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千年桐物种特异PGK3-TPS10-CYP726基因簇挖掘及其进化和表达特征
1
作者
王银行
高暝
+3 位作者
赵耘霄
汪阳东
李伟
陈益存
《北京林业大学学报》
北大核心
2025年第2期1-9,共9页
【目的】基于全基因组挖掘高质量物种特异基因簇,为深入分析物种性状和遗传改良提供新的思路。【方法】通过基因组、转录组、蛋白数据联合分析,利用生物信息手段进行高质量基因簇预测与筛选,对目标基因簇进行基因组共线性、基因组结构...
【目的】基于全基因组挖掘高质量物种特异基因簇,为深入分析物种性状和遗传改良提供新的思路。【方法】通过基因组、转录组、蛋白数据联合分析,利用生物信息手段进行高质量基因簇预测与筛选,对目标基因簇进行基因组共线性、基因组结构、系统进化和转录表达分析。【结果】(1)预测了千年桐高可信度PGK3-TPS10-CYP726基因簇,该基因簇中共包括13个酶编码基因,具体包括:3-磷酸甘油醛脱氢酶3(GAPCP3)、CHD4细胞色素P45071D(CYP71D55)、细胞色素P450726A(CYP726A)、萜类合酶10(TPS10)、磷酸甘油酸激酶3(PGK3)等。(2)PGK3-TPS10-CYP726基因簇具有良好的共表达和共通路特征,在千年桐基因组中展示了良好的独特性和完整性。(3)PGK3-TPS10-CYP726基因簇有约一半基因在双子叶植物中存在较高的保守性,但在单子叶植物中存在基因缺失的现象;PGK3基因一直保留于单双子叶植物和苔藓植物中,其序列在进化过程中高度保守;推测PGK3-TPS10-CYP726基因簇起源于早期基部类群,并在千年桐物种分化后形成。(4)千年桐物种特异PGK3-TPS10-CYP726基因簇在根部特异高表达,在枯萎病病原菌侵染后的早、中期的千年桐根木质部呈现持续显著高表达。【结论】首次鉴定了千年桐物种特异基因簇PGK3-TPS10-CYP726,并分析了其进化起源和表达特征,为解析千年桐抗枯萎病等特有性状提供了新的视角。
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关键词
千年桐
基因簇
物种特异
进化起源
细胞色素P450
磷酸甘油酸激酶3
抗枯萎病
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职称材料
基于KNT-PGK3型的水箱液位模糊PID控制研究
被引量:
2
2
作者
魏玉莉
《自动化与仪器仪表》
2016年第7期9-11,共3页
在KNT-PGK3型高级过程控制实验装置的基础上,研究了基于超声波传感器的水箱液位模糊PID控制。具体是在现有实验装置与i FIX组态软件环境下采用模糊PID控制方法对实验台的水箱液位进行控制研究。实验过程中,结合以前的PID控制与模糊控制...
在KNT-PGK3型高级过程控制实验装置的基础上,研究了基于超声波传感器的水箱液位模糊PID控制。具体是在现有实验装置与i FIX组态软件环境下采用模糊PID控制方法对实验台的水箱液位进行控制研究。实验过程中,结合以前的PID控制与模糊控制实验结果,设计了模糊PID控制器与控制算法,然后将算法程序在实验台上运行验证。根据实验结果知,模糊PID控制方法进一步改善了控制系统的动态性能与稳态性能,取得了更好的控制效果。
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关键词
水箱液位
模糊PID控制
超声波传感器
KNT-
pgk3
型
原文传递
题名
千年桐物种特异PGK3-TPS10-CYP726基因簇挖掘及其进化和表达特征
1
作者
王银行
高暝
赵耘霄
汪阳东
李伟
陈益存
机构
林木遗传育种国家重点实验室
中国林业科学研究院亚热带林业研究所
出处
《北京林业大学学报》
北大核心
2025年第2期1-9,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(31971685)
浙江省科技创新领军人才项目(2022R52028)。
文摘
【目的】基于全基因组挖掘高质量物种特异基因簇,为深入分析物种性状和遗传改良提供新的思路。【方法】通过基因组、转录组、蛋白数据联合分析,利用生物信息手段进行高质量基因簇预测与筛选,对目标基因簇进行基因组共线性、基因组结构、系统进化和转录表达分析。【结果】(1)预测了千年桐高可信度PGK3-TPS10-CYP726基因簇,该基因簇中共包括13个酶编码基因,具体包括:3-磷酸甘油醛脱氢酶3(GAPCP3)、CHD4细胞色素P45071D(CYP71D55)、细胞色素P450726A(CYP726A)、萜类合酶10(TPS10)、磷酸甘油酸激酶3(PGK3)等。(2)PGK3-TPS10-CYP726基因簇具有良好的共表达和共通路特征,在千年桐基因组中展示了良好的独特性和完整性。(3)PGK3-TPS10-CYP726基因簇有约一半基因在双子叶植物中存在较高的保守性,但在单子叶植物中存在基因缺失的现象;PGK3基因一直保留于单双子叶植物和苔藓植物中,其序列在进化过程中高度保守;推测PGK3-TPS10-CYP726基因簇起源于早期基部类群,并在千年桐物种分化后形成。(4)千年桐物种特异PGK3-TPS10-CYP726基因簇在根部特异高表达,在枯萎病病原菌侵染后的早、中期的千年桐根木质部呈现持续显著高表达。【结论】首次鉴定了千年桐物种特异基因簇PGK3-TPS10-CYP726,并分析了其进化起源和表达特征,为解析千年桐抗枯萎病等特有性状提供了新的视角。
关键词
千年桐
基因簇
物种特异
进化起源
细胞色素P450
磷酸甘油酸激酶3
抗枯萎病
Keywords
Vernicia montana
gene cluster
species-specific
evolutionary origin
CYP450
pgk3
resistance to Fusarium wilt
分类号
S794.3 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
基于KNT-PGK3型的水箱液位模糊PID控制研究
被引量:
2
2
作者
魏玉莉
机构
兰州资源环境职业技术学院
出处
《自动化与仪器仪表》
2016年第7期9-11,共3页
基金
甘肃省自然科学基金项目(1308RJZA116)
甘肃省高等学校科研项目(2013A-051)
文摘
在KNT-PGK3型高级过程控制实验装置的基础上,研究了基于超声波传感器的水箱液位模糊PID控制。具体是在现有实验装置与i FIX组态软件环境下采用模糊PID控制方法对实验台的水箱液位进行控制研究。实验过程中,结合以前的PID控制与模糊控制实验结果,设计了模糊PID控制器与控制算法,然后将算法程序在实验台上运行验证。根据实验结果知,模糊PID控制方法进一步改善了控制系统的动态性能与稳态性能,取得了更好的控制效果。
关键词
水箱液位
模糊PID控制
超声波传感器
KNT-
pgk3
型
Keywords
tank liquid level
fuzzy PID control
ultrasonic sensor
KNT-
pgk3
分类号
TP273 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
千年桐物种特异PGK3-TPS10-CYP726基因簇挖掘及其进化和表达特征
王银行
高暝
赵耘霄
汪阳东
李伟
陈益存
《北京林业大学学报》
北大核心
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
基于KNT-PGK3型的水箱液位模糊PID控制研究
魏玉莉
《自动化与仪器仪表》
2016
2
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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