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猪PGAM2基因的克隆、序列特征及表达分析 被引量:5
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作者 伍晓雄 唐中林 +4 位作者 李勇 杨述林 储明星 马月辉 李奎 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1183-1189,共7页
克隆了猪PGAM2基因的cDNA序列,并利用生物信息学方法进行分析。所得cDNA序列全长913 bp,包含1个完整的开放阅读框,编码253个氨基酸。序列分析表明,该基因预测编码蛋白与已报道的狗(97.6%)、人(96%)、黑猩猩(96%)、大鼠(94.5)和... 克隆了猪PGAM2基因的cDNA序列,并利用生物信息学方法进行分析。所得cDNA序列全长913 bp,包含1个完整的开放阅读框,编码253个氨基酸。序列分析表明,该基因预测编码蛋白与已报道的狗(97.6%)、人(96%)、黑猩猩(96%)、大鼠(94.5)和小鼠(94.1%)等物种的PGAM2蛋白高度同源其在N端和C端分别存在1个ATHR和QGKA模体,在14~15AA处存在1个信号肽切割位点,含有1个典型的碳水化合物运输和代谢(GPMA)保守结构域。该基因在猪胚胎骨骼肌发育过程中差异表达,且在通城猪和长白猪中呈现不同表达模式。在通城猪中,PGAM2基因呈波浪式表达,即妊娠65 d时表达水平最高,且各时间点表达水平差异极显著(P〈0.01)。在长白猪中呈上调表达模式,妊娠65和90 d时表达丰富,且极显著高于妊娠33 d(P〈0.01)。品种间比较来看,在妊娠33和65 d时两品种表达水平相当,但妊娠90 d时长白猪中的表达水平极显著高于通城猪(P=0.006)。 展开更多
关键词 pgam2基因 序列分析 表达 胚胎骨骼肌
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意大利蜜蜂amPGAM2基因的克隆、序列特征及表达分析 被引量:1
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作者 欧阳霞辉 彭帅 +3 位作者 徐文凯 朱雪蕾 郑相相 陈红 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期889-897,共9页
【目的】磷酸甘油酸变位酶(PGAM)是糖酵解和葡萄糖异生途径中一种发挥重要作用的蛋白酶,本研究拟明确amPGAM2基因的序列特征及表达模式。【方法】以意大利蜜蜂Apismellifera为研究对象,克隆了amPGAM2基因的cDNA序列,分析了其序列特征及... 【目的】磷酸甘油酸变位酶(PGAM)是糖酵解和葡萄糖异生途径中一种发挥重要作用的蛋白酶,本研究拟明确amPGAM2基因的序列特征及表达模式。【方法】以意大利蜜蜂Apismellifera为研究对象,克隆了amPGAM2基因的cDNA序列,分析了其序列特征及其在工蜂、雄蜂、蜂王的不同发育时期的表达模式。【结果】序列特征分析表明,克隆所得序列全长976 bp,包含1个完整的开放阅读框,共编码254个氨基酸。该基因核苷酸序列与中华蜜蜂Apiscerana(98.4%)高度相似,并存在15个潜在抗原表位、9个磷酸化位点和5个组氨酸磷酸酶域活性部位,属于组氨酸磷酸酶超家族,是一种二磷酸甘油酸依赖性的可溶中性稳定蛋白。荧光定量PCR结果表明,amPGAM2基因在不同品级、不同发育时期的表达差异显著(P<0.05)。工蜂卵期3日龄、幼虫期5日龄表达最高,雄蜂成虫期表达最高,蜂王幼虫期4日龄表达最高,且工蜂、雄蜂及蜂王由卵孵化成幼虫阶段和由红眼蛹羽化至成虫阶段,其表达都呈上升趋势。【结论】本研究结果推测amPGAM2基因在卵的孵化及精卵发生过程中具有重要作用,为进一步认识意大利蜜蜂生殖发育过程中的能量代谢提供理论基础。 展开更多
关键词 意大利蜜蜂 pgam2基因 糖酵解 序列特征 荧光定量
