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滇龙胆PGIP基因家族全基因组鉴定及表达模式 被引量：1
1
作者 徐梦恒 袁文雪 +2 位作者 陈丹 王亚轩 梁艳丽 《云南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第3期97-107,共11页
【目的】探究多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting protein,PGIP)基因在滇龙胆(Gentiana rigescens)花冠感温运动中的潜在功能。【方法】基于滇龙胆的全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法分析PGIP家族的理化性... 【目的】探究多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting protein,PGIP)基因在滇龙胆(Gentiana rigescens)花冠感温运动中的潜在功能。【方法】基于滇龙胆的全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法分析PGIP家族的理化性质、基因结构、系统发育关系、保守结构域、顺式作用元件和表达模式。【结果】滇龙胆PGIP基因家族包含10个成员,不均匀地分布在第1、2、4、5、9号染色体上。GrPGIP基因都含有外显子。GrPGIP均为亲水性蛋白,亚细胞定位预测其主要位于细胞壁。大部分GrPGIP基因家族成员的启动子区域都包含光响应元件与激素响应元件。共线性分析显示:PGIP基因家族在双子叶植物中较为保守。GO富集分析显示:GrPGIP基因可能在细胞壁中发挥重要作用。10个GrPGIP基因在滇龙胆花冠感温过程中均存在差异表达,推测GrPGIP基因可能参与花冠运动。【结论】研究结果初步阐明了GrPGIP在滇龙胆感温运动中的表达模式,为进一步研究GrPGIP在滇龙胆花冠运动中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 滇龙胆 感温运动 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(pgip) 细胞壁
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甘蓝型油菜PGIP基因家族新成员PGIP18的克隆及序列分析 被引量：2
2
作者 彭琦 陈松 +5 位作者 张维 伍林涛 周晓婴 高建芹 张洁夫 戚存扣 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期687-693,共7页
菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中... 菌核病是油菜的主要病害之一,目前尚未在油菜及相关植物中找到抗性基因。油菜等植物中的PGIP蛋白对核盘菌的致病因子PG具有诱导性防卫反应作用,有关PGIP蛋白的防卫反应机制研究已成为热点。本研究利用同源序列法,从甘蓝型油菜宁RS-1中克隆得到1个尚未报道的PGIP基因家族新成员——PGIP18。通过生物信息学分析发现,该基因的DNA具有1段长97bp的内含子序列和两段外显子序列,编码的氨基酸序列与甘蓝型油菜PGIP2亚家族蛋白同源性较高,且都由保守的N端信号肽和富含亮氨酸的LRR重复结构域组成。该基因的克隆为揭示油菜中内源PGIP基因的抗病机制和功能研究提供了新的基因资源。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 pgip家族 pgip18 克隆 生物信息学分析
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小麦可溶性和不溶性PGIP分离纯化的初步研究 被引量：1
3
作者 阮期平 周立 谢家建 《绵阳师范学院学报》 1999年第2期47-54,共8页
以小麦黄化苗为材料,采用不同离子强度的缓冲液抽提,通过硫酸铵分级沉淀、离子交换层析和分子筛层等步骤分离出两种不同分布的PGIP.经SDS-PAGE分析:不溶性PGIP出现两条谱带,分子量为41KD和39KD,而可溶性PGIP出现一条谱带,分子量为41KD.
