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PDK4调控“内质网-线粒体对话”关联阿霉素心脏毒性研究进展
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作者 史彦蕾 张冰 +4 位作者 王雨 许卓欣 田敏 孟敏 萨日娜 《中国药物警戒》 2025年第8期863-868,875,共7页
目的分析PDK4调控内质网-线粒体接触位点(Mitochondria-Associated Membranes,MAMs)即“内质网-线粒体对话”的分子机制,并探讨其与蒽环类药物心脏毒性的潜在关联,为研发心脏保护策略提供理论依据。方法通过对近年来相关文献的检索和分... 目的分析PDK4调控内质网-线粒体接触位点(Mitochondria-Associated Membranes,MAMs)即“内质网-线粒体对话”的分子机制,并探讨其与蒽环类药物心脏毒性的潜在关联,为研发心脏保护策略提供理论依据。方法通过对近年来相关文献的检索和分析,系统综述了PDK4在MAMs中的作用机制,及其在蒽环类药物心脏毒性中的作用。结果研究发现,PDK4、MAMs及蒽环类药物心脏毒性之间存在复杂的相互作用,主要体现在能量代谢障碍、氧化应激、细胞凋亡和钙稳态失衡等方面,这些相互作用在蒽环类药物心脏毒性的发展过程中发挥重要作用。结论PDK4通过过表达,主要破坏MAMs介导的钙稳态,造成线粒体钙超载,进而影响蒽环类药物心脏毒性,这为开发针对蒽环类药物心脏毒性的保护策略提供思路和潜在靶点。 展开更多
关键词 蒽环类药物 pdk4 心脏毒性 内质网-线粒体接触位点 线粒体功能障碍 钙稳态
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LncRNA GAS6-AS1调节miR-708-5p/PDK4轴对喉癌细胞增殖、凋亡和侵袭的影响
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作者 谢洋 麻琳 +2 位作者 要兆旭 刘琳 何冰 《临床肿瘤学杂志》 2025年第8期729-734,共6页
目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)生长停滞特异基因转录的反义RNA(GAS6-AS1)调节微小RNA-708-5p(miR-708-5p)/丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)轴对喉癌细胞增殖、凋亡和侵袭的影响。方法实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测喉癌组织标本中LncRNA GAS6... 目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)生长停滞特异基因转录的反义RNA(GAS6-AS1)调节微小RNA-708-5p(miR-708-5p)/丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)轴对喉癌细胞增殖、凋亡和侵袭的影响。方法实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测喉癌组织标本中LncRNA GAS6-AS1、miR-708-5p、PDK4的表达;将喉癌TU686细胞分为:siRNA阴性对照组(si-NC组)、单独抑制GAS6-AS1组(si-GAS6-AS1组)、si-GAS6-AS1与抑制剂阴性对照共转染组(si-GAS6-AS1+anti-NC组)以及si-GAS6-AS1与anti-miR-708-5p共转染组(si-GAS6-AS1+anti-miR-708-5p组);检测各组TU686细胞中LncRNA GAS6-AS1、miR-708-5p及PKD4的表达水平;平板克隆法、流式细胞仪、Transwell实验分别检测TU686细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭能力;Western blotting法检测蛋白表达;双荧光素酶报告基因实验验证基因的靶向关系。结果喉癌组织LncRNA GAS6-AS1、PDK4的表达水平显著升高,而miR-708-5p表达水平显著降低(P<0.05)。si-GAS6-AS1组TU686细胞中LncRNA GAS6-AS1表达、PDK4 mRNA表达、克隆细胞数、迁移细胞数、侵袭细胞数及PCNA、MMP-9和PDK4的蛋白表达均低于si-NC组,而miR-708-5p表达、细胞凋亡率及Bax蛋白表达高于si-NC组(P<0.05);与si-GAS6-AS1组、si-GAS6-AS1+anti-NC组比较,si-GAS6-AS1+anti-miR-708-5p组PDK4 mRNA表达、克隆细胞数、迁移细胞数、侵袭细胞数及PCNA、MMP-9和PDK4的蛋白表达水平升高,而miR-708-5p表达、凋亡率及Bax蛋白表达降低(P<0.05)。LncRNA GAS6-AS1靶向负调控miR-708-5p表达,miR-708-5p靶向负调控PDK4表达。结论抑制LncRNA GAS6-AS1可能通过靶向miR-708-5p来下调PDK4表达,进而抑制TU686细胞增殖、侵袭,促进其凋亡。 展开更多
关键词 喉癌 LncRNA GAS6-AS1 miR-708-5p pdk4 增殖 侵袭
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Compatibility of cold herb CP and hot herb AZ in Huanglian Ganjiang decoction alleviates colitis mice through M1/M2 macrophage polarization balance via PDK4-mediated glucose metabolism reprogramming
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作者 Yanyang Li Chang Liu +6 位作者 Yi Wang Peiqi Chen Shihua Xu Yequn Wu Lingzhi Ren Yang Yu Lei Yang 《Chinese Journal of Natural Medicines》 2025年第10期1183-1194,共12页
