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用Y.pestis接种某些植物的研究 被引量:10
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作者 宋志忠 顾锋 +1 位作者 杨桂荣 申晶 《中国地方病防治》 北大核心 1996年第4期194-195,共2页
本研究采用鼠疫弱毒株061号对大豆、小麦、兴安胡枝子、紫苜蓿、青蒿等进行接种,在不同时期从大豆组织中分离到目的菌,并发现其菌落形态由R型向S型改变,其营养需求也发生了明显的变化。
关键词 Y.pestis 接种 植物 鼠疫杆菌
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人tPA信号肽和Yersinia pestis保护性抗原F1-V融合基因的构建及其免疫效果观察 被引量:3
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作者 韩岳 王希良 +3 位作者 董梅 邢丽 赵光宇 刘秀华 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期811-816,共6页
为获得含有鼠疫F1和V抗原编码基因,以及人tPA信号肽基因的重组质粒tPA-pVAX1/F1-V,测定其诱导特异性免疫应答的能力,用PCR扩增鼠疫菌F1和V编码基因,分别与pGEM-T连接测序.构建pVAX1/F1-V融合重组质粒,PCR扩增tPA信号肽片段,并将其插入到... 为获得含有鼠疫F1和V抗原编码基因,以及人tPA信号肽基因的重组质粒tPA-pVAX1/F1-V,测定其诱导特异性免疫应答的能力,用PCR扩增鼠疫菌F1和V编码基因,分别与pGEM-T连接测序.构建pVAX1/F1-V融合重组质粒,PCR扩增tPA信号肽片段,并将其插入到F1-V的上游,构建tPA-pVAX1/F1-V融合重组质粒;转染COS-7细胞,Western印迹法鉴定目的蛋白的表达,重组质粒tPA-pVAX1/F1-V加GM-CSF佐剂免疫BALB/c小鼠,观察免疫效果.400个LD50强毒鼠疫菌皮下攻毒观察保护率.结果表明,tPA-pVAX1/F1-V在COS-7细胞中表达;免疫鼠体内产生特异性抗体;抗体亚型分析、细胞因子等指标的测定表明,所构建DNA疫苗以诱发Th1型免疫为主;(攻毒保护率达90%.结果提示,已成功构建F1-V融合蛋白真核表达载体tPA-pVAX1/F1-V,它具有诱导特异性细胞免疫和体液免疫应答的能力,对强毒鼠疫菌皮下攻毒有一定的保护效力,为鼠疫菌新型疫苗研制奠定了基础. 展开更多
关键词 鼠疫杆菌 F1-V抗原 基因融合双价疫苗 tPA信号肽
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Transcriptomic Response to Yersinia pestis:RIG-I Like Receptor Signaling Response Is Detrimental to the Host against Plague 被引量:2
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作者 Zongmin Du Huiying Yang +12 位作者 Yafang Tan Guang Tian Qingwen Zhang Yujun Cui Yanfeng Yan Xiaohong Wu Zuyun Chen Shiyang Cao Yujing Bi Yanping Han Xiaoyi Wang Yajun Song Ruifu Yan 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2014年第7期379-396,共18页
Bacterial pathogens have evolved various mechanisms to modulate host immune responses for successful infection. In this study, RNA- sequencing technology was used to analyze the responses of human monocytes THP1 to Ye... Bacterial pathogens have evolved various mechanisms to modulate host immune responses for successful infection. In this study, RNA- sequencing technology was used to analyze the responses of human monocytes THP1 to Yersinia pestis infection. Over 6000 genes were differentially expressed over the 12 h infection. Kinetic responses of pathogen recognition receptor signaling pathways, apoptosis, antigen processing, and presentation pathway and coagulation system were analyzed in detail. Among them, RIG-I-like receptor (RLR) signaling pathway, which was established for antiviral defense, was significantly affected. Mice lacking MAVS, the adaptor of the RLR signaling pathway, were less sensitive to infection and exhibited lower IFN-13 production, higher Thl-type cytokines IFN-γ and IL-12 production, and lower Th2-type cytokines IL-4 and IL-13 production in the serum compared with wild-type mice. Moreover, infection of pathogenic bacteria other than E pestis also altered the expression of the RLR pathway, suggesting that the response of RLR pathway to bacterial infection is a universal mechanism. 展开更多
