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猪PID1基因CDS区的克隆及其mRNA表达与肌内脂肪沉积关系 被引量:21
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作者 钱源 曾勇庆 +5 位作者 杜金芳 崔景香 李华 陈其美 宋一萍 陈伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1153-1158,共6页
为了探索PID1(Phosphotyrosine interaction domain containing1)基因的表达与脂肪沉积的关系,文章利用兼并引物进行RT-PCR从猪脂肪和肌肉组织中克隆PID1基因CDS(Coding region)区全序列,并采用荧光定量PCR方法对大白猪、鲁莱黑猪、莱芜... 为了探索PID1(Phosphotyrosine interaction domain containing1)基因的表达与脂肪沉积的关系,文章利用兼并引物进行RT-PCR从猪脂肪和肌肉组织中克隆PID1基因CDS(Coding region)区全序列,并采用荧光定量PCR方法对大白猪、鲁莱黑猪、莱芜猪3个猪品种的肝脏、脂肪和肌肉组织PID1基因mRNA表达进行了相对定量分析。结果表明:经克隆、测序,得到了猪PID1基因654bp全编码区序列,通过Blast比对,与人、大鼠、牛有93.88%、66.94%、88.07%的同源性。PID1基因在同一个品种猪中mRNA表达水平总体表现为:肝脏>脂肪>肌肉。在不同品种3种组织中PID1基因mRNA表达水平总体表现为:莱芜猪>鲁莱黑猪>大白猪,其中肝脏中差异显著(P<0.05),但是在脂肪和肌肉组织中莱芜猪与鲁莱黑猪差异不显著(P>0.05)。对于高肌内脂肪(LWH)、中等肌内脂肪(LWI)和低肌内脂肪(LWL)沉积的3组莱芜猪,PID1基因在肝脏组织中的表达水平是LWH显著高于LWL(P<0.05),在肌肉组织中则是LWH显著高于LWI和LWL(P<0.05)。PID1基因在莱芜猪品种内3个组织中mRNA表达量与IMF含量相关均不显著,而在品种间3个组织中mRNA表达量与IMF含量呈显著正相关(P<0.05)。结果提示:PID1的表达可能与脂肪沉积性状存在一定的关系。 展开更多
关键词 pid1基因 组织表达 肌内脂肪
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莱芜猪PID1基因的功能分析及表达谱研究 被引量:17
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作者 钱源 曾勇庆 +4 位作者 崔景香 陈其美 宋一萍 杜金芳 陈伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期621-628,共8页
为进一步了解莱芜猪PID1基因的结构和功能,本研究以莱芜猪为试验对象,分析PID1基因的结构和功能,并利用SYBR-Green实时荧光定量PCR方法,分析该基因在莱芜猪10个不同组织(心脏、背最长肌、脾脏、肝脏、肺脏、小肠、大肠、脑、脂肪、脊髓... 为进一步了解莱芜猪PID1基因的结构和功能,本研究以莱芜猪为试验对象,分析PID1基因的结构和功能,并利用SYBR-Green实时荧光定量PCR方法,分析该基因在莱芜猪10个不同组织(心脏、背最长肌、脾脏、肝脏、肺脏、小肠、大肠、脑、脂肪、脊髓)的表达谱信息。生物信息学分析表明:PID1基因编码含217个氨基酸的蛋白,其定位在细胞质,无跨膜结构,为非分泌蛋白,具有亲水性,分子量为54ku,等电点为5.11,二级结构中α螺旋占很大的比例,PID1的C端有一PTB(磷酸酪氨酸作用位点)结构域,与人和黑猩猩的亲缘关系较近。组织表达谱分析结果显示该基因在大多数组织中均有表达,其在各组织中的mRNA表达丰度表现为:心脏>脑>肝脏>脂肪>背最长肌>肺脏>脊髓>大肠>脾脏,而在小肠中未见明显表达。结果提示:PID1可能与胰岛素信号途径有关,并可能调控GLUT4基因的表达,呈现多组织表达特征,提示其调节目的基因转录具有广泛性。 展开更多
关键词 莱芜猪 pid1基因 生物信息学 表达谱
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RNA干扰沉默PID1基因肉兔模型的构建 被引量:5
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作者 徐正刚 杨伦 +5 位作者 曾勇庆 张哲 陈伟 杨云 房国锋 王守栋 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期750-756,共7页
为进一步研究PID1基因的功能,本试验在前期构建并筛选得到的高效PID1RNA干扰表达载体pGPU6/GFP/Neo-PID1-2的基础上,利用精子介导法制备RNA干扰PID1转基因肉兔模型。对繁殖的F1代肉兔个体进行活体荧光检测、PCR、RT-PCR和Western blot检... 为进一步研究PID1基因的功能,本试验在前期构建并筛选得到的高效PID1RNA干扰表达载体pGPU6/GFP/Neo-PID1-2的基础上,利用精子介导法制备RNA干扰PID1转基因肉兔模型。对繁殖的F1代肉兔个体进行活体荧光检测、PCR、RT-PCR和Western blot检测,并对不同组别(阳性组、阴性组和空白对照组)体重达3.0kg左右的F1代肉兔抽样屠宰进行肌内脂肪的测定。研究结果表明:外源基因和绿色荧光蛋白基因(GFP)在转基因兔后代中可成功表达,试验组得到F1代个体106只,其中阳性兔7只,转基因阳性率为6.60%。PID1基因RNAi阳性兔与阴性兔、空白对照兔相比,RT-PCR检测PID1基因mRNA表达量显著降低(P<0.05),Western blot测得PID1蛋白表达水平呈下降趋势,肌内脂肪的含量显著降低(P<0.05);综上表明,PID1基因与肌内脂肪沉积密切相关。本研究从RNAi肉兔模型构建的角度进一步验证了PID1基因对肌内脂肪沉积影响的功能,也为下一步研究制备高肌内脂肪优质PID1转基因猪奠定了基础。 展开更多
关键词 新西兰肉兔 pid1基因 RNA干扰 肌内脂肪
