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2017-2020年华东地区猪源多杀性巴氏杆菌耐药性和PFGE分析 被引量:2
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作者 宋强强 轩慧勇 +7 位作者 朱维 魏建超 刘珂 邵东华 邱亚峰 马志永 李蓓蓓 夏利宁 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期128-133,共6页
为了解华东地区猪源多杀性巴氏杆菌的耐药情况及流行特征,本研究收集了2017—2020年华东地区分离的31株猪源多杀性巴氏杆菌,通过琼脂稀释法检测其对12种临床常用抗菌药物的最小抑菌浓度;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法进行分子分型探求... 为了解华东地区猪源多杀性巴氏杆菌的耐药情况及流行特征,本研究收集了2017—2020年华东地区分离的31株猪源多杀性巴氏杆菌,通过琼脂稀释法检测其对12种临床常用抗菌药物的最小抑菌浓度;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法进行分子分型探求菌株亲缘关系。结果显示:31株猪源多杀性巴氏杆菌,对复方新诺明的耐药率最高(61.29%),其次为泰妙菌素(32.26%)、氟苯尼考(25.81%)、多西环素(12.90%)和大观霉素(3.23%)。所有菌株对头孢噻呋、庆大霉素、阿莫西林、阿莫西林/克拉维酸、恩诺沙星完全敏感;耐药谱型呈现多样化特点,31株猪源多杀性巴氏杆菌共表现为8种耐药谱型,其中有2株3药耐药菌株,耐药谱型分别为DOX+TIA+SPT和FFC+TIA+SXT;依据85%相似性标准可将其分为14个PFGE分型,其中A、G、H、J簇共有19株菌,占61.29%,并且PFGE分型相同的菌株耐药表型也高度相似。研究结果表明,华东地区猪源多杀性巴氏杆菌呈现耐药模式和PFGE分子分型多样化的特性,PFGE分型与耐药表型之间存在一定的相关性,应加强猪源多杀性巴氏杆菌的耐药性监测和流行性防控。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 耐药性 pfge
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重庆市食源性肯塔基沙门菌病原分析 被引量:1
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作者 王文斟 罗争 +6 位作者 李志峰 王红 赵婷 段刚 廖春艳 王玲 聂术君 《公共卫生与预防医学》 2025年第3期17-21,共5页
目的 对13株肯塔基沙门菌生化和血清型复核,并进行溯源、药敏检测、耐药及毒力基因分析,了解肯塔基沙门菌的传播方式、耐药及毒力情况,为防控提供依据。方法 使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴定并按国标法进... 目的 对13株肯塔基沙门菌生化和血清型复核,并进行溯源、药敏检测、耐药及毒力基因分析,了解肯塔基沙门菌的传播方式、耐药及毒力情况,为防控提供依据。方法 使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)快速鉴定并按国标法进行复核以确认菌株型别;脉冲场凝胶电泳(PFGE)溯源分析菌株传播方式;药敏实验检测菌株耐药性;全基因组测序并分析,识别耐药基因和毒力岛、分析进化关系等。结果 MALDI-TOF MS快速鉴定到沙门菌;国标检测法确认这13株菌为肯塔基沙门菌,药敏结果显示所有菌株对3~14种抗生素耐药;PFGE分析到永川病例分离株和万州食品株相似度100%;全基因组测序分子血清分型为肯塔基沙门菌;基因组中存在7个毒力岛和多个耐药基因/位点和基因突变;统进化树显示病例菌株和万州食品分离菌株处于同一进化分支的末端。结论 MALDI-TOF MS鉴定结果早于国标法2 d;13株肯塔基沙门菌均为多重耐药菌株,携带多种耐药基因和7个毒力岛,提示菌株可能对多类抗生素/消毒剂耐药且有较强的致病能力;PFGE和WGS溯源分析永川病例株与万州食品株高度一致,提示食源性疾病传播方式。 展开更多
关键词 肯塔基沙门菌 飞行时间质谱 脉冲场电泳 全基因组测序 毒力岛 耐药基因
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猪肉生产环节中沙门菌的污染调查及关键点的消减控制
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作者 孟闯 金宣辰 +4 位作者 彭通通 翟贤月 康喜龙 焦新安 潘志明 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第10期5137-5147,共11页