关键词 小麦黄化苗 不溶性pgip 可溶性pgip 纯化
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梅PGIP基因的克隆及全序列分析 被引量：18
4
作者 李广平 房经贵 +2 位作者 蔡斌华 章镇 张长青 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期125-127,共3页
通过PCR扩增,从梅基因组中得到1条全长1 192 bp的多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PG IP)基因序列。该序列包含有1个完整的开放阅读框和1个内元。比对结果表明,克隆到的序列与桃、马哈利樱桃中相应序列一致度分别为96%和95%,其蛋白质序列与桃... 通过PCR扩增,从梅基因组中得到1条全长1 192 bp的多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PG IP)基因序列。该序列包含有1个完整的开放阅读框和1个内元。比对结果表明,克隆到的序列与桃、马哈利樱桃中相应序列一致度分别为96%和95%,其蛋白质序列与桃、马哈利樱桃的蛋白质序列一致度分别为97%和94%。该蛋白质序列中包含着一段亮氨酸重复序列。 展开更多
关键词 梅 pgip基因 克隆 序列分析
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中国李PGIP基因的克隆及序列分析 被引量：12
5
作者 李广平 乔玉山 +2 位作者 陶建敏 高志红 章镇 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1870-1873,共4页
以中国李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列为引物,扩增到1条全长1 192 bp的目的片段（Genbank登录号：DQ200847）.序列分析表明：该片段与杏、桃、马哈利樱桃、梅的PGIP基因序列一致度达96%～99%,包含有1个完整的开放阅读框和1个内含... 以中国李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列为引物,扩增到1条全长1 192 bp的目的片段（Genbank登录号：DQ200847）.序列分析表明：该片段与杏、桃、马哈利樱桃、梅的PGIP基因序列一致度达96%～99%,包含有1个完整的开放阅读框和1个内含子,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列;分子进化分析表明,在分子进化树中,该序列与杏、桃、马哈利樱桃、梅的PGIP序列位于同一类.为植物分子抗病育种提供了1条基因资源. 展开更多
关键词 李 pgip基因 基因克隆 序列分析
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花生HyPGIP基因克隆及抗叶腐病表达分析 被引量：1
6
作者 隋鹏飞 王麒然 +5 位作者 王琰 王志葵 张茹琴 迟玉成 夏淑春 鄢洪海 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期346-356,共11页
本文采用基因克隆和生物信息学方法研究了花生Hy PGIP基因及编码蛋白的基本性质和生物学功能,并通过测定接种叶腐病菌后花生植株内PG酶的活性变化和PGIP蛋白的生成量变化,以及Hy PGIP基因瞬时表达分析,探讨了PGIP蛋白与寄主抗病性关系... 本文采用基因克隆和生物信息学方法研究了花生Hy PGIP基因及编码蛋白的基本性质和生物学功能,并通过测定接种叶腐病菌后花生植株内PG酶的活性变化和PGIP蛋白的生成量变化,以及Hy PGIP基因瞬时表达分析,探讨了PGIP蛋白与寄主抗病性关系。结果表明,受叶腐病菌侵染的花生植株中,抗病品种的PG酶活性都明显低于感病品种,而生成的PGIP蛋白量都比感病品种显著多,暗示PGIP蛋白与花生叶腐病抗性有关。经基因克隆和测序获得HyPGIP基因全长序列为1 029 bp,编码342个氨基酸,无内含子,终止密码子为TGA,与已报道的五个花生PGIP序列的同源性都很高;结构预测发现该序列存在8个LRR结构域,存在信号肽,疏水性较强,定位于细胞壁上;RT-PCR显示,经接种叶腐病菌处理后,花生植株中的PGIP基因表达量明显增加。 展开更多
关键词 花生叶腐病 多聚半乳糖醛酸酶(PG) 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(pgip) Hypgip基因克隆 定量分析
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转梅PGIP基因增强菊花抗病性研究 被引量：10
7
作者 于淼 刘兆磊 +1 位作者 陈素梅 陈发棣 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1111-1116,共6页
