一个常染色体显性多囊肾家系PKD1/PKD2基因突变的鉴定 被引量：1

1

作者 王琛 黄杰 +1 位作者 孔祥阳 袁红伶 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第12期1713-1715,共3页

常染色体显性多囊肾（autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD）是一种常染色体延迟性显性疾病。ADPKD具有遗传异质性,85%的患者由多囊肾基因1（polycystic kidney disease gene 1,PKD1）突变所致,称Ⅰ型多囊肾,15%的患者... 常染色体显性多囊肾（autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD）是一种常染色体延迟性显性疾病。ADPKD具有遗传异质性,85%的患者由多囊肾基因1（polycystic kidney disease gene 1,PKD1）突变所致,称Ⅰ型多囊肾,15%的患者由多囊肾基因2（polycystic kidney disease gene 2,PKD2）突变所致,Ⅱ型多囊肾。除了损伤肾脏以外,ADPKD基因还累及全身多个器官. 展开更多

关键词 多囊肾 pkd1/pkd2 常染色体 ADpkd 动脉血管瘤 延迟性 autosomal 基因突变 测序技术 Sanger

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PKD1和PKD2在结直肠癌中的表达及临床意义 被引量：1

2

作者 杨震 宋金丽 胡博 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2024年第11期1095-1099,共5页

目的探讨结直肠癌组织中PKD1和PKD2的表达及临床意义。方法收集黑龙江省林业第二医院2019年1月至2020年12月收治的90例结直肠癌患者的癌组织及对应癌旁组织。免疫组化染色法检测PKD1和PKD2的表达,分析PKD1和PKD2表达与结直肠癌临床病理... 目的探讨结直肠癌组织中PKD1和PKD2的表达及临床意义。方法收集黑龙江省林业第二医院2019年1月至2020年12月收治的90例结直肠癌患者的癌组织及对应癌旁组织。免疫组化染色法检测PKD1和PKD2的表达,分析PKD1和PKD2表达与结直肠癌临床病理特征的关系。Kaplan-Meire法绘制生存曲线,生存差异行Log-rank检验。Cox风险比例回归模型分析影响结直肠癌预后的因素。结果结直肠癌组织中PKD1阳性率为72.2%(65/90),高于癌旁组织的31.1%(28/90),差异有统计学意义(P<0.05);PKD2阳性率为66.7%(60/90),高于癌旁组织的33.3%(30/90),差异有统计学意义(P<0.05)。PKD1、PKD2表达与分化程度、TNM分期、浸润深度和淋巴结转移有关(P<0.05)。Kaplan-Meier分析显示,PKD1阴性患者中位总生存(OS)为34.0个月(31.5~36.0个月),显著高于PKD1阳性患者的20.0个月(17.3~26.7个月),差异有统计学意义(P<0.05)。PKD2阴性患者中位OS为33.0个月(25.6~36.2个月),显著高于PKD2阳性患者的21.0个月(19.1~27.2个月),差异有统计学意义(P<0.05)。多因素Cox风险比例回归模型分析显示,分化程度、TNM分期、淋巴结转移、PKD1表达和PDK2表达是影响结直肠癌患者OS的独立因素(P<0.05)。结论结直肠癌组织中PKD1和PKD2高表达,PKD1和PKD2阳性表达可作为评估结直肠癌患者预后不良的独立因素。 展开更多

关键词 结直肠癌 pkd1 pkd2 预后

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常染色体显性遗传性多囊肾家系PKD1、PKD2基因突变分析 被引量：8

3

作者 骆杰伟 孟晓嵘 +5 位作者 郑星宇 魏世超 胡丹 杨笑 张雪梅 范丁前 《肾脏病与透析肾移植杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期321-325,336,共6页