本研究旨在调查猪养殖场、屠宰场和猪肉销售市场这一猪肉生产链中沙门菌的流行情况并结合分子分型探明沙门菌污染的关键控制点,评估关键控制点相关干预措施对沙门菌的消减防控作用。采集有供应链关系的猪养殖场、屠宰场和猪肉市场相关... 本研究旨在调查猪养殖场、屠宰场和猪肉销售市场这一猪肉生产链中沙门菌的流行情况并结合分子分型探明沙门菌污染的关键控制点,评估关键控制点相关干预措施对沙门菌的消减防控作用。采集有供应链关系的猪养殖场、屠宰场和猪肉市场相关样品进行沙门菌的分离和血清型鉴定,利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对沙门菌分离株进行分子分型和溯源,分析沙门菌污染的关键控制点并评价增加淋洗次数对沙门菌消减的作用。结果表明,采集的950份不同类型样品中分离出沙门菌417株,总分离率为43.9%,其中,养殖场粪便样品80份,分离率为28.8%;屠宰场猪胴体和环境擦拭样品470份,分离率为35.5%,不同屠宰环节中劈半后样品的分离率最高,达51.0%,冷却后的样品分离率显著降低至23.0%(P<0.05);超市猪肉样品400份,分离率为56.8%;沙门菌分离株包含9种血清型,其中,德尔卑沙门菌(39.6%)、鼠伤寒沙门菌(38.1%)、伦敦沙门菌(10.3%)和里森沙门菌(8.4%)为优势血清型。67株德尔卑沙门菌分离株的PFGE分型结果显示,共分为32个脉冲型,其中屠宰场样品的脉冲型分布最广泛,同一批次样品分离株会出现在同一种脉冲型中,存在相似度>95%的屠宰场、养殖场、市场环节分离株,显示其沿生产链传播的特点。在劈半后、修饰前环节增加2次淋洗操作,每次淋洗1 min,使后续环节沙门菌的平均分离率从增加淋洗前的41.7%显著降低至20.0%(P<0.01)。综上,沙门菌可通过交叉污染沿猪肉生产链传播,屠宰过程中的劈半环节是污染的关键控制点之一,增加劈半后的淋洗处理能有效降低猪肉中的沙门菌污染,为猪肉中沙门菌防控提供重要指导。 展开更多
关键词 猪肉 生产链 沙门菌 脉冲场凝胶电泳 关键控制点
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310株人源金黄色葡萄球菌肠毒素/类肠毒素基因携带及分子分型分析
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作者 李倩 王琦 +2 位作者 郝民 王恒伟 宋衍燕 《首都公共卫生》 2025年第4期234-238,共5页
目的 了解310株分离自2009—2020年北京市朝阳区健康从业体检人员的鼻拭子的金黄色葡萄球菌菌株肠毒素/类肠毒素基因携带情况及其分子分型,筛查菌株的耐药性情况。方法 对310株人源金黄色葡萄球菌进行毒素编码基因多重荧光定量聚合酶链... 目的 了解310株分离自2009—2020年北京市朝阳区健康从业体检人员的鼻拭子的金黄色葡萄球菌菌株肠毒素/类肠毒素基因携带情况及其分子分型,筛查菌株的耐药性情况。方法 对310株人源金黄色葡萄球菌进行毒素编码基因多重荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测,使用细菌多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对菌株进行分子分型,头孢西丁纸片法和mecA基因扩增法进行MRSA菌株筛查。结果 310株人源金黄色葡萄球菌检出27种肠毒素/类肠毒素基因(53种毒力谱)、57种MLST分型、66种PFGE分型、1株MRSA菌株;selw、selx、seg、sei、sem和sen共6种新型肠毒素/类肠毒素检出率在30%以上,61株(19.68%)菌株携带10种以上肠毒素/类肠毒素毒力谱;57种MLST分型聚类为6个克隆群,CC1(47株)、CC5(44株)为优势克隆群;新发现15种MLST分型,CC188克隆群中检出7个新MLST分型;66种PFGE分型中4种优势分型包含了25.16%的菌株。结论 310株金黄色葡萄球菌人源性肠毒素/类肠毒素毒力谱及分子分型均具有多样性,提示其在不同人群中的分布和传播具有复杂性。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 肠毒素 类肠毒素 MLST pfge
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乌鲁木齐市6~45岁健康人群脑膜炎奈瑟菌携带情况及病原学分析
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作者 杨艳梅 陈国利 +6 位作者 牟文婷 官蕾 张妍 谢康 王正军 吴越 布买然木汗·吾布力艾山 《疾病预防控制通报》 2025年第3期98-103,共6页
目的了解乌鲁木齐市6~45岁健康人群脑膜炎奈瑟菌(Nm)携带情况,为调整防控措施和免疫策略提供依据。方法采用简单随机抽样方法,2021-2023年选取乌鲁木齐市7区1县的6~45岁健康人群作为调查对象,采集咽拭子样本进行Nm分离培养、PCR检测鉴... 目的了解乌鲁木齐市6~45岁健康人群脑膜炎奈瑟菌(Nm)携带情况,为调整防控措施和免疫策略提供依据。方法采用简单随机抽样方法,2021-2023年选取乌鲁木齐市7区1县的6~45岁健康人群作为调查对象,采集咽拭子样本进行Nm分离培养、PCR检测鉴定分群、脉冲场凝胶电泳分子分型、(PFGE)药物敏感试验,并分析检测结果。结果共检测样本1359份,检出49株Nm菌株,总带菌率3.61%。中学生带菌率最高,为8.33%。菌群以B群为主、占69.40%,未检出A群、X群。PFGE分子分型呈多态性分布,无优势带型。对左氧氟沙星、阿奇霉素、氯霉素敏感率均大于93.00%,对磺胺甲噁唑、磺胺异噁唑耐药。7种耐药谱型中,耐2类3种为优势类型、占56.25%,总多重耐药率91.67%。结论乌鲁木齐市6~45岁健康人群Nm携带者以中学生为主,优势血清群为B群,多重耐药较严重;应重点加强中学生群体的Nm携带监测,加速研发针对B群Nm的疫苗,优化抗菌药物使用指南,以应对耐药问题。 展开更多
关键词 脑膜炎奈瑟菌 流行性脑脊髓膜炎 带菌率 pfge