关键词 Yersinia pestis Innate immunity RIG-I-like receptor signaling RNA-seq Transcriptomic response
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Different Strategies for Preparation of Non-tagged rV270 Protein and Its Efficacy against Yersinia Pestis Challenge 被引量:1
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作者 WANG WANG ZHI-ZHEN QI +12 位作者 QING-WEN ZHANG BEN-CHUAN WU ZI-WEN ZHU YONG-HAI YANG BAI-ZHONG CUI RUI-XIA DAI YE-FENG QIU ZU-YUN WANG ZHAO-BIAO GUO TAO-XING SHI HU WANG RUI-FU YANG XIAO-YI WANG 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2010年第5期333-340,共8页
Objective LcrV is an important component for the development of a subunit vaccine against plague.To reduce immunosuppressive activity of LcrV,a recombinant LcrV variant lacking amino acids 271 to 326 (rV270) was pre... Objective LcrV is an important component for the development of a subunit vaccine against plague.To reduce immunosuppressive activity of LcrV,a recombinant LcrV variant lacking amino acids 271 to 326 (rV270) was prepared by different methods in this study.Methods A new strategy that produced non-tagged or authentic rV270 protein was designed by insertion of rV270-thrombin-hexahistidine fusion gene into the vector pET24a,or by insertion of hexahistidine-enterokinase-rV270 or hexahistitine-factor Xa-rV270 fusion gene into the vector pET32a.After Co2+ affinity chromatography,a purification strategy was developed by cleavage of His tag on column,following Sephacryl S-200HR column filtration chromatography.Results Removal of His tag by thrombin,enterokinase and factor Xa displayed a yield of 99.5%,32.4% and 15.3%,respectively.Following Sephacryl S-200HR column filtration chromatography,above 97% purity of rV270 protein was obtained.Purified rV270 that was adsorbed to 25% (v/v) Al(OH)3 adjuvant in phosphate-buffered saline (PBS) induced very high titers of antibody to rV270 in BALB/c mice and protected them (100% survival) against subcutaneous challenge with 106 CFU of Y.pestis virulent strain 141.Conclusion The completely authentic rV270 protein can be prepared by using enterokinase or factor Xa,but they exhibited extremely low cleavage activity to the corresponding recognition site.Thrombin cleavage is an efficient strategy to prepare non-tagged rV270 protein and can be easily operated in a large scale due to its relatively low cost and high cleavage efficacy.The recombinant rV270 can be used as a key component to develop a subunit vaccine of plague. 展开更多
关键词 Yersinia pestis rV270 antigen PURIFICATION Protection PLAGUE
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Comparative Genomic Analysis of Gene Variations of Two Chinese Yersinia pestis Isolates from Vaccine Strain EV76 被引量:1
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作者 YOU Yuan Hai WANG Peng +7 位作者 WANG Yan Hua ZHANG Mao Jun SONG Zhi Zhong HAl Rong YU Dong Zheng WANG Hai Bin DONG Xing Qi ZHANG Jian Zhong 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2012年第4期440-448,共9页
