果实表达PGIPs的基因克隆及功能研究进展 被引量：1

1

作者 周阿涛 刘迪秋 +3 位作者 葛锋 陈朝银 饶健 丁为群 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期14-18,共5页

多聚半乳糖醛酸酶(PGs)是病原真菌早期侵染植物的一个重要致病因子。多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIPs)作为植物防御蛋白,能特异性抑制真菌分泌的多聚半乳糖醛酸酶,并通过延长寡聚半乳糖醛酸(OGs)的稳定期激活植物防御反应。综述PGIPs在... 多聚半乳糖醛酸酶(PGs)是病原真菌早期侵染植物的一个重要致病因子。多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIPs)作为植物防御蛋白,能特异性抑制真菌分泌的多聚半乳糖醛酸酶,并通过延长寡聚半乳糖醛酸(OGs)的稳定期激活植物防御反应。综述PGIPs在植物细胞中的定位,PGIPs与PGs之间的作用方式,PGIPs基因的分离与克隆,以及PGIPs对果实感病的影响,并对PGIPs的研究前景进行展望。 展开更多

关键词 果实 pgips PGS 基因 克隆 抑制

在线阅读 下载PDF 职称材料

滇龙胆PGIP基因家族全基因组鉴定及表达模式 被引量：1

2

作者 徐梦恒 袁文雪 +2 位作者 陈丹 王亚轩 梁艳丽 《云南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期97-107,共11页

【目的】探究多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting protein,PGIP)基因在滇龙胆(Gentiana rigescens)花冠感温运动中的潜在功能。【方法】基于滇龙胆的全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法分析PGIP家族的理化性... 【目的】探究多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting protein,PGIP)基因在滇龙胆(Gentiana rigescens)花冠感温运动中的潜在功能。【方法】基于滇龙胆的全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法分析PGIP家族的理化性质、基因结构、系统发育关系、保守结构域、顺式作用元件和表达模式。【结果】滇龙胆PGIP基因家族包含10个成员,不均匀地分布在第1、2、4、5、9号染色体上。GrPGIP基因都含有外显子。GrPGIP均为亲水性蛋白,亚细胞定位预测其主要位于细胞壁。大部分GrPGIP基因家族成员的启动子区域都包含光响应元件与激素响应元件。共线性分析显示:PGIP基因家族在双子叶植物中较为保守。GO富集分析显示:GrPGIP基因可能在细胞壁中发挥重要作用。10个GrPGIP基因在滇龙胆花冠感温过程中均存在差异表达,推测GrPGIP基因可能参与花冠运动。【结论】研究结果初步阐明了GrPGIP在滇龙胆感温运动中的表达模式,为进一步研究GrPGIP在滇龙胆花冠运动中的功能奠定了基础。 展开更多

关键词 滇龙胆 感温运动 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP) 细胞壁

在线阅读 下载PDF 职称材料

彩色马蹄莲多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因家族的鉴定及对胡萝卜果胶杆菌的响应

3

作者 张梦涵 杨拓 +7 位作者 黄肖镕 吴乐乐 田威 曾臻 张国君 卫尊征 杨学军 王壹 《浙江农林大学学报》 北大核心 2025年第5期1037-1047,共11页