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山羊PID1基因组织表达谱及其与肌内脂肪含量的相关性 被引量:2
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作者 殷捷 凌英会 +3 位作者 丁建平 王丽娟 张运海 章孝荣 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期784-789,共6页
为探索调控山羊脂肪沉积的关键基因表达规律,筛选影响山羊育肥性状的候选基因,选取0月龄、6月龄和12月龄安徽白山羊,屠宰后取背最长肌、腿肌和胸肌检测肌内脂肪含量,用荧光定量RT-PCR分析磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)在安徽白山羊... 为探索调控山羊脂肪沉积的关键基因表达规律,筛选影响山羊育肥性状的候选基因,选取0月龄、6月龄和12月龄安徽白山羊,屠宰后取背最长肌、腿肌和胸肌检测肌内脂肪含量,用荧光定量RT-PCR分析磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)在安徽白山羊的心、肝、脾、肺、肾、小肠、脂肪、腿肌、背最长肌和胸肌等组织中mRNA的发育性变化。随着月龄的增加,肌内脂肪含量持续上升;同月龄背最长肌肌内脂肪含量显著高于腿肌和胸肌(P<0.05)。PID1基因在心、肝、脾、肺、肾、小肠、脂肪、腿肌、背最长肌和胸肌中均有不同程度的表达,12月龄脂肪组织中的表达水平大于6月龄脂肪组织中的表达水平,且PIDI基因表达水平与背最长肌肌内脂肪含量呈显著相关(r=0.968,P<0.05)。说明PID1基因与脂肪沉积性状显著相关,是影响肉羊育肥性状的候选基因。 展开更多
关键词 山羊 肌内脂肪 pid1基因 表达 脂肪沉积
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RNA干扰沉默PID1基因在C2C12细胞中表达的研究 被引量:3
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作者 杨伦 徐正刚 +6 位作者 王慧 陈其美 陈伟 胡艳霞 石元 祝洪磊 曾勇庆 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期36-42,共7页
构建和筛选对PID1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因有RNA干扰作用的PID1-shRNA表达载体。据小鼠PID1 cDNA序列,优化设计了4条shRNA及1条阴性干扰序列,插入pGPU6/GFP/Neo载体中,得到pGPU6/GFP/Neo-PID1-1、pG... 构建和筛选对PID1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因有RNA干扰作用的PID1-shRNA表达载体。据小鼠PID1 cDNA序列,优化设计了4条shRNA及1条阴性干扰序列,插入pGPU6/GFP/Neo载体中,得到pGPU6/GFP/Neo-PID1-1、pGPU6/GFP/Neo-PID1-2、pGPU6/GFP/Neo-PID1-3、pGPU6/GFP/Neo-PID1-4和pGPU6/GFP/Neo-PID1-NC。干扰载体转染C2C12细胞,以RT-PCR和Western blot技术检测shRNA对C2C12细胞中PID1 mRNA和蛋白表达的下调作用。结果表明:靶向PID1基因的4个shRNA重组质粒载体经测序分析,其shRNA编码序列与预期设计的完全一致,经酶切鉴定和测序分析证实,靶向PID1基因的shRNA重组质粒载体构建成功。进一步将构建的4个表达载体分别转染C2C12细胞,24 h后细胞中PID1基因mRNA表达水平依次下调(23.58±1.87)%、(75.44±0.77)%、(70.52±0.41)%和(56.60±3.13)%。48 h后细胞中PID1蛋白表达水平依次降低(30.15±5.05)%、(71.86±4.85)%、(67.93±2.28)%和(56.81±2.01)%。所筛选出的pGPU6/GFP/Neo-PID1-2、pGPU6/GFP/Neo-PID1-3和pGPU6/GFP/Neo-PID1-4三个表达载体均能高效地抑制转染细胞PID1 mRNA和蛋白的表达,为进一步研究PID1基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 小鼠 pid1基因 RNA干扰 表达载体
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白洗猪PID1基因克隆及序列分析 被引量:2
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作者 冯文武 孙振梅 +4 位作者 李鹏程 丁玫 许厚强 赵佳福 陈祥 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第4期906-912,共7页
本研究旨在对白洗猪磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因进行克隆和生物信息学分析。采用Nest PCR及T克隆技术对白洗猪PID1基因进行克隆测序,运用生物学分析软件分析其结构功能及其在种... 本研究旨在对白洗猪磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID1)基因进行克隆和生物信息学分析。采用Nest PCR及T克隆技术对白洗猪PID1基因进行克隆测序,运用生物学分析软件分析其结构功能及其在种内及种间的遗传进化关系。结果表明,白洗猪PID1基因CDS区全长654bp,编码217个氨基酸,白洗猪与山东莱芜猪、广西陆川猪PID1蛋白氨基酸同源性为98.2%与97.7%;进化树分析结果表明白洗猪与两个猪种间遗传关系相对较远,种间比对黄牛、牦牛、猕猴、小鼠、眼镜王蛇、人、原鸡、非洲爪蟾、大鼠和斑马鱼PID1蛋白氨基酸同源性依次为96.6%、96.6%、96.3%、95.0%、93.9%、91.7%、90.8%、88.2%、69.7%和67.3%;系统进化树分析表明PID1基因在多物种之间的进化高度保守,结构功能分析表明白洗猪PID1基因功能区主要是编码链氨基酸C端的PTB结构域。本研究成功克隆了白洗猪PID1基因,为探究其对白洗猪肌内脂肪沉积方面的影响及为白洗猪种资源开发利用奠定理论基础。 展开更多