Ulcerative colitis(UC)is a chronic and non-specific inflammatory bowel disease(IBD).Huanglian Ganjiang decoction(HGD),derived from ancient book Beiji Qianjin Yao Fang,has demonstrated efficacy in treating UC patients ... Ulcerative colitis(UC)is a chronic and non-specific inflammatory bowel disease(IBD).Huanglian Ganjiang decoction(HGD),derived from ancient book Beiji Qianjin Yao Fang,has demonstrated efficacy in treating UC patients traditionally.Previous research established that the compatibility of cold herb Coptidis Rhizoma+Phellodendri Chinensis Cortex(CP)and hot herb Angelicae Sinensis Radix+Zingiberis Rhizoma(AZ)in HGD synergistically improved colitis mice.This study investigated the compatibility mechanisms through which CP and AZ regulated inflammatory balance in colitis mice.The experimental colitis model was established by administering 3%dextran sulphate sodium(DSS)to mice for 7 days,followed by CP,AZ and CPAZ treatment for an additional 7 days.M1/M2 macrophage polarization levels,glucose metabolites levels and pyruvate dehydrogenase kinase 4(PDK4)expression were analyzed using flow cytometry,Western blot,immunofluorescence and targeted glucose metabolomics.The findings indicated that CP inhibited M1 macrophage polarization,decreased inflammatory metabolites associated with tricarboxylic acid(TCA)cycle,and suppressed PDK4 expression and pyruvate dehydrogenase(PDH)(Ser-293)phosphorylation level.AZ enhanced M2 macrophage polarization,increased lactate axis metabolite lactate levels,and upregulated PDK4 expression and PDH(Ser-293)phosphorylation level.TCA cycle blocker AG-221 and adeno-associated virus(AAV)-PDK4 partially negated CP’s inhibition of M1 macrophage polarization.Lactate axis antagonist oxamate and PDK4 inhibitor dichloroacetate(DCA)partially reduced AZ’s activation of M2 macrophage polarization.In conclusion,the compatibility of CP and AZ synergistically alleviated colitis in mice through M1/M2 macrophage polarization balance via PDK4-mediated glucose metabolism reprogramming.Specifically,CP reduced M1 macrophage polarization by restoration of TCA cycle via PDK4 inhibition,while AZ increased M2 macrophage polarization through activation of PDK4/lactate axis. 展开更多
关键词 Compatibility COLITIS Cold herb Hot herb Huanglian Ganjiang decoction M1/M2 macrophage polarization pdk4 Glucose metabolism reprogramming
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绵羊PDK4基因序列克隆、分析及亚细胞定位 被引量:1
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作者 曹阳 方文文 +5 位作者 刘宇 刘昕昕 肖成 李欣 于长辉 曹阳 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期359-363,共5页