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大白猪PGAM2基因多态性与生长繁殖性状的关联分析
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作者 陈鑫 罗柯 +3 位作者 李清春 卢世豪 赵玉强 黄涛 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期237-243,共7页
实验旨在挖掘大白猪磷酸甘油酸变位酶2(PGAM2)基因单核苷酸多态位点(SNPs),分析遗传多样性、连锁不平衡程度及其不同基因型与生长、繁殖性状的相关性。选取大白母猪316头,提取DNA,采用混合DNA样本PCR扩增产物测序,确定PGAM2基因SNPs位... 实验旨在挖掘大白猪磷酸甘油酸变位酶2(PGAM2)基因单核苷酸多态位点(SNPs),分析遗传多样性、连锁不平衡程度及其不同基因型与生长、繁殖性状的相关性。选取大白母猪316头,提取DNA,采用混合DNA样本PCR扩增产物测序,确定PGAM2基因SNPs位点。采用多重PCR靶向基因捕获技术对每个个体进行目标SNPs位点分型,并分别与大白猪初产和经产的总产仔数、产活仔数、木乃伊数和死胎数进行关联分析,与大白猪生长性状的达100 kg日龄、达100 kg背膘厚、达100 kg眼肌厚和初生重进行关联分析。共鉴定出5个突变位点,均为已知SNP,其中rs331014516和rs346188790位点为稀有突变,不适合用作分子标记;所有位点均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);rs331014516与rs346188790完全连锁,rs80977507与rs80902904完全连锁且与rs343549757强连锁;rs80977507及其完全连锁位点与初产母猪总产仔数、产活仔数显著相关;rs343549757位点与大白猪经产死胎数显著相关。这5个位点的基因型与大白猪达100 kg日龄、达100 kg背膘厚、达100 kg眼肌厚和母猪出生重均无显著相关。本研究在大白猪群体共鉴定出5个PGAM2基因突变位点,4个SNP两两完全连锁;筛选到3个与繁殖性状显著相关的突变位点,为大白猪的分子标记辅助选育提供了参考依据。 展开更多
关键词 大白猪 pgam2基因 SNPS 生长性状 繁殖性状
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前列腺癌组织PGAM2和PRRX2表达与临床病理特征和预后的关系
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作者 顾浩 李帛 +3 位作者 苏瑞平 郭博昕 武国军 李小顺 《中华实用诊断与治疗杂志》 2026年第1期31-37,共7页
目的观察前列腺癌组织PGAM2、PRRX2表达变化,探讨其与临床病理特征和预后的关系。方法2017年9月—2020年9月西安市人民医院诊治前列腺癌患者130例,均行前列腺癌根治术,术后切缘阳性、T3a期或极高危患者行内分泌治疗,并规律随访至2023年1... 目的观察前列腺癌组织PGAM2、PRRX2表达变化,探讨其与临床病理特征和预后的关系。方法2017年9月—2020年9月西安市人民医院诊治前列腺癌患者130例,均行前列腺癌根治术,术后切缘阳性、T3a期或极高危患者行内分泌治疗,并规律随访至2023年10月。取手术切除的癌组织与癌旁组织,采用实时荧光定量PCR法检测PGAM2、PRRX2 mRNA相对表达量;采用免疫组织化学SP法检测PGAM2、PRRX2蛋白表达阳性率;比较不同临床病理特征者PGAM2、PRRX2蛋白表达阳性率。将130例患者依据PGAM2、PRRX2蛋白表达分为阳性组和阴性组,采用Kaplan-Meier生存曲线分析PGAM2、PRRX2阳性组与阴性组的3年无进展生存率和总生存率;采用多因素Cox回归分析前列腺癌患者无进展生存的危险因素。结果(1)前列腺癌组织PGAM2 mRNA(3.78±0.65)、PRRX2 mRNA(2.91±0.71)相对表达量均高于癌旁组织(0.87±0.22、0.95±0.26)(t=48.350、29.556,P均<0.001)。