关键词 白洗猪 肉质 肌内脂肪 pid1基因 克隆 PTB
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睾丸注射法制备携带猪PID1基因的转基因兔 被引量:2
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作者 祝洪磊 石元 +5 位作者 曾勇庆 陈伟 徐正刚 张哲 杨云 张天阳 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2014年第2期6-12,共7页
目的研究磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)基因与肌内脂肪含量的关系,探究睾丸注射法在转基因动物制备中的可行性。方法将携带猪PID1基因的重组质粒pIRES2-acGFP-PID1与转染试剂共孵育后,对新西兰兔进行了睾丸打点注射试验。对繁殖的F1代个... 目的研究磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)基因与肌内脂肪含量的关系,探究睾丸注射法在转基因动物制备中的可行性。方法将携带猪PID1基因的重组质粒pIRES2-acGFP-PID1与转染试剂共孵育后,对新西兰兔进行了睾丸打点注射试验。对繁殖的F1代个体进行了活体荧光检测、PCR和western blotting检测,以及抽样屠宰进行肌内脂肪含量等检测;将F1代阳性个体互交,繁殖了F2代兔,对其进行了阳性率检测以及肌内脂肪含量检测。结果外源PID1基因和荧光蛋白基因在后代中均成功表达,其中,F1代阳性率为35.88%,F2代阳性率为34.33%;转基因阳性兔与阴性和空白对照兔相比,PID1蛋白表达水平有所增加,肌内脂肪含量有显著提高(P<0.05)。结论 PID1基因与肌内脂肪沉积密切相关,同时,进一步证明了睾丸注射法可以用于制备转基因动物,且外源基因可以稳定遗传。 展开更多
关键词 睾丸注射法 pid1基因 转基因兔 肌内脂肪
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藏山羊PID1基因克隆及组织表达分析 被引量:1
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作者 吕明 林森 +5 位作者 朱江江 王永 梅寒 廖红海 李倩 林亚秋 《家畜生态学报》 北大核心 2016年第9期13-17,共5页
研究旨在获得藏山羊磷酸酪氨酸互作结构域(phosphotyrosine interaction domain containing l,PID1)基因序列,并进一步分析该基因的生物学特性以及揭示其组织表达规律。以藏山羊为材料,利用RT-PCR技术克隆PID1基因,利用荧光定量PCR检测... 研究旨在获得藏山羊磷酸酪氨酸互作结构域(phosphotyrosine interaction domain containing l,PID1)基因序列,并进一步分析该基因的生物学特性以及揭示其组织表达规律。以藏山羊为材料,利用RT-PCR技术克隆PID1基因,利用荧光定量PCR检测其组织表达特性。结果表明,藏山羊PID1基因CDS区为654bp,编码217个氨基酸,为无跨膜结构的酸性不溶类蛋白。同源性分析表明,藏山羊与山羊的同源性较高为99%,且处在进化树的同一个分支上。PID1在藏山羊的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌等组织中均检测到表达,但在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01)。研究获得了藏山羊PID1基因序列,其在脂肪组织中的表达水平最高。 展开更多
关键词 藏山羊 pid1 基因克隆 表达分析
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2A肽介导猪PID1与CuZnSOD双基因真核共表达载体的构建与细胞表达
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作者 张哲 李同明 +6 位作者 曾勇庆 陈伟 徐正刚 杨云 房国锋 王守栋 楚青惠 《生物学杂志》 CAS CSCD 2014年第6期1-5,共5页
构建PID1基因与CuZnSOD基因的真核共表达载体,在PK15细胞中鉴定基因的表达。PCR扩增的PID1与CuZnSOD两基因分别经双酶切后定向插入pIRES2-AcGFP1空载体,构建pIRES2-CuZnSOD-PID1真核双表达载体并进行测序与酶切鉴定。采用脂质体转染法... 构建PID1基因与CuZnSOD基因的真核共表达载体,在PK15细胞中鉴定基因的表达。PCR扩增的PID1与CuZnSOD两基因分别经双酶切后定向插入pIRES2-AcGFP1空载体,构建pIRES2-CuZnSOD-PID1真核双表达载体并进行测序与酶切鉴定。采用脂质体转染法将重组质粒转染至PK15细胞,细胞内荧光显微镜下观察其荧光的表达,RT-PCR、Westernblot技术分别检测PID1基因与CuZnSOD基因mRNA和蛋白表达情况。重组克隆载体插入目的片段序列与PID1基因与CuZnSOD基因序列完全一致。PIRES2-CuZnSOD-PID1真核双表达载体测序、酶切鉴定结果与预期结果一致。荧光显微镜下观察转染后的PK15细胞出现绿色荧光。RT-PCR检测结果显示,转染细胞中PID1基因与CuZnSOD基因表达量明显高于对照组(P<0.05)。Westernblot检测结果表明pIRES2-CuZnSODPID1真核双表达载体稳定有效表达。成功构建pIRES2-CuZnSOD-PID1真核共表达载体,且双基因在真核细胞独立稳定表达,为转基因猪等育种新材料的制备奠定基础。 展开更多
关键词 2A肽 pid1 CUZNSOD 真核共表达载体 PK15细胞