为了明确丙酮酸脱氢酶激酶4(Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4,PDK4)基因的结构,利用c DNA末端快速扩增技术(RACE),以绵羊脂肪组织总RNA为模板扩增得到绵羊PDK4基因全部序列,使用生物信息学软件对扩增得到的序列进行分析,并预测其蛋白结... 为了明确丙酮酸脱氢酶激酶4(Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4,PDK4)基因的结构,利用c DNA末端快速扩增技术(RACE),以绵羊脂肪组织总RNA为模板扩增得到绵羊PDK4基因全部序列,使用生物信息学软件对扩增得到的序列进行分析,并预测其蛋白结构,通过免疫荧光染色观察PDK4亚细胞定位,RT-PCR检测其在绵羊各组织中的表达。结果表明:绵羊PDK4基因序列共存在6个转录本,其中最长转录本长度为4 018 bp,5'UTR为289 bp,开放阅读框长为1 224 bp,3'UTR存在选择性多聚腺苷酸化(Alternative Polyadenylation,APA)现象,有6条不同长度的3'UTR,分别为120、512、672、1 418、2 245、2 505 bp,其中编码区共编码407个氨基酸,理论分子质量为46.21 ku,等电位点为6.90,为亲水性蛋白,无信号肽,不属于分泌蛋白,与其他物种PDK4进行同源性比对,发现其与牛和山羊的同源性最高;预测其亚细胞定位于线粒体、细胞质和核,通过免疫荧光染色将PDK4与线粒体和细胞核共定位,结果发现其在线粒体表达中较多,少量存在与细胞核中;检测PDK4基因在40日龄羔羊各组织中表达水平,其在肌肉组织中表达最高,在肺中表达最低。本研究通过对绵羊PDK4全序列克隆、蛋白结构分析以及亚细胞定位,为绵羊PDK4的后续研究提供了有效信息和理论依据。 展开更多
关键词 pdk4 绵羊 选择性多聚腺苷酸化 亚细胞定位
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健脾化痰方通过调控FOXO1/PDK4信号通路干预PCOS-IR大鼠脂代谢的作用机制研究 被引量:4
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作者 杨璐瑜 林安盈 +2 位作者 杨正望 李岚 余曦明 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期451-460,共10页
目的 探讨健脾化痰方对多囊卵巢综合征合并胰岛素抵抗(PCOS-IR)大鼠脂代谢及叉头盒转录因子-1(FOXO1)/丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)信号通路的影响。方法 40只雌性SD大鼠随机分为空白对照组10只和造模组30只。采用高脂饮食(8周)联合来曲唑(... 目的 探讨健脾化痰方对多囊卵巢综合征合并胰岛素抵抗(PCOS-IR)大鼠脂代谢及叉头盒转录因子-1(FOXO1)/丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)信号通路的影响。方法 40只雌性SD大鼠随机分为空白对照组10只和造模组30只。采用高脂饮食(8周)联合来曲唑(第4~8周加入)建立PCOS-IR大鼠模型。完成造模后,将造模组大鼠随机分为模型对照组、健脾化痰方组、二甲双胍组,药物干预4周。观察各组一般情况,测定中医证候评分,计算体重变化;采用苏木素-伊红(HE)染色观察卵巢组织病理学改变;血液生化仪测定空腹血糖(FBG)和血脂四项;酶联免疫吸附(ELISA)法测定性激素如卵泡刺激素(FSH)、促黄体生成素(LH)、睾酮(T)、雌激素(E_2)、胰岛素(FINS)水平;蛋白免疫印迹(Western Blot)法及实时荧光定量PCR法测定卵巢FOXO1、PDK4表达的变化。结果 与空白对照组相比,模型对照组出现脾虚痰湿症状,体重明显增加,血清LH、T、LH/FSH升高,E2、FSH降低,卵巢多囊性改变明显,糖脂代谢调控失常(P<0.01)。与模型对照组相比,健脾化痰方组与二甲双胍组大鼠体重增速放缓,卵泡发育情况见好,血清LH、T、LH/FSH、FBG、FINS、HOMA-IR、TC、TG、LDL-C降低,E2、FSH升高,卵巢FOXO1、PDK4 mRNA及蛋白表达下调(P<0.05,P<0.01);可升高血清HDL-C含量,但是组间差别无统计学意义(P>0.05)。结论 健脾化痰方能有效调节性激素分泌,改善PCOS-IR大鼠卵巢生殖功能,调节糖脂代谢,其机制可能是通过抑制FOXO1/PDK4通路发挥作用。 展开更多
关键词 多囊卵巢综合征 胰岛素抵抗 脂代谢 FOXO1 pdk4 健脾化痰方
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双乾肉羊PDK4基因的组织表达差异及多态性分析 被引量:1
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作者 缪立生 肖成 +7 位作者 杨少滢 栾祜 赵文军 沈宏旭 刘宇 曹阳 巩俊明 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期47-53,共7页
为了研究丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因在双乾肉羊不同组织中的表达差异,以及基因外显子多态性对肉质性状的影响,试验以45只健康的8月龄双乾肉羊公羊为研究对象,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾... 为了研究丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因在双乾肉羊不同组织中的表达差异,以及基因外显子多态性对肉质性状的影响,试验以45只健康的8月龄双乾肉羊公羊为研究对象,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、十二指肠及背最长肌,利用PCR法与Sanger测序法结合的方式检测PDK4基因外显子中的单核苷酸多态性位点(SNP),并与肉质性状数据进行关联分析。结果表明:PDK4基因广泛分布于各组织中,在十二指肠组织中的相对表达量最高。PDK4基因第1外显子存在2个SNP位点,分别为Chr 4.14723148 T>C突变、Chr 4.14723208 T>C突变。Chr 4.14723148 T>C存在2种基因型,分别为CC和CT基因型;Chr 4.14723208 T>C存在3种基因型,分别是TT、TC和CC基因型。突变基因型分布符合哈代温伯格(Hardy-Weinberg)定律,突变个体在群体中处于稳定状态。Chr 4.14723148 T>C和Chr 4.14723208 T>C位点的多态性信息含量分别为0.94和0.61,均为高度多态(P>0.5),Chr 4.14723148 T>C突变中CC基因型为优势基因型,其个体压榨水分率显著低于CT基因型个体(P<0.05)。说明双乾肉羊群体稳定存在Chr 4.14723148突变位点,并且CC优势基因型个体肌肉水分保持能力更强,正向影响肉质性状。 展开更多
关键词 双乾肉羊 pdk4基因 突变位点 肉质性状 组织表达谱
