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乳房炎奶牛金黄色葡萄球菌毒素基因的检测及PFGE分型研究 被引量:21
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作者 王新 韦艺媛 +7 位作者 张静 周婷 梁珍娟 杨保伟 席美丽 夏效东 孟江洪 俞英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期974-980,共7页
作者针对临床及亚临床乳房炎奶牛乳汁中金黄色葡萄球菌分离株的毒素基因进行检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因分型,比较2种类型乳房炎金黄色葡萄球菌分离株的差异。无菌法采集奶样,采用国际标准方法从中分离金黄色葡萄球菌,用多重PCR方... 作者针对临床及亚临床乳房炎奶牛乳汁中金黄色葡萄球菌分离株的毒素基因进行检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因分型,比较2种类型乳房炎金黄色葡萄球菌分离株的差异。无菌法采集奶样,采用国际标准方法从中分离金黄色葡萄球菌,用多重PCR方法扩增nuc基因和mecA基因以确证金黄色葡萄球菌(SA)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)。进一步用PCR方法检测SA的各种毒素基因(SEs、ETs、TSST-1和PVL基因等)。利用限制性内切酶SmaⅠ对SA基因组DNA进行酶切和PFGE分析,最后利用BioNumerics软件进行聚类分析。结果:19.3%(23/119)的临床乳房炎奶样和14.8%(26/176)的亚临床乳房炎奶样确定为金黄色葡萄球菌阳性样品,分别从中分离鉴定出43株和26株金黄色葡萄球菌,其中临床乳房炎分离株中有5株为mecA基因阳性。临床乳房炎奶牛奶样中检测到SA的SEA、SEB、SED、SEJ和PVL毒素基因,检出率分别为3.8%(1株)、11.5%(3株)、19.2%(5株)、7.7%(2株)和31.2%(10株);亚临床乳房炎奶牛乳样中仅检测到SA的SEA和PVL毒力基因,检出率分别为7.0%(3株)和84.1%(37株)。表明临床与亚临床乳房炎奶牛乳汁中SA菌株携带的毒素基因不一样,SEs可能是临床乳房炎菌株的重要致病基因,PVL可能是亚临床乳房炎菌株的重要致病基因。69株SA使用SmaⅠ酶切分型后,可分为7个大簇、50个基因型,来源相同的SA分型后大部分位于同一簇内。临床乳房炎奶牛乳汁中检测到MRSA菌株,PVL基因在亚临床乳房炎中的检出率为临床乳房炎的2.7倍。PFGE方法能较好的区分临床乳房炎和亚临床乳房炎的SA分离菌株。 展开更多
关键词 奶牛 金黄色葡萄球菌 MECA基因 毒素基因 pfge分型
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鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的污染分析及PFGE分型研究 被引量:15
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作者 陈荀 刘书亮 +3 位作者 吴聪明 韩新锋 陈栎娜 陆思琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1012-1016,共5页
目的了解鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的分布和传播情况。方法参考GB/T4789.9-2008、SN0175-2010、ISO10272-1:2006、FDA/BAM:2001、USDA/FSIS:1998等方法组合出分离鸡源疑似空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的方法,采用16SrDN... 目的了解鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的分布和传播情况。方法参考GB/T4789.9-2008、SN0175-2010、ISO10272-1:2006、FDA/BAM:2001、USDA/FSIS:1998等方法组合出分离鸡源疑似空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的方法,采用16SrDNA和hipO基因的二重PCR方法对其准确鉴定;采用SmaⅠ对83株空肠弯曲杆菌进行PFGE分型。结果从鸡肉生产链中采集样品519份,分离鉴定出空肠弯曲杆菌180株,分离率为34.87%。其中养鸡场和屠宰场鸡粪样空肠弯曲杆菌分离率分别为74.29%和66.38%,屠宰场和市场的鸡肉样中空肠弯曲杆菌的分离率分别为17.33%和13.66%。83株空肠弯曲杆菌通过PFGE分型结果产生了45种不同的谱型。结论四川省部分地区鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的污染较严重,空肠弯曲杆菌在鸡肉生产链中可能存在水平传播现象。 展开更多