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绵羊肌肉组织MyoG和PID1基因的表达及其与肌内脂肪含量的关系 被引量:7
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作者 栾兆进 贺建宁 +3 位作者 程明 刘开东 曲绪仙 柳楠 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1986-1994,共9页
本研究旨在探究绵羊不同部位肌肉MyoG和PID1基因mRNA的发育变化规律,分析MyoG和PID1基因mRNA表达水平对肌内脂肪沉积的影响。选取2、4、5、6月龄敖汉细毛羊公羔和12月龄敖汉细毛羊成年公羊各5只,屠宰后取背最长肌和股二头肌检测肌内脂肪... 本研究旨在探究绵羊不同部位肌肉MyoG和PID1基因mRNA的发育变化规律,分析MyoG和PID1基因mRNA表达水平对肌内脂肪沉积的影响。选取2、4、5、6月龄敖汉细毛羊公羔和12月龄敖汉细毛羊成年公羊各5只,屠宰后取背最长肌和股二头肌检测肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)含量,用实时荧光定量PCR检测两个部位肌肉MyoG和PID1mRNA表达量,并进一步分析表达量与肌内脂肪含量的关系。结果表明,2~5月龄时,背最长肌和股二头肌的IMF含量均随着月龄的增加而增加;而5~12月龄时则基本保持不变;同月龄背最长肌IMF含量极显著高于股二头肌(P〈0.01)。两个部位肌肉MyoG和PID1mRNA表达的发育模式有所不同,具有组织特异性。背最长肌MyoG基因表达量5月龄最高(P〈0.01),PID1基因表达量6月龄最高(P〈0.05),均呈上升-下降趋势;股二头肌MyoG和PID1基因各月龄之间表达量均差异极显著(P〈0.01),MyoG基因表达量随着月龄增长呈上升-下降趋势,PID1基因表达量大体呈下降-上升趋势。同月龄MyoG和PID1表达量存在组织差异。相关分析表明,MyoG和PID1表达量与IMF含量呈不同程度正相关。综上,MyoG基因表达对绵羊肌内脂肪的沉积可能有正调控作用,而PID1基因表达可能对肌内脂肪的沉积产生一定的影响。 展开更多
关键词 肌内脂肪 MYOG pid1 表达规律 相关性
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宣和猪PID1基因外显子3的SNP检测及其与肉质性状的关联分析 被引量:6
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作者 刘梅 朱怡轩 +4 位作者 王孝义 陈强 董新星 严达伟 李明丽 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第7期1707-1714,共8页
【目的】探讨PID1基因多态性对宣和猪肉质性状的影响。【方法】以119头宣和猪为本试验的试验材料,对PID1基因外显子3采取PCR产物直接测序的方法对其进行SNP位点检测,选择最小二乘模型对各突变位点基因型及单倍型组合进行肉质性状方面的... 【目的】探讨PID1基因多态性对宣和猪肉质性状的影响。【方法】以119头宣和猪为本试验的试验材料,对PID1基因外显子3采取PCR产物直接测序的方法对其进行SNP位点检测,选择最小二乘模型对各突变位点基因型及单倍型组合进行肉质性状方面的差异分析。【结果】在宣和猪PID1基因外显子3区域共检测出4个SNP位点,分别为253 643 bp处的T→C(T253643C)、253 675 bp处的G→C(G253675C)、253 734 bp处的A→G(A253734G)和253 827 bp处的G→A(G253827A)。4个SNP位点均检测出3种基因型,分别以等位基因T、G、G、A及基因型TT、GC、AG、AA的频率最高。4个SNP位点共有9种单倍型和24种单倍型组合,其中单倍型CGGA和单倍型组合CGGA/TCAA的频率最高。各位点杂合度在0.4490~0.4997,都属于中度多态且都处于Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),遗传多样性比较丰富。G253675C位点与大理石纹评分存在显著关联,其中GC基因型可显著提高大理石纹评分(P<0.05),并且该基因型失水率、熟肉率以及滴水损失均表现最佳;A253734G位点与失水率和IMF含量存在显著关联,其中AG基因型可显著降低失水率(P<0.05),GG基因型可显著提高IMF含量(P<0.05);G253827A位点与失水率存在显著关联,其中GG基因型可显著降低失水率(P<0.05),并且该基因型大理石纹和熟肉率均表现最佳;单倍型组合中,TCAA/TCAA组合的失水率最高,大理石纹评分、熟肉率和IMF含量最低;CGGA单倍型具有提高大理石纹评分、熟肉率和IMF,降低失水率的效应。【结论】研究结果进一步丰富了PID1基因的SNP标记,初步证实了PID1基因对宣和猪的肉质性状有一定影响,可为实际生产中利用PID1基因标记改良宣和猪肉质性状提供了科学依据。 展开更多
关键词 宣和猪 磷酸酪氨酸互作结构域1(pid1)基因 单核苷酸多态性 肉质性状 关联分析
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雷州黑鸭PID1基因部分序列的克隆与蛋白功能分析 被引量:3
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作者 黄汉光 汤绮明 +4 位作者 苏瑛 许冲 崔红艳 常羽 黄骏腾 《安徽农业科学》 CAS 2015年第34期207-210,共4页
[目的]了解雷州黑鸭磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID 1)基因的序列结构特征及其蛋白的功能,为利用其改善雷州黑鸭肉品质与提高肉风味提供分子理论依据。[方法]采用RT-PCR方法克隆雷州黑鸭P... [目的]了解雷州黑鸭磷酸酪氨酸互作结构域1(phosphotyrosine interaction domain containing 1,PID 1)基因的序列结构特征及其蛋白的功能,为利用其改善雷州黑鸭肉品质与提高肉风味提供分子理论依据。[方法]采用RT-PCR方法克隆雷州黑鸭PID1基因部分序列,测序后比对其同源性,构建系统发育树,并预测其蛋白结构与功能。[结果]该核苷酸序列长度为369 bp,编码80个氨基酸,且大多为疏水性氨基酸。与人、牛、鸡等物种进行同源性比对,发现雷州黑鸭PID1基因序列与鸡具有高度同源性,同源性高达94%,且雷州黑鸭与鸡聚于同一系统发育支。蛋白质结构预测表明,该蛋白无跨膜结构与信号肽,氨基酸序列呈疏水性,位于细胞质中。[结论]雷州黑鸭的PID1基因与鸡的亲缘关系最近,其蛋白主要功能是在细胞质中参与肌内脂肪沉积的调控。 展开更多