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京津冀地区肉鸡不同生产环节沙门菌的流行和传播 被引量:2
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作者 刘芳琴 崔明全 +3 位作者 张璐 陈玉 王鹤佳 张纯萍 《中国农业科学》 北大核心 2025年第1期192-202,共11页
【背景】沙门菌是重要的人畜共患病原菌和食源性病原菌,目前已发现2600多种血清型,不同血清型的沙门菌对动物和人的致病性不同。肉鸡是沙门菌流行传播的重要宿主之一,其污染状况直接关系着肉鸡的健康养殖和公共卫生安全,肉鸡生产链是肉... 【背景】沙门菌是重要的人畜共患病原菌和食源性病原菌,目前已发现2600多种血清型,不同血清型的沙门菌对动物和人的致病性不同。肉鸡是沙门菌流行传播的重要宿主之一,其污染状况直接关系着肉鸡的健康养殖和公共卫生安全,肉鸡生产链是肉鸡感染沙门菌的主要来源,主要涵盖了种鸡养殖、肉鸡孵化和肉鸡养殖等环节,研究沙门菌在肉鸡不同生产环节中的流行和传播情况对肉鸡沙门菌的防控和公共卫生安全具有重要意义。【目的】以京津冀地区肉种鸡养殖场、肉鸡孵化场和商品化肉鸡养殖场为切入点,系统研究肉鸡不同生产环节沙门菌的流行性、血清型分布和分子分型情况,为肉鸡生产中沙门菌流行和传播情况的研究提供参考。【方法】从北京、天津和河北地区肉鸡不同生产环节(包括同一养殖集团内部)的28个养殖场共采集样品2572份,其中肉种鸡养殖场、肉鸡孵化场和商品化肉鸡养殖场分别采集324份、747份和1501份样品。首先对采集样品进行沙门菌的增菌培养,然后用显色培养基和聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)进行沙门菌的分离与鉴定;其次应用丹麦血清对已鉴定的沙门菌进行血清分型,并用脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)方法对沙门菌进行分子分型;最后对不同生产环节养殖场肉鸡的带菌状况、血清型分布和分子分型结果进行分析比较。【结果】从肉鸡不同生产环节共分离沙门菌335株,总体分离率为13.0%,其中肉种鸡养殖场、肉鸡孵化场和商品化肉鸡养殖场沙门菌的分离率分别为3.4%、30.3%和6.5%。同一养殖集团内部不同生产环节共分离沙门菌32株,分离率为8.6%,其中肉种鸡养殖场、肉鸡孵化场和商品化肉鸡养殖场的沙门菌分离率分别为2.0%、14.0%和9.2%。沙门菌分离株共有11种血清型分布,优势血清型为肠炎,其次为田纳西、鸡白痢和爪哇纳。肉鸡不同生产环节沙门菌的优势血清存在差异,其中肉种鸡养殖场为肠炎和尼特拉;肉鸡孵化场为肠炎、田纳西和鸡白痢;商品化肉鸡养殖场为肠炎、爪哇纳和鸡白痢。除从饲料中分离出5株埃施魏勒沙门菌外,同一养殖集团内部不同生产环节分离的沙门菌血清型均为肠炎。肉鸡不同生产环节沙门菌分离株的PFGE分型结果显示,不同血清型沙门菌的PFGE同源性较低,而同一血清型的同源性相对较高;多数肠炎沙门菌的PFGE条带谱型属于聚类I群,相似度93.1%;同一养殖集团内部不同生产环节分离的肠炎沙门菌存在完全相同的PFGE谱型。【结论】京津冀地区肉鸡各生产环节沙门菌的分离率差异较大,主要以肠炎沙门菌流行传播为主,肉鸡不同生产环节之间存在肠炎沙门菌的垂直克隆传播,种鸡是肉鸡沙门菌的重要感染来源,养殖场环境和饲料也是肉鸡沙门菌感染的来源之一,因此,必须加强种鸡沙门菌的净化,同时做好其他生产环节沙门菌的防控,以保障肉鸡的健康养殖和公共卫生安全。 展开更多
关键词 肉鸡 沙门菌 生产环节 血清型 pfge
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耐碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌的耐药基因及同源性分析 被引量:1
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作者 刘平娟 邓间开 +5 位作者 郭鹏豪 伍众文 彭雅琴 廖康 陈培松 陈怡丽 《分子诊断与治疗杂志》 2025年第3期400-403,408,共5页
目的分析收集到的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药基因及同源性,为细菌耐药监测以及临床精准合理用药提供依据,为医院感控防治等工作提供有力证据。方法收集2016至2023年中山大学附属第一医院临床分离的37株CRKP,利用PCR方法对细... 目的分析收集到的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药基因及同源性,为细菌耐药监测以及临床精准合理用药提供依据,为医院感控防治等工作提供有力证据。方法收集2016至2023年中山大学附属第一医院临床分离的37株CRKP,利用PCR方法对细菌耐药基因进行测定;用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)方法对CRKP菌株进行同源性分析。结果共检出bla_(KPC)基因阳性共20/37株(54%);检出bla_(NDM-1)基因阳性共21/37株(56.8%);检出bla_(IMP)基因阳性共5/37株(13.5%);bla_(SHV)基因阳性29/37株(78.4%);bla_(TEM)基因阳性24/37株(64.9%);bla_(CTX-M)基因阳性22/37株(59.5%);检出膜孔蛋白缺失22/37株(59.5%)。37株CRKP分为22个亚型。MLST结果显示共分为14种ST分型,以ST-11为主,共18/37株(48.6%)。结论产碳青霉烯酶是肺炎克雷伯菌耐碳青霉烯类抗生素最主要的机制,本中心CRKP菌株同时携带多种耐药基因的现象普遍,ST分型多样且存在ST-656等较为少见的型别,临床应该严格控制抗生素的使用,避免细菌耐药问题加剧。 展开更多