关键词 空肠弯曲杆菌 鸡肉生产链 分离 鉴定 pfge
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奶牛乳源大肠杆菌耐药性、毒素基因鉴定及PFGE分型研究 被引量:17
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作者 王晓 王新 +6 位作者 郝丹 唐晓双 周传丽 王雅春 张胜利 张沅 俞英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期463-470,共8页
通过采集中国北方地区某荷斯坦牛场生产群牛及乳房炎牛197份样品(195份奶样及2份洗布水样),分离出28株大肠杆菌菌株,并进行细菌药敏试验、毒力基因检测及PFGE分型,为牛场防治大肠杆菌型乳房炎提供数据支持。检测28株大肠杆菌对35种抗生... 通过采集中国北方地区某荷斯坦牛场生产群牛及乳房炎牛197份样品(195份奶样及2份洗布水样),分离出28株大肠杆菌菌株,并进行细菌药敏试验、毒力基因检测及PFGE分型,为牛场防治大肠杆菌型乳房炎提供数据支持。检测28株大肠杆菌对35种抗生素的敏感性发现,兽用临床抗生素庆大霉素和大观霉素应作为该奶牛场大肠杆菌型乳房炎的主要治疗药物。但该牛场出现了对非兽用广谱抗生素麦迪霉素的耐受性菌株,提示牛场在治疗奶牛大肠杆菌型乳房炎时应该注意用药问题。同时,洗布水样分离出的大肠杆菌的多重耐药性较强,也应引起重视,以便及时切断病菌传播途径。基于本研究在28株大肠杆菌中Ecs3703毒力基因的检出率为100%,证实所分离的大肠杆菌为肠出血性大肠杆菌(EHEC)而非肠毒素大肠杆菌(ETEC)。细菌毒力基因Irp2和CNF2的检出则暗示携带这两类毒力基因的大肠杆菌极可能为奶牛乳房炎致病菌。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 大肠杆菌 药敏试验 毒力基因 pfge分型
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动物、环境及饲养员多重耐药大肠杆菌的PFGE分型研究 被引量:16
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作者 杨玲丽 陈杖榴 +3 位作者 刘健华 曾振灵 马俊英 吴聪明 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期2597-2602,共6页
目的了解养殖场多重耐药大肠杆菌耐药性的传播机制,探讨人、动物与环境间耐药菌垂直克隆传播的可能性。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对分离自养殖场动物、环境和饲养员的86株耐药谱相近多重耐药大肠杆菌进行DNA指纹图谱分型,... 目的了解养殖场多重耐药大肠杆菌耐药性的传播机制,探讨人、动物与环境间耐药菌垂直克隆传播的可能性。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对分离自养殖场动物、环境和饲养员的86株耐药谱相近多重耐药大肠杆菌进行DNA指纹图谱分型,比较菌株之间的亲缘关系。结果37株鸡场来源大肠杆菌可分为20种PFGE分型;49株猪场来源大肠杆菌可分为24种PFGE分型;同一动物、环境或饲养员采样点分离菌株PFGE指纹图谱相同者较多;同一养殖场不同动物个体、养殖场环境不同采样点、动物和环境以及饲养员和环境都存在PFGE指纹图谱完全相同菌株;鸡场和猪场都发现有属同一PFGE分型的来自动物、饲养员和环境的菌株;86株菌全部对环丙沙星、氨苄西林、链霉素、四环素、多西环素和复方新诺明耐药,相同PFGE分型的菌株其耐药谱型不一定相同。结论养殖场动物、环境及饲养员之间存在多重耐药大肠杆菌的克隆传播。 展开更多
关键词 大肠杆菌 多重耐药 pfge分型 动物 克隆传播
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肠炎沙门菌食物中毒中PFGE的应用 被引量:20
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作者 王芳 赵滢 +2 位作者 陈智 王军华 熊燕 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第10期922-924,共3页
目的对2014年武汉市某区一起食物中毒事件的病原体进行分离鉴定及同源性分析。方法参照GB4789-2012和WS/T 13-1996的方法进行病原菌的分离培养,对检出菌进行表型鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对检出菌及实验室收集的其他肠炎... 目的对2014年武汉市某区一起食物中毒事件的病原体进行分离鉴定及同源性分析。方法参照GB4789-2012和WS/T 13-1996的方法进行病原菌的分离培养,对检出菌进行表型鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对检出菌及实验室收集的其他肠炎沙门氏菌进行分子分型和流行病学特征分析;采用WHO推荐的改良K-B法对检出菌进行抗生素敏感试验结果流行病学调查及实验室病原学检测证实,本起事件是一起由肠炎沙门氏菌引起的食物中毒,共分离到18株肠炎沙门氏菌。分离自该事件可疑食物及患者肛拭子的肠炎沙门氏菌相似系数为100%,与同一时期散发临床患者分离的肠炎沙门氏菌相似系数约为90%,与2012年健康体检分离株及2013年、2014年临床患者分离株最小相似系数>90%。此次食物中毒株对所检测药物敏感性较好。结论此次食物中毒病原菌为本地区流行的肠炎沙门氏菌优势株。PFGE可用于细菌性食物中毒的溯源分析。 展开更多