【目的】揭示PGIP基因家族在彩色马蹄莲Zantedeschia elliottiana中的结构特征及在胡萝卜果胶杆菌Pectobacterium carotovorum侵染下的表达差异,为ZePGIP基因功能研究和彩色马蹄莲抗胡萝卜果胶杆菌机制解析提供理论依据。【方法】采用... 【目的】揭示PGIP基因家族在彩色马蹄莲Zantedeschia elliottiana中的结构特征及在胡萝卜果胶杆菌Pectobacterium carotovorum侵染下的表达差异,为ZePGIP基因功能研究和彩色马蹄莲抗胡萝卜果胶杆菌机制解析提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法在全基因组范围内鉴定并分析彩色马蹄莲ZePGIP基因家族成员,并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测ZePGIP基因在胡萝卜果胶杆菌侵染下的表达模式。【结果】在彩色马蹄莲基因组中共鉴定出6个ZePGIP基因:ZePGIP1、ZePGIP2、ZePGIP3、ZePGIP4、ZePGIP5和ZePGIP6。系统发育及保守结构域分析表明:这些基因均包含同一亚家族内保守的基序,其中MEME-1和MEME-2序列高度相似,并在所有基因中均可鉴定到MEME-1、MEME-2、MEME-6,显示出较高保守性。启动子顺式作用元件分析发现:ZePGIP基因启动子区含有与脱落酸、生长素、茉莉酸甲酯、光、低温、赤霉素、胁迫及.水杨酸相关的响应元件。基因共线性分析显示:ZePGIP2与ZePGIP5为旁系同源基因。跨天南星科Araceae物种的基因共线性分析发现:彩色马蹄莲与虎掌Pinellia pedatisecta、大薸Pistia stratiotes、芋Colocasia esculenta和魔芋Amorphophallus konjac存在2对直系同源基因。胡萝卜果胶杆菌接菌处理和相关性分析表明:在胡萝卜果胶杆菌侵染下彩色马蹄莲ZePGIP基因呈现差异性表达,其中ZePGIP2和ZePGIP6在胡萝卜果胶杆菌侵染早期表达水平受到抑制,而在后期则被显著诱导。【结论】PGIP基因家族在彩色马蹄莲中主要以串联重复形式存在,整体结构高度保守。ZePGIP2和ZePGIP6对胡萝卜果胶杆菌具有显著响应,揭示其可能在抗胡萝卜果胶杆菌中发挥关键作用。 展开更多

关键词 彩色马蹄莲 PGIP基因 胡萝卜果胶杆菌 表达分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白的结构、功能以及应用研究进展 被引量：2

4

作者 李文娴 刘迪秋 +3 位作者 葛锋 丁元明 王继磊 田荣欢 《生物学杂志》 CAS CSCD 2010年第5期77-80,共4页

真菌病害严重影响植物的生长发育。为了自我保护,植物进化出了许多抵御病原真菌入侵的策略,例如防御相关蛋白的产生。多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting proteins,PGIPs)是近年来研究较多的一种植物防御蛋白,它能... 真菌病害严重影响植物的生长发育。为了自我保护,植物进化出了许多抵御病原真菌入侵的策略,例如防御相关蛋白的产生。多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting proteins,PGIPs)是近年来研究较多的一种植物防御蛋白,它能与真菌分泌的多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonases,PGs)特异性结合,降低PGs水解植物细胞壁的活性并在植物体内累积能激活多种防御反应的长链寡聚半乳糖醛酸(oligogalacturonides,OGs),从而达到抑制真菌侵染的目的。主要介绍了PGIPs的结构、功能及其抗菌机理,并综述了PGIPs在国内外转基因抗病育种中的应用研究进展。 展开更多

关键词 pgips PGS OGs 病原真菌 转基因植物

在线阅读 下载PDF 职称材料

烟草PGIP基因在枯草芽孢杆菌中的表达 被引量：1

5

作者 江翱 吴辉 +1 位作者 袁梦思 孙文秀 《湖北农业科学》 2015年第11期2767-2772,共6页

根据Gen Bank数据库报道的林烟草(Nicotiana sylvestris)PGIP基因c DNA序列,设计特异性引物,从普通烟草(Nicotiana tabacum)种植品种小黄金中分离得到了其g DNA序列,分析结果发现烟草PGIP基因没有内含子序列。信号肽分析结果表明,烟草P... 根据Gen Bank数据库报道的林烟草(Nicotiana sylvestris)PGIP基因c DNA序列,设计特异性引物,从普通烟草(Nicotiana tabacum)种植品种小黄金中分离得到了其g DNA序列,分析结果发现烟草PGIP基因没有内含子序列。信号肽分析结果表明,烟草PGIP基因含有一段长28个氨基酸的信号肽。将去除信号肽的烟草PGIP基因片段亚克隆至枯草芽孢杆菌表达载体p HT43中,转化枯草芽孢杆菌菌株WB600并进行IPTG诱导。SDS-PAGE电泳表明,重组菌株可成功表达目的蛋白质,分子质量符合预期大小;琼脂扩散试验结果发现,表达的烟草PGIP蛋白质能够明显抑制辣椒疫霉PGs的活性。 展开更多