目的:分析常染色体显性遗传性多囊肾病(ADPKD)家系基因突变位置及遗传特征。方法:应用二代测序外显子序列捕获技术,对ADPKD家系先证者PKD1、PKD2基因测序,并对8个家系成员针对突变位点进行Sanger测序筛查。并经SIF和Polyphen软件对基因... 目的:分析常染色体显性遗传性多囊肾病(ADPKD)家系基因突变位置及遗传特征。方法:应用二代测序外显子序列捕获技术,对ADPKD家系先证者PKD1、PKD2基因测序,并对8个家系成员针对突变位点进行Sanger测序筛查。并经SIF和Polyphen软件对基因突变进行蛋白功能预测。结果:发现PKD1基因1个框移突变c.2085_2086ins C(p.Ala696Argfs17X)为杂合子,造成PKD1氨基酸编码提前终止,很可能影响其蛋白功能;还发现2个错义突变杂合子(p.Ala1447Val和P.Arg739Gln,经蛋白功能预测为无害)及2个同义变异(p.Leu373Leu、p.Asn890Asn)。PKD2基因未发现框移、无义、剪切、错义或同义变异位点。其他患病的家系成员中发现p.Ala696Argfs17X突变,而正常成员中未查出此突变。结论:推测PKD1基因的框移突变(p.Ala696Argfs17X)为此家系的可疑致病性突变。 展开更多

关键词 常染色体显性遗传性多囊肾 pkd1基因 pkd2基因 突变

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哮喘小鼠C7-T5节段脊髓后角PKD1与PKD2的表达研究 被引量：1

4

作者 张宝辉 方秀斌 刘晓湘 《解剖学研究》 CAS 2013年第5期368-371,共4页

目的探讨在哮喘发病中,蛋白激酶D1、蛋白激酶D2(protein kinase D1,D2,PKD1,PKD2)在哮喘小鼠C7-T5节段脊髓后角内的表达变化。方法 BALB/c小鼠20只,按随机数字表法均分为正常对照组和哮喘组,利用AniRes2005肺功能仪测小鼠气道阻力、免... 目的探讨在哮喘发病中,蛋白激酶D1、蛋白激酶D2(protein kinase D1,D2,PKD1,PKD2)在哮喘小鼠C7-T5节段脊髓后角内的表达变化。方法 BALB/c小鼠20只,按随机数字表法均分为正常对照组和哮喘组,利用AniRes2005肺功能仪测小鼠气道阻力、免疫荧光方法和Western blot方法检测各组小鼠C7-T5节段脊髓后角内PKD1,PKD2的表达变化。结果哮喘组小鼠吸气阻力和呼气阻力明显高于正常组(P<0.01),哮喘模型建立成功。免疫荧光结果显示哮喘组C7-T5节段脊髓后角内PKD1,PKD2阳性产物的平均光密度值(MOD)显著高于正常对照组(P<0.01),western blot方法检测也得到了相同的结果。结论哮喘小鼠C7-T5节段脊髓后角内PKD1,PKD2的表达升高。 展开更多

关键词 哮喘 驱动蛋白-1 脊髓后角 小鼠

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遗传性多囊肾家系PKD1、PKD2基因突变探讨与研究 被引量：4

5

作者 李新伟 张群芝 《中国优生与遗传杂志》 2017年第10期10-11,共2页

目的对常染色体显性遗传多囊肾的PKD1、PKD2基因突变问题进行研究分析。方法采用二代外显子测序序列捕获技术,对常染色体显性遗传显性遗传性多囊肾系家族PKD1、PKD2基因进行测序,同时对8个家系的成员针对性的对基因突变的位点采取Sange... 目的对常染色体显性遗传多囊肾的PKD1、PKD2基因突变问题进行研究分析。方法采用二代外显子测序序列捕获技术,对常染色体显性遗传显性遗传性多囊肾系家族PKD1、PKD2基因进行测序,同时对8个家系的成员针对性的对基因突变的位点采取Sanger测序筛查,对通过Polyphen软件和SIF软件对基因突变的粗劣进行蛋白功能的测定。结果研究结果发现,PKD1基因存在一个框移突变C.2085-2086ins C为杂合子,这种氨基酸编码序列提前终止的现象既有可能影响蛋白质的功能;研究还发现存在两个错意突变杂合子,分别为p.Ala1447Val、p.Arg739Gln,其通过蛋白功能的检测初步预测其无害,同时还有两个同义变异,分别为p.Leu373Leu和p.Asn890Asn;而PKD2为基因为发现有框移突变、剪切、无义以及同义变异和措意变异等发生。同时发现在患病的家族成员中存在一个框移突变p.Ala696Argfs17X。正常的家族成员中未见此突变。结论研究初步发现,p.Ala696Argfs17X突变可能是导致常染色体显性遗传性多囊肾病的可疑治病突变。 展开更多