关键词 碳青霉烯酶 肺炎克雷伯菌 pfge MLST 同源性
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乳房炎奶牛金黄色葡萄球菌毒素基因的检测及PFGE分型研究 被引量:20
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作者 王新 韦艺媛 +7 位作者 张静 周婷 梁珍娟 杨保伟 席美丽 夏效东 孟江洪 俞英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期974-980,共7页
作者针对临床及亚临床乳房炎奶牛乳汁中金黄色葡萄球菌分离株的毒素基因进行检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因分型,比较2种类型乳房炎金黄色葡萄球菌分离株的差异。无菌法采集奶样,采用国际标准方法从中分离金黄色葡萄球菌,用多重PCR方... 作者针对临床及亚临床乳房炎奶牛乳汁中金黄色葡萄球菌分离株的毒素基因进行检测和脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因分型,比较2种类型乳房炎金黄色葡萄球菌分离株的差异。无菌法采集奶样,采用国际标准方法从中分离金黄色葡萄球菌,用多重PCR方法扩增nuc基因和mecA基因以确证金黄色葡萄球菌(SA)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)。进一步用PCR方法检测SA的各种毒素基因(SEs、ETs、TSST-1和PVL基因等)。利用限制性内切酶SmaⅠ对SA基因组DNA进行酶切和PFGE分析,最后利用BioNumerics软件进行聚类分析。结果:19.3%(23/119)的临床乳房炎奶样和14.8%(26/176)的亚临床乳房炎奶样确定为金黄色葡萄球菌阳性样品,分别从中分离鉴定出43株和26株金黄色葡萄球菌,其中临床乳房炎分离株中有5株为mecA基因阳性。临床乳房炎奶牛奶样中检测到SA的SEA、SEB、SED、SEJ和PVL毒素基因,检出率分别为3.8%(1株)、11.5%(3株)、19.2%(5株)、7.7%(2株)和31.2%(10株);亚临床乳房炎奶牛乳样中仅检测到SA的SEA和PVL毒力基因,检出率分别为7.0%(3株)和84.1%(37株)。表明临床与亚临床乳房炎奶牛乳汁中SA菌株携带的毒素基因不一样,SEs可能是临床乳房炎菌株的重要致病基因,PVL可能是亚临床乳房炎菌株的重要致病基因。69株SA使用SmaⅠ酶切分型后,可分为7个大簇、50个基因型,来源相同的SA分型后大部分位于同一簇内。临床乳房炎奶牛乳汁中检测到MRSA菌株,PVL基因在亚临床乳房炎中的检出率为临床乳房炎的2.7倍。PFGE方法能较好的区分临床乳房炎和亚临床乳房炎的SA分离菌株。 展开更多
关键词 奶牛 金黄色葡萄球菌 MECA基因 毒素基因 pfge分型
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鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的污染分析及PFGE分型研究 被引量:15
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作者 陈荀 刘书亮 +3 位作者 吴聪明 韩新锋 陈栎娜 陆思琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1012-1016,共5页
目的了解鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的分布和传播情况。方法参考GB/T4789.9-2008、SN0175-2010、ISO10272-1:2006、FDA/BAM:2001、USDA/FSIS:1998等方法组合出分离鸡源疑似空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的方法,采用16SrDN... 目的了解鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的分布和传播情况。方法参考GB/T4789.9-2008、SN0175-2010、ISO10272-1:2006、FDA/BAM:2001、USDA/FSIS:1998等方法组合出分离鸡源疑似空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni,C.jejuni)的方法,采用16SrDNA和hipO基因的二重PCR方法对其准确鉴定;采用SmaⅠ对83株空肠弯曲杆菌进行PFGE分型。结果从鸡肉生产链中采集样品519份,分离鉴定出空肠弯曲杆菌180株,分离率为34.87%。其中养鸡场和屠宰场鸡粪样空肠弯曲杆菌分离率分别为74.29%和66.38%,屠宰场和市场的鸡肉样中空肠弯曲杆菌的分离率分别为17.33%和13.66%。83株空肠弯曲杆菌通过PFGE分型结果产生了45种不同的谱型。结论四川省部分地区鸡肉生产链中空肠弯曲杆菌的污染较严重,空肠弯曲杆菌在鸡肉生产链中可能存在水平传播现象。 展开更多
关键词 空肠弯曲杆菌 鸡肉生产链 分离 鉴定 pfge