关键词 食物中毒 肠炎沙门氏菌 血清学鉴定 耐药性 pfge分型
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贵州省3株钩端螺旋体分离株PFGE分型与基因种鉴定 被引量:7
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作者 李世军 张翠彩 +7 位作者 李秀文 唐光鹏 田克成 刘英 蔡星和 于春 聂一新 蒋秀高 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期587-591,共5页
目的应用脉冲场电泳(PFGE)分型技术和16S rRNA基因测序分析技术分别对贵州省3株动物宿主钩端螺旋体分离菌株进行分子分型和基因种鉴定,了解贵州省钩端螺旋体的分子流行病学特征。方法应用DNA限制性内切酶NotI对钩端螺旋体染色体DNA酶切... 目的应用脉冲场电泳(PFGE)分型技术和16S rRNA基因测序分析技术分别对贵州省3株动物宿主钩端螺旋体分离菌株进行分子分型和基因种鉴定,了解贵州省钩端螺旋体的分子流行病学特征。方法应用DNA限制性内切酶NotI对钩端螺旋体染色体DNA酶切后,用PFGE将DNA片段分离,采用BionumericsV4.0将3株钩体菌株PFGE图谱与中国15群15型参考菌株进行聚类分析;同时,应用PCR扩增几乎全长的钩体16S rRNA基因片段,并将扩增产物进行双向序列测定,并与GenBank数据库已注册的核酸序列进行同源性比对、确定基因种、分析亲缘进化关系。结果来自贵州省的3株动物宿主分离钩体菌株PFGE带型命名为LepNot I 002和LepNot I 003,经聚类分析,3株菌株与黄疸出血群黄疸出血型赖株的相似性大于95%。16S rRNA基因测序和分析表明,3株贵州分离钩体菌株之间的同源性为100%,与致病性钩体问号钩端螺旋体种(L.interrogans)不同血清型参考菌株的同源性达100%。结论 3株贵州动物分离钩体菌株经PFGE分型鉴定与黄疸出血群赖型赖株的相似性大于95%,经16S rRNA基因测序分析鉴定为L.interrogans种,上述两种方法对贵州省钩体分离菌株的鉴定结果一致,有助于贵州省钩端螺旋体病的主动监测、暴发调查和传染源追踪。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 pfge 16S RRNA 序列分析 同源性 基因种
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广西罗非鱼链球菌病流行菌株PCR鉴定和PFGE基因型分析 被引量:27
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作者 李莉萍 王瑞 +7 位作者 黄婷 黄维义 梁万文 李健 黄彦 雷爱莹 甘西 陈明 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期927-935,共9页
为获知近年广西罗非鱼链球菌病流行菌种及其基因型变化信息,采用特异PCR方法对2006—2012年从广西发病罗非鱼分离获得的77株临床菌株进行鉴定,并通过脉冲电场凝胶电泳(PFGE)对2006—2011年分离获得的37株流行菌株进行基因型分析。结果显... 为获知近年广西罗非鱼链球菌病流行菌种及其基因型变化信息,采用特异PCR方法对2006—2012年从广西发病罗非鱼分离获得的77株临床菌株进行鉴定,并通过脉冲电场凝胶电泳(PFGE)对2006—2011年分离获得的37株流行菌株进行基因型分析。结果显示,其中20株鉴定为海豚链球菌其余57株鉴定为无乳链球菌。2006—2007年获得的19株流行菌株中有18株为海豚链球菌(94.7%),仅1株无乳链球菌;2009—2012年分离的58株流行菌株中56株为无乳链球菌(96.6%),仅2株海豚链球菌。PFGE图谱聚类显示,海豚和无乳链球菌分别聚类为两个大分支,20株海豚链球菌共产生4种PFGE带型,带型相似度为83.9%~100%;17株无乳链球菌共产生5种PFGE带型,带型相似度为47.4%~100%。研究表明,广西罗非鱼链球菌病流行菌种已从过去(2008年前)以海豚链球菌为主转变为现在(2009—2012年)以无乳链球菌为主;流行菌株PFGE基因型存在多样性。 展开更多
关键词 罗非鱼 无乳链球菌 海豚链球菌 脉冲场凝胶电泳 基因型
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广东、海南、福建3省罗非鱼链球菌病流行菌株PCR鉴定和PFGE基因型分析 被引量:11
