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鸡PLA2G7基因编码蛋白的结构分析
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作者 吴铭茵 谢璐 +4 位作者 何静怡 陈钰婷 谢春琳 罗成龙 计坚 《广东畜牧兽医科技》 2025年第3期26-32,共7页
PLA2G7基因编码的脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)主要由炎症细胞分泌,与许多代谢、免疫功能障碍等疾病有关。该研究采用生物信息学方法从分子水平对鸡PLA2G7蛋白的理化性质、亲水性/疏水性、蛋白质结构、磷酸化位点及跨膜区等多方面进行... PLA2G7基因编码的脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)主要由炎症细胞分泌,与许多代谢、免疫功能障碍等疾病有关。该研究采用生物信息学方法从分子水平对鸡PLA2G7蛋白的理化性质、亲水性/疏水性、蛋白质结构、磷酸化位点及跨膜区等多方面进行结构分析,结合蛋白互作网络分析进行综合评价。结果表明:鸡PLA2G7基因全长1 923 bp,编码的蛋白质由641个氨基酸组成,主要分布于细胞质,属于亲水分泌型蛋白;二级结构以无规则卷曲(48.36%)为主,还有α-螺旋(31.36%)、延伸链(12.79%)和β-折叠(7.49%)形式组成。功能预测发现,该蛋白有46个潜在的磷酸化位点,其中29个可能是丝氨酸磷酸化位点。通过STRING蛋白互作网络推测,其与4个免疫反应和磷脂代谢相关蛋白存在互作关系。结论:PLA2G7基因编码蛋白的序列特征和结构揭示其可能与鸡的磷脂代谢调控以及免疫应答过程有密切关系,为进一步探讨Lp-PLA2的功能机理提供了理论依据。 展开更多
关键词 pla2g7基因 生物信息学 LP-PLA2
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PLA2G7基因在宫颈癌中的表达及与临床预后和免疫浸润的关系 被引量:2
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作者 王小燕 李虎玲 +1 位作者 张晶 王凯 《激光生物学报》 CAS 2022年第3期268-277,共10页
通过多种肿瘤数据库和生物信息学方法分析磷脂酶A2-Ⅶ(PLA2G7)的基因在宫颈癌中的表达与预后及免疫浸润的关系。利用cBioPortal、GEO、GEPIA2、TCGA数据库分析PLA2G7基因的遗传变异、表达情况及其与患者预后的关系。利用基因集富集分析(... 通过多种肿瘤数据库和生物信息学方法分析磷脂酶A2-Ⅶ(PLA2G7)的基因在宫颈癌中的表达与预后及免疫浸润的关系。利用cBioPortal、GEO、GEPIA2、TCGA数据库分析PLA2G7基因的遗传变异、表达情况及其与患者预后的关系。利用基因集富集分析(GSEA)和基因集变异分析(GSVA)方法研究TCGA中宫颈癌患者PLA2G7表达的生物学功能及参与的信号通路。通过TIMER数据库分析PLA2G7表达与免疫浸润细胞及其标记基因之间的相关性。结果显示:与正常宫颈组织相比,PLA2G7在宫颈肿瘤组织中高表达;PLA2G7的高表达显著富集在趋化因子信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、T细胞受体信号通路等免疫相关通路上;PLA2G7高表达与总生存期(OS)的延长相关(log-rank P=0.030);亚组分析表明,PLA2G7高表达在年老组、stageⅠ&stageⅡ和G3&G4中与较长的OS相关;PLA2G7表达与宫颈肿瘤组织中CD4^(+)T细胞、CD8^(+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平呈正相关,并与免疫细胞基因标记物CD86、CD115(CSF1R)、CD163、MS4A4A、CD11c(ITGAX)、CTLA4和TIM-3(HAVCR2)的表达存在强相关性。本研究表明,在宫颈癌患者中PLA2G7高表达可能是通过增强免疫细胞的募集信号通路、调节免疫浸润细胞的富集,从而改善宫颈癌患者的生存状况。这为PLA2G7作为宫颈癌诊断治疗及其预后评估的生物标志物提供了理论基础。 展开更多
关键词 pla2g7 宫颈癌 免疫浸润 预后
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Inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia decreases neuroinflammation after spinal cord injury
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作者 Wei Zhang Yubao Lu +6 位作者 Ruoqi Shen Yingjie Wu Chenrui Liu Xingxing Fang Liangming Zhang Bin Liu Limin Rong 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第10期2955-2968,共14页