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奶牛乳源大肠杆菌耐药性、毒素基因鉴定及PFGE分型研究 被引量:17
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作者 王晓 王新 +6 位作者 郝丹 唐晓双 周传丽 王雅春 张胜利 张沅 俞英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期463-470,共8页
通过采集中国北方地区某荷斯坦牛场生产群牛及乳房炎牛197份样品(195份奶样及2份洗布水样),分离出28株大肠杆菌菌株,并进行细菌药敏试验、毒力基因检测及PFGE分型,为牛场防治大肠杆菌型乳房炎提供数据支持。检测28株大肠杆菌对35种抗生... 通过采集中国北方地区某荷斯坦牛场生产群牛及乳房炎牛197份样品(195份奶样及2份洗布水样),分离出28株大肠杆菌菌株,并进行细菌药敏试验、毒力基因检测及PFGE分型,为牛场防治大肠杆菌型乳房炎提供数据支持。检测28株大肠杆菌对35种抗生素的敏感性发现,兽用临床抗生素庆大霉素和大观霉素应作为该奶牛场大肠杆菌型乳房炎的主要治疗药物。但该牛场出现了对非兽用广谱抗生素麦迪霉素的耐受性菌株,提示牛场在治疗奶牛大肠杆菌型乳房炎时应该注意用药问题。同时,洗布水样分离出的大肠杆菌的多重耐药性较强,也应引起重视,以便及时切断病菌传播途径。基于本研究在28株大肠杆菌中Ecs3703毒力基因的检出率为100%,证实所分离的大肠杆菌为肠出血性大肠杆菌(EHEC)而非肠毒素大肠杆菌(ETEC)。细菌毒力基因Irp2和CNF2的检出则暗示携带这两类毒力基因的大肠杆菌极可能为奶牛乳房炎致病菌。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 大肠杆菌 药敏试验 毒力基因 pfge分型
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动物、环境及饲养员多重耐药大肠杆菌的PFGE分型研究 被引量:16
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作者 杨玲丽 陈杖榴 +3 位作者 刘健华 曾振灵 马俊英 吴聪明 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期2597-2602,共6页
目的了解养殖场多重耐药大肠杆菌耐药性的传播机制,探讨人、动物与环境间耐药菌垂直克隆传播的可能性。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对分离自养殖场动物、环境和饲养员的86株耐药谱相近多重耐药大肠杆菌进行DNA指纹图谱分型,... 目的了解养殖场多重耐药大肠杆菌耐药性的传播机制,探讨人、动物与环境间耐药菌垂直克隆传播的可能性。方法采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对分离自养殖场动物、环境和饲养员的86株耐药谱相近多重耐药大肠杆菌进行DNA指纹图谱分型,比较菌株之间的亲缘关系。结果37株鸡场来源大肠杆菌可分为20种PFGE分型;49株猪场来源大肠杆菌可分为24种PFGE分型;同一动物、环境或饲养员采样点分离菌株PFGE指纹图谱相同者较多;同一养殖场不同动物个体、养殖场环境不同采样点、动物和环境以及饲养员和环境都存在PFGE指纹图谱完全相同菌株;鸡场和猪场都发现有属同一PFGE分型的来自动物、饲养员和环境的菌株;86株菌全部对环丙沙星、氨苄西林、链霉素、四环素、多西环素和复方新诺明耐药,相同PFGE分型的菌株其耐药谱型不一定相同。结论养殖场动物、环境及饲养员之间存在多重耐药大肠杆菌的克隆传播。 展开更多
关键词 大肠杆菌 多重耐药 pfge分型 动物 克隆传播
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肠炎沙门菌食物中毒中PFGE的应用 被引量:20
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作者 王芳 赵滢 +2 位作者 陈智 王军华 熊燕 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第10期922-924,共3页
目的对2014年武汉市某区一起食物中毒事件的病原体进行分离鉴定及同源性分析。方法参照GB4789-2012和WS/T 13-1996的方法进行病原菌的分离培养,对检出菌进行表型鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对检出菌及实验室收集的其他肠炎... 目的对2014年武汉市某区一起食物中毒事件的病原体进行分离鉴定及同源性分析。方法参照GB4789-2012和WS/T 13-1996的方法进行病原菌的分离培养,对检出菌进行表型鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法对检出菌及实验室收集的其他肠炎沙门氏菌进行分子分型和流行病学特征分析;采用WHO推荐的改良K-B法对检出菌进行抗生素敏感试验结果流行病学调查及实验室病原学检测证实,本起事件是一起由肠炎沙门氏菌引起的食物中毒,共分离到18株肠炎沙门氏菌。分离自该事件可疑食物及患者肛拭子的肠炎沙门氏菌相似系数为100%,与同一时期散发临床患者分离的肠炎沙门氏菌相似系数约为90%,与2012年健康体检分离株及2013年、2014年临床患者分离株最小相似系数>90%。此次食物中毒株对所检测药物敏感性较好。结论此次食物中毒病原菌为本地区流行的肠炎沙门氏菌优势株。PFGE可用于细菌性食物中毒的溯源分析。 展开更多