Objective To investigate genomic variations of two Chinese Yersinia pestis isolates that were isolated from different plague foci obtained from vaccine strain EV76 from the Yunnan province of China. Methods A microarr... Objective To investigate genomic variations of two Chinese Yersinia pestis isolates that were isolated from different plague foci obtained from vaccine strain EV76 from the Yunnan province of China. Methods A microarray containing 12 000 probes covering the entire genome of seven Yersinie pestis and two Yersinia pseudotuberculosis strains, was used. PCR assays were performed to confirm microarray results. Results The gene variations detected included the absence of five genes related to the synthesis of betaine in both EV76 and another sequenced attenuated strain, KIM D27. Several genes related to phage-related membrane proteins were found to be absent in the Antiqua biovar Yunnan strain, 485, which was isolated from a rodent plague foci. Conclusion These findings provide initial insight into the distinct strains isolated from natural foci, within their genomic context, including Yunnan Y. pestis strains. This information will be used therefore to establish subsequent comparisons of these sequences with published complete genomes of other strains. 展开更多
关键词 ARRAYCGH Yersinia pestis
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Use of Rich BHI Medium Instead of Synthetic TMH Medium for Gene Regulation Study in Yersinia pestis
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作者 ZHANG Yi Quan MA Li Zhi +6 位作者 WANG Li GAO He TAN Ya Fang GUO Zhao Biao QIU Jing Fu YANG Rui Fu ZHOU Dong Sheng 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2012年第6期639-644,共6页
Objective This study is to verify the use of rich BHI medium to substitute synthetic media for gene regulation studies in Yersinia pestis. Methods The transcriptional regulation of rovA by PhoP or via temperature upsh... Objective This study is to verify the use of rich BHI medium to substitute synthetic media for gene regulation studies in Yersinia pestis. Methods The transcriptional regulation of rovA by PhoP or via temperature upshift, and that of pla by CRP were investigated when Y. pestis was cultured in BHI. After cultivation under 26 ~C, and with temperature shifting from 26 to 37 ~C, the wild-type (WT) strain or its phoP or crp null mutant (AphoP or Acrp, respectively) was subject to RNA isolation, and then the promoter activity of rovA or plo in the above strains was detected by the primer extension assay. The rovA promoter-proximal region was cloned into the pRW50 containing a promoterless lacZ gene. The recombinant LacZ reporter plasmid was transformed into WT and AphoP to measure the promoter activity of rovA in these two strains with the ^-Galactosidase enzyme assay system. Results When Y. pestis was cultured in BHI, the transcription of rovA was inhibited by PhoP and upon temperature upshift while that ofpla was stimulated by CRP. Conclusion The rich BHI medium without the need for modification to be introduced into the relevant stimulating conditions (which are essential to triggering relevant gene regulatory cascades), can be used in lieu of synthetic TMH media to cultivate Y. pestis for gene regulation studies. 展开更多