关键词 pkd1基因 pkd2基因 常染色体显性遗传多囊肾 临床意义

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常染色体显性成人多囊肾病两家系PKD1、PKD2基因的突变鉴定 被引量：4

6

作者 余朝文 杨元 张思仲 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期485-489,共5页

目的鉴定两个常染色体显性成人多囊。肾病家系的致病突变。方法采用酚氯仿法提取家系成员及无亲缘关系的100名健康对照个体的外周血白细胞DNA，PCR扩增先证者致病基因PKD1、PKD2的所有外显子序列及其侧翼内含子剪切区域，直接测序确定DN... 目的鉴定两个常染色体显性成人多囊。肾病家系的致病突变。方法采用酚氯仿法提取家系成员及无亲缘关系的100名健康对照个体的外周血白细胞DNA，PCR扩增先证者致病基因PKD1、PKD2的所有外显子序列及其侧翼内含子剪切区域，直接测序确定DNA序列的变异。通过家系和正常对照的比较分析，对检测到的变异是否与疾病相关进行了初步探讨。结果在两个家系中共检测到5个序列变异：PKD1：c．2469G〉A，PKD1：c．5014_5015delAG，PKDl：C．10529C〉T，PKD2：c．568G〉A和PKD2：c．2020_12020delAG。其中PKD1：c．2469G〉A和PKD2：c．2020—1_2020delAG为新发现的变异。此外，检测到的移码突变和剪切突变未见于家系中健康成员及无亲缘关系的正常对照。结论PKDl：c．50145015 delAG和PKD2：c．2020-1_2020delAG分别为家系A和B的致病突变，且PKD2：c．2020-1_2020 delAG为先证者新发生的突变。 展开更多

关键词 常染色体显性成人多囊肾病 pkd1基因 pkd2基因 新生突变

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两个成人型多囊肾伴男性不育家系的PKD1基因突变分析 被引量：1

7

作者 冯宗刚 魏磊 谭丽 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2018年第3期376-379,共4页

目的探讨两个常染色体显性遗传多囊肾伴男性不育（adult polycystic kidney disease，ADPKD）家系的遗传学病因，为遗传咨询及产前诊断提供依据。方法应用直接测序法对2个ADPKD家系进行PKDl和PKD2基因的突变检测，对可疑致病突变进行家... 目的探讨两个常染色体显性遗传多囊肾伴男性不育（adult polycystic kidney disease，ADPKD）家系的遗传学病因，为遗传咨询及产前诊断提供依据。方法应用直接测序法对2个ADPKD家系进行PKDl和PKD2基因的突变检测，对可疑致病突变进行家系分析及生物信息学分析，并在50名正常对照者中进行突变筛查。结果测序结果显示家系1先证者及另外3例患者的PKD1基因第16外显子存在c．6953—6977del（P．Arg2318Hisfs＊15）杂合突变，2名表型正常的家系成员未检测到该位点突变。家系2先证者和另3例患者的PKD1基因第37外显子存在c．10937T〉G（P．Val3646Gly）杂合突变，而2名表型正常的家系成员未检测到突变。经检索人类基因突变数据库（HGMD）这2个突变均为未报道过的新突变。通过家系分析及生物信息学分析结果显示这2个突变为致病突变的可能性大。在50名正常对照者未检测到该突变。结论PKD1基因C．6953—6977del（P．Arg2318Hisfs＊15）和C．10937T〉G（P．Val3646Gly）突变可能为这2个家系的致病原因，本研究结果丰富了PKD1基因突变谱及ADPKD表型谱，为家系遗传咨询和产前诊断提供了依据。 展开更多

关键词 成人型多囊肾 男性不育 pkd1基因 pkd2基因

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应用改良的方法检测常染色体显性遗传多囊肾基因突变 被引量：3