关键词 食物中毒 肠炎沙门氏菌 血清学鉴定 耐药性 pfge分型
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贵州省3株钩端螺旋体分离株PFGE分型与基因种鉴定 被引量:7
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作者 李世军 张翠彩 +7 位作者 李秀文 唐光鹏 田克成 刘英 蔡星和 于春 聂一新 蒋秀高 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期587-591,共5页
目的应用脉冲场电泳(PFGE)分型技术和16S rRNA基因测序分析技术分别对贵州省3株动物宿主钩端螺旋体分离菌株进行分子分型和基因种鉴定,了解贵州省钩端螺旋体的分子流行病学特征。方法应用DNA限制性内切酶NotI对钩端螺旋体染色体DNA酶切... 目的应用脉冲场电泳(PFGE)分型技术和16S rRNA基因测序分析技术分别对贵州省3株动物宿主钩端螺旋体分离菌株进行分子分型和基因种鉴定,了解贵州省钩端螺旋体的分子流行病学特征。方法应用DNA限制性内切酶NotI对钩端螺旋体染色体DNA酶切后,用PFGE将DNA片段分离,采用BionumericsV4.0将3株钩体菌株PFGE图谱与中国15群15型参考菌株进行聚类分析;同时,应用PCR扩增几乎全长的钩体16S rRNA基因片段,并将扩增产物进行双向序列测定,并与GenBank数据库已注册的核酸序列进行同源性比对、确定基因种、分析亲缘进化关系。结果来自贵州省的3株动物宿主分离钩体菌株PFGE带型命名为LepNot I 002和LepNot I 003,经聚类分析,3株菌株与黄疸出血群黄疸出血型赖株的相似性大于95%。16S rRNA基因测序和分析表明,3株贵州分离钩体菌株之间的同源性为100%,与致病性钩体问号钩端螺旋体种(L.interrogans)不同血清型参考菌株的同源性达100%。结论 3株贵州动物分离钩体菌株经PFGE分型鉴定与黄疸出血群赖型赖株的相似性大于95%,经16S rRNA基因测序分析鉴定为L.interrogans种,上述两种方法对贵州省钩体分离菌株的鉴定结果一致,有助于贵州省钩端螺旋体病的主动监测、暴发调查和传染源追踪。 展开更多
关键词 钩端螺旋体 pfge 16S RRNA 序列分析 同源性 基因种
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广西罗非鱼链球菌病流行菌株PCR鉴定和PFGE基因型分析 被引量:28
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作者 李莉萍 王瑞 +7 位作者 黄婷 黄维义 梁万文 李健 黄彦 雷爱莹 甘西 陈明 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期927-935,共9页
为获知近年广西罗非鱼链球菌病流行菌种及其基因型变化信息,采用特异PCR方法对2006—2012年从广西发病罗非鱼分离获得的77株临床菌株进行鉴定,并通过脉冲电场凝胶电泳(PFGE)对2006—2011年分离获得的37株流行菌株进行基因型分析。结果显... 为获知近年广西罗非鱼链球菌病流行菌种及其基因型变化信息,采用特异PCR方法对2006—2012年从广西发病罗非鱼分离获得的77株临床菌株进行鉴定,并通过脉冲电场凝胶电泳(PFGE)对2006—2011年分离获得的37株流行菌株进行基因型分析。结果显示,其中20株鉴定为海豚链球菌其余57株鉴定为无乳链球菌。2006—2007年获得的19株流行菌株中有18株为海豚链球菌(94.7%),仅1株无乳链球菌;2009—2012年分离的58株流行菌株中56株为无乳链球菌(96.6%),仅2株海豚链球菌。PFGE图谱聚类显示,海豚和无乳链球菌分别聚类为两个大分支,20株海豚链球菌共产生4种PFGE带型,带型相似度为83.9%~100%;17株无乳链球菌共产生5种PFGE带型,带型相似度为47.4%~100%。研究表明,广西罗非鱼链球菌病流行菌种已从过去(2008年前)以海豚链球菌为主转变为现在(2009—2012年)以无乳链球菌为主;流行菌株PFGE基因型存在多样性。 展开更多
关键词 罗非鱼 无乳链球菌 海豚链球菌 脉冲场凝胶电泳 基因型
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广东、海南、福建3省罗非鱼链球菌病流行菌株PCR鉴定和PFGE基因型分析 被引量:11
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作者 李莉萍 王瑞 +7 位作者 黄婷 甘西 李健 黄维义 黄彦 雷爱莹 陈明 梁万文 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第5期2133-2140,共8页