关键词 Yersinia pestis BHI TMH Gene regulation
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Reciprocal Regulation between Fur and Two RyhB Homologs in Yersinia pestis,and Roles of RyhBs in Biofilm Formation
7
作者 NI Bin WU Hai Sheng +2 位作者 XIN You Quan ZHANG Qing Wen ZHANG Yi Quan 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2021年第4期299-308,共10页
Objective To investigate reciprocal regulation between Fur and two RyhB homologs in Yersinia pestis(Y.pestis),as well as the roles of RyhBs in biofilm formation.Methods Regulatory relationships were assessed by a comb... Objective To investigate reciprocal regulation between Fur and two RyhB homologs in Yersinia pestis(Y.pestis),as well as the roles of RyhBs in biofilm formation.Methods Regulatory relationships were assessed by a combination of colony morphology assay,primer extension,electrophoretic mobility shift assay and DNase I footprinting.Results Fur bound to the promoter-proximal DNA regions of ryhB1 and ryhB2 to repress their transcription,while both RyhB1 and RyhB2 repressed the expression of Fur at the post-transcriptional level.In addition,both RyhB1 and RyhB2 positively regulated Y.pestis biofilm exopolysaccharide(EPS)production and the expression of hmsHFRS and hmsT.Conclusion Fur and the two RyhB homologs exert negative reciprocal regulation,and RyhB homologs have a positive regulatory effect on biofilm formation in Y.pestis. 展开更多
关键词 Yersinia pestis RYHB FUR BIOFILM
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基于智慧社区新国标的业内形势PESTI分析参考
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作者 钱卫 《中国有线电视》 2021年第3期280-282,共3页
从管理角度,使用PESTI(政策、经济、社会、技术、行业)理论对广电行业作了系统性的分析。探讨了在住建部新发布智慧社区建设规范以及5G和IPv6大发展的背景下,广电行业(以山东广电为例)所面临的外部宏观环境。
关键词 智慧社区 5G pesti分析
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Genotyping of strains of Yersinia pestis from Marmota baibacina-Spermophilus undulates Plague Focus of Tianshan Mountains in China
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作者 LI XIA JIN ER HEI DAI +11 位作者 DONG SHENG ZHOU BAI ZHONG CWI RI XIA DAI SHAN LONG YUE MEI YING QI HAI HONG ZHAO CUN XIANG LI XIAO YAN YANG XIAO TAO YU XIANG DAI MIN LI RUI FU YANG 《Journal of Microbiology and Immunology》 2005年第4期266-269,共4页
The aim of this study is to carry out genotyping of 61 Y. pestts strmns tsolated trom lwarmota baibacina-Spermophilus undulates Plague Focus of Tianshan Mountains in China. Primer pairs targeting the 22 DFRs were desi... The aim of this study is to carry out genotyping of 61 Y. pestts strmns tsolated trom lwarmota baibacina-Spermophilus undulates Plague Focus of Tianshan Mountains in China. Primer pairs targeting the 22 DFRs were designed for detecting the genotypes of 61 strains. As a result, 61 strains of