通过农杆菌介导法将梅多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)转入盆栽小菊品种‘05-44-2’中,以提高对真菌病害的抗性。经Hyg抗性筛选,获得232株抗性苗。对其中40株进行PCR检测,有8株扩增出目的条带;对这8株进行RT-PCR检测,发现其中有5个... 通过农杆菌介导法将梅多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)转入盆栽小菊品种‘05-44-2’中,以提高对真菌病害的抗性。经Hyg抗性筛选,获得232株抗性苗。对其中40株进行PCR检测,有8株扩增出目的条带;对这8株进行RT-PCR检测,发现其中有5个株系有目的条带出现,且发生基因转录。转基因菊花的抗病性检测证实,与对照相比,转基因株系对黑斑病有不同程度的抗性,表现为发病延迟,病情指数降低;株系7抗性最强,其苗期病情指数仅为33。 展开更多
关键词 菊花 pgip基因 转化 黑斑病 抗病性
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中国李pgip启动子的克隆及调控元件分析 被引量：11
8
作者 李广平 张长青 +1 位作者 章镇 曹福亮 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1425-1430,共6页
在已克隆中国李pgip序列的基础上,通过染色体步行法获得了该基因上游1869bp的启动子序列,联合生物信息学中的进化印记法和启动子扫描法对克隆的启动子序列进行了调控元件识别。结果报道了3个调控元件:1个TGA1结合位点(TGACG)和2个WRKY... 在已克隆中国李pgip序列的基础上,通过染色体步行法获得了该基因上游1869bp的启动子序列,联合生物信息学中的进化印记法和启动子扫描法对克隆的启动子序列进行了调控元件识别。结果报道了3个调控元件:1个TGA1结合位点(TGACG)和2个WRKY结合位点(TGAC)。这为全面揭示pgip表达的转录调控机制提供了遗传基础。 展开更多
关键词 中国李 pgip启动子 克隆 调控元件分析
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龙眼梅PGIP基因的克隆及序列分析 被引量：8
9
作者 王家福 朱春林 +3 位作者 陈桂信 潘东明 潘才博 叶露莹 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期55-58,共4页
利用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)得到在龙眼梅(PrunusmumeSiebetZucc.Longyan)嫩芽中特异性表达的PGIP基因。DNA序列分析表明,所获得龙眼梅的PGIPcDNA的序列全长为1045bp,该序列与已发表的PGIP基因有很高的同源性。
关键词 龙眼梅 pgip基因 克隆
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马哈利樱桃PGIP cDNA克隆及序列分析 被引量：6
10
作者 张军科 张开春 +1 位作者 李嘉瑞 张晓明 《西北植物学报》 CAS CSCD 2001年第6期1123-1127,共5页
以马哈利樱桃 (Prunus mahaleb L .)为材料 ,通过 RT- PCR获得了 1 0 4 5 bp的目的片段 ,经克隆测序 ,证实该片段包含 1个完整的开放阅读框架 ,该阅读框架由 990碱基组成 ,编码 3 3 0个氨基酸。该序列与杏、梨、苹果的 PGIP c DNA序列... 以马哈利樱桃 (Prunus mahaleb L .)为材料 ,通过 RT- PCR获得了 1 0 4 5 bp的目的片段 ,经克隆测序 ,证实该片段包含 1个完整的开放阅读框架 ,该阅读框架由 990碱基组成 ,编码 3 3 0个氨基酸。该序列与杏、梨、苹果的 PGIP c DNA序列同源性分别达 97.2 %、83 .4%和83 .6 % ,可能编码的氨基酸与杏、梨、苹果的 PGIP c DNA所编码的氨基酸的同源性分别达到96 .7%、85 .2 %和 85 .2 %。与已经克隆的 PGIP DNA序列的对比分析表明 ,PGIP DNA序列中包含 2个外显子和 1个内含子 ,内含子全长 1 47bp,符合 TG- AG规律 ,2个外显子长度分别为 5 81 bp、46 4 展开更多
关键词 樱桃 pgip CDNA 基因克隆 测序 真菌病害 抗病性
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桃PGIP基因及其启动子的克隆与分析 被引量：4
11
作者 王秀云 张计育 +3 位作者 高志红 章镇 俞明亮 张妤艳 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期159-167,共9页
桃流胶病是一种严重危害桃树的真菌性病害,为研究PGIP基因在桃抗流胶病及抗其它真菌性病害中的作用,本研究以桃抗流胶病品种‘南京白沙’叶片为材料,对其PGIP基因及启动子序列进行克隆与分析。克隆测序获得了‘南京白沙’桃PGIP基因cDN... 桃流胶病是一种严重危害桃树的真菌性病害,为研究PGIP基因在桃抗流胶病及抗其它真菌性病害中的作用,本研究以桃抗流胶病品种‘南京白沙’叶片为材料,对其PGIP基因及启动子序列进行克隆与分析。克隆测序获得了‘南京白沙’桃PGIP基因cDNA序列(GenBank登录号:HQ453972)和PGIP基因组DNA序列以及起始密码子上游453bp的启动子序列(GenBank登录号:HQ453974),并将该PGIP基因命名为PpPGIP2。‘南京白沙’桃PpPGIP2序列分析显示,该DNA序列具有完整的阅读框,无内含子,与GenBank中登录的李属PGIP基因序列同源性在93%～98%之间,与测序完成的桃全基因组中该基因的序列同源性为96%;PpPGIP2编码的氨基酸序列分析显示,该氨基酸序列含有2个典型的亮氨酸重复序列,信号肽为第1～第24个氨基酸残基;PGIP基因的序列聚类图显示,除了科、属、种间的同源性差异外,桃的种内PGIP基因同源性也有较大差异;PpPGIP2启动子序列分析发现3个抗病相关元件,分别为:GT1CONSENSUS、SEBFCONSSTPR10A和WBOXATNPR1,另外还有与激素调控、胁迫有关的调控元件。本研究对‘南京白沙’桃PGIP基因和启动子的克隆与分析,将为进一步研究桃PGIP基因的表达调控及其功能分析提供参考。 展开更多