关键词 烟草(Nicotiana tabacum) 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白质(pgips)基因 枯草芽孢杆菌 表达

在线阅读 下载PDF 职称材料

梅PGIP基因的克隆及全序列分析 被引量：18

6

作者 李广平 房经贵 +2 位作者 蔡斌华 章镇 张长青 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期125-127,共3页

通过PCR扩增,从梅基因组中得到1条全长1 192 bp的多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PG IP)基因序列。该序列包含有1个完整的开放阅读框和1个内元。比对结果表明,克隆到的序列与桃、马哈利樱桃中相应序列一致度分别为96%和95%,其蛋白质序列与桃... 通过PCR扩增,从梅基因组中得到1条全长1 192 bp的多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PG IP)基因序列。该序列包含有1个完整的开放阅读框和1个内元。比对结果表明,克隆到的序列与桃、马哈利樱桃中相应序列一致度分别为96%和95%,其蛋白质序列与桃、马哈利樱桃的蛋白质序列一致度分别为97%和94%。该蛋白质序列中包含着一段亮氨酸重复序列。 展开更多

关键词 梅 PGIP基因 克隆 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

小麦多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白对几种病原真菌抑制作用的研究 被引量：15

7

作者 周立 刘勇 +2 位作者 李建吾 杨雪海 曹阳 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第2期107-112,共6页

本文以单子叶植物小麦（ＴｒｉｔｉｃｕｍａｅｓｔｉｖｕｍＬ．）的黄化苗为材料，用小麦品种ＳＷ８９－２５８９的多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白（ＰＧＩＰ）作用４种病原真菌，发现小麦ＰＧＩＰ对几种病原真菌分泌的内切多聚半乳糖醛酸酶... 本文以单子叶植物小麦（ＴｒｉｔｉｃｕｍａｅｓｔｉｖｕｍＬ．）的黄化苗为材料，用小麦品种ＳＷ８９－２５８９的多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白（ＰＧＩＰ）作用４种病原真菌，发现小麦ＰＧＩＰ对几种病原真菌分泌的内切多聚半乳糖醛酸酶（ｅｎｄｏ－ＰＧ）有抑制作用，４种病原真菌ｅｎｄｏ－ＰＧ被抑制程度的大小关系依次为Ｐｙｒｉ－ａｃｌａｒｉａｏｒｙｚａｅ、Ｓｃｌｅｒｏｔｉｎｉａｓｃｌｅｒｏｔｉｏｒｉｕｍ、Ｆｕｓａｒｉｕｍｇｒａｍｉｎｅａｒｕｍ、Ｅｘｓｅｒｏｈｉｌｕｍｔｕｒｃｉｃｕｍ；小麦ＰＧＩＰ对４种病原真菌生长有抑制作用，并且能引起小麦禾谷镰刀菌和玉米大斑病菌生长异常。 展开更多

关键词 小麦 PGIP 病原真菌 endo-PG 抑制作用

在线阅读 下载PDF 职称材料

中国李PGIP基因的克隆及序列分析 被引量：12

8

作者 李广平 乔玉山 +2 位作者 陶建敏 高志红 章镇 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1870-1873,共4页