Y. pestis were divided into four genotypes 1, 2, 3, and 4. Genotypes 1, 2 and 3 were found from west part in Northern Tianshan Mountains Plague Focus, but type 1 was only from Nileke county. The type of strains from Aheqi was different from those of Atushi counties in Southern Tianshan Mountains and similar to strains in Northern Tianshan Mountains Plague Focus. The type 4 distributed over Atushi county, which was identical with that of strains from Marmota caudae Plague Focus of the Pamiri Plateau. It is concluded that geonotyping is identical with ecotyping made by Shuli Ji. Tianshan Mountains Plague Focus and Marmota caudae Plague Focus of the Pamiri Plateau have a cross spreading profile. 展开更多
关键词 Yersinia pestis PCR Comparative genomics DFR Plague Focus Natural
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新疆阿尔泰山地鼠疫分离株生物学特性及基因差异区段分型研究
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作者 王信惠 罗勇军 +11 位作者 王宇萌 麦迪娜·肖开提 王希江 王启果 古丽阿依·包开西 王蒴 李博 特列吾别克·斯拉木别克 李冰 贵有军 王效俊 李伟 《中国地方病防治》 2025年第5期366-368,382,共4页
目的 分析新疆阿尔泰山地鼠疫分离菌株的生物学特性和DFR基因型,为突发鼠疫应急处置和人间鼠疫病例追溯和溯源提供数据支撑。方法 对2021—2024年期间分离于新疆阿尔泰山地和北天山山地的鼠疫菌株进行生化鉴定和毒力测定;病原菌全基因... 目的 分析新疆阿尔泰山地鼠疫分离菌株的生物学特性和DFR基因型,为突发鼠疫应急处置和人间鼠疫病例追溯和溯源提供数据支撑。方法 对2021—2024年期间分离于新疆阿尔泰山地和北天山山地的鼠疫菌株进行生化鉴定和毒力测定;病原菌全基因组提取,PCR差异区段扩增、电泳、凝胶成像获得DFR片断信息,数据库比对分析DFR基因型。结果 阿尔泰山地鼠疫菌株生化型表现为古典型,不具备酵解鼠李唐的能力;毒力测定属于鼠疫强毒株,半数致死量(LD_(50))7.9个菌体,最小致死量(MLD)<10个菌体;9株新疆阿尔泰山地鼠疫分离菌株均表现为缺失DFR01、DFR10、DFR13、DFR23,经文献数据库比对为我国一种新的DFR基因型。结论 新疆阿尔泰山地鼠疫分离菌株生化表型为古典型、鼠疫强毒株,半数致死量(LD50)7.9个菌体,最小致死量(MLD)<10个菌体;为我国一种新的鼠疫菌DFR基因型。 展开更多
关键词 鼠疫菌 阿尔泰山地 新疆 生物学特性 DFR分型
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青海省鼠疫菌单核苷酸多态性分析
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作者 何建 靳娟 +5 位作者 李胜 柏吉祥 金泳 张丽 杨晓艳 辛有全 《中华卫生杀虫药械》 2025年第1期103-106,共4页
目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用... 目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用传统的苯酚-氯仿混合抽提法提取鼠疫菌DNA。使用Illumina HiSeq 2000平台对250株鼠疫菌进行全基因测序,根据文献中鼠疫菌全基因组SNPs分析方法,基于133株国内外鼠疫菌株及假结核耶尔森菌IP32953,比对2 298个SNP位点,用MEGA 6.0软件对250株青海省鼠疫菌以及32株参考菌株构建系统发育关系。结果 青海省250株鼠疫菌分布于8个市(州),31个县(区)。其中海西州共66株,海北州共70株,海南州共28株,玉树州共62株,黄南州、果洛州、西宁市、海东市共24株。基于2 298个SNPs位点的聚类结果显示,青海省250株鼠疫菌分布在5个亚分支中,分别为0.PE分支6株(2.0%),1.IN分支235株(94.0%),2.ANT分支4株(1.6%),2.MED分支1株(0.4%),3.ANT分支4株(1.6%)。结论 青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌SNP基因型具有高度多样性,地区分布特征明显。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) SNP基因分型 青海省
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云南省梁河县鼠体寄生蚤鼠疫耶尔森菌及莫氏立克次体感染调查
12
作者 陈怡 苏超 +7 位作者 黄莹 亚红祥 杨世伟 姚仕堂 田楚琦 赵莹 浦恩念 高子厚 《中国热带医学》 北大核心 2025年第8期984-989,共6页