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贵州从江香猪PDK4、FGF10基因的克隆及组织表达分析 被引量:13
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作者 杨洋 许厚强 +8 位作者 陈伟 周迪 徐敏 张青青 赵焕平 孙成娟 王圆圆 张鸣 杨涛 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第12期3401-3409,共9页
试验旨在克隆获得PDK4、FGF10基因,并研究大白猪与从江香猪不同组织中PDK4、FGF10基因mRNA的表达差异。采用RT-PCR分别克隆从江香猪PDK4、FGF10基因并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR技术检测PDK4、FGF10基因在大白猪和从江香... 试验旨在克隆获得PDK4、FGF10基因,并研究大白猪与从江香猪不同组织中PDK4、FGF10基因mRNA的表达差异。采用RT-PCR分别克隆从江香猪PDK4、FGF10基因并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR技术检测PDK4、FGF10基因在大白猪和从江香猪不同组织中mRNA的相对表达量。结果显示,从江香猪PDK4基因的编码区全长1 224bp,编码407个氨基酸;FGF10基因的编码区全长636bp,编码211个氨基酸。经BLAST软件进行同源性比对,发现从江香猪PDK4基因与羊、马、人的核苷酸序列同源性分别为93%、92%和91%;FGF10基因与羊、牛、人、鼠的核苷酸序列同源性分别为94%、93%、93%和90%。由PDK4基因系统进化树可知,从江香猪与牛、绵羊亲缘关系较近;由FGF10基因系统进化树可知,从江香猪与绵羊、牛、人、猕猴亲缘关系较近,与小鼠和鸡亲缘关系较远。实时荧光定量PCR结果显示,在从江香猪不同组织中,PDK4基因在肾脏中的表达量最高,在胃和脂肪中表达量较高,FGF10基因在胃中表达量最高,在肾脏和脂肪中表达量较高,两个基因在背最长肌中的表达量均最低;在大白猪的不同组织中,PDK4、FGF10基因在脂肪中的表达量均最高,PDK4基因在背最长肌中的表达量最低,而FGF10基因在心脏中表达量最低。本试验成功克隆了从江香猪PDK4、FGF10基因,并检测了其在大白猪与从江香猪不同组织中的表达,为进一步研究PDK4、FGF10基因在脂质代谢及脂肪沉积等方面的调控作用提供科学依据。 展开更多
关键词 从江香猪 pdk4基因 FGP10基因 实时荧光定量PCR
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不同训练方式对静息骨骼肌糖酵解能力及线粒体PDK4、CPT-1基因转录的影响 被引量:7
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作者 漆正堂 郭维 +1 位作者 张媛 丁树哲 《体育科学》 CSSCI 北大核心 2009年第3期38-42,共5页
目的:比较耐力训练和间歇性速度训练对静息骨骼肌糖酵解能力及线粒体PDK4、CPT-1基因转录的影响;方法:30只大鼠随机分为3组:安静组(C,n=10)、耐力训练组(E,n=10)、间歇性速度训练组(S,n=10),训练8周。间歇性速度训练:每天9~10次10s极... 目的:比较耐力训练和间歇性速度训练对静息骨骼肌糖酵解能力及线粒体PDK4、CPT-1基因转录的影响;方法:30只大鼠随机分为3组:安静组(C,n=10)、耐力训练组(E,n=10)、间歇性速度训练组(S,n=10),训练8周。间歇性速度训练:每天9~10次10s极量强度(≥42m/min)的跑台运动,间歇时间30~60s;耐力训练:每天30~60min低强度(≤16.7m/min)的持续跑台运动;每周均训练6天。最后一次训练结束后的24~48h内切取腓肠肌,比色法检测丙酮酸、乳酸、HK、PK活性,Real-timePCR检测PDK4、CPT-1的mR-NA表达;结果:1)E组和S组丙酮酸均非常显著地高于C组(P<0.01),E组与S组无显著差异;乳酸浓度E组与C组无显著差异,但S组显著高于E组(P<0.05)和C组(P<0.01);2)E组(P<0.05)和S组(P<0.01)HK活性显著高于C组,但E组、S组PK活性与C组无显著差异;E组与S组的HK、PK活性均无显著差异;3)E组PDK4mRNA表达显著低于C组(P<0.05),S组CPT-1mRNA表达显著高于C组(P<0.05),E组与S组的PDK4、CPT-1mRNA表达均无显著差异;结论:1)耐力训练与间歇性速度训练都能提高静息骨骼肌的丙酮酸水平,但只有间歇性速度训练提高静息骨骼肌的乳酸水平,说明间歇性速度训练很可能使骨骼肌在静息时的无氧代谢已处于活跃状态。耐力训练使丙酮酸升高则可能是脂肪酸氧化能力提高所必需的匹配效应;2)耐力训练与间歇性速度训练都能提高HK活性,但对PK活性无影响。耐力训练与间歇性速度训练在糖脂代谢中有着许多类似效应。间歇性速度训练也能作为一种节省时间的方式提高有氧代谢能力,但在提高有氧代谢能力的同时也能促进静息骨骼肌丙酮酸向乳酸的转化;3)耐力训练使PDK4转录抑制,间歇性速度训练使CPT-1转录上调,这与各训练方式下静息骨骼肌的乳酸水平有着高度一致性。 展开更多
关键词 耐力训练 间歇训练 速度训练 丙酮酸 乳酸 pdk4 CPT-1 动物实验
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鸡PDKPDK4基因的克隆及组织差异表达研究 被引量:12
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作者 奚子英 何小梅 +6 位作者 陈刚 周加义 钟翠丽 李永霞 张榕婧 聂庆华 刘满清 《中国家禽》 北大核心 2015年第15期6-10,共5页
丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)基因在动物机体的糖-脂代谢过程中起着重要的调节作用。为揭示PDK4基因对家禽生长和脂肪沉积的影响,以快速生长型肉鸡(隐性白羽洛克鸡)和慢速生长型肉鸡(杏花鸡)为试验对象,采用分子克隆、生物信息学分析和实时... 丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)基因在动物机体的糖-脂代谢过程中起着重要的调节作用。为揭示PDK4基因对家禽生长和脂肪沉积的影响,以快速生长型肉鸡(隐性白羽洛克鸡)和慢速生长型肉鸡(杏花鸡)为试验对象,采用分子克隆、生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法,克隆鸡PDK4基因并分析其多态位点及在不同生长速度肉鸡组织的表达差异。克隆获得杏花鸡PDK4基因全长3 473 bp序列,并筛查到22处核苷酸多态性位点。生物信息学分析结果表明鸡PDK4蛋白与哺乳动物该基因蛋白序列之间的同源性较高,与爪蟾、斑马鱼的同源性较低;实时荧光定量PCR结果表明PDK4基因在不同生长速度的肉鸡组织中的表达存在较大差异,从组织表达来看,PDK4基因在脂肪组织中(皮脂和腹脂)的表达高于下丘脑和肝脏;从品种来看,PDK4基因在杏花鸡各组织的表达高于隐性白洛克鸡。可见,PDK4基因对家禽的生长和脂肪沉积有重要影响,是影响家禽生长和脂肪沉积的重要候选基因。 展开更多
关键词 pdk4 克隆 组织表达
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巴马香猪和杜长大猪的PDK4基因的克隆及组织表达分析 被引量:7
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作者 瞿秋红 夏琴 +5 位作者 崔悦悦 黄叶 江雨航 邹辉 蒋钦杨 黄艳娜 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期1013-1019,共7页
为了获得广西巴马香猪和杜长大猪丙酮酸脱氢酶激酶4 (PDK4)基因编码区序列(CDS),并研究PDK4基因在广西巴马香猪和杜长大猪不同组织中的mRNA表达差异,本研究利用基因克隆技术分别从巴马香猪和杜长大猪的背最长肌组织中提取总RNA,PCR扩增... 为了获得广西巴马香猪和杜长大猪丙酮酸脱氢酶激酶4 (PDK4)基因编码区序列(CDS),并研究PDK4基因在广西巴马香猪和杜长大猪不同组织中的mRNA表达差异,本研究利用基因克隆技术分别从巴马香猪和杜长大猪的背最长肌组织中提取总RNA,PCR扩增出PDK4基因CDS,并进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR技术检测PDK4基因在这两品种猪不同组织中m RNA的相对表达量。结果表明:本研究分别成功克隆获得巴马香猪和杜长大猪PDK4基因CDS,长度为1 224 bp,这两品种猪的PDK4基因CDS同源性为100%,与GenBank报道的普通猪、人、鼠、马、羊的同源性分别为100%、91.0%、85.5%、92.3%、93.0%。基于PDK4基因碱基同源性构建的物种系统进化树可知,巴马猪和杜长大猪遗传距离是最近的,最远的是小鼠。两品种猪PDK4氨基酸组成中亮氨酸含量较高,占总氨基酸数的10.8%,同时发现PDK4蛋白具有较强的亲水性。巴马香猪和杜长大猪PDK4蛋白的高级结构中均包含有α螺旋、无规卷曲和延伸链。实时荧光定量PCR结果显示,巴马香猪和杜长大猪的不同组织PDK4基因表达量最高的为腹脂,最低的是脾。巴马香猪背最长肌中PDK4基因表达水平极显著高于杜长大猪,而杜长大猪的皮脂、腹脂、肝、脾以及肾中PDK4基因表达水平极显著高于巴马香猪。本试验成功克隆了巴马香猪和杜长猪的PDK4基因,并且检测了该基因在两品种猪不同组织中的基因表达水平的差异,为今后深入探讨PDK4基因在地方猪种脂质代谢和脂肪沉积方面发挥的作用奠定工作基础。 展开更多
关键词 巴马香猪 杜长大猪 pdk4基因 生物信息学分析 实时荧光定量PCR
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伊犁马PDK4基因多态性与耐力性能的相关性研究 被引量:6
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作者 曹行 何美升 +7 位作者 于茜 马海玉 刘玲玲 高程程 姜鑫 董亚菲 地丽达尔.地 刘武军 《新疆农业大学学报》 CAS 北大核心 2016年第4期302-306,共5页
寻找与伊犁马耐力运动性能相关的DNA标记,为提高伊犁马耐力运动性能的标记辅助选择提供科学依据。丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)基因为伊犁马优秀耐力运动候选基因,采用PCR-ARMS、DAN测序技术对伊犁马PDK4基因的多态性进行分析,研究其与耐力... 寻找与伊犁马耐力运动性能相关的DNA标记,为提高伊犁马耐力运动性能的标记辅助选择提供科学依据。丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)基因为伊犁马优秀耐力运动候选基因,采用PCR-ARMS、DAN测序技术对伊犁马PDK4基因的多态性进行分析,研究其与耐力性能的关系。PDK4基因在伊犁马中具有多态,存在3种基因型:GG、GA和AA,测序结果显示,PDK4基因在g.38973231处碱基发生由G到A的转换,该突变为错义突变,导致其编码的氨基酸由酪氨酸变为半胱氨酸。关联分析结果表明:该突变位点对伊犁马的耐力运动性能有极显著影响(P<0.01)。伊犁马PDK4基因突变与速度之间存在关联性,且可能是影响伊犁马耐力性能的重要位点。 展开更多
关键词 伊犁马 pdk4基因 耐力性能
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陆川猪PDK4基因序列分析、真核表达载体构建及组织表达分析 被引量:8
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作者 潘鹏丞 温斌华 +5 位作者 谢婉 姜长津 焦迪 陈宝剑 关志惠 谢炳坤 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第8期2337-2347,共11页