为研究近年来罗非鱼链球菌病流行菌株菌种与基因型变化信息,对广东、海南和福建3省罗非鱼主养区(共17个市县,93个养殖场)近4年的链球菌病流行菌株进行了分离,采用特异PCR方法对2009-2012年分离获得的流行菌株进行检测,并通过脉冲电场凝... 为研究近年来罗非鱼链球菌病流行菌株菌种与基因型变化信息,对广东、海南和福建3省罗非鱼主养区(共17个市县,93个养殖场)近4年的链球菌病流行菌株进行了分离,采用特异PCR方法对2009-2012年分离获得的流行菌株进行检测,并通过脉冲电场凝胶电泳(PFGE)对2009-2011年分离获得的流行菌株进行基因型分析。3省共分离到102株流行菌株,PCR鉴定结果显示均为无乳链球菌(Streptococcus agalactiae,S.agalactiae)。67株无乳链球菌PFGE图谱聚类显示产生A^G共7种PFGE带型,带型相似度在52.1%~100%之间。基因型A和D为广东优势菌群(93.48%,43/46),基因型F为海南优势菌群(66.7%,10/15),而福建6株分属于B、C和E共3个基因型。2009-2012年3省罗非鱼链球菌病流行菌种为无乳链球菌,流行菌株菌型较复杂,各省优势菌群存在较大差异,并且随时间发生变化。 展开更多
关键词 罗非鱼 无乳链球菌 脉冲场凝胶电泳(pfge) 基因型
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宠物犬及犬粮源沙门氏菌的耐药性分析及PFGE分型 被引量:11
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作者 陈传荣 周妮妮 +3 位作者 韩敏敏 魏建忠 孙裴 李郁 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期544-549,共6页
为了解宠物犬和犬粮源沙门氏菌的耐药表型特征与耐药基因分布,以及不同分离菌株之间的同源性,本研究采用K-B法测定27株分离菌的药物敏感性、PCR检测耐药基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行基因分型。结果显示,27株沙门氏菌分离株对氨苄西... 为了解宠物犬和犬粮源沙门氏菌的耐药表型特征与耐药基因分布,以及不同分离菌株之间的同源性,本研究采用K-B法测定27株分离菌的药物敏感性、PCR检测耐药基因、脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行基因分型。结果显示,27株沙门氏菌分离株对氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、链霉素、复方新诺明、强力霉素耐药率在29.63%~22.22%,33.33%分离菌对3种及3种以上抗生素耐药,其中阿莫西林/克拉维酸-氨苄西林-复方新诺明-强力霉素所占比率最大,为66.67%(6/9);74.07%分离菌至少含有1种耐药基因,以str A-B、bla PSE、tet B、sul1检出率最高,分别为40.7%、37.0%、29.6%、25.9%,四环素类、氯霉素类、磺胺类、β-内酰胺类耐药基因与耐药表型符合率较高,分别为100%、100%、87.5%、72.7%;27株分离菌形成12种PFGE基因型,优势型别为pt1和pt7型。本研究结果表明宠物犬和犬粮源沙门氏菌呈现多重耐药,耐药表型与其相对应的耐药基因间存在密切的相关性;PFGE基因型呈多态性,而其与血清型之间不呈相关性,但与多重耐药菌株(耐>8)间存在一定程度的关联性。 展开更多
关键词 宠物犬和犬粮 沙门氏菌 耐药表型 耐药基因 pfge
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规模化养殖肉鸡泄殖腔拭子弯曲菌分离及PFGE分型分析 被引量:8
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作者 邓义贞 顾一心 +5 位作者 何利华 张艾煜 梁昊 张建中 张茂俊 邓俊良 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期778-783,789,共7页
为了了解规模化养殖肉鸡弯曲菌的带菌现状,比较2种基础培养基对于粪便标本弯曲菌检出差异,获得菌株菌型特征。本研究选择规模化肉鸡养殖场共300份肉鸡泄殖腔拭子,分别应用Columbia、Karmali 2种基础培养基,采用滤膜过滤法进行弯曲菌的... 为了了解规模化养殖肉鸡弯曲菌的带菌现状,比较2种基础培养基对于粪便标本弯曲菌检出差异,获得菌株菌型特征。本研究选择规模化肉鸡养殖场共300份肉鸡泄殖腔拭子,分别应用Columbia、Karmali 2种基础培养基,采用滤膜过滤法进行弯曲菌的分离培养。结合革兰染色、生化鉴定以及PCR方法对疑似菌落进行弯曲菌菌种鉴定;选择60株空肠弯曲菌进行脉冲场凝胶电泳分析并用BioNumerics软件对脉冲场凝胶电泳结果进行聚类分析。结果显示,300份泄殖腔拭子样品中,弯曲菌的检出率为51.33%(154/300)。空肠弯曲菌、结肠弯曲菌检出率分别为40%(120/300)和14.67%(44/300),空、结肠弯曲菌混合感染的感染率为3.33%(10/300)。检测标本中空肠弯曲菌的感染率显著大于结肠弯曲菌(P<0.01)。应用Columbia、Karmali培养基对弯曲菌的检出率分别为41.67%(125/300)、42.67%(128/300),2种基础培养基检出率无显著性差异(P>0.05),2种培养基的补充使用样本的检出率增加了15%(45/300)。本次滤膜过滤法同时获得相同培养条件下标本中其他细菌3种,分别为:Cellulosimicrobiumsp.、Microbacteriumsp.、Helicobacter brante,共45株。60株空肠弯曲菌脉冲场凝胶电泳共分为39个带型。结果表明,本研究发现规模化养殖肉鸡中弯曲菌的携带情况较为严重,相同鸡场及不同鸡场分离菌株脉冲场凝胶电泳带型呈多样性特征。滤膜过滤法能够有效检测家禽肛拭子标本中弯曲菌,缩减了因使用选择性抗生素添加剂的成本。本研究没有检出除空肠弯曲菌和结肠弯曲菌外的其他弯曲菌菌种。 展开更多