关键词 雷州黑鸭 pid1 克隆 蛋白功能分析
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布莱凯特黑牛PID1基因的多态性分析及原核表达 被引量:1
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作者 毕庆伟 董雅娟 +4 位作者 柏学进 董懿为 李敬瑞 康晓晨 刘瑞莉 《贵州农业科学》 CAS 2016年第12期101-105,共5页
为提高布莱凯特黑牛肉质品质,参照NCBI公布的牛PID1基因mRNA序列设计引物,以117头布莱凯特黑牛为试验材料,提取其眼肌总RNA,通过RT-PCR对布莱凯特黑牛PID1基因cDNA进行克隆测序,对PID1基因的每个外显子进行SNP检测,并分析其多态性。结... 为提高布莱凯特黑牛肉质品质,参照NCBI公布的牛PID1基因mRNA序列设计引物,以117头布莱凯特黑牛为试验材料,提取其眼肌总RNA,通过RT-PCR对布莱凯特黑牛PID1基因cDNA进行克隆测序,对PID1基因的每个外显子进行SNP检测,并分析其多态性。结果显示:布莱凯特黑牛PID1基因cDNA全长2 561bp,包括1个612bp的完整开放阅读框,编码203个氨基酸;在第2外显子上存在2处变异位点,但仅1处位点的突变引起氨基酸序列变化,表明PID1基因在种内保守性较强。 展开更多
关键词 布莱凯特黑牛 pid1基因 多态性 原核表达 载体构建
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牦牛PID1基因克隆、生物信息学及组织表达分析 被引量:1
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作者 余道宁 王佟 +6 位作者 洛桑顿珠 平措占堆 张强 卓玛次仁 尼玛加措 张德荣 梁春年 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期216-223,共8页
为研究牦牛磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)的结构及功能,并探究其在各组织中的表达情况,以桑桑牦牛脂肪组织cDNA为模板克隆桑桑牦牛PID1基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析。同时,采用实时荧光定量PCR方法(RT-qPCR),对牦牛的7个... 为研究牦牛磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)的结构及功能,并探究其在各组织中的表达情况,以桑桑牦牛脂肪组织cDNA为模板克隆桑桑牦牛PID1基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析。同时,采用实时荧光定量PCR方法(RT-qPCR),对牦牛的7个不同组织包括心、肝、脾、肺、肾、背部肌肉及脂肪进行PID1基因表达水平的定量。结果表明,牦牛PID1基因的编码区长度是654 bp,编码217个氨基酸;通过同源性比对,结果发现,牦牛与野牦牛之间的亲缘关系最为接近,相似度达到100%;经过蛋白质分析发现,牦牛PID1蛋白的分子质量约为24.84 ku,理论等电点为6.30。根据不稳定系数计算结果显示,其不稳定性较高(47.96),属于一种不稳定蛋白质。该蛋白内含有1个N-糖基化位点和23个磷酸化位点,无信号肽和跨膜结构。RT-qPCR试验结果表明,在各个组织中都能检测到PID1基因的表达情况,其中在肺部表达量最高。该研究克隆了牦牛PID1基因,并对其蛋白结构进行了分析,同时还研究了该基因在牦牛组织中的表达情况。为进一步探究PID1基因在牦牛脂肪沉积过程中的作用提供了初步数据。 展开更多
关键词 牦牛 pid1基因 基因克隆 生物信息学
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PID1基因在白洗猪不同组织器官中的表达研究及生物信息学分析 被引量:2
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作者 苑洪霞 冯文武 +1 位作者 孙振梅 陈祥 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第7期83-87,248,共6页
为了探究PID1基因在白洗猪各组织器官中的表达水平及其结构和功能特性,为PID1基因对猪脂肪沉积的作用及其蛋白质特性研究提供理论基础,试验以白洗猪为研究对象,运用实时荧光定量PCR和Nest PCR法分析PID1基因mRNA在白洗猪9个不同组织器... 为了探究PID1基因在白洗猪各组织器官中的表达水平及其结构和功能特性,为PID1基因对猪脂肪沉积的作用及其蛋白质特性研究提供理论基础,试验以白洗猪为研究对象,运用实时荧光定量PCR和Nest PCR法分析PID1基因mRNA在白洗猪9个不同组织器官中的表达水平,运用T克隆、蓝白斑筛选等技术克隆PID1基因的CDS区,进一步运用生物信息学软件分析PID1蛋白的生物特性。结果表明:PID1基因mRNA表达量在肝脏中最高,心脏中最低,其表达水平依次为肝脏〉肾脏〉肺脏〉小肠〉胃〉脾脏〉大肠〉肌肉〉心脏;白洗猪PID1基因的克隆CDS区与NCBI上传的序列一致;白洗猪PID1基因编码217个氨基酸,分子质量为24.8 ku,属亲水性蛋白,在PID1蛋白的二级结构中α螺旋比率较大,跨膜区预测分析未发现跨膜区域。 展开更多
关键词 白洗猪 pid1 荧光定量PCR 二级结构 结构域
