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Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析 被引量：18
1
作者 孙铮 马亮 +2 位作者 MURPHY Robert 张宪省 黄大卫 《中国科学（C辑）》 CSCD 北大核心 2009年第10期948-953,共6页
本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式，并推测影响其密码子组成的因素．选择了478条蛋白编码基因作为研究对象，它们的GC含量比较低，约0．282～0．432．本研究结果显示，关联突变（contex... 本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式，并推测影响其密码子组成的因素．选择了478条蛋白编码基因作为研究对象，它们的GC含量比较低，约0．282～0．432．本研究结果显示，关联突变（context-dependent mutation）是影响W.pipientis wMel基因组密码子组成的主要因素．同时，Nc—Plot曲线显示，基因组的密码子组成还受到了核苷酸组成偏好性（nucleotide composition bias）的影响．对应分析的结果显示，基因长度（R=0．123，P〈0．01）和基因表达水平（R=-0．312，P〈0．01）也对基因组的密码子使用偏好性起到了一定的作用．因此，关联突变、核苷酸组成、基因长度和基因表达水平都会影响到基因组的密码子使用偏好性．Wolbachia基因组的几个特征和动物线粒体基因组具有较高的相似性，而且现在已有报道说明它们有共同的起源，但仍需进一步验证． 展开更多
关键词 Wolbaehia pipientis wMel 密码子使用 对应分析 关联突变
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