关键词 弯曲菌 分离率 COLUMBIA Karmali pfge1
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辽宁省食源性副溶血性弧菌PFGE分子分型及血清型、耐药谱 被引量:16
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作者 李雪 张眉眉 +9 位作者 马景宏 耿英芝 魏彤竹 于淼 孙婷婷 李飞 王伟杰 张铭琰 刘海霞 韩佳敏 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2017年第11期1269-1271,1304,共4页
目的分析辽宁省副溶血性弧菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别及血清型、耐药谱,探讨辽宁省副溶血性弧菌污染的同源性,为食源性疾病溯源和预警提供基础。方法对50株从辽宁省2015年食源性疾病和食品中分离的副溶血性弧菌进行PFGE分子分型、血清... 目的分析辽宁省副溶血性弧菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别及血清型、耐药谱,探讨辽宁省副溶血性弧菌污染的同源性,为食源性疾病溯源和预警提供基础。方法对50株从辽宁省2015年食源性疾病和食品中分离的副溶血性弧菌进行PFGE分子分型、血清学分型、药物敏感试验,采用BioNumerics version 6.6软件进行分析,比较同源性。结果 50株副溶血性弧菌共分为19个血清型,食源性疾病分离株分为5个血清群,主要的血清型为O3群,其次为O1群;食品分离株分为9个血清群,主要的血清型为O3群,其次为O1和O4群。50株副溶血性弧菌对15种抗生素的耐药试验,对头孢唑啉耐药率最高达72%。50株副溶血性弧菌共分为4种PFGE优势带型,相似度为90.8%~100.0%。结论辽宁省食源性副溶血性弧的血清型以O3群和O1群为主,致病菌流行株血清型为O3:K6;食品中分离菌株血清型和PFGE带型非常分散,提示这些多为遗传不相关菌株。PFGE图谱可看出,绝大部分相同血清型菌株的PFGE带型相似度很高,O3与O1血清型菌株有高度同源性密切相关,耐药菌株间PFGE带型相似度很高,均具有高度同源性。相比2014年的耐药情况,对头孢唑啉耐药率显著增高。另外,少数菌株出现多重耐药,耐药情况不容乐观。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 脉冲场凝胶电泳 血清学分型 耐药
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牛奶源金黄色葡萄球菌血清型、毒力基因及PFGE分型 被引量:14
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作者 刘保光 蔡田 +5 位作者 李小申 刘营营 贺丹丹 匡秀华 高延玲 胡功政 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第2期281-286,共6页
目的:研究生鲜牛奶中金黄色葡萄球菌分离、荚膜多糖血清型分布、毒力基因携带及脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型情况。方法:从河南省4个地区奶牛养殖场采集生鲜牛奶样品按照国标法进行分离,扩增耐热核酸酶基... 目的:研究生鲜牛奶中金黄色葡萄球菌分离、荚膜多糖血清型分布、毒力基因携带及脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型情况。方法:从河南省4个地区奶牛养殖场采集生鲜牛奶样品按照国标法进行分离,扩增耐热核酸酶基因nuc鉴定金黄色葡萄球菌,利用聚合酶链式反应方法测定荚膜多糖血清型和毒力基因携带情况,采用PFGE分析菌株间的相关性和遗传关系。结果:从350份生鲜牛奶样品中分离鉴定到80株金黄色葡萄球菌,分离率为22.86%。荚膜多糖血清型测定发现,cap5(60%)是流行血清型。从这些阳性菌株中,发现有62株(77.5%)携带有毒力基因,毒力基因set、hlb、hld、lukED、ebp、clfA和clfB,检出率分别为40.00%、51.25%、57.50%、60.00%、58.75%、57.50%和58.75%。此外,47株(58.75%)菌携带不少于6个毒力基因,流行的毒力基因谱型为set-hla-hlb-hld-lukED-cna-ebp-clfA-clfB。PFGE结果显示,获得72株菌的PFGE图谱,按90%的相似性可分为12个簇和46种PFGE型。D簇(3种PFGE型)、G簇(3种PFGE型)和J簇(5种PFGE型)菌株中均检出一定基因类型的毒力基因,表明河南地区生鲜牛奶中金黄色葡萄球菌毒力基因广泛存在于多种PFGE型别中。结论:生鲜牛奶均有一定程度的金黄色葡萄球菌污染,多数菌株携带毒力基因,且毒力基因的类型较为复杂,这对消费这些牛奶的人群构成潜在的健康威胁。PFGE分型菌株主要以克隆形式进行传播,且克隆型具有多样性和差异性,故临床应加强生奶及乳品血清型、毒力基因检测及分子分型研究。 展开更多
关键词 牛奶 金黄色葡萄球菌 血清型 毒力基因 脉冲场凝胶电泳
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