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藏鸡磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)的克隆及组织表达谱研究 被引量:6
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作者 聂晓庆 林亚秋 +5 位作者 徐亚欧 赵燕英 吕明 左璐璐 张小玉 李想 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1102-1111,共10页
本研究旨在阐明藏鸡PID1基因在不同组织与时序表达谱,并研究PID1基因表达与肌内脂肪含量(IMF)的关系。利用RT-PCR技术克隆藏鸡PID1基因,用相关软件预测PID1蛋白的结构和功能,采用荧光定量PCR研究PID1基因在藏鸡不同组织、不同日龄的表达... 本研究旨在阐明藏鸡PID1基因在不同组织与时序表达谱,并研究PID1基因表达与肌内脂肪含量(IMF)的关系。利用RT-PCR技术克隆藏鸡PID1基因,用相关软件预测PID1蛋白的结构和功能,采用荧光定量PCR研究PID1基因在藏鸡不同组织、不同日龄的表达谱,并分析其与IMF的相关性。结果显示,克隆得到藏鸡PID1基因序列长度为654bp(GenBank登录号:KT000001),共编码217个氨基酸,是具有PTB结构域的不稳定亲水酸性蛋白质;有14个磷酸化位点、4个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点、7种保守特异性蛋白激酶结合位点、3个二硫键;预测其二级结构中α-螺旋占26.73%,β折叠占20.74%,无规则卷曲占52.53%,属于混合型蛋白且主要存在于细胞质中。荧光定量PCR结果显示,PID1基因在藏鸡的不同组织中均存在表达,且在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01);时序表达谱结果显示,PID1基因在1日龄公藏鸡胸肌中表达水平最高。在210日龄的公鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄的表达水平(P<0.01),在119日龄母鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄表达水平(P<0.01)。在119和154日龄公鸡脂肪组织中表达水平较高,在210日龄母鸡脂肪组织中的表达量最高(P<0.01)。相关性分析结果显示,PID1mRNA的表达量与藏鸡胸肌的IMF含量存在显著相关(P<0.05)。结果提示,PID1基因可能是影响藏鸡IMF沉积的候选基因。 展开更多
关键词 藏鸡 磷酸酪氨酸互作结构域1 克隆 组织表达 时序表达 肌内脂肪
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PID1,a new tumor-promoting gene in insulin resistance mediated acceleration of hepatocellular carcinoma development and progression
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作者 Ming XIANG Qian-qian XU +3 位作者 Na XU Zhong-shi ZHOU Ya-li TUO Cheng TIAN 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期977-978,共2页
OBJECTIVE To investigate the effect of phosphotyrosine interaction domain containing 1(PID1,NYGGF4)on promotion of IR and HCC,and explore its underlying mechanisms.METHODS Lentivirus were used to mediate the knockdown... OBJECTIVE To investigate the effect of phosphotyrosine interaction domain containing 1(PID1,NYGGF4)on promotion of IR and HCC,and explore its underlying mechanisms.METHODS Lentivirus were used to mediate the knockdown of PID1 in HFD induced IR mouse model as well as ob/ob mice.Intraperitoneal glucose and insulin tolerance were performed 4 weeks after lentivirus injection.Hydrodynamics-based transfection was applied to inducethe liver specific overexpression of PID1.Flow cytometry was exerted to detect the proportion and function of immune cells.qR T-PCR and Western blot were used to detect the expression of downstream pathways of PID1.Immunoprecipitation was used to determine the receptor of PID1.Chromatin immunoprecipitation(ChI P)was operated to measure the modification of H3K4me3 of PID1 promoter.RESULTS PID1 restriction improved insulin resistance,hyperglycemia and fatty liver.Conversely,hepatic knockdown of PID1 attenuated liver xenografted