前列腺癌组织PGAM2蛋白阳性、PRRX2蛋白阳性表达率(66.15%、67.69%)均高于癌旁组织(7.69%、6.15%)(χ^(2)=95.386、105.691,P均<0.001)。(2)Gleason评分>7分(83.33%、85.00%)、T3a期者(84.21%、86.84%)前列腺癌组织PGAM2、PRRX2蛋白阳性表达率分别高于Gleason评分≤7分(51.43%、52.86%)、T1-2期(58.70%、59.78%)者(χ^(2)=7.819~15.263,P均<0.05)。(3)随访至2023年10月,130例患者肿瘤局部复发18例,转移17例,死亡15例,3年总生存率为88.46%,3年无进展生存率为61.53%。PGAM2阳性组3年无进展生存率(51.16%)低于PGAM2阴性组(81.82%)(χ^(2)=10.920,P<0.001),PRRX2阳性组3年无进展生存率(48.86%)低于PRRX2阴性组(88.10%)(χ^(2)=12.390,P<0.001)。PGAM2阳性组与阴性组,PRRX2阳性组与阴性组3年总生存率比较差异均无统计学意义(P>0.05)。(4)T3a期(HR=1.172,95%CI:1.016~1.353,P<0.001)、Gleason评分>7分(HR=1.185,95%CI:1.029~1.365,P<0.001)、PGAM2蛋白阳性表达(HR=1.280,95%CI:1.082~1.515,P<0.001)、PRRX2蛋白阳性表达(HR=1.189,95%CI:1.037~1.363,P<0.001)是前列腺癌患者无进展生存的危险因素。结论前列腺癌组织中PGAM2、PRRX2表达上调,与T分期晚、Gleason评分高、无进展生存率低有关,其可能是评估前列腺癌患者无进展生存的标志物。 展开更多
关键词 前列腺癌 pgam2 PRRX2 预后
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大白猪和从江香猪PGAM2基因克隆及表达水平的研究 被引量:1
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作者 龙清孟 周迪 +5 位作者 毛世明 赵忠海 李平 李俊 熊胜利 陈大芳 《当代畜牧》 2020年第8期14-18,共5页
为了探究磷酸甘油酸变位酶(Phosphog lyce rate mutase,PGAMD)mRNA在从江香猪和大白猪不同组织中的表达情况,揭示其在肌肉类型磷酸甘油酸变位酶(PGAM2)基因表达规律,笔者以大白猪和从江香猪作为实验动物,分别提取心脏、肝脏、脾脏、肺... 为了探究磷酸甘油酸变位酶(Phosphog lyce rate mutase,PGAMD)mRNA在从江香猪和大白猪不同组织中的表达情况,揭示其在肌肉类型磷酸甘油酸变位酶(PGAM2)基因表达规律,笔者以大白猪和从江香猪作为实验动物,分别提取心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、大肠、小肠、背最长肌、脂肪等10个组织的总RNA,设计各自实时荧光定量引物,扩增CDS区序列,以猪GAPDH基因作为内参基因,应用实时定量PCR技术检测PGAM2基因不同组织中mRNA的相对表达量。结果发现,贵州从江香猪和大白猪PGAM2基因长度均为913 bp的ORF序列,其中CDS区长度为762 bp,并发现在从江香猪PGAM2基因的CDS序列存在2个碱基突变:A235G、A613G,均属同义突变,和大白猪相比存在A235G一处突变。PGAM2基因在从江香猪和大白猪背最长肌组织中的表达水平极显著(P<0.01)高于其他组织。本研究为PGAM2基因后续真核表达的研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 从江香猪 pgam2 组织表达
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