试验旨在了解陆川猪丙酮酸脱氢激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因CDS区序列信息及其所编码蛋白的结构和功能,构建PDK4基因的真核表达载体,分析PDK4基因在陆川猪不同组织中的表达情况,以期为阐明PDK4基因在陆川猪生长发... 试验旨在了解陆川猪丙酮酸脱氢激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因CDS区序列信息及其所编码蛋白的结构和功能,构建PDK4基因的真核表达载体,分析PDK4基因在陆川猪不同组织中的表达情况,以期为阐明PDK4基因在陆川猪生长发育过程中的分子机制奠定基础。采用RT-PCR技术扩增陆川猪皮下脂肪PDK4基因CDS区,利用生物信息学软件预测分析其结构与功能,并利用常规分子克隆技术将其插入真核表达载体中获得pEGFP-N1-PDK4,用脂质体法将重组质粒转染3T3-L1细胞并观察荧光,用实时荧光定量PCR检测PDK4基因mRNA在陆川猪心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、背最长肌、皮下脂肪中的表达情况。结果显示,陆川猪PDK4基因CDS区全长1224 bp,编码407个氨基酸,与NCBI上公布的野猪PDK4基因CDS区同源性达99.8%。对陆川猪PDK4基因所编码的蛋白进行生物信息学分析发现,其分子质量约为46.144 ku,原子总数为6509个,理论等电点(pI)为7.21,带正电荷和负电荷的氨基酸数均为42个。PDK4蛋白可能有2个N-糖基化位点、33个磷酸化位点。亚细胞定位结果发现,PDK4蛋白有34.8%存在于线粒体,30.4%存在于细胞质,26.1%存在于细胞核,质膜和液泡膜各占4.3%。细胞试验发现,对照组和试验组均发出荧光,相较于对照组,试验组中PDK4表达量极显著升高(P<0.01),PDK4基因在皮下脂肪中表达丰度最高,随之为肝脏、肺脏、心脏、脾脏和肾脏,在背最长肌中表达量最低,而且在皮下脂肪中的表达量极显著高于背最长肌(P<0.01)。本试验成功扩增出PDK4基因CDS区并构建了真核表达载体,成功对其结构和功能进行预测分析,为研究陆川猪皮下脂肪沉积的遗传改良提供了参考依据。 展开更多
关键词 陆川猪 pdk4基因 克隆 序列分析 真核表达载体 组织表达
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鸡PDK4基因的组织表达分析 被引量:4
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作者 张榕婧 何小梅 +4 位作者 闫景旭 韩琦琦 雷文龙 聂庆华 刘满清 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第15期121-125,共5页
利用Real Time-PCR的方法研究PDK4基因在肉鸡中的组织表达规律、在不同生长阶段的组织表达趋势及在不同生长速度肉鸡中的组织差异表达。结果表明:(1)鸡PDK4基因在肌肉组织(包括腿肌、胸肌、心脏)表达最高;(2)肌肉组织PDK4基因在12胚龄... 利用Real Time-PCR的方法研究PDK4基因在肉鸡中的组织表达规律、在不同生长阶段的组织表达趋势及在不同生长速度肉鸡中的组织差异表达。结果表明:(1)鸡PDK4基因在肌肉组织(包括腿肌、胸肌、心脏)表达最高;(2)肌肉组织PDK4基因在12胚龄的表达较低,初生1日龄时表达最高,此后有所下降;(3)在垂体、胸肌、心脏中,PDK4基因在杏花鸡中的表达高于白洛克鸡,而在腿肌中的表达趋势相反;胸肌中,PDK4基因表达在体重轻组中表达高于重组,而在腿肌中的表达趋势相反。 展开更多
关键词 肉鸡 pdk4基因 组织表达
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中国草原红牛PDK4基因多态性及其与肉质性状的关联分析 被引量:5
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作者 马彦茹 于永生 +3 位作者 曹阳 秦立红 赵玉民 吴健 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第6期2186-2194,共9页
【目的】研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因多态性与肉质性状的关系。【方法】挑选120头中国草原红牛为研究对象,采用Sanger测序法检测PDK4基因第1~11外显子的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析... 【目的】研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因多态性与肉质性状的关系。【方法】挑选120头中国草原红牛为研究对象,采用Sanger测序法检测PDK4基因第1~11外显子的单核苷酸多态性(SNP)位点,分析SNP位点的基因型频率、基因频率及群体遗传参数等。利用SPSS 21.0软件对中国草原红牛PDK4基因SNP位点多态性与肉质性状(熟肉率、肉嫩度、失水率、pH、滴水损失、肌内脂肪含量、初水分含量、蛋白质含量)进行关联分析。【结果】在中国草原红牛PDK4基因外显子8和外显子11上共检测到3个SNPs;PDK4基因第8外显子57 bp处存在1个SNP位点(G57C),且引起编码氨基酸的改变,存在GG、GC和CC 3种基因型;PDK4基因第11外显子在330和389 bp处存在2个SNPs位点(G330T和C389T),在G330T位点上存在GG、GT和TT 3种基因型;在C389T位点上存在CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验结果显示,中国草原红牛第8外显子G57C位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),第11外显子的G330T和C398T符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);群体遗传参数分析发现,第8外显子G57C突变位点属于低度多态性位点(PIC<0.25),等位基因数为1.1429,表明其在中国草原红牛中的变异较小;第11外显子G330T和C398T属于中度多态性位点(0.25<PIC<0.5),等位基因数分别为1.6431和1.6447,说明该遗传标记能够提供遗传信息。关联分析结果表明,PDK4基因第8外显子中G57C位点GG和CC基因型个体肌内脂肪含量显著高于GC基因型(P<0.05);第11外显子G330T位点GG基因型滴水损失和初水分量显著高于GT基因型(P<0.05);GG基因型肉嫩度显著高于TT基因型(P<0.05);GT基因型肌内脂肪含量显著高于TT基因型(P<0.05),C389T处CT基因型失水率显著低于TT基因型(P<0.05)。【结论】PDK4基因多态性与中国草原红牛肉质性状相关,可作为肉质性状的候选基因。 展开更多
关键词 pdk4基因 中国草原红牛 肉质性状 多态性 关联分析
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热应激下鸡肝脏SFRP1和PDK4基因表达水平研究 被引量:4