目的调查梁河县鼠类动物的种类、体表寄生蚤的种类以及鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)和莫氏立克次体(Rickettsia mooseri)感染情况,为当地蚤传疾病的防控提供依据。方法于2024年4月在云南省梁河县遮岛镇、芒东镇、九保乡、河西乡和囊... 目的调查梁河县鼠类动物的种类、体表寄生蚤的种类以及鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)和莫氏立克次体(Rickettsia mooseri)感染情况,为当地蚤传疾病的防控提供依据。方法于2024年4月在云南省梁河县遮岛镇、芒东镇、九保乡、河西乡和囊宋乡采用笼夜法和夹夜法捕获鼠类,采集鼠体表寄生蚤,并对鼠和蚤的种类进行鉴定,计算染蚤率和蚤指数,不同调查点染蚤率的比较采用χ^(2)检验或Fisher确切概率法分析;提取蚤的总DNA,采用普通PCR扩增鼠疫菌的caf1和pla基因、莫氏立克次体的gltA基因,阳性样本进行测序,并与GenBank中核苷酸序列进行比对;使用MEGA 6.06软件,采取邻接法构建系统进化树,进行系统进化分析。结果本研究共捕获到鼠类动物163只,隶属2目2科8属10种,其中黄胸鼠113只(69.33%),为当地的优势鼠种;其次是灰麝鼩14只,黑缘齿鼠10只,卡氏小鼠和大臭鼩各8只,大足鼠6只,其他4只。共采获鼠体寄生蚤127匹,隶属1目3科3属3种,其中缓慢细蚤最多,占74.02%,为当地优势蚤种;其次是印鼠客蚤,占22.05%;近端远棒蚤二刺亚种最少,占3.94%。5个调查点居民区的鼠体染蚤率为38.57%,农耕区为6.45%,居民区高于农耕区,差异有统计学意义(χ^(2)=25.519,P<0.001)。对21份合并的蚤样本进行鼠疫耶尔森菌和莫氏立克次体PCR检测,鼠疫菌检测均为阴性,莫氏立克次体检出3份阳性。获得的3条(LHM10、LHM14和LHM15)gltA基因序列无差异;同源性和系统进化分析表明,梁河县获得的莫氏立克次体gltA基因序列与莫氏立克次体代表株Wilmington株(U59714.1)同源性高达99.14%,系统进化树处于同一分支。结论在云南省梁河县鼠体寄生蚤中未检测到鼠疫耶尔森菌感染,但检测到莫氏立克次体感染,该地区存在地方性斑疹伤寒疫源地,部分地区的鼠蚤密度较高,当地居民有地方性斑疹伤寒感染风险,应加强监测。 展开更多
关键词 鼠类 寄生蚤 鼠疫耶尔森菌 莫氏立克次体 地方性斑疹伤寒 梁河县
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环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性研究
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作者 李胜 靳娟 +7 位作者 何建 杨晓艳 柏吉祥 辛有全 张丽 张晓璐 杜文琪 李伟 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第6期592-596,共5页
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础。方法利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列... 目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性分析,明确环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌分子特征,为该地区鼠疫菌的分子流行病学分析和溯源奠定基础。方法利用全基因组测序技术,获得环青海湖地区鼠疫自然疫源地84株代表性鼠疫菌株的全基因组序列,以NCBI数据库中的鼠疫菌及假结核耶尔森菌IP32953的全基因组序列为参考,比对2298个SNP位点并进行分析。结果1957—2020年,环青海湖地区鼠疫疫源地分离的84株代表性鼠疫菌株分为1.IN2和3.ANT1两个分支,其中1.IN2分支作为该地区鼠疫菌的特征种群遍及所有疫情流行年代;鼠疫菌SNP地区分布显示除乌兰县外其余5个县的鼠疫菌均位于1.IN2分支中;不同宿主SNP分布显示,除分离自喜马拉雅旱獭和狗体内的2株鼠疫菌位于3.ANT1分支外,其余均位于1.IN2分支中。结论环青海湖地区鼠疫疫源地鼠疫菌的SNP种群结构较为单一,基于鼠疫菌基因组单核苷酸多态性分析,可以为该地区鼠疫疫情的溯源和防控措施的制定提供科学依据。 展开更多
关键词 环青海湖地区 鼠疫疫源地 鼠疫菌 单核苷酸多态性
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鼠疫耶尔森菌多酶等温快速扩增检测方法的建立和应用
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作者 张传宇 扎西 +7 位作者 曹轩烨 刘祎 刘倩 李玲雯 史艳文 王宇萌 刘国宪 李伟 《疾病监测》 北大核心 2025年第5期619-625,共7页
目的建立多酶等温快速扩增(MIRA)结合成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/Cas12a核酸检测方法检测鼠疫耶尔森菌,评价方法的灵敏性、特异性,评价方法对鼠疫临床患者和动物鼠疫标本的适用性。方法选择pla和caf1两个靶基因,建立MIRA-CRISP... 目的建立多酶等温快速扩增(MIRA)结合成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/Cas12a核酸检测方法检测鼠疫耶尔森菌,评价方法的灵敏性、特异性,评价方法对鼠疫临床患者和动物鼠疫标本的适用性。方法选择pla和caf1两个靶基因,建立MIRA-CRISPR检测方法。其中,caf1基因位于pMT1质粒上,具有高度特异性;而针对pla基因在近缘菌中存在同源序列的问题,利用鼠疫耶尔森菌pla基因特异性核酸位点作为引物3'端的策略来保障pla基因检测鼠疫菌的特异性。通过梯度配比法对该方法进行体积比优化,采用阳性质粒模板评估方法的敏感性,使用包含了鼠疫耶尔森菌近缘菌的非鼠疫耶尔森菌DNA模板评估方法的特异性。最后通过检测6例临床确诊鼠疫患者的血液或淋巴液样本及6份自然疫源地动物肝脏样本,评价该方法的适用性。结果MIRA-CRISPR方法可在30 min内完成检测。当MIRA与CRISPR体系体积比为1∶2时,检测灵敏度达到最优,该方法对阳性质粒模板的检测限为9拷贝(caf1)和2拷贝(pla)。特异性实验表明,该方法能有效区分鼠疫耶尔森菌与其近缘菌株。经实际鼠疫阳性样本和阴性对照验证,所有临床样本(6/6)和动物样本(6/6)均被准确检出,展现出良好的实用性能。结论本研究发展的MIRA-CRISPR具有高灵敏度和高特异性,因此适用于人间鼠疫和动物间鼠疫的检测,尤其是在检测目标DNA含量较低的样本中具有显著优势。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 簇状规则间隔短回文重复序列 多酶恒温核酸快速扩增
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鼠疫荧光定量PCR检测靶标基因pla的改进 被引量:1
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作者 曹轩烨 扎西 +3 位作者 张传宇 刘倩 王宇萌 李伟 《中国地方病防治》 2025年第3期187-190,共4页