关键词 桃 pgip基因 CDNA序列 启动子 调控元件
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小麦PGIP的免疫组织细胞化学定位 被引量：4
12
作者 周立 阮期平 +1 位作者 李建吾 张杰 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期916-923,共8页
通过电镜及光镜采用酶免疫组织化学技术 ,快速组织印迹及dot immunobindingassay研究了多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (Polygalacturonaseinhibitingprotein ,简称PGIP)在小麦组织细胞中的定位分布及含量 .结果表明 ,PGIP主要集中分布于维... 通过电镜及光镜采用酶免疫组织化学技术 ,快速组织印迹及dot immunobindingassay研究了多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (Polygalacturonaseinhibitingprotein ,简称PGIP)在小麦组织细胞中的定位分布及含量 .结果表明 ,PGIP主要集中分布于维管系统和表皮 ,亚细胞水平定位于与细胞壁连接的外侧细胞质膜和细胞质中 ,同一品种小麦的不同器官PGIP含量不同 ,其中茎的PGIP含量最高 ,根次之 ,叶中最少 .对小麦PGIP的分布定位与其功能关系进行了讨论 。 展开更多
关键词 小麦 pgip 免疫细胞定位 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 免疫组织化学 快速组织印迹
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小麦在与水杨酸诱导的应答过程中PGIP的积累 被引量：10
13
作者 阮期平 周立 刘勇 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2000年第4期313-316,共4页
以SW8 9 2 5 89小麦品系为材料 ,利用自制的小麦抗PGIP血清和dot immunobindingassay ,并结合PGIP粗提液对endo PG的抑制实验 ,研究了小麦内源多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (PGIP)水平与水杨酸之间的应答关系 .发现用水杨酸处理过的PGIP粗... 以SW8 9 2 5 89小麦品系为材料 ,利用自制的小麦抗PGIP血清和dot immunobindingassay ,并结合PGIP粗提液对endo PG的抑制实验 ,研究了小麦内源多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白 (PGIP)水平与水杨酸之间的应答关系 .发现用水杨酸处理过的PGIP粗提液在NC膜上的显色斑点颜色均较H2 O处理的PGIP粗提液深 ,而且对en do PG的抑制程度也高于未用水杨酸处理的PGIP粗提液 .这充分说明水杨酸能诱导小麦内源PGIP水平稳定的提高 .此结果为进一步弄清PGIP抗病机理提供了有用的资料 .图 4表 1参 展开更多
关键词 水杨酸 诱导 pgip 小麦
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扁桃PGIP基因的克隆及其序列分析 被引量：9
14
作者 武彦霞 田建保 +2 位作者 曹秋芬 樊新萍 杨晓宇 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期54-59,共6页
以晋扁一号扁桃(Prunus dulcis Miller.)基因组DNA为模板,用已登录的扁桃PGIP(多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白)基因保守序列设计引物进行PCR扩增,得到了6个PGIP基因片段并克隆到PBS-T载体中。根据测序结果分析,可利用其中的3个片断,分别命名... 以晋扁一号扁桃(Prunus dulcis Miller.)基因组DNA为模板,用已登录的扁桃PGIP(多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白)基因保守序列设计引物进行PCR扩增,得到了6个PGIP基因片段并克隆到PBS-T载体中。根据测序结果分析,可利用其中的3个片断,分别命名为PdPGIP1(717bp),PdPGIP2(864bp)和PdPGIP3(796bp),与公共数据库中的序列相似性比较,其中PdPGIP2和PdPGIP3各包含2个外显子和1个内含子,内含子符合GT-AG规律。