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作者 赵妤娟 许生友 +1 位作者 姜润深 曲鲁江 《中国家禽》 北大核心 2012年第15期12-15,共4页
为研究热应激条件下,鸡SFRP1和PDK4两个与代谢相关的基因在鸡肝脏组织中的差异表达,选取12只60日龄体重相近的黄羽肉母鸡,分为正常对照组(CL)、热应激反应组(HS)和热应激反应后的降温组(HF)3个处理组,并对这两个基因在三组肝脏组织中的... 为研究热应激条件下,鸡SFRP1和PDK4两个与代谢相关的基因在鸡肝脏组织中的差异表达,选取12只60日龄体重相近的黄羽肉母鸡,分为正常对照组(CL)、热应激反应组(HS)和热应激反应后的降温组(HF)3个处理组,并对这两个基因在三组肝脏组织中的表达水平进行荧光定量表达分析。结果表明,在热应激状态下,SFRP1和PDK4基因在肝脏中的表达均上调,且PDK4在对照组和热应激组间差异显著(P<0.05)。本研究结果还表明,当热应激反应后温度重新降至(25±1)℃时,SFRP1和PDK4在肝脏中的相对表达量均有不同程度的恢复,进一步说明这两个基因在热应激中发挥的作用。本研究为从分子机制分析热应激提供了相应的参考。 展开更多
关键词 热应激 SFRP1 pdk4 表达分析
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乳腺癌组织中PDK4的表达及其与预后的关系 被引量:2
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作者 孙书娟 赵美松 +3 位作者 韩迎燕 吴娟子 吴鹏 刘佳 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 2018年第2期73-76,共4页
目的探讨影响乳腺癌组织中PDK4的表达与预后的相关性。方法 Pub Med数据库The Gene Expression Omnibus(GEO,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)分析PDK4在正常乳腺及乳腺癌组织中的表达水平。使用The Kaplan–Meier plotter(www.kmplot... 目的探讨影响乳腺癌组织中PDK4的表达与预后的相关性。方法 Pub Med数据库The Gene Expression Omnibus(GEO,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)分析PDK4在正常乳腺及乳腺癌组织中的表达水平。使用The Kaplan–Meier plotter(www.kmplot.com)分析工具评估PDK4表达水平与乳腺癌临床预后的相关性。TGF-β细胞因子处理MCF-7细胞系,Real-time PCR技术检测经处理后MCF-7细胞系中PDK4 m RNA表达水平。si RNA干扰技术降低细胞内PDK4的表达水平,Transwell检测MCF-7细胞的侵袭能力。结果 PDK4在乳腺癌组织中的表达水平低于正常乳腺组织,并且PDK4低表达与乳腺癌预后差呈正相关;在乳腺癌细胞系中,TGF-β降低PDK4 m RNA表达水平,且PDK4的低表达增强了MCF-7细胞的侵袭能力。结论 PDK4低表达是乳腺癌预后差的一个重要指标。 展开更多
关键词 pdk4 乳腺癌 生存率 预后
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中国草原红牛PDK4基因克隆及其组织表达差异性研究 被引量:1
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作者 马彦茹 于永生 +4 位作者 肖成 曹阳 秦立红 赵玉民 吴健 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第10期191-197,共7页
为研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4,PDK4)基因功能,本研究克隆了PDK4基因编码区序列(CDS),从mRNA水平检测PDK4基因在中国草原红牛各组织及其前体脂肪细胞成脂分化过程中的表达差异,最后进行生物信... 为研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4,PDK4)基因功能,本研究克隆了PDK4基因编码区序列(CDS),从mRNA水平检测PDK4基因在中国草原红牛各组织及其前体脂肪细胞成脂分化过程中的表达差异,最后进行生物信息学分析。根据NCBI公布的牛PDK4基因序列(登录号:NM_001101883.1)设计引物,PCR扩增和克隆测序,获得草原红牛PDK4基因完整CDS序列,应用生物信息学软件分析蛋白理化性质和结构,预测蛋白信号肽和磷酸化位点及构建系统进化树;通过实时荧光定量PCR检测PDK4基因在中国草原红牛各组织中mRNA的相对表达量及PDK4基因在前体脂肪细胞分化过程中mRNA水平上的表达情况。结果显示:本研究成功获得中国草原红牛PDK4基因CDS序列,长度为1223bp,编码407个氨基酸,与野牦牛同源性较高(99.8%),与埃及果蝠的同源性较低(89.7%)。PDK4基因在草原红牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、十二指肠、背最长肌和脂肪中均显著表达,其中在背最长肌中的表达量显著高于其他组织。成脂分化结果表明,PDK4基因mRNA表达量在0~4 d呈上升趋势,4^(6) d之间无显著差异。 展开更多
关键词 草原红牛 pdk4基因 生物信息学分析 实时荧光定量PCR
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美仁牦牛 PDK4 基因克隆及组织表达 被引量:3
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作者 马小勇 戴荣凤 +5 位作者 李歆怡 杨国武 扎老 路建卫 赵雪 梁春年 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期197-205,共9页