目的探讨改进荧光定量PCR检测方法中鼠疫菌纤溶酶原激活剂蛋白基因(pla)基因的引物和探针,提高其对鼠疫菌特异性。方法基于pla基因的鼠疫菌特异性位点设计引物和探针,筛选改进荧光定量PCR的引物和探针,优化荧光定量PCR方法。共选取90株... 目的探讨改进荧光定量PCR检测方法中鼠疫菌纤溶酶原激活剂蛋白基因(pla)基因的引物和探针,提高其对鼠疫菌特异性。方法基于pla基因的鼠疫菌特异性位点设计引物和探针,筛选改进荧光定量PCR的引物和探针,优化荧光定量PCR方法。共选取90株非鼠疫菌进行特异性评价,选取12株鼠疫菌DNA、6例鼠疫患者临床样本核酸模板和6个鼠疫阳性宿主动物模板开展应用评价。结果经过优化的基于pla基因荧光定量PCR方法可以准确地检测所有鼠疫菌或鼠疫阳性样本,包括33株枸橼酸杆菌和17株大肠杆菌等在内的非鼠疫菌没有出现扩增。结论新改进的pla荧光定量PCR方法可以对鼠疫菌进行准确、快速的鉴别诊断,将在鼠疫菌监测和诊断中发挥重要作用。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 实时荧光定量PCR pla基因
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山羊肾细胞氧化还原状态对小反刍兽疫病毒体外复制的影响
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作者 杨紫倩 郭薇 +1 位作者 陈绍红 刘铀 《中国草食动物科学》 北大核心 2025年第5期16-26,共11页
为研究山羊肾细胞(LDG-2)氧化还原状态对小反刍兽疫病毒(PPRV)体外复制的影响,采用MTT法分别测定N-乙酰半胱氨酸(NAC)、维生素C(VC)、还原型谷胱甘肽(GSH)和叔丁基过氧化氢(TBHP)的安全浓度及PPRV感染细胞活力;分别用DCFH-DA荧光探针和E... 为研究山羊肾细胞(LDG-2)氧化还原状态对小反刍兽疫病毒(PPRV)体外复制的影响,采用MTT法分别测定N-乙酰半胱氨酸(NAC)、维生素C(VC)、还原型谷胱甘肽(GSH)和叔丁基过氧化氢(TBHP)的安全浓度及PPRV感染细胞活力;分别用DCFH-DA荧光探针和ELISA检测了与细胞氧化应激和氧化还原状态有关的活性氧(ROS)水平和丙二醛(MDA)含量,以及超氧化物歧化酶(SOD)、黄嘌呤氧化酶(XOD)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADPH)氧化酶(NOX)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)的活性;用IFA和Western-blot观察PPRV在LDG-2细胞中的复制与增殖。结果表明,PPRV感染的LDG-2细胞中的ROS水平、MDA含量,以及NOX和XOD活性极显著增加(P<0.001),GSH-Px活性显著降低(P<0.05),PPRV-N蛋白表达水平显著或极显著上调(P<0.05或P<0.01)。NAC和GSH处理能极显著降低PPRV感染细胞的ROS水平、MDA含量,以及NOX和XOD活性(P<0.001),PPRV-N蛋白表达水平显著下调(P<0.05或P<0.01)。经VC和TBHP处理的PPRV感染细胞中ROS水平、MDA含量,以及NOX和XOD活性极显著升高(P<0.01或P<0.001),PPRV-N蛋白表达水平显著上调(P<0.05)。上述结果表明,PPRV感染可诱导LDG-2细胞的氧化应激,NAC和GSH可缓解PPRV感染细胞的氧化应激,进而抑制病毒的复制,TBHP和VC则可通过增强PPRV诱导的氧化应激促进病毒复制。 展开更多
关键词 小反刍兽疫病毒 山羊肾细胞 氧化应激 病毒复制
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青海共和县鼠疫耶尔森菌分子特性及CRISPR分型研究
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作者 彭文轩 何建 +3 位作者 辛有全 柏吉祥 张雪飞 杜文琪 《中国地方病防治》 2025年第3期194-196,共3页
目的分析青海省海南藏族自治州共和县内的鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis,以下简称鼠疫菌)的基因特征及规律间隔成簇短回文重复序列(CRISPR),为该地区制定疾病控制策略提供理论基础。方法对不同年代从当地采集到的38份样本进行了生化鉴... 目的分析青海省海南藏族自治州共和县内的鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis,以下简称鼠疫菌)的基因特征及规律间隔成簇短回文重复序列(CRISPR),为该地区制定疾病控制策略提供理论基础。方法对不同年代从当地采集到的38份样本进行了生化鉴定、鼠疫菌毒力因子分析[荚膜抗原(F1)、鼠疫菌素Ⅰ(PstⅠ)、毒力抗原因子(VW)、色素沉着因子(Pgm)],并进行了差异区段(DFR)分型和规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)分型研究。结果38株鼠疫菌生物型均为古典型。36株鼠疫菌均含有4个毒力因子(F1、Pst1、VW、Pgm),占94.7%(36/38)。1株分离于喜马拉雅旱獭鼠疫菌为VW阴性,97.37%(37/38)的受试菌株VW阳性,其他3个毒力因子(F1、Pst1、Pgm)均为阳性。1株分离于喜马拉雅旱獭鼠疫菌为Pgm混合型,97.37%(37/38)的受试菌株Pgm阳性,其他3个毒力因子(F1、Pst1、VW)均为阳性。DFR基因分型中,8型占据了主导地位,占总数的92.11%。对受试菌株进行了CRISPR基因分析,发现了15种不同的spacer,YPa有8种,YPb有4种,而YPc则有3种。38株鼠疫菌都被归类到三个基因型(G22-a1′、G26-a1′、G22),其中以G26-a1′为主。结论从青海省共和县分离出的鼠疫菌与青藏高原鼠疫自然疫源地的鼠疫菌特性相符,其毒性较强,人一旦感染鼠疫可能会出现症状严重、死亡率高现象。 展开更多
关键词 鼠疫菌 共和县 生化特性 规律间隔成簇短回文重复序列(CRISPR) 毒力因子
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青海省海南州鼠疫耶尔森菌单核苷酸多态性分析
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作者 张丽 靳娟 +5 位作者 何建 杨晓艳 辛有全 柏吉祥 张晓璐 李胜 《中华卫生杀虫药械》 2025年第3期270-273,共4页
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据... 目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据比对2298个SNP位点的变异情况,构建系统发育树,分析该疫源地鼠疫菌种群结构。结果海南州31株鼠疫菌生物型均为古典型,29株鼠疫菌的生态型为青藏高原型,2株为祁连山型;31株鼠疫菌均聚类至1.IN谱系1.IN2分支;1.IN2支群是该地的优势种群,海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地稳定存在。结论青海省海南州鼠疫菌菌株保守性高,系统发育的聚类与地理位置对应关系较好,SNP检测方法可以用于鼠疫菌暴发疫情的溯源分析。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) 海南州 鼠疫疫源地 基因分型