Microglia,the resident monocyte of the central nervous system,play a crucial role in the response to spinal cord injury.However,the precise mechanism remains unclear.To investigate the molecular mechanisms by which mi... Microglia,the resident monocyte of the central nervous system,play a crucial role in the response to spinal cord injury.However,the precise mechanism remains unclear.To investigate the molecular mechanisms by which microglia regulate the neuroinflammatory response to spinal cord injury,we performed single-cell RNA sequencing dataset analysis,focusing on changes in microglial subpopulations.We found that the MG1 subpopulation emerged in the acute/subacute phase of spinal cord injury and expressed genes related to cell pyroptosis,sphingomyelin metabolism,and neuroinflammation at high levels.Subsequently,we established a mouse model of contusive injury and performed intrathecal injection of siRNA and molecular inhibitors to validate the role of ceramide synthase 5 in the neuroinflammatory responses and pyroptosis after spinal cord injury.Finally,we established a PC12-BV2 cell co-culture system and found that ceramide synthase 5 and pyroptosis-associated proteins were highly expressed to induce the apoptosis of neuron cells.Inhibiting ceramide synthase 5 expression in a mouse model of spinal cord injury effectively reduced pyroptosis.Furthermore,ceramide synthase 5-induced pyroptosis was dependent on activation of the NLRP3 signaling pathway.Inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia in vivo reduced neuronal apoptosis and promoted recovery of neurological function.Pla2g7 formed a“bridge”between sphingolipid metabolism and ceramide synthase 5-mediated cell death by inhibiting the NLRP3 signaling pathway.Collectively,these findings suggest that inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia after spinal cord injury effectively suppressed microglial pyroptosis mediated by NLRP3,thereby exerting neuroprotective effects. 展开更多
关键词 ceramide synthase 5 gasdermin D MICROGLIA NEUROINFLAMMATION NLRP3 nuclear factor kappa B pla2g7 PYROPTOSIS sphingomyelin metabolism spinal cord injury
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The cardioprotective mechanisms of draconis sanguis:An integrated network pharmacology,bioinformatics,and experimental validation study
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作者 Keyan Wang Rongxin Zhu +7 位作者 Junjun Li Binhua Yuan Xiang Li Yunlin Li Mingyue Huang Fangfang Rui Chun Li Wei Wang 《Journal of Traditional Chinese Medical Sciences》 2025年第3期336-347,共12页
Objective:To investigate the potential targets and mechanisms of Draconis Sanguis(DS),a valuable traditional Chinese medicine derived from the resin of the palm tree Daemonorops draco Bl(D.Sanguis,Xue Jie),in the trea... Objective:To investigate the potential targets and mechanisms of Draconis Sanguis(DS),a valuable traditional Chinese medicine derived from the resin of the palm tree Daemonorops draco Bl(D.Sanguis,Xue Jie),in the treatment of myocardial infarction(MI).Methods:We explored the potential mechanisms