为研究美仁牦牛PDK4基因在各组织中的表达特征,探索其与脂肪沉积机制的相关性,采集了美仁牦牛背最长肌、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪和睾丸等组织样,并提取了其总RNA,通过RT-PCR、生物信息学软件及qPCR等技术对美仁牦牛PDK4基... 为研究美仁牦牛PDK4基因在各组织中的表达特征,探索其与脂肪沉积机制的相关性,采集了美仁牦牛背最长肌、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪和睾丸等组织样,并提取了其总RNA,通过RT-PCR、生物信息学软件及qPCR等技术对美仁牦牛PDK4基因进行了扩增、生信分析和表达特征研究。结果表明,美仁牦牛PDK4基因CDS区全长1224 bp,编码407个氨基酸,蛋白相对分子质量为46.15914 ku,理论等电点6.60,总平均亲水性-0.169,为亲水性蛋白;系统进化树结果表明,美仁牦牛与野牦牛亲缘关系最近,与鬣狗亲缘关系最远;PDK4蛋白有34处磷酸化位点,无信号肽和跨膜区,主要在线粒体中发挥生物学功能;美仁牦牛PDK4蛋白主要是由α-螺旋和无规则卷曲组成。PDK4基因在7日龄美仁牦牛肝脏和肺脏中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),在肌肉、脂肪、脾脏和睾丸中中度表达,在肾和心脏中低表达。随着牦牛年龄增长,PDK4基因在30月龄美仁牦牛脂肪组织中的表达量增加,并显著高于7日龄美仁牦牛脂肪中的表达量(P<0.05)。以上结果表明,PDK4基因可能在美仁牦牛的生长过程中参与脂肪调控,在脂肪沉积过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 美仁牦牛 pdk4基因 克隆 实时荧光定量PCR
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miR-122调控PDK4表达对食管癌增殖和凋亡影响的实验研究 被引量:2
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作者 范啸文 廖威麟 韩泳涛 《临床肿瘤学杂志》 CAS 北大核心 2020年第6期500-504,共5页
目的探讨微小RNA122(miR-122)对食管癌细胞增殖、凋亡的影响及可能机制。方法向食管癌Eca-109细胞转染miR-122 mimics(miR-122 mimics组)和阴性对照质粒(miR-NC组),另设未处理的对照组。实时荧光定量(qPCR)法检测miR-122表达。MTT和流... 目的探讨微小RNA122(miR-122)对食管癌细胞增殖、凋亡的影响及可能机制。方法向食管癌Eca-109细胞转染miR-122 mimics(miR-122 mimics组)和阴性对照质粒(miR-NC组),另设未处理的对照组。实时荧光定量(qPCR)法检测miR-122表达。MTT和流式细胞术检测细胞增殖、凋亡,Western blotting和qPCR检测PDK4表达。双荧光素酶报告实验评价miR-122与PDK4的靶向调控作用。结果 Eca-109、KYSE-30、TE-1细胞中miR-122表达水平分别为0. 46±0. 05、0. 85±0. 10、0. 83±0. 07,均低于正常食管上皮细胞HEEC的1. 00±0. 08,差异有统计学意义(P<0. 05)。miR-122 mimics组miR-122表达水平为16. 33±0. 88,均高于对照组和miR-NC组,差异有统计学意义(P<0. 05)。miR-122 mimics组24、48、72 h的A值分别为0. 389±0. 016、0. 590±0. 019、0. 692±0. 020,低于对照组和miR-NC组,差异有统计学意义(P<0. 05)。miR-122 mimics组转染48 h的凋亡率为(32. 11±5. 71)%,高于miR-NC组和对照组,差异有统计学意义(P<0. 05)。miR-122 mimics组PDK4mRNA表达水平为0. 132±0. 044,低于对照组的1. 0±0. 017和miR-NC组的1. 025±0. 058,差异有统计学意义(P<0. 05)。miR-122 mimics组PDK4蛋白表达水平为0. 217±0. 071,低于对照组的0. 853±0. 035和miR-NC组的0. 830±0. 015,差异有统计学意义(P<0. 05)。miR-122可抑制野生型PDK4 3’UTR报告基因载体的荧光素酶活性,而对突变型PDK4 3’UTR的荧光素酶活性无影响。结论上调miR-122表达能靶向抑制PDK4表达,进而抑制食管癌细胞增殖和促进凋亡。 展开更多
关键词 食管癌 MIR-122 pdk4 增殖 凋亡
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努比亚山羊PDK4基因克隆、序列分析及表达水平研究 被引量:2
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作者 蔡沛燃 邹菊红 +3 位作者 胡艳 张叁保 宋颖 蒋钦杨 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第9期55-60,141,共7页
为了探究努比亚山羊PDK4基因的脂质代谢途径,试验以40~48周龄努比亚山羊为研究对象,取其心脏、肾脏、肝脏、脾脏、背最长肌及皮下脂肪等组织/器官,分别提取总RNA,将其反转录为cDNA,采用PCR方法扩增PDK4基因片段,利用生物信息学软件分析P... 为了探究努比亚山羊PDK4基因的脂质代谢途径,试验以40~48周龄努比亚山羊为研究对象,取其心脏、肾脏、肝脏、脾脏、背最长肌及皮下脂肪等组织/器官,分别提取总RNA,将其反转录为cDNA,采用PCR方法扩增PDK4基因片段,利用生物信息学软件分析PDK4基因序列,通过实时荧光定量PCR方法检测努比亚山羊不同组织/器官内PDK4基因的表达情况,同时以都安山羊为对照。结果表明:通过克隆成功获得努比亚山羊PDK4基因的CDS片段,其长度为1224 bp,共编码407个氨基酸残基;PDK4基因核苷酸序列与GenBank中的绵羊、牛、欧亚猪、马、人、小鼠的同源性分别为99.3%、97.6%、93.0%、92.5%、91.0%、85.0%;努比亚山羊PDK4蛋白氨基酸组成中亮氨酸含量较高,占总氨基酸数的10.8%,属于亲水性蛋白;努比亚山羊PDK4蛋白大部分是由α-螺旋和无规则卷曲组成,少部分由延伸链和β-转角组成。此外,努比亚山羊皮下脂肪中PDK4基因相对表达量最高,与其他组织比较差异显著(P<0.05),且心脏中PDK4基因相对表达量最低;努比亚山羊皮下脂肪中的PDK4基因相对表达量显著高于都安山羊(P<0.05)。说明PDK4基因可作为研究努比亚山羊脂肪沉积的主要候选基因之一。 展开更多
关键词 努比亚山羊 都安山羊 pdk4基因 克隆 生物信息学
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