以中国李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列为引物,扩增到1条全长1 192 bp的目的片段（Genbank登录号：DQ200847）.序列分析表明：该片段与杏、桃、马哈利樱桃、梅的PGIP基因序列一致度达96%～99%,包含有1个完整的开放阅读框和1个内含... 以中国李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列为引物,扩增到1条全长1 192 bp的目的片段（Genbank登录号：DQ200847）.序列分析表明：该片段与杏、桃、马哈利樱桃、梅的PGIP基因序列一致度达96%～99%,包含有1个完整的开放阅读框和1个内含子,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列;分子进化分析表明,在分子进化树中,该序列与杏、桃、马哈利樱桃、梅的PGIP序列位于同一类.为植物分子抗病育种提供了1条基因资源. 展开更多

关键词 李 PGIP基因 基因克隆 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料

转梅PGIP基因增强菊花抗病性研究 被引量：10

9

作者 于淼 刘兆磊 +1 位作者 陈素梅 陈发棣 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1111-1116,共6页

通过农杆菌介导法将梅多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)转入盆栽小菊品种‘05-44-2’中,以提高对真菌病害的抗性。经Hyg抗性筛选,获得232株抗性苗。对其中40株进行PCR检测,有8株扩增出目的条带;对这8株进行RT-PCR检测,发现其中有5个... 通过农杆菌介导法将梅多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)转入盆栽小菊品种‘05-44-2’中,以提高对真菌病害的抗性。经Hyg抗性筛选,获得232株抗性苗。对其中40株进行PCR检测,有8株扩增出目的条带;对这8株进行RT-PCR检测,发现其中有5个株系有目的条带出现,且发生基因转录。转基因菊花的抗病性检测证实,与对照相比,转基因株系对黑斑病有不同程度的抗性,表现为发病延迟,病情指数降低;株系7抗性最强,其苗期病情指数仅为33。 展开更多

关键词 菊花 PGIP基因 转化 黑斑病 抗病性

在线阅读 下载PDF 职称材料

龙眼梅PGIP基因的克隆及序列分析 被引量：8

10

作者 王家福 朱春林 +3 位作者 陈桂信 潘东明 潘才博 叶露莹 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期55-58,共4页

利用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)得到在龙眼梅(PrunusmumeSiebetZucc.Longyan)嫩芽中特异性表达的PGIP基因。DNA序列分析表明,所获得龙眼梅的PGIPcDNA的序列全长为1045bp,该序列与已发表的PGIP基因有很高的同源性。

关键词 龙眼梅 PGIP基因 克隆

在线阅读 下载PDF 职称材料

中国李pgip启动子的克隆及调控元件分析 被引量：11

11

作者 李广平 张长青 +1 位作者 章镇 曹福亮 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1425-1430,共6页

在已克隆中国李pgip序列的基础上,通过染色体步行法获得了该基因上游1869bp的启动子序列,联合生物信息学中的进化印记法和启动子扫描法对克隆的启动子序列进行了调控元件识别。结果报道了3个调控元件:1个TGA1结合位点(TGACG)和2个WRKY... 在已克隆中国李pgip序列的基础上,通过染色体步行法获得了该基因上游1869bp的启动子序列,联合生物信息学中的进化印记法和启动子扫描法对克隆的启动子序列进行了调控元件识别。结果报道了3个调控元件:1个TGA1结合位点(TGACG)和2个WRKY结合位点(TGAC)。这为全面揭示pgip表达的转录调控机制提供了遗传基础。 展开更多

关键词 中国李 pgip启动子 克隆 调控元件分析

原文传递

小麦在与水杨酸诱导的应答过程中PGIP的积累 被引量：10

12

作者 阮期平 周立 刘勇 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2000年第4期313-316,共4页

