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甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析
被引量:
2
1
作者
彭琦
陈松
+5 位作者
张维
伍林涛
周晓婴
高建芹
张洁夫
戚存扣
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期687-693,共7页
菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中...
菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中克隆得到1个尚未报道的PGIP基因家族新成员——PGIP18。通过生物信息学分析发现,该基因的DNA具有1段长97bp的内含子序列和两段外显子序列,编码的氨基酸序列与甘蓝型油菜PGIP2亚家族蛋白同源性较高,且都由保守的N端信号肽和富含亮氨酸的LRR重复结构域组成。该基因的克隆为揭示油菜中内源PGIP基因的抗病机制和功能研究提供了新的基因资源。
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关键词
甘蓝型油菜
PGIP家族
pgip18
克隆
生物信息学分析
原文传递
题名
甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析
被引量:
2
1
作者
彭琦
陈松
张维
伍林涛
周晓婴
高建芹
张洁夫
戚存扣
机构
国家油菜改良中心南京分中心农业部长江下游棉花与油菜重点实验室江苏省农业科学院经济作物研究所
贵州禾睦福种子有限公司
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期687-693,共7页
基金
国家自然科学基金(31301357)
江苏省自然科学基金(BK20130719)
+1 种基金
江苏省农业科技自主创新资金(CX(13)5009)
贵州省筑科基金(2012HK209-38)共同资助
文摘
菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中克隆得到1个尚未报道的PGIP基因家族新成员——PGIP18。通过生物信息学分析发现,该基因的DNA具有1段长97bp的内含子序列和两段外显子序列,编码的氨基酸序列与甘蓝型油菜PGIP2亚家族蛋白同源性较高,且都由保守的N端信号肽和富含亮氨酸的LRR重复结构域组成。该基因的克隆为揭示油菜中内源PGIP基因的抗病机制和功能研究提供了新的基因资源。
关键词
甘蓝型油菜
PGIP家族
pgip18
克隆
生物信息学分析
Keywords
Brassica napus L. PGIP family
pgip18
Cloning Bioinformatics analysis
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析
彭琦
陈松
张维
伍林涛
周晓婴
高建芹
张洁夫
戚存扣
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
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