8

作者 张明超 刘帅妹 +4 位作者 何群鹏 朱培冉 李卫巍 吴秋月 夏欣一 《肾脏病与透析肾移植杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期347-351,共5页

目的:常染色体显性遗传性多囊肾(ADPKD)是常见的遗传性肾脏疾病,主要是由PKD1和PKD2基因突变引起的。其中,PKD1包含46个外显子,编码区域大概为13 kb,而PKD2有约3 kb的编码区域,含有15个外显子。然而传统的ADPKD基因检测方法繁琐、费时,... 目的:常染色体显性遗传性多囊肾(ADPKD)是常见的遗传性肾脏疾病,主要是由PKD1和PKD2基因突变引起的。其中,PKD1包含46个外显子,编码区域大概为13 kb,而PKD2有约3 kb的编码区域,含有15个外显子。然而传统的ADPKD基因检测方法繁琐、费时,本研究即旨在建立方便快捷的突变筛查方法。方法:根据临床和实验室检查入选3个互不相关的中国汉族ADPKD家系。利用新一代测序技术(NGS),针对PKD1和PKD2外显子,剪接位点和10 bp内含子侧翼序列进行基因芯片捕获,检出的变异经过筛选,并与单核苷酸多肽数据库进行比对。结果:通过与人类基因突变数据库核对,本研究新鉴定的PKD1中c.7318del G,c.5884C>T和继往报道的PKD2中c.916C>T杂合变异可能是这3个家系的致病性突变。PCR联合Sanger序列分析证实家系中上述杂合突变的存在,在家系中呈现基因型与表现型共分离;并分别导致PKD1编码的氨基酸发生移码(p.Asp2440Thrfs*180)及无义突变引发PKD1(p.Gln1962*)和PKD2(p.Arg306*)蛋白的提前中止。结论:我们利用NGS技术建立了快速分析ADPKD遗传变异的方法,并成功应用于3个家系,鉴定两个新发突变,可作为疑似ADPKD及家系成员的常规筛查手段。 展开更多

关键词 常染色体显性遗传性多囊肾 pkd1 pkd2 新一代测序技术

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脊髓小脑共济失调3型伴多囊肾家系的临床特征和基因突变分析

9

作者 李海江 张林明 +3 位作者 陈涛 杨丹 朱杨帆 王丽红 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期60-63,共4页

目的对1个脊髓小脑共济失调3型（spinocerebellar ataxia3，SCA3）伴多囊肾病（polycystic kidney disease，PKD）家系的临床特征和致病基因突变进行研究。方法应用PCR扩增、DNA测序等技术分析该家系成员SCA3基因第10外显子，PKDI、PKD... 目的对1个脊髓小脑共济失调3型（spinocerebellar ataxia3，SCA3）伴多囊肾病（polycystic kidney disease，PKD）家系的临床特征和致病基因突变进行研究。方法应用PCR扩增、DNA测序等技术分析该家系成员SCA3基因第10外显子，PKDI、PKD2基因所有外昆子及荩邻近DNA系列片段，同时分析该家系患者的临床特征。结果先证者SCA3基因CAG重复次数为28／76，一个等位基因的重复次数在全突变范围，其PKDl基因第23外显子发现序列异常。先证者临床症状严重，表现为严重的共济失调、锥体柬征、Meige综合征、抑郁症和高血压。结论遗传性脊髓小脑共济失调3型和常染色体最性多囊肾病可同时发生在一个家系，基因检测是主要的确诊于段。 展开更多

关键词 脊髓小脑共济失调 多囊肾 三核苷酸重复 SCA3/MJD基因 pkd1基因 pkd2基因 突变

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64个常染色体显性多囊肾病家系的基因检测及产前诊断

10

作者 王莉 李晶晶 +6 位作者 徐菁晗 白莹 孙玥 段会坤 孙阁阁 赵干业 孔祥东 《中华肾脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期903-911,共9页