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作者 李莉萍 王瑞 +7 位作者 黄婷 甘西 李健 黄维义 黄彦 雷爱莹 陈明 梁万文 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第5期2133-2140,共8页
为研究近年来罗非鱼链球菌病流行菌株菌种与基因型变化信息,对广东、海南和福建3省罗非鱼主养区(共17个市县,93个养殖场)近4年的链球菌病流行菌株进行了分离,采用特异PCR方法对2009-2012年分离获得的流行菌株进行检测,并通过脉冲电场凝... 为研究近年来罗非鱼链球菌病流行菌株菌种与基因型变化信息,对广东、海南和福建3省罗非鱼主养区(共17个市县,93个养殖场)近4年的链球菌病流行菌株进行了分离,采用特异PCR方法对2009-2012年分离获得的流行菌株进行检测,并通过脉冲电场凝胶电泳(PFGE)对2009-2011年分离获得的流行菌株进行基因型分析。3省共分离到102株流行菌株,PCR鉴定结果显示均为无乳链球菌(Streptococcus agalactiae,S.agalactiae)。67株无乳链球菌PFGE图谱聚类显示产生A^G共7种PFGE带型,带型相似度在52.1%~100%之间。基因型A和D为广东优势菌群(93.48%,43/46),基因型F为海南优势菌群(66.7%,10/15),而福建6株分属于B、C和E共3个基因型。2009-2012年3省罗非鱼链球菌病流行菌种为无乳链球菌,流行菌株菌型较复杂,各省优势菌群存在较大差异,并且随时间发生变化。 展开更多
关键词 罗非鱼 无乳链球菌 脉冲场凝胶电泳(pfge) 基因型
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宠物犬及犬粮源沙门氏菌的耐药性分析及PFGE分型 被引量:11
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作者 陈传荣 周妮妮 +3 位作者 韩敏敏 魏建忠 孙裴 李郁 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期544-549,共6页
为了解宠物犬和犬粮源沙门氏菌的耐药表型特征与耐药基因分布,以及不同分离菌株之间的同源性,本研究采用K-B法测定27株分离菌的药物敏感性、PCR检测耐药基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行基因分型。结果显示,27株沙门氏菌分离株对氨苄西... 为了解宠物犬和犬粮源沙门氏菌的耐药表型特征与耐药基因分布,以及不同分离菌株之间的同源性,本研究采用K-B法测定27株分离菌的药物敏感性、PCR检测耐药基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行基因分型。结果显示,27株沙门氏菌分离株对氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、链霉素、复方新诺明、强力霉素耐药率在29.63%~22.22%,33.33%分离菌对3种及3种以上抗生素耐药,其中阿莫西林/克拉维酸-氨苄西林-复方新诺明-强力霉素所占比率最大,为66.67%(6/9);74.07%分离菌至少含有1种耐药基因,以str A-B、bla PSE、tet B、sul1检出率最高,分别为40.7%、37.0%、29.6%、25.9%,四环素类、氯霉素类、磺胺类、β-内酰胺类耐药基因与耐药表型符合率较高,分别为100%、100%、87.5%、72.7%;27株分离菌形成12种PFGE基因型,优势型别为pt1和pt7型。本研究结果表明宠物犬和犬粮源沙门氏菌呈现多重耐药,耐药表型与其相对应的耐药基因间存在密切的相关性;PFGE基因型呈多态性,而其与血清型之间不呈相关性,但与多重耐药菌株(耐>8)间存在一定程度的关联性。 展开更多
关键词 宠物犬和犬粮 沙门氏菌 耐药表型 耐药基因 pfge
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规模化养殖肉鸡泄殖腔拭子弯曲菌分离及PFGE分型分析 被引量:8
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作者 邓义贞 顾一心 +5 位作者 何利华 张艾煜 梁昊 张建中 张茂俊 邓俊良 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期778-783,789,共7页