tumor growth.Moreover,PID1 liver-specific protooncogenes via hydrodynamics-based transfection established a primary hepatocellular carcinoma mouse model,induced an immunosuppressive environment,with the reduction of CD3^+,CD4^+,CD8^+T cel s,retarded maturation of dendritic cel s(DCs),pronounced differentiation of regulatory T cells(Tregs),and recruitment of MDSC.In addition,PID1 overexpression activated proliferation related genes,promoted anti-inflammatory genes,suppressed pro-inflammatory genes,induced glycolysis and lipid metabolism genes to facilitate tumorigenesis in liver.Importantly,PID1 exerted its tumor-promoting function through binding to epidermal growth factor receptor(EGFR)and activation of downstream MAPK pathway.As such,PID1 exist trimethylation of histone H3 at lysine 4(H3K4me3)modification and IR up-regulated the expression of PID1 by activation the H3K4me3 modification.CONCLUSION PID1 is a new gene that exerts both liver cancer-promoting and insulin resistance inducing function.IR accelerates liver cancer development and progressionpartially dependent on the activation of PID1. 展开更多
关键词 pid1 insulin resistance hepatocellular carcinoma cancer promoting IMMUNOSUPPRESSION
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PID1 based connection of insulin resistance to hepatocellular carcinogenesis
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作者 Ming XIANG Qian-qian XU +2 位作者 Sen-lin LI Bao-tian WANG Ya-li TUO 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期316-316,共1页
OBJECTIVE To investigate the effect of phosphotyrosine interaction domain containing1(PID1,NYGGF4) onpromotion of IR and HCC,and explore its underlying mechanisms.METHODS Lentivirus were used to mediate the knockdown ... OBJECTIVE To investigate the effect of phosphotyrosine interaction domain containing1(PID1,NYGGF4) onpromotion of IR and HCC,and explore its underlying mechanisms.METHODS Lentivirus were used to mediate the knockdown of PID1 in HFD induced IR mouse model as well as ob/ob mice.Intraperitoneal glucose and insulin tolerance were performed 4 weeks after lentivirus injection.Hydrodynamics-based transfection was applied to induce the liver specific overexpression of PID1.Flow cytometry was exerted to detect the proportion and function of immune cells.qRT-PCR and Western blot were used to detect the expression of downstream pathways of PID1.Liquid chromatographymass spectrometry(LC-MS) and co-immunoprecipitation(Co-IP) were conducted to identify proteins interacting with PID1.Chromatin immunoprecipitation(ChIP) was operated to measure the modification of H3K4me3 of PID1 promoter.RESULTS PID1 restriction improved insulin resistance,hyperglycemia and fatty liver.Conversely,hepatic knockdown