其核苷酸序列分别与Genbank中登录的3个扁桃以及桃(P.persica Linn.)、杏(P.armeniaca Linn.)、美洲李(P.americana Marsh.)、中国李(P.salicina Lindl.)、马哈利樱桃(P.mahaleb Linnaeus)、苦樱桃(P.emarginata Walp.)、梅(P.mume Sieb.)的mRNA、DNA序列显示出极高的同源性,基本都在90%以上,其中PdPGIP1、PdPGIP2、PdPGIP3与Genbank中登录的3个扁桃PGIP基因的同源性为92%～99%。对氨基酸序列保守性分析发现,含有多数植物PGIP抗病基因表达蛋白特有的亮氨酸重复序列。证明我们所克隆的目的片段为PGIP基因。 展开更多
关键词 扁桃 pgipDNA 克隆 测序
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九台晚李PGIP基因的克隆及生物信息学分析 被引量：4
15
作者 郭庆勋 张春雨 +2 位作者 王晶莹 周连霞 王彦涛 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期650-653,共4页
以九台晚李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,PCR扩增到1条全长1192bp的目的片段（GenBank登录号：GU068978）。该基因包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基... 以九台晚李叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,PCR扩增到1条全长1192bp的目的片段（GenBank登录号：GU068978）。该基因包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列。序列分析表明：该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95%-99%。系统进化分析显示出属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点。该序列为植物分子抗病育种提供了1条新的基因资源。 展开更多
关键词 九台晚李 pgip基因 基因克隆 生物信息学
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梅PGIP基因的启动子克隆及生物信息学分析 被引量：5
16
作者 李广平 张长青 章镇 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期883-887,共5页
根据梅PGIP基因（GenBank登录号：DQ364056.1）5′端序列设计特异反向引物,利用染色体步行法获得了该基因上游1 037 bp的启动子序列.启动子结构分析表明,梅PGIP基因启动子序列与中国李PGIP基因启动子显著相似,相似度达89%~96%,较中国李P... 根据梅PGIP基因（GenBank登录号：DQ364056.1）5′端序列设计特异反向引物,利用染色体步行法获得了该基因上游1 037 bp的启动子序列.启动子结构分析表明,梅PGIP基因启动子序列与中国李PGIP基因启动子显著相似,相似度达89%~96%,较中国李PGIP基因启动子多一个100 bp的区段,与水稻和豆的启动子序列均无Blast比对结果.转录调控元件预测结果表明,克隆序列与豆相应序列的保守区存在着能调控抗病基因转录的GT1结合位点. 展开更多
关键词 梅 pgip基因 启动子 调控元件
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抗根腐病的转GmPGIP3基因小麦扬麦18的获得与鉴定 被引量：7
17
作者 党良 王爱云 +4 位作者 徐惠君 祝秀亮 杜丽璞 邵艳军 张增艳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1833-1838,共6页
GmPGIP3是大豆的一种多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白,能够特异性地抑制部分病原真菌内切多聚半乳糖醛酸活性,从而减弱病原菌对植株的侵害。利用基因重组技术构建了GmPGIP3基因的单子叶植物表达载体pA25-GmPGIP3,通过基因枪介导法将pA25-GmPG... GmPGIP3是大豆的一种多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白,能够特异性地抑制部分病原真菌内切多聚半乳糖醛酸活性,从而减弱病原菌对植株的侵害。利用基因重组技术构建了GmPGIP3基因的单子叶植物表达载体pA25-GmPGIP3,通过基因枪介导法将pA25-GmPGIP3转入小麦品种扬麦18中。对转GmPGIP3基因扬麦18的T0至T2代植株进行PCR、Southern杂交、半定量RT-PCR和荧光定量Q-RT-PCR分析,并对根腐病进行抗性鉴定。结果表明,GmPGIP3已转入扬麦18,并在转基因小麦中遗传、转录和表达;与受体材料相比,5个GmPGIP3过表达的转基因小麦株系对根腐病的抗性有明显提高。 展开更多