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青海省共和县喜马拉雅旱獭血清中鼠疫菌抗体的检测分析
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作者 张丽 李翔 +6 位作者 张晓璐 李广辉 金泳 马龙 李胜 赵海红 李存香 《医学动物防制》 2025年第7期649-653,共5页
目的分析青海省共和县喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫宿主动物、媒介动物的流行特征,结合喜马拉雅旱獭血清中鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)抗体和鼠疫菌噬菌体抗体检测结果,为预测该地鼠疫的发生和流行、监测方案的及时调整提供理论依据。方法... 目的分析青海省共和县喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫宿主动物、媒介动物的流行特征,结合喜马拉雅旱獭血清中鼠疫耶尔森菌(简称鼠疫菌)抗体和鼠疫菌噬菌体抗体检测结果,为预测该地鼠疫的发生和流行、监测方案的及时调整提供理论依据。方法基于1990—2018年青海省共和县喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地监测数据,进行病原学和血清学回顾性调查,同时采用间接血凝试验(indirect hemagglutination assay,IHA)(微量法)和双层琼脂平板法检测593份喜马拉雅旱獭血清中鼠疫菌F1抗体、特异性鼠疫菌噬菌体免疫抗体。采用描述性流行病学方法对数据进行整理分析。结果1990—2018年青海省共和县喜马拉雅旱獭自然疫源地旱獭平均密度为0.096只/hm^(2),蚤指数年际变化呈“W”型排列。593份喜马拉雅旱獭血清中鼠疫菌F1抗体、特异性鼠疫菌噬菌体免疫抗体结果均为阴性。结论青海省共和县喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地动物间鼠疫病原学、血清学及噬菌体抗体流行规律一致,却仍存在动物间鼠疫暴发的可能,还需继续完善该地区鼠疫监测系统,持续开展定期监测。 展开更多
关键词 鼠疫 喜马拉雅旱獭 血清 噬菌体 特异性鼠疫菌噬菌体免疫抗体 分析
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Yersinia pestis: examining wildlife plague surveillance in China and the USA 被引量:4
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作者 Sarah N.BEVINS John A.BAROCH +2 位作者 Dale L.NOLTE Min ZHANG Hongxuan HE 《Integrative Zoology》 SCIE CSCD 2012年第1期99-109,共11页
Plague is a zoonotic disease caused by the bacterium Yersinia pestis Lehmann and Neumann,1896.Although it is essentially a disease of rodents,plague can also be transmitted to people.Historically,plague has caused mas... Plague is a zoonotic disease caused by the bacterium Yersinia pestis Lehmann and Neumann,1896.Although it is essentially a disease of rodents,plague can also be transmitted to people.Historically,plague has caused mas-sive morbidity and mortality events in human populations,and has recently been classified as a reemerging dis-ease in many parts of the world.This public health threat has led many countries to set up wild and domestic an-imal surveillance programs in an attempt to monitor plague activity that could potentially spill over into human populations.Both China and the USA have plague surveillance programs in place,but the disease dynamics dif-fer in each country.We present data on plague seroprevalence in wildlife and review different approaches for plague surveillance in the 2 countries.The need to better comprehend plague dynamics,combined with the fact that there are still several thousand human plague cases per year,make well-designed wildlife surveillance pro-grams a critical part of both understanding plague risks to humans and preventing disease outbreaks in the future. 展开更多
关键词 PLAGUE sentinel species SURVEILLANCE Yersinia pestis
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