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肺腺癌患者PLA2G1B表达情况与预后的相关性 被引量：1
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作者 朱中山 杨洲 +6 位作者 江承川 李小兵 任斗 黄橙 张维薇 李湘军 赵顺利 《昆明医科大学学报》 CAS 2022年第9期70-76,共7页
目的基于数据挖掘分析PLA2G1B基因在肺腺癌患者中的表达特征、预后特征、免疫特征以及潜在的治疗方案影响。方法通过对TCGA以及GEO数据库中的肺腺癌患者RNAseq表达谱数据以及临床信息进行分析,对比PLA2G1B高表达和低表达在肺腺癌患者的... 目的基于数据挖掘分析PLA2G1B基因在肺腺癌患者中的表达特征、预后特征、免疫特征以及潜在的治疗方案影响。方法通过对TCGA以及GEO数据库中的肺腺癌患者RNAseq表达谱数据以及临床信息进行分析,对比PLA2G1B高表达和低表达在肺腺癌患者的预后差异,并通过CIBERSORT计算患者的免疫细胞浸润程度,对比PLA2G1B高低表达组之间的浸润程度差异。并通过p RRophetic算法分析2组之间的药物敏感性差异。结果PLA2G1B基因在肺腺癌组织中相比癌旁表达量显著降低,且表达量越低其患者的预后总生存越差,在TCGA以及2个GEO的独立验证数据集中均表现出一致的统计学差异,经多因素校正之后证明PLA2G1B低表达为差预后的独立因素(P<0.05),且在预后较差的样本中其免疫浸润水平更低,主要表现为Bcellmemory,Tcell CD4+memoryresting,Monocyte,Myeloiddendriticcell,Mastcellactivated细胞类型。但差预后的样本对多种化疗药物的敏感性要显著更好。结论PLA2G1B低表达为肺腺癌独立的差预后风险因素,且低表达患者中整体免疫浸润水平显著更低。 展开更多
关键词 肺腺癌 pla2g1b 预后 数据挖掘 免疫浸润
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基于分子对接和药效团的磷脂酶PLA2G1B抑制剂的虚拟筛选
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作者 王玉婷 刘霞 +2 位作者 彭媛媛 王潇婕 赵琳静 《上海工程技术大学学报》 CAS 2022年第3期295-300,共6页
磷脂酶PLA2G1B与饮食诱导肥胖及相关代谢紊乱密切联系,研究表明一些天然类黄酮化合物对磷脂酶有抑制作用.采用整合分子对接和药效团策略筛选PLA2G1B靶向小分子抑制剂.对5种类黄酮化合物与PLA2G1B靶标进行分子模拟对接,分析其相互作用,... 磷脂酶PLA2G1B与饮食诱导肥胖及相关代谢紊乱密切联系,研究表明一些天然类黄酮化合物对磷脂酶有抑制作用.采用整合分子对接和药效团策略筛选PLA2G1B靶向小分子抑制剂.对5种类黄酮化合物与PLA2G1B靶标进行分子模拟对接,分析其相互作用,建立基于配体分子共同特征(HipHop)的药效团模型,应用该模型对ZINC数据库中小分子化合物进行筛选,并对匹配评分良好的化合物进行类药性和药代动力学性质(ADME)预测分析.结果表明,山柰酚、木犀草素、槲皮素、杨梅素和表没食子儿茶素没食子酸酯与PLA2G1B均能较好结合,结合能为-7.17~-6.17 kJ/mol;所构建的药效团模型含有3个氢键供体和1个氢键受体4个特征元素;通过对ZINC数据库中10897个小分子的筛选,共得到722个分子,命中率为6.6%.其中匹配评分>2.5的29个化合物均满足Lipinski规则,大部分化合物的ADME参数良好.研究结果为PLA2G1B抑制剂设计及先导化合物发现提供了参考数据. 展开更多
关键词 pla2g1b抑制剂 类黄酮 分子对接 药效团 虚拟筛选
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