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猪PFKL基因克隆及生物信息学分析
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作者 葛晨玲 李珣 +6 位作者 王晓晔 梁莹莹 陈志英 杜倩 唐胤晟 黄明光 胡传活 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第2期315-325,共11页
试验旨在探究猪精液6-磷酸果糖激酶(6-phosphofructokinase,PFKL)基因的理化性质和结构特点,以期阐明糖酵解在精子发生过程中的生理作用及调控机制。通过RT-PCR技术扩增PFKL基因,将获得的基因片段插入到pUC57载体上进行克隆测序,并结合... 试验旨在探究猪精液6-磷酸果糖激酶(6-phosphofructokinase,PFKL)基因的理化性质和结构特点,以期阐明糖酵解在精子发生过程中的生理作用及调控机制。通过RT-PCR技术扩增PFKL基因,将获得的基因片段插入到pUC57载体上进行克隆测序,并结合生物信息学方法预测和分析其氨基酸序列、跨膜结构、修饰位点、二级结构、三级结构、抗原位点、功能注释等。结果表明,PFKL基因全长2349 bp,编码782个氨基酸,蛋白质分子质量为83.819 ku,等电点为6.96,为酸性蛋白质,分子式为C3674H5897 N1051O1109S40。猪源PFKL基因与鼠、鸭、羊、牛、猩猩、人的参考序列同源性均高达80.0%以上。该蛋白不存在跨膜结构和信号肽区域,含有2个N-糖基化修饰位点、14个O-糖基化位点、35个磷酸化位点。PFKL蛋白三维建模结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成,与肌肉型磷酸果糖激酶和血小板型磷酸果糖激酶的同源性分别为68.24%和70.84%。PFKL基因含有的27个抗原位点强弱不同,柔韧性分布较均匀,有较高的表面可塑性,且存在PKC、PKA特异性蛋白激酶的结合位点,为具有较多潜在B细胞抗原表位的亲水性蛋白。GO功能注释分析结果表明,PFKL基因具有碳水化合物激酶活性、磷酸果糖激酶活性,能够参与己糖代谢和单糖代谢。本研究结果为改善精子品质和提高精卵结合发生率奠定了分子生物学基础。 展开更多
关键词 pfkl基因 糖酵解 生物信息学分析
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Targeting PFKL with penfluridol inhibits glycolysis and suppresses esophageal cancer tumorigenesis in an AMPK/FOXO3a/BIM-dependent manner 被引量:13
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作者 Cancan Zheng Xiaomei Yu +9 位作者 Yiyao Liang Yidong Zhu Yan He Long Liao Dingkang Wang Yanming Yang Xingfeng Yin Ang Li Qingyu He Bin Li 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2022年第3期1271-1287,共17页
As one of the hallmarks of cancer,metabolic reprogramming leads to cancer progression,and targeting glycolytic enzymes could be useful strategies for cancer therapy.By screening a small molecule library consisting of ... As one of the hallmarks of cancer,metabolic reprogramming leads to cancer progression,and targeting glycolytic enzymes could be useful strategies for cancer therapy.By screening a small molecule library consisting of 1320 FDA-approved drugs,we found that penfluridol,an antipsychotic drug used to treat schizophrenia,could inhibit glycolysis and induce apoptosis in esophageal squamous cell carcinoma(ESCC).Gene profiling and Ingenuity Pathway Analysis suggested the important role of AMPK in action mechanism of penfluridol.By using drug affinity responsive target stability(DARTS)technology and proteomics,we identified phosphofructokinase,liver type(PFKL),a key enzyme in glycolysis,as a direct target of penfluridol.Penfluridol could not exhibit its anticancer property in PFKL-deficient cancer cells,illustrating that PFKL is essential for the bioactivity of penfluridol.High PFKL expression is correlated with advanced stages and poor survival of ESCC patients,and silencing of PFKL significantly suppressed tumor growth.Mechanistically,direct binding of penfluridol and PFKL inhibits glucose consumption,lactate and ATP production,leads to nuclear translocation of FOXO3a and subsequent transcriptional activation of BIM in an AMPK-dependent manner.Taken together,PFKL is a potential prognostic biomarker and therapeutic target in ESCC,and penfluridol may be a new therapeutic option for management of this lethal disease. 展开更多
关键词 Drug repurposing Metabolic reprogramming GLYCOLYSIS pfkl DARTS technology Esophageal cancer Penfluridol
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扩增人肝型磷酸果糖激酶基因对唐氏综合征进行定量基因诊断的研究
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作者 邬晋芳 杨华 +3 位作者 李昭荣 刘琪 蔡晓宁 叶国玲 《中国实用妇科与产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第9期537-539,共3页
目的 扩增位于唐氏综合征关键区域的人肝型磷酸果糖激酶基因 (PFKL基因 ) ,对唐氏综合征进行定量基因诊断。方法 采用定量PCR—微孔板杂交检测PCR产物量的方法 ,对 2 6例唐氏综合征患者及 2 78例正常人外周血DNA标本 ,扩增PFKL基因 ,... 目的 扩增位于唐氏综合征关键区域的人肝型磷酸果糖激酶基因 (PFKL基因 ) ,对唐氏综合征进行定量基因诊断。方法 采用定量PCR—微孔板杂交检测PCR产物量的方法 ,对 2 6例唐氏综合征患者及 2 78例正常人外周血DNA标本 ,扩增PFKL基因 ,扩增片段长度为 185bp ;另外 ,将人肌型磷酸果糖激酶基因 (PFKM基因 )作为内参照同时扩增 ,扩增片段长度为 36 5bp ,定量PCR产物用微孔板杂交检测。 结果  2 6例患者 (包括 1例易位型 )PFKM与PFKL扩增产物的OD值比值介于 0 4 0~ 0 6 0之间 ,平均值为 0 5 1;正常人扩增产物的OD值比值介于 0 80~ 1 2 0之间 ,平均值为 1 12 ,两者比较差异显著 (P <0 0 0 1)。对 2 78例正常人进行同样基因扩增和检测无一例假阳性 ,所得结果与染色体核型分析结果完全符合。结论 定量PCR—微孔板杂交检测PFKL基因拷贝数的方法 ,简便、快速、特异 。 展开更多
关键词 基因诊断 唐氏综合征 21-三体 大肝型磷酸果糖激酶基因 定量聚合酶链反应
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