为了了解规模化养殖肉鸡弯曲菌的带菌现状,比较2种基础培养基对于粪便标本弯曲菌检出差异,获得菌株菌型特征。本研究选择规模化肉鸡养殖场共300份肉鸡泄殖腔拭子,分别应用Columbia、Karmali 2种基础培养基,采用滤膜过滤法进行弯曲菌的... 为了了解规模化养殖肉鸡弯曲菌的带菌现状,比较2种基础培养基对于粪便标本弯曲菌检出差异,获得菌株菌型特征。本研究选择规模化肉鸡养殖场共300份肉鸡泄殖腔拭子,分别应用Columbia、Karmali 2种基础培养基,采用滤膜过滤法进行弯曲菌的分离培养。结合革兰染色、生化鉴定以及PCR方法对疑似菌落进行弯曲菌菌种鉴定;选择60株空肠弯曲菌进行脉冲场凝胶电泳分析并用BioNumerics软件对脉冲场凝胶电泳结果进行聚类分析。结果显示,300份泄殖腔拭子样品中,弯曲菌的检出率为51.33%(154/300)。空肠弯曲菌、结肠弯曲菌检出率分别为40%(120/300)和14.67%(44/300),空、结肠弯曲菌混合感染的感染率为3.33%(10/300)。检测标本中空肠弯曲菌的感染率显著大于结肠弯曲菌(P<0.01)。应用Columbia、Karmali培养基对弯曲菌的检出率分别为41.67%(125/300)、42.67%(128/300),2种基础培养基检出率无显著性差异(P>0.05),2种培养基的补充使用样本的检出率增加了15%(45/300)。本次滤膜过滤法同时获得相同培养条件下标本中其他细菌3种,分别为:Cellulosimicrobiumsp.、Microbacteriumsp.、Helicobacter brante,共45株。60株空肠弯曲菌脉冲场凝胶电泳共分为39个带型。结果表明,本研究发现规模化养殖肉鸡中弯曲菌的携带情况较为严重,相同鸡场及不同鸡场分离菌株脉冲场凝胶电泳带型呈多样性特征。滤膜过滤法能够有效检测家禽肛拭子标本中弯曲菌,缩减了因使用选择性抗生素添加剂的成本。本研究没有检出除空肠弯曲菌和结肠弯曲菌外的其他弯曲菌菌种。 展开更多
关键词 弯曲菌 分离率 COLUMBIA Karmali pfge1
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辽宁省食源性副溶血性弧菌PFGE分子分型及血清型、耐药谱 被引量:16
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作者 李雪 张眉眉 +9 位作者 马景宏 耿英芝 魏彤竹 于淼 孙婷婷 李飞 王伟杰 张铭琰 刘海霞 韩佳敏 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第11期1269-1271,1304,共4页
目的分析辽宁省副溶血性弧菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别及血清型、耐药谱,探讨辽宁省副溶血性弧菌污染的同源性,为食源性疾病溯源和预警提供基础。方法对50株从辽宁省2015年食源性疾病和食品中分离的副溶血性弧菌进行PFGE分子分型、血清... 目的分析辽宁省副溶血性弧菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别及血清型、耐药谱,探讨辽宁省副溶血性弧菌污染的同源性,为食源性疾病溯源和预警提供基础。方法对50株从辽宁省2015年食源性疾病和食品中分离的副溶血性弧菌进行PFGE分子分型、血清学分型、药物敏感试验,采用BioNumerics version 6.6软件进行分析,比较同源性。结果 50株副溶血性弧菌共分为19个血清型,食源性疾病分离株分为5个血清群,主要的血清型为O3群,其次为O1群;食品分离株分为9个血清群,主要的血清型为O3群,其次为O1和O4群。50株副溶血性弧菌对15种抗生素的耐药试验,对头孢唑啉耐药率最高达72%。50株副溶血性弧菌共分为4种PFGE优势带型,相似度为90.8%~100.0%。结论辽宁省食源性副溶血性弧的血清型以O3群和O1群为主,致病菌流行株血清型为O3:K6;食品中分离菌株血清型和PFGE带型非常分散,提示这些多为遗传不相关菌株。PFGE图谱可看出,绝大部分相同血清型菌株的PFGE带型相似度很高,O3与O1血清型菌株有高度同源性密切相关,耐药菌株间PFGE带型相似度很高,均具有高度同源性。相比2014年的耐药情况,对头孢唑啉耐药率显著增高。另外,少数菌株出现多重耐药,耐药情况不容乐观。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 脉冲场凝胶电泳 血清学分型 耐药
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牛奶源金黄色葡萄球菌血清型、毒力基因及PFGE分型 被引量:14
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作者 刘保光 蔡田 +5 位作者 李小申 刘营营 贺丹丹 匡秀华 高延玲 胡功政 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期281-286,共6页