目的检测和分析64个无亲缘关系的常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)家系的基因变异类型,探讨多种基因分析技术的检测效能和基因变异特点。方法该研究为横断面研究,回顾性分析2017年12月至2020... 目的检测和分析64个无亲缘关系的常染色体显性多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)家系的基因变异类型,探讨多种基因分析技术的检测效能和基因变异特点。方法该研究为横断面研究,回顾性分析2017年12月至2020年8月就诊于郑州大学第一附属医院肾脏内科或遗传与产前诊断中心的64个ADPKD家系的临床资料,采集先证者和家系成员血样,应用二代测序对先证者进行基因检测,对筛选出的可疑变异通过多重连接依赖式探针扩增或长片段PCR结合Sanger测序进一步验证。抽取高风险家系胎儿绒毛或羊水样本,排除母源污染后进行产前基因诊断。结果64个ADPKD家系中有57个家系(89.06%)检测到PKD1/PKD2基因变异,其中51个家系(79.69%)共检出49种PKD1/PKD2基因致病性/可能致病性变异,包含14种(28.57%)无义变异、14种(28.57%)移码变异、11种(22.45%)错义变异、5种(10.20%)剪接变异和5种(10.20%)缺失变异,PKD1和PKD2基因变异分别占87.76%(43/49)和12.24%(6/49)。共检测到14种PKD1/PKD2基因新变异,包含7种移码变异、3种剪接变异、2种无义变异、1种缺失变异和1种错义变异,其中11种为PKD1基因变异,3种为PKD2基因变异。来自17个家系的20例高风险胎儿接受了产前基因诊断,6例胎儿检出PKD1基因杂合变异,14例胎儿未检出PKD1/PKD2基因变异。结论联合应用二代测序、多重连接依赖式探针扩增及长片段PCR结合Sanger测序可对ADPKD家系进行快速、高效和准确的基因诊断。PKD1/PKD2基因变异均以点突变最为常见。14种PKD1/PKD2基因新变异的检出丰富了其基因变异谱,可为ADPKD家系的遗传咨询和产前诊断提供依据。 展开更多

关键词 多囊肾 常染色体显性 高通量核苷酸序列测序 产前诊断 pkd1基因 pkd2基因

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常染色体显性多囊肾病的基因诊断与产前诊断 被引量：5

11

作者 邱碧原 杨季云 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2019年第5期419-423,共5页

目的研究常染色体显性遗传多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)的遗传病因,为家系的遗传咨询和产前诊断提供理论依据.方法应用芯片捕获高通量测序检测17例先证者PKD1、PKD2基因,通过多个突变数据库过滤及生... 目的研究常染色体显性遗传多囊肾病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)的遗传病因,为家系的遗传咨询和产前诊断提供理论依据.方法应用芯片捕获高通量测序检测17例先证者PKD1、PKD2基因,通过多个突变数据库过滤及生物信息学分析,并采用Sanger测序进行家系验证.对其中一个家系行产前基因诊断.结果17例先证者中检出14个PKD1突变,3个PKD2突变,包括6个错义突变、4个无义突变、7个移码突变.其中,8个突变位点已报道与ADPKD相关,9个突变位点未报道过:PKD1:c.7625G>T(p.Gly2542Val),c.3673C>T(p.Gln1225*),c.11048dupT(p.Thr3684Aspfs*38),c.9083_9084delAG(p.Glu3028Glyfs*40),c.10560delG(p.Pro3521 Hisfs*6),c.7952_7974 delTGTCCCTGAGGGTCCACACTGTG(p.Va12651Glyfs*2);PKD2:c.662T>G(p.Leu221*),c.1202_1203 insCT(p.Glu401Aspfs*2),c.919 delA(p.Ser307Valfs*10).1个家系的产前基因检测结果显示胎儿未携带与先证者相同的突变.结论明确了17个ADPKD家系的遗传病因,鉴定了PKD1、PKD2基因的9个未曾报道的新突变,丰富了ADPKD基因突变谱,为其遗传咨询和生育指导提供了理论依据.并成功对1个家系进行了产前诊断. 展开更多

关键词 常染色体显性遗传多囊肾病 高通量测序 pkd1基因 pkd2基因 产前诊断

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