以SW8 9 2 5 89小麦品系为材料 ,利用自制的小麦抗PGIP血清和dot immunobindingassay ,并结合PGIP粗提液对endo PG的抑制实验 ,研究了小麦内源多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (PGIP)水平与水杨酸之间的应答关系 .发现用水杨酸处理过的PGIP粗... 以SW8 9 2 5 89小麦品系为材料 ,利用自制的小麦抗PGIP血清和dot immunobindingassay ,并结合PGIP粗提液对endo PG的抑制实验 ,研究了小麦内源多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (PGIP)水平与水杨酸之间的应答关系 .发现用水杨酸处理过的PGIP粗提液在NC膜上的显色斑点颜色均较H2 O处理的PGIP粗提液深 ,而且对en do PG的抑制程度也高于未用水杨酸处理的PGIP粗提液 .这充分说明水杨酸能诱导小麦内源PGIP水平稳定的提高 .此结果为进一步弄清PGIP抗病机理提供了有用的资料 .图 4表 1参 展开更多

关键词 水杨酸 诱导 PGIP 小麦

在线阅读 下载PDF 职称材料

马哈利樱桃PGIP cDNA克隆及序列分析 被引量：6

13

作者 张军科 张开春 +1 位作者 李嘉瑞 张晓明 《西北植物学报》 CAS CSCD 2001年第6期1123-1127,共5页

以马哈利樱桃 (Prunus mahaleb L .)为材料 ,通过 RT- PCR获得了 1 0 4 5 bp的目的片段 ,经克隆测序 ,证实该片段包含 1个完整的开放阅读框架 ,该阅读框架由 990碱基组成 ,编码 3 3 0个氨基酸。该序列与杏、梨、苹果的 PGIP c DNA序列... 以马哈利樱桃 (Prunus mahaleb L .)为材料 ,通过 RT- PCR获得了 1 0 4 5 bp的目的片段 ,经克隆测序 ,证实该片段包含 1个完整的开放阅读框架 ,该阅读框架由 990碱基组成 ,编码 3 3 0个氨基酸。该序列与杏、梨、苹果的 PGIP c DNA序列同源性分别达 97.2 %、83 .4%和83 .6 % ,可能编码的氨基酸与杏、梨、苹果的 PGIP c DNA所编码的氨基酸的同源性分别达到96 .7%、85 .2 %和 85 .2 %。与已经克隆的 PGIP DNA序列的对比分析表明 ,PGIP DNA序列中包含 2个外显子和 1个内含子 ,内含子全长 1 47bp,符合 TG- AG规律 ,2个外显子长度分别为 5 81 bp、46 4 展开更多

关键词 樱桃 PGIP CDNA 基因克隆 测序 真菌病害 抗病性

在线阅读 下载PDF 职称材料

桃PGIP基因及其启动子的克隆与分析 被引量：4

14

作者 王秀云 张计育 +3 位作者 高志红 章镇 俞明亮 张妤艳 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期159-167,共9页

桃流胶病是一种严重危害桃树的真菌性病害,为研究PGIP基因在桃抗流胶病及抗其它真菌性病害中的作用,本研究以桃抗流胶病品种‘南京白沙’叶片为材料,对其PGIP基因及启动子序列进行克隆与分析。克隆测序获得了‘南京白沙’桃PGIP基因cDN... 桃流胶病是一种严重危害桃树的真菌性病害,为研究PGIP基因在桃抗流胶病及抗其它真菌性病害中的作用,本研究以桃抗流胶病品种‘南京白沙’叶片为材料,对其PGIP基因及启动子序列进行克隆与分析。克隆测序获得了‘南京白沙’桃PGIP基因cDNA序列(GenBank登录号:HQ453972)和PGIP基因组DNA序列以及起始密码子上游453bp的启动子序列(GenBank登录号:HQ453974),并将该PGIP基因命名为PpPGIP2。‘南京白沙’桃PpPGIP2序列分析显示,该DNA序列具有完整的阅读框,无内含子,与GenBank中登录的李属PGIP基因序列同源性在93%～98%之间,与测序完成的桃全基因组中该基因的序列同源性为96%;PpPGIP2编码的氨基酸序列分析显示,该氨基酸序列含有2个典型的亮氨酸重复序列,信号肽为第1～第24个氨基酸残基;PGIP基因的序列聚类图显示,除了科、属、种间的同源性差异外,桃的种内PGIP基因同源性也有较大差异;PpPGIP2启动子序列分析发现3个抗病相关元件,分别为:GT1CONSENSUS、SEBFCONSSTPR10A和WBOXATNPR1,另外还有与激素调控、胁迫有关的调控元件。本研究对‘南京白沙’桃PGIP基因和启动子的克隆与分析,将为进一步研究桃PGIP基因的表达调控及其功能分析提供参考。 展开更多