目的:研究生鲜牛奶中金黄色葡萄球菌分离、荚膜多糖血清型分布、毒力基因携带及脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型情况。方法:从河南省4个地区奶牛养殖场采集生鲜牛奶样品按照国标法进行分离,扩增耐热核酸酶基... 目的:研究生鲜牛奶中金黄色葡萄球菌分离、荚膜多糖血清型分布、毒力基因携带及脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型情况。方法:从河南省4个地区奶牛养殖场采集生鲜牛奶样品按照国标法进行分离,扩增耐热核酸酶基因nuc鉴定金黄色葡萄球菌,利用聚合酶链式反应方法测定荚膜多糖血清型和毒力基因携带情况,采用PFGE分析菌株间的相关性和遗传关系。结果:从350份生鲜牛奶样品中分离鉴定到80株金黄色葡萄球菌,分离率为22.86%。荚膜多糖血清型测定发现,cap5(60%)是流行血清型。从这些阳性菌株中,发现有62株(77.5%)携带有毒力基因,毒力基因set、hlb、hld、lukED、ebp、clfA和clfB,检出率分别为40.00%、51.25%、57.50%、60.00%、58.75%、57.50%和58.75%。此外,47株(58.75%)菌携带不少于6个毒力基因,流行的毒力基因谱型为set-hla-hlb-hld-lukED-cna-ebp-clfA-clfB。PFGE结果显示,获得72株菌的PFGE图谱,按90%的相似性可分为12个簇和46种PFGE型。D簇(3种PFGE型)、G簇(3种PFGE型)和J簇(5种PFGE型)菌株中均检出一定基因类型的毒力基因,表明河南地区生鲜牛奶中金黄色葡萄球菌毒力基因广泛存在于多种PFGE型别中。结论:生鲜牛奶均有一定程度的金黄色葡萄球菌污染,多数菌株携带毒力基因,且毒力基因的类型较为复杂,这对消费这些牛奶的人群构成潜在的健康威胁。PFGE分型菌株主要以克隆形式进行传播,且克隆型具有多样性和差异性,故临床应加强生奶及乳品血清型、毒力基因检测及分子分型研究。 展开更多
关键词 牛奶 金黄色葡萄球菌 血清型 毒力基因 脉冲场凝胶电泳
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2007年中国四省福氏志贺菌分离菌株的毒力基因检测和PFGE分析 被引量:13
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作者 易旭 夏胜利 +9 位作者 张锦 秦豫青 于德山 张秋香 张少敏 崔志刚 金东 李振军 孙强正 叶长芸 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期730-734,共5页
目的分析中国河南等四省的福氏志贺菌分离菌株毒力基因和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。方法应用PCR方法检测2007年从河南、青海、甘肃和山西分离的262株福氏志贺菌的侵袭性质粒抗原H基因(ipaH)、志贺肠毒素2基因(sen)、志贺肠毒素1基因(se... 目的分析中国河南等四省的福氏志贺菌分离菌株毒力基因和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。方法应用PCR方法检测2007年从河南、青海、甘肃和山西分离的262株福氏志贺菌的侵袭性质粒抗原H基因(ipaH)、志贺肠毒素2基因(sen)、志贺肠毒素1基因(set1A)以及侵袭性蛋白基因(ipaBCD)。参考美国CDC的PulseNet实验方法 ,用限制性内切酶NotI对细菌染色体进行酶切,对这些分离菌株进行PFGE分析,使用BioNumerics软件进行聚类分析,并按照PulseNet命名原则对带型进行命名。结果 262株福氏志贺菌分离菌株ipaH、sen、set1A和ipaBCD基因的携带率分别为100%、93.89%、96.18%和92.75%。具有7种毒力基因携带模式,其中89.31%的菌株为Ⅰ型毒力基因携带模式(ipaH+sen+set1A+ipaB-CD+),有99.24%菌株同时携带两种或以上毒力基因。262株福氏志贺菌共分为83个PFGE型别,其中CNJZXN11.0002、CNJZXN11.0003、CNJZXN11.0060、CNJZXN11.0081、CNJZXN11.0137、CNJZXN11.0169、CNJZXN11.0190、CNJZXN11.0195、CNJZXN11.0196、CNJZXN11.0199、CNJZXN11.0217、CNJZXN11.0325和CNJZXN11.0327为13种主要带型。CNJZXN11.0003型菌株在4省均有分布,CNJZXN11.0199为河南菌株的优势带型,CNJZXN11.0137、CNJZXN11.0325和CNJZXN11.0327为山西特有的PFGE带型,与CNJZXN11.0003等主要带型聚类相似性较小。结论四省分离的福氏志贺菌株中ipaH、sen、set1A和iPaBCD毒力基因的携带率较高,而且这些菌株的PFGE型别既具有地区性差异,又具有优势型别的交叉。 展开更多
关键词 志贺菌 毒力基因 pfge
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福建省嗜肺军团菌血清1型及血清6型菌株PFGE分型研究 被引量:8
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作者 原灵 陈爱平 +1 位作者 杨劲松 林震宇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期461-463,共3页