of PID1 attenuated liver xenografted tumor growth.Moreover,PID1 liver-specific protooncogenes via hydrodynamics-based transfection established a primary hepatocellular carcinoma mouse model,induced an immunosuppressive environment,with the reduction of CD3+,CD4+,CD8+T cells,retarded maturation of dendritic cells(DCs),pronounced differentiation of regulatory T cells(Tregs),and recruitment of MDSC.In addition,PID1 overexpression activated prolifer.ation related genes,promoted anti-inflammatory genes,suppressed pro-inflammatory genes,induced glycolysis and lipid metabolism genes to facilitate tumorigenesis in liver.Importantly,PID1 exerted its tumor-promoting function through binding to epidermal growth factor receptor(EGFR) and activation of downstream KRAS/ERK pathway.As such,PID1 exist trimethylation of histone H3 at lysine 4(H3K4me3)modification and IR up-regulated the expression of PID1 by activation the H3K4me3 modification.CONCLUSION PID1 is a new gene that exerts both liver cancer-promoting and insulin resistance inducing function.IR accelerates liver cancer development and progression partially dependent on the activation of PID1. 展开更多
关键词 磷酸酪氨酸 治疗方法 临床分析 药物治疗
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肥胖相关基因PID1的研究进展 被引量:3
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作者 徐洪刚 郑程莉 徐刚毅 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2013年第9期92-96,共5页
人和动物脂肪代谢受到多种因素的调节,其中最重要的是遗传因素。磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)是近年来发现的新基因,作为一种信号分子在细胞生长和成脂过程中直接作用,在脂肪组织中都出现PID1的高表达现象,这就提示了PID1基因和脂肪沉... 人和动物脂肪代谢受到多种因素的调节,其中最重要的是遗传因素。磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)是近年来发现的新基因,作为一种信号分子在细胞生长和成脂过程中直接作用,在脂肪组织中都出现PID1的高表达现象,这就提示了PID1基因和脂肪沉积存在关系。本文将系统介绍PID1基因结构、编码产物特征以及其对肥胖影响作用机理及其研究进展。 展开更多
关键词 结构 肥胖 脂肪 pid1基因
原文传递
猪磷酸酪氨酸互作结构域1基因的融合表达及其多克隆抗体的制备和鉴定
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作者 陈小玲 王欢 +4 位作者 黄志清 周波 贾刚 刘光芒 赵华 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期3349-3355,共7页
本文旨在通过原核表达获得猪磷酸酪氨酸互作结构域1(p PID1)重组蛋白,并制备p PID1多克隆抗体。将p PID1基因插入p ET28a(+),构建重组p ET28a(+)-p PID1大肠杆菌表达质粒,然后将重组质粒p ET28a(+)-p PID1转化到大肠杆菌BL21感受态细胞... 本文旨在通过原核表达获得猪磷酸酪氨酸互作结构域1(p PID1)重组蛋白,并制备p PID1多克隆抗体。将p PID1基因插入p ET28a(+),构建重组p ET28a(+)-p PID1大肠杆菌表达质粒,然后将重组质粒p ET28a(+)-p PID1转化到大肠杆菌BL21感受态细胞中,获得的重组子以不同异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)浓度、温度和时间诱导,确定p PID1融合蛋白表达的最适条件。将表达产物经镍离子-亚氨基二乙酸(Ni2+-IDA)亲和层析纯化后进行基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MSMS)鉴定。同时,将纯化获得的p PID1融合蛋白免疫SD大鼠,制备p PID1多克隆抗体,并检测抗体效价。结果表明:p PID1融合蛋白表达的最佳条件为30℃以0.1 mmol/L IPTG诱导4 h;纯化的融合蛋白经MALDI-TOF-MSMS鉴定为p PID1;特异性的p PID1多克隆抗体成功制备,抗体效价为1∶20 480。本试验成功制备了高纯度的重组p PID1及其多克隆抗体。 展开更多
关键词 pid1 原核表达 纯化 质谱鉴定 多克隆抗体
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