关键词 桃 PGIP基因 CDNA序列 启动子 调控元件

在线阅读 下载PDF 职称材料

九台晚李PGIP基因的克隆及生物信息学分析 被引量：4

15

作者 郭庆勋 张春雨 +2 位作者 王晶莹 周连霞 王彦涛 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期650-653,共4页

以九台晚李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,PCR扩增到1条全长1192bp的目的片段（GenBank登录号：GU068978）。该基因包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基... 以九台晚李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,PCR扩增到1条全长1192bp的目的片段（GenBank登录号：GU068978）。该基因包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列。序列分析表明：该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95%-99%。系统进化分析显示出属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点。该序列为植物分子抗病育种提供了1条新的基因资源。 展开更多

关键词 九台晚李 PGIP基因 基因克隆 生物信息学

原文传递

梅PGIP基因的启动子克隆及生物信息学分析 被引量：5

16

作者 李广平 张长青 章镇 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期883-887,共5页

根据梅PGIP基因（GenBank登录号：DQ364056.1）5′端序列设计特异反向引物,利用染色体步行法获得了该基因上游1 037 bp的启动子序列.启动子结构分析表明,梅PGIP基因启动子序列与中国李PGIP基因启动子显著相似,相似度达89%~96%,较中国李P... 根据梅PGIP基因（GenBank登录号：DQ364056.1）5′端序列设计特异反向引物,利用染色体步行法获得了该基因上游1 037 bp的启动子序列.启动子结构分析表明,梅PGIP基因启动子序列与中国李PGIP基因启动子显著相似,相似度达89%~96%,较中国李PGIP基因启动子多一个100 bp的区段,与水稻和豆的启动子序列均无Blast比对结果.转录调控元件预测结果表明,克隆序列与豆相应序列的保守区存在着能调控抗病基因转录的GT1结合位点. 展开更多

关键词 梅 PGIP基因 启动子 调控元件

在线阅读 下载PDF 职称材料

甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析 被引量：2

17

作者 彭琦 陈松 +5 位作者 张维 伍林涛 周晓婴 高建芹 张洁夫 戚存扣 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期687-693,共7页

菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中... 菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中克隆得到1个尚未报道的PGIP基因家族新成员——PGIP18。通过生物信息学分析发现,该基因的DNA具有1段长97bp的内含子序列和两段外显子序列,编码的氨基酸序列与甘蓝型油菜PGIP2亚家族蛋白同源性较高,且都由保守的N端信号肽和富含亮氨酸的LRR重复结构域组成。该基因的克隆为揭示油菜中内源PGIP基因的抗病机制和功能研究提供了新的基因资源。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 PGIP家族 PGIP18 克隆 生物信息学分析

原文传递

小麦PGIP的免疫组织细胞化学定位 被引量：4

18

作者 周立 阮期平 +1 位作者 李建吾 张杰 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期916-923,共8页

通过电镜及光镜采用酶免疫组织化学技术 ,快速组织印迹及dot immunobindingassay研究了多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (Polygalacturonaseinhibitingprotein ,简称PGIP)在小麦组织细胞中的定位分布及含量 .结果表明 ,PGIP主要集中分布于维... 通过电镜及光镜采用酶免疫组织化学技术 ,快速组织印迹及dot immunobindingassay研究了多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (Polygalacturonaseinhibitingprotein ,简称PGIP)在小麦组织细胞中的定位分布及含量 .结果表明 ,PGIP主要集中分布于维管系统和表皮 ,亚细胞水平定位于与细胞壁连接的外侧细胞质膜和细胞质中 ,同一品种小麦的不同器官PGIP含量不同 ,其中茎的PGIP含量最高 ,根次之 ,叶中最少 .对小麦PGIP的分布定位与其功能关系进行了讨论 。 展开更多