关键词 多聚半乳糖醛酸抑制蛋白 Gmpgip3 转基因小麦 分子检测 根腐病 抗性
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中矮1号梨砧木(S_2)PGIP基因的克隆及序列分析 被引量：2
18
作者 蒋豪 汤浩茹 +2 位作者 古英洪 张勇 罗娅 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期462-466,共5页
利用RT-PCR技术,根据GenBank中梨属PGIP基因序列设计1对特异引物,以梨矮化砧木S2叶片总RNA为模板,克隆到1条约1100bp的cDNA片段,将其与pMD18-Tvector连接后转化Escherichia coli JM109,对筛选到的阳性克隆进行序列测定并使用生物信息学... 利用RT-PCR技术,根据GenBank中梨属PGIP基因序列设计1对特异引物,以梨矮化砧木S2叶片总RNA为模板,克隆到1条约1100bp的cDNA片段,将其与pMD18-Tvector连接后转化Escherichia coli JM109,对筛选到的阳性克隆进行序列测定并使用生物信息学方法对所得结果进行综合分析。结果表明,克隆片段为梨PGIP基因,该cDNA编码330个氨基酸,预测分子量为36388ku,第1～24个氨基酸残基是信号肽。与梨属其它种中已获得的PGIP核苷酸序列开放阅读框(Open reading frame,ORF)的同源性为97.5%～99.6%,氨基酸序列的同源性为97.6%～99.1%。 展开更多
关键词 梨(Pyres ussuriensis) 矮化砧木 基因克隆 pgip基因 序列分析
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云南野生中华猕猴桃PGIP基因的克隆与分析 被引量：4
19
作者 于瑶 刘小珍 +1 位作者 刘惠民 张汉尧 《经济林研究》 北大核心 2013年第4期73-77,共5页
多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)是存在于多种植物细胞壁中的一种糖蛋白,它能专一性识别真菌多聚半乳糖醛酸酶并抑制其活性,并能在一定程度上抑制真菌对植物细胞壁的降解。该蛋白在植物抵制真菌病害的发生中发挥着重要作用。文中利用PC... 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)是存在于多种植物细胞壁中的一种糖蛋白,它能专一性识别真菌多聚半乳糖醛酸酶并抑制其活性,并能在一定程度上抑制真菌对植物细胞壁的降解。该蛋白在植物抵制真菌病害的发生中发挥着重要作用。文中利用PCR技术,从抗病能力较强的云南野生中华猕猴桃中成功地克隆了多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因(PGIP)的完整开放阅框架,并对其进行了序列和BLAST比对分析,此外,还通过生物信息学分析,对该基因氨基酸序列进行了结构域分析和蛋白质高级结构预测。结果表明:所得的PGIP基因996 bp为一个完整的开放阅读框,编码332个氨基酸;该片段与其它植物中的PGIP有很高的同源性,其与美味猕猴桃的同源性最高(达99%),与美洲李、越桔灌蓝莓和葡萄的PGIP基因的同源性分别为96%、78%、72%。该基因的成功克隆与文中的分析结果,为后续的基因功能确证及猕猴桃品种改良打下了基础。 展开更多
关键词 中华猕猴桃 pgip基因 克隆 分析
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草原樱桃PGIP基因的克隆及生物信息学分析 被引量：2
20
作者 于文全 刘海荣 +1 位作者 杨晓华 赵恒田 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第6期38-42,共5页
为了克隆草原樱桃多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,并进行生物信息学分析。以草原樱桃叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,通过PCR扩增获得约1 kb的DNA片段。序列分析表明,该基因全长1 193 bp,包含有1个完整的开放阅读框,由2个外... 为了克隆草原樱桃多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,并进行生物信息学分析。以草原樱桃叶片基因组为模板,PGIP基因保守序列设计引物,通过PCR扩增获得约1 kb的DNA片段。序列分析表明,该基因全长1 193 bp,包含有1个完整的开放阅读框,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长990 bp,编码330个氨基酸,其编码的氨基酸序列中含有一段典型的亮氨酸重复序列,GenBank登录号为GU068977;该基因与中国李、杏、桃、马哈利樱桃、梅等李属植物的PGIP基因序列一致度达95%～99%。系统进化分析显示,属内亲缘关系较近、属间亲缘关系较远的特点。克隆了草原樱桃PGIP基因,为樱桃抗病育种提供一条新的基因资源。 展开更多
关键词 草原樱桃 pgip基因 基因克隆 生物信息学
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