研究旨在针对水产品中活的副溶血性弧菌建立一种快速定量的PCR检测方法。基于叠氮溴化丙锭(PMA)在一定光照条件下能抑制死亡菌DNA扩增,以及微滴式数字PCR技术能将检测精度扩展至单分子目标基因,并实现绝对定量的特点,以副溶血性弧菌tlh基因为目的片段设计及筛选适合的特异性引物与探针,优化反应体系,通过对PMA浓度及曝光条件等优化,建立了一种联用PMA-ddPCR技术快速检测水产品中活的副溶血性弧菌的定量检测方法。研究结果显示:选择16μg/mL作为PMA工作浓度,曝光时间为8min,此条件下能够完全抑制副溶血性弧菌死菌的DNA扩增并对活菌扩增无影响。通过对比PMA-ddPCR和PMA-qPCR的检测低限分别为2×10^1cfu/mL、2×10^2cfu/mL,PMA-ddPCR法的灵敏度比PMA-qPCR法的高。应用PMA-ddPCR定量方法检测人工污染的基围虾和小帆立贝这两种海产品,在基围虾中最低可检出1.9×10^1cfu/g的副溶血性弧菌、在小帆立贝中最低可检出8.9cfu/g的副溶血性弧菌。该研究为将PCR技术实际应用于水产品中低量污染、活的副溶血性弧菌的定量检测奠定了基础。
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关键词
副溶血性弧菌
叠氮溴化丙锭
微滴式数字PCR
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职称材料
题名
PMA-ddPCR法检测活的非可培养状态高产乙醇肺炎克雷伯菌
1
作者
赵硕
窦晨镤
张建
袁静
机构
首都儿科研究所细菌学研究室
首都儿科研究所附属儿童医院神经外科
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期998-1003,共6页
基金
中国博士后基金(2023M742428)
2024年北京市博士后工作经费科研活动资助
+1 种基金
北京市朝阳区2023年度博士后科研基金
国家自然科学基金(82130065, 82104243)。
文摘
目的建立活的非可培养(VBNC)状态高产乙醇肺炎克雷伯菌的绝对定量方法。方法诱导高产乙醇肺炎克雷伯菌进入VBNC状态,评价乙醇产量。建立PMA-ddPCR方法通过单拷贝基因来计数高产乙醇肺炎克雷伯菌VBNC状态的活细胞基因拷贝数。进一步在VBNC状态粪便模拟中,评价ddPCR对低浓度样品检测的灵敏度和适应性。结果对高产乙醇肺炎克雷伯菌梯度稀释液进行定量时ddPCR的检测下限是qPCR的10倍。在低温、低营养状态,高产乙醇肺炎克雷伯菌第45天进入VBNC状态,通过PMA-ddPCR对VBNC状态细胞进行定量结果为(5.46±0.05)log10 DNA 拷贝数/ml。VBNC状态的乙醇产量为<2.2 mmol/L,复苏后恢复产乙醇能力。VBNC状态粪便模拟样品中ddPCR最低检测下限为3.2 log10 DNA拷贝数/ml。结论建立VBNC状态高产乙醇肺炎克雷伯菌的ddPCR检测方法灵敏度和适应性良好,可用于临床样品中VBNC状态细胞的检测。
关键词
叠氮溴化丙锭-微液滴数字聚合酶链反应
活的非可培养状态
高产乙醇肺炎克雷伯菌
Keywords
pma-ddpcr
Viable but non culturable state
HiAlc Kpn
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
PMA结合ddPCR检测食品中金黄色葡萄球菌的研究
被引量:
16
2
作者
赵丽青
王静
秦燕
贾俊涛
姜英辉
唐静
张健
机构
山东出入境检验检疫局
威海出入境检验检疫局
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2017年第1期105-109,共5页
基金
国家质检总局科研项目(2014IK114,2016IK198)
文摘
研究了将叠氮溴化丙锭(PMA)与微滴式数字PCR(ddPCR)技术相结合,用于金黄色葡萄球菌活菌的检测。结果表明,强烈光照15 min,可以使PMA与死菌DNA共价交联,同时钝化游离的PMA;可以有效抑制金黄色葡萄球菌死菌DNAPCR扩增的PMA终浓度为2.0μg/m L;不抑制活菌DNA扩增的PMA最高浓度是5.0μg/m L。在不同死、活菌比例下,PMA-ddPCR可以定量检测活菌,避免了死菌DNA的干扰,本方法的检出限为10 copy/20μL。利用PMA-ddPCR检测人工污染鸡肉样品,最低可检出102cfu/m L的金黄色葡萄球菌。表明PMA-ddPCR方法的灵敏度高。
关键词
叠氮溴化丙锭
微滴式数字PCR
金黄色葡萄球菌
Keywords
propidium monoazide(PMA)
droplet digital PCR(ddPCR)
Staphylococcus aureus
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
TS207 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
水产品中副溶血性弧菌PMA-dd PCR活菌定量检测方法的研究
被引量:
8
3
作者
翁文川
管锦绣
谢会
凌莉
陈文锐
冼钰茵
许喜林
机构
广东检验检疫技术中心
华南理工大学食品科学与工程学院
广州双螺旋基因技术有限公司
出处
《现代食品科技》
EI
CAS
北大核心
2019年第6期273-279,190,共8页
基金
广东省科技计划项目(2016A040403093)
广州市科技计划项目(201804010500)
文摘
本研究旨在针对水产品中活的副溶血性弧菌建立一种快速定量的PCR检测方法。基于叠氮溴化丙锭(PMA)在一定光照条件下能抑制死亡菌DNA扩增,以及微滴式数字PCR技术能将检测精度扩展至单分子目标基因,并实现绝对定量的特点,以副溶血性弧菌tlh基因为目的片段设计及筛选适合的特异性引物与探针,优化反应体系,通过对PMA浓度及曝光条件等优化,建立了一种联用PMA-ddPCR技术快速检测水产品中活的副溶血性弧菌的定量检测方法。研究结果显示:选择16μg/mL作为PMA工作浓度,曝光时间为8min,此条件下能够完全抑制副溶血性弧菌死菌的DNA扩增并对活菌扩增无影响。通过对比PMA-ddPCR和PMA-qPCR的检测低限分别为2×10^1cfu/mL、2×10^2cfu/mL,PMA-ddPCR法的灵敏度比PMA-qPCR法的高。应用PMA-ddPCR定量方法检测人工污染的基围虾和小帆立贝这两种海产品,在基围虾中最低可检出1.9×10^1cfu/g的副溶血性弧菌、在小帆立贝中最低可检出8.9cfu/g的副溶血性弧菌。该研究为将PCR技术实际应用于水产品中低量污染、活的副溶血性弧菌的定量检测奠定了基础。
关键词
副溶血性弧菌
叠氮溴化丙锭
微滴式数字PCR
Keywords
Vibrio parahaemolyticus
propidium monoazide (PMA)
droplet digital PCR (ddPCR)
分类号
TS254.7 [轻工技术与工程—水产品加工及贮藏工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PMA-ddPCR法检测活的非可培养状态高产乙醇肺炎克雷伯菌
赵硕
窦晨镤
张建
袁静
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
2
PMA结合ddPCR检测食品中金黄色葡萄球菌的研究
赵丽青
王静
秦燕
贾俊涛
姜英辉
唐静
张健
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2017
16
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
水产品中副溶血性弧菌PMA-dd PCR活菌定量检测方法的研究
翁文川
管锦绣
谢会
凌莉
陈文锐
冼钰茵
许喜林
《现代食品科技》
EI
CAS
北大核心
2019
8
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