关键词 小麦 PGIP 免疫细胞定位 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 免疫组织化学 快速组织印迹

在线阅读 下载PDF 职称材料

紫花苜蓿PGIP同源基因克隆与序列核苷酸多态性分析 被引量：3

19

作者 桂枝 肖婷 +4 位作者 皮永硕 袁庆华 杨建翔 刘妍 高建明 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1603-1611,共9页

多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)是植物重要的防卫蛋白之一,了解PGIP基因的核苷酸序列是对其进行分子遗传学与分子生物学研究的前提与基础。本研究采用同源克隆法,从16个紫花苜蓿(Medicago sativa)品种的集群DNA中克隆了7个苜蓿PGIP基... 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)是植物重要的防卫蛋白之一,了解PGIP基因的核苷酸序列是对其进行分子遗传学与分子生物学研究的前提与基础。本研究采用同源克隆法,从16个紫花苜蓿(Medicago sativa)品种的集群DNA中克隆了7个苜蓿PGIP基因的部分基因组编码序列,分别对应于蒺藜苜蓿(M.truncatula)7个不同的PGIP基因,并命名为Ms PGIP5、Ms PGIP6、Ms PGIP7、Ms PGIP8、Ms PGIP9、Ms PGIP10和Ms PGIP11。其中,Ms PGIP5、Ms PGIP6、Ms PGIP8、Ms PGIP9和Ms PGIP11的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点间的平均距离分别为20、74、34、423和21 bp,差异较大。对Ms PGIP5、Ms PGIP6、Ms PGIP8和Ms PGIP11进行荧光标记PCR单链构象多态性(FPCR-SSCP)分析,结果表明,其等位基因数目与PCR片段长度的比值分别为20、56、22和19 bp,变化趋势与这4个基因SNP位点间的平均距离基本一致。比较而言,在发现的7个苜蓿PGIP基因中,Ms PGIP9序列高度保守,Ms PGIP5和Ms PGIP11的变异较大,而Ms PGIP6与Ms PGIP8的变异中等。 展开更多

关键词 紫花苜蓿 PGIP 基因组序列分离 单核苷酸多态性 荧光标记PCR单链构象多态性

在线阅读 下载PDF 职称材料

中矮1号梨砧木(S_2)PGIP基因的克隆及序列分析 被引量：2

20

作者 蒋豪 汤浩茹 +2 位作者 古英洪 张勇 罗娅 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期462-466,共5页

利用RT-PCR技术,根据GenBank中梨属PGIP基因序列设计1对特异引物,以梨矮化砧木S2叶片总RNA为模板,克隆到1条约1100bp的cDNA片段,将其与pMD18-Tvector连接后转化Escherichia coli JM109,对筛选到的阳性克隆进行序列测定并使用生物信息学... 利用RT-PCR技术,根据GenBank中梨属PGIP基因序列设计1对特异引物,以梨矮化砧木S2叶片总RNA为模板,克隆到1条约1100bp的cDNA片段,将其与pMD18-Tvector连接后转化Escherichia coli JM109,对筛选到的阳性克隆进行序列测定并使用生物信息学方法对所得结果进行综合分析。结果表明,克隆片段为梨PGIP基因,该cDNA编码330个氨基酸,预测分子量为36388ku,第1～24个氨基酸残基是信号肽。与梨属其它种中已获得的PGIP核苷酸序列开放阅读框(Open reading frame,ORF)的同源性为97.5%～99.6%,氨基酸序列的同源性为97.6%～99.1%。 展开更多

关键词 梨(Pyres ussuriensis) 矮化砧木 基因克隆 PGIP基因 序列分析

在线阅读 下载PDF 职称材料