of DS in the treatment of MI using network pharmacology,bioinformatic techniques,and transcriptomic analysis,followed by validation through in vivo and in vitro experiments.Results:Network pharmacology and bioinformatic analyses identified five genes(Fpr1,Glul,Mme,Mmp9,and Pla2g7)as potential targets for MI treatment.Moreover,DS significantly ameliorated cardiac function,inflammatory responses,and MI-induced myocardial fibrosis in vivo.Transcriptomic and bioinformatic analyses identified Pla2g7 as the most critical target in the DS treatment of MI.Molecular docking revealed that the key active ingredient in DS has a strong affinity for this gene.Furthermore,DS reduced the expression of Pla2g7(P=.0009),NLRP3(P=.003),interleukin-18(P<.001),and interleukin-1b(P=.004)mRNAs in vivo.Conclusions:The results indicate that DS can downregulate the expression of Pla2g7 and reduce the inflammatory response.This demonstrates the potential therapeutic target of DS and the mechanism underlying its cardioprotective effects. 展开更多
关键词 Myocardial infarction Draconis sanguis Network pharmacology BIOINFORMATICS RNA-SEQ pla2g7
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血清Lp-PLA2对肺炎相关急性呼吸窘迫综合征诊断分级和预后评估的价值 被引量:3
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作者 杨玉嘉 董宝军 +3 位作者 屈金辉 黄津 白雪 杨宏伟 《临床检验杂志》 CAS 2024年第8期580-585,共6页
目的探讨脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)对肺炎相关急性呼吸窘迫综合征(p-ARDS)诊断分级和预后评估的价值。方法采用前瞻性观察研究设计,将2022年1月至2023年8月天津医院ICU连续收治的57例p-ARDS患者作为研究对象,选择同期普通呼吸病房收... 目的探讨脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)对肺炎相关急性呼吸窘迫综合征(p-ARDS)诊断分级和预后评估的价值。方法采用前瞻性观察研究设计,将2022年1月至2023年8月天津医院ICU连续收治的57例p-ARDS患者作为研究对象,选择同期普通呼吸病房收治的26例肺炎患者和10例体检健康者作为对照。收集3组人群的血清样本,其中p-ARDS组和肺炎组样本于患者入院24 h内获得,采用Luminex?多重检测试剂盒检测各组血清Lp-PLA2、IL-6和IL-8的表达水平。收集p-ARDS组和肺炎组患者基线资料以及入院血常规、生化指标、C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)和D-二聚体(D-dimer)等实验室资料。按照临床诊断、p-ARDS严重程度和28 d临床结局进行分组比较,通过绘制ROC曲线、Spearman相关分析和Logistic回归分析等方法评估Lp-PLA2对p-ARDS的诊断及预后价值。结果p-ARDS组血清Lp-PLA2水平显著高于肺炎组[(233.67±83.49)ng/mL vs(150.86±39.48)ng/mL,P<0.05],而肺炎组显著高于健康人对照组[(150.86±39.48)ng/mL vs(92.07±12.89)ng/mL,P<0.05]。ROC曲线分析结果显示,血清Lp-PLA2对p-ARDS和肺炎的鉴别能力优于IL-6、IL-8、CRP和PCT等指标,其ROC曲线下面积(AUCROC)为0.781(95%CI:0.685~0.878),Lp-PLA2与D-dimer联合的诊断价值更高(AUCROC=0.897,95%CI:0.832~0.963)。亚组分析发现,随着肺损伤加重,血清Lp-PLA2水平递增,Lp-PLA2与p-ARDS患者PaO2/FiO2比值呈负相关(r=-0.549),但与入院SOFA评分呈正相关(r=0.412)。与p-ARDS生存组相比,死亡组血清Lp-PLA2水平更高[(314.5±43.1)ng/mL vs(174.9±48.9)ng/mL,P<0.001];Logistic回归分析显示校正SOFA评分后,Lp-PLA2与28 d死亡风险独立相关(OR=1.099,95%CI:1.026~1.178,P=0.007),校正IL-8或PaO2/FiO2后可得到类似结果。结论血清Lp-PLA2可作为辅助p-ARDS诊断分级和预后评估的生物学标志物。 展开更多
关键词 急性呼吸窘迫综合征 肺炎 脂蛋白相关磷脂酶A2 血小板活化因子乙酰水解酶 pla2g7基因
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