目的研究福建省2008年至2010年公共场所空调冷却塔水及冷凝水中分离的嗜肺军团菌血清Ⅰ型(LP1)及血清Ⅵ型(LP6)的基因特征。方法应用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术对57株LP1型军团菌及15株LP6军团菌进行电... 目的研究福建省2008年至2010年公共场所空调冷却塔水及冷凝水中分离的嗜肺军团菌血清Ⅰ型(LP1)及血清Ⅵ型(LP6)的基因特征。方法应用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术对57株LP1型军团菌及15株LP6军团菌进行电泳,并用BioNumerics(version 6.0,Applied Maths,Inc)软件包对其进行聚类分析。结果 57株LP1军团菌可分为40种PFGE型,菌株间相似性系数在24.107%~100.000%之间不等,大部分菌株的PFGE型别差异明显,无优势型别。不同地区分离的LP1军团菌既有差异较大的带型,也存在相同和相似的带型;相同地区,菌株间相似性系数存在差异,无优势菌株。15株LP6军团菌可分为12个不同的PFGE型别,菌株间相似性系数在27.87%~100.00%之间。结论 2008-2010年福建省公共场所空调冷却塔水及冷凝水中分离的LP1及LP6军团菌呈现基因多样性。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌1型 嗜肺军团菌6型 脉冲场凝胶电泳 指纹图谱 pfge
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O1群霍乱弧菌PFGE分子分型和菌株流行能力关系研究 被引量:5
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作者 陈爱平 杨劲松 +4 位作者 李曲文 徐海滨 王灵岚 郑金凤 严延生 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期259-262,共4页
目的调查福建省1962-2005年不同流行时期、不同流行血清群的O1群埃尔托型霍乱弧菌(EVC)的菌株间的遗传关联度和基因组的多态性;探讨不同PFGE型(簇)和霍乱菌株流行能力的关系。方法运用脉冲场凝胶电泳分子分型(PFGE)技术,对福建省1962-2... 目的调查福建省1962-2005年不同流行时期、不同流行血清群的O1群埃尔托型霍乱弧菌(EVC)的菌株间的遗传关联度和基因组的多态性;探讨不同PFGE型(簇)和霍乱菌株流行能力的关系。方法运用脉冲场凝胶电泳分子分型(PFGE)技术,对福建省1962-2005年代表性霍乱菌株进行分型,结合流行病学背景资料探讨不同PFGE型(簇)和相关霍乱菌株的流行能力。结果 77株霍乱菌株按100%的相似度分为61个PFGE型,按照90%的相似度可得到5个主要的PFGE簇,命名为G1-G5;52株小川型霍乱弧菌,按照100%的相似度分为47个PFGE型,按照90%的相似度可得到4个主要的PFGE簇[G1(o)-G4(o)];25株稻叶型霍乱弧菌按照100%的相似度分为15个PFGE型,按照90%的相似度,可得到2个主要的PFGE簇[G1(i)-G2(i)]。各个流行时期的菌株均有优势的PFGE簇,散发的菌株呈现分散的PFGE型,没有集中趋势。结论福建省3次流行的霍乱菌株有遗传关联性,在流行过程中产生基因变异出现新的优势PFGF簇;各地区间的霍乱流行有传播上的相关性。小川型G2(o)PFGE簇和稻叶型G1(i)PFGE簇的菌株有引起霍乱持续流行的能力,后者更有引发大规模病例数的能力。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 pfge 分子分型
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辽宁食源性沙门菌血清型、耐药谱及PFGE分型特征 被引量:12
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作者 马景宏 张眉眉 +6 位作者 马妮 耿英芝 魏彤竹 李雪 于淼 李飞 张铭琰 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2018年第3期268-272,共5页
目的分析辽宁食源性沙门菌血清型、耐药谱及脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别,探讨辽宁沙门菌污染的同源性,为食源性疾病溯源和预警提供基础。方法对辽宁省2015年食品中、食源性疾病中分离的41株沙门菌进行血清学分型、耐药试验、PFGE分子分型... 目的分析辽宁食源性沙门菌血清型、耐药谱及脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别,探讨辽宁沙门菌污染的同源性,为食源性疾病溯源和预警提供基础。方法对辽宁省2015年食品中、食源性疾病中分离的41株沙门菌进行血清学分型、耐药试验、PFGE分子分型,采用Bio Numerics version 6.6软件分析,比较同源性。结果 41株菌分为15个血清型,居前三位的是15株肠炎沙门菌、5株德尔卑沙门菌、5株姆班达卡沙门菌(辽宁省内少见血清型);对41株菌进行15种抗生素的耐药试验,对单一一种抗生素的耐药率为100.0%,其中红霉素97.6%,萘啶酸61.0%,氨苄西林53.7%;41株菌共分为18种PFGE带型,带型分布分散,只有两种优势,一种带型包含20株菌,有14株肠炎沙门菌,6株其他沙门菌,相似度为92.7%~100%;另一种包含5株菌,4株姆班达卡沙门菌,1株鼠伤寒沙门菌,相似度为96.6%~100.0%。结论辽宁省食源性沙门菌的血清型以肠炎沙门菌为主,生肉制品是其主要污染来源;血清型与PFGE图谱带型分布广泛,相同血清型沙门菌的PFGE带型聚集成簇、菌株具有高度同源性;相同PFGE型别的菌株耐药谱一致或相似;沙门菌的耐药情况较严重。 展开更多
关键词 沙门菌 血清学分型 耐药 脉冲场凝胶电泳
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福建省鼠伤寒沙门菌PFGE分子分型和耐药的关联性研究 被引量:12
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作者 杨劲松 陈建辉 +3 位作者 林杰 郑金凤 严延生 陈爱平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期10-13,共4页
目的分析福建省鼠伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型和耐药结果之间的关联性,探讨二者的内在联系。方法对福建省66株鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型和药敏试验,并对分子分型和药敏试验结果进行关联性分析。结果 66株鼠伤寒沙门... 目的分析福建省鼠伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型和耐药结果之间的关联性,探讨二者的内在联系。方法对福建省66株鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型和药敏试验,并对分子分型和药敏试验结果进行关联性分析。结果 66株鼠伤寒沙门菌分为32个PFGE型,P1、P8型为优势型别,其中40.9%(27/66)的菌株为P1型,10.6%(7/66)的菌株为P8型,51.52%(34/66)的试验菌株归于P1和P8型别;耐药结果经聚类分析,可将抗生素分为4类,其中头孢类和环丙沙星(氟喹诺酮类)是较高敏感药物,敏感率分别为94.42%(61/66)和62.12%(41/66);P1型在多重耐药严重的菌株中(>6耐)为优势型别,占该类菌株数的56.82%,以6耐为分界,P1型菌株在两组中的分布存在差异,具有统计学意义;P8型菌株在两组中的分布差异无统计学意义。结论 P1和P8型是福建省鼠伤寒沙门菌的PFGE分型的优势基因型,其中P1型与多重耐药严重的菌株(>6耐)间存在关联性;头孢类和环丙沙星(氟喹诺酮类)仍是当前治疗福建省严重耐药鼠伤寒菌的主要药物。 展开更多
关键词 鼠伤寒沙门菌 脉冲场凝胶电泳 分子分型 耐药性 关联性
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市售猪肉中沙门氏菌耐药基因与毒力基因筛查及PFGE分型研究 被引量:12
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作者 黄秀梅 盖文燕 +5 位作者 曲志娜 赵思俊 李月华 王玉东 王君玮 王娟 《中国动物检疫》 CAS 2018年第11期81-86,共6页
为了解市售猪肉中沙门氏菌耐药基因和毒力基因携带状况,以及PFGE分子分型情况,用PCR方法对分离的22株沙门氏菌携带的耐药基因和毒力基因进行检测,并运用XbaⅠ酶进行酶切后完成PFGE分析,再利用BioNumerics软件对分离菌株的指纹图谱进行... 为了解市售猪肉中沙门氏菌耐药基因和毒力基因携带状况,以及PFGE分子分型情况,用PCR方法对分离的22株沙门氏菌携带的耐药基因和毒力基因进行检测,并运用XbaⅠ酶进行酶切后完成PFGE分析,再利用BioNumerics软件对分离菌株的指纹图谱进行聚类分析。结果显示:分离菌株对氨苄西林的耐药性最严重,耐药率为72.73%,其次是对氟苯尼考,耐药率为68.18%;在10种耐药基因检测中,共检出9种;除喹诺酮类药物外,分离菌株耐药基因与耐药表型的符合率为95%,其中88%的分离菌株携带酰胺醇类耐药基因(catI)和β-内酰胺类耐药基因(blatem-1/blapsE-1/blaCMY-1/blaoxA-1)。在14种毒力基因检测中,共检出13种;所有分离菌株均携带mgt C和bcfA毒力基因,其次是mogA、araB、stn、fimA毒力基因,携带率均为95.45%;22株沙门氏菌共分为10个群,包括8个带型,菌株相似度为60%~100%。结果表明:市售猪肉中的沙门氏菌携带多种耐药基因和毒力基因,须采取措施防止沙门氏菌污染猪肉产品。 展开更多
关键词 沙门氏菌 耐药基因 毒力基因 pfge分型
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