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基于生物信息学分析PDE2A基因在消化系统肿瘤预后及免疫浸润的临床意义
被引量：
1
1
作者
张钊熊
韩强
刘树业
《世界华人消化杂志》
CAS
2021年第18期1055-1063,共9页
背景消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,然而其预后仍不好.探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向.我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.目的探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性,探索PDE2A在消化系统肿...
背景消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,然而其预后仍不好.探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向.我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.目的探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性,探索PDE2A在消化系统肿瘤中的预后价值.方法通过HPA、TIMER和UALCAN数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤中的mRNA及蛋白表达,利用GEPIA数据库探索PDE2A在不同消化系统肿瘤患者预后的影响.通过TIMER数据库探索PDE2A表达与不同消化系统肿瘤免疫浸润相关性.利用cBioPortal数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤的遗传突变信息.通过STRING数据库探索PDE2A的潜在蛋白相互作用网络.结果PDE2A基因mRNA和蛋白在肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌组织中表达低于正常癌旁组织.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者较PDE2A低表达的患者预后良好.PDE2A表达与肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌不同免疫细胞如CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、B细胞、巨噬细胞和中性粒细胞呈正相关或负相关.PDE2A基因在胃癌、胰腺癌、结肠癌及食管癌中存在错义突变等遗传改变.结论PDE2A表达与消化系统肿瘤免疫浸润有关.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者预后良好.PDE2A基因可能为潜在的消化系统肿瘤免疫治疗靶点和预后标志物.
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关键词
消化系统肿瘤
免疫浸润
预后
pde2a
生物信息学
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职称材料
磷酸二酯酶2(PDE2)结构及其选择性抑制剂的研究进展
被引量：
3
2
作者
赵新筠
陈喜
湛昌国
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期159-165,共7页
磷酸二酯酶2(PDE2)主要分布在大脑、心脏细胞中,作为潜在的药物靶标,通过水解细胞内第二信使cAMP和cGMP,对维持cAMP和cGMP的水平起着重要的作用,其选择性抑制剂有望在内皮渗透性和改善记忆力等方面发挥作用.综述了PDE2的组织分布、生理...
磷酸二酯酶2(PDE2)主要分布在大脑、心脏细胞中,作为潜在的药物靶标,通过水解细胞内第二信使cAMP和cGMP,对维持cAMP和cGMP的水平起着重要的作用,其选择性抑制剂有望在内皮渗透性和改善记忆力等方面发挥作用.综述了PDE2的组织分布、生理功能、催化区域和调节区域晶体结构的特点以及选择性的抑制剂.最后,根据药物设计发展的趋势对未来PDE2抑制剂的设计进行了展望.
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关键词
磷酸二酯酶2(PDE2)
酶功能
酶分布
调节区域
催化区域
选择性抑制剂
暂未订购
糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌中PDE2和PDE3蛋白表达变化
3
作者
金政
张默函
+2 位作者
姜京植
朴丽花
蔡英兰
《辽东学院学报（自然科学版）》
CAS
2016年第4期272-275,共4页
为了观察糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌组织中PDE2和PDE3的蛋白含量变化,由腹腔注射STZ制备糖尿病动物模型,利用多道生理信号记录系统记录糖尿病大鼠胃窦平滑肌收缩活动,将发生胃窦平滑肌收缩活动紊乱的大鼠列入糖尿病胃动力障碍模型...
为了观察糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌组织中PDE2和PDE3的蛋白含量变化,由腹腔注射STZ制备糖尿病动物模型,利用多道生理信号记录系统记录糖尿病大鼠胃窦平滑肌收缩活动,将发生胃窦平滑肌收缩活动紊乱的大鼠列入糖尿病胃动力障碍模型,再采用免疫组织化学方法观察糖尿病胃动力障碍组大鼠胃窦平滑肌中PDE2和PDE3的分布。结果发现,糖尿病发病胃动力障碍大鼠与正常对照组相比,胃窦平滑肌组织PDE2表达无明显差异,但PDE3表达明显减少(P<0.05)。因此,糖尿病大鼠发生胃动力障碍可能与胃窦平滑肌中PDE3下调有关,糖尿病大鼠胃c GMP-PDE3的改变可能参与胃动力障碍的发生。
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关键词
糖尿病
胃动力障碍
PDE2
PDE3
暂未订购
题名
基于生物信息学分析PDE2A基因在消化系统肿瘤预后及免疫浸润的临床意义
被引量：
1
1
作者
张钊熊
韩强
刘树业
机构
天津市第三中心医院检验科
中国医科大学基础医学院及附属第一医院病理科
出处
《世界华人消化杂志》
CAS
2021年第18期1055-1063,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目,No.81902986.
文摘
背景消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,然而其预后仍不好.探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向.我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.目的探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性,探索PDE2A在消化系统肿瘤中的预后价值.方法通过HPA、TIMER和UALCAN数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤中的mRNA及蛋白表达,利用GEPIA数据库探索PDE2A在不同消化系统肿瘤患者预后的影响.通过TIMER数据库探索PDE2A表达与不同消化系统肿瘤免疫浸润相关性.利用cBioPortal数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤的遗传突变信息.通过STRING数据库探索PDE2A的潜在蛋白相互作用网络.结果PDE2A基因mRNA和蛋白在肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌组织中表达低于正常癌旁组织.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者较PDE2A低表达的患者预后良好.PDE2A表达与肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌不同免疫细胞如CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、B细胞、巨噬细胞和中性粒细胞呈正相关或负相关.PDE2A基因在胃癌、胰腺癌、结肠癌及食管癌中存在错义突变等遗传改变.结论PDE2A表达与消化系统肿瘤免疫浸润有关.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者预后良好.PDE2A基因可能为潜在的消化系统肿瘤免疫治疗靶点和预后标志物.
关键词
消化系统肿瘤
免疫浸润
预后
pde2a
生物信息学
Keywords
Gastrointestinal cancer
Immune infiltration
Prognosis
pde2a
Bioinformatics analysis
分类号
R735 [医药卫生—肿瘤]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
磷酸二酯酶2(PDE2)结构及其选择性抑制剂的研究进展
被引量：
3
2
作者
赵新筠
陈喜
湛昌国
机构
华中师范大学化学学院农药与化学生物学教育部重点实验室
Department of Pharmaceutical Sciences
出处
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期159-165,共7页
基金
国家自然科学基金(Nos.20503008,20372023,20602014)资助项目
文摘
磷酸二酯酶2(PDE2)主要分布在大脑、心脏细胞中,作为潜在的药物靶标,通过水解细胞内第二信使cAMP和cGMP,对维持cAMP和cGMP的水平起着重要的作用,其选择性抑制剂有望在内皮渗透性和改善记忆力等方面发挥作用.综述了PDE2的组织分布、生理功能、催化区域和调节区域晶体结构的特点以及选择性的抑制剂.最后,根据药物设计发展的趋势对未来PDE2抑制剂的设计进行了展望.
关键词
磷酸二酯酶2(PDE2)
酶功能
酶分布
调节区域
催化区域
选择性抑制剂
Keywords
phosphodiesterase 2 （PDE2）
enzyme function
enzyme distribution
regulatory domain
catalytic domain
selective inhibitor
分类号
R914 [医药卫生—药物化学]
暂未订购
题名
糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌中PDE2和PDE3蛋白表达变化
3
作者
金政
张默函
姜京植
朴丽花
蔡英兰
机构
延边大学医学院
出处
《辽东学院学报（自然科学版）》
CAS
2016年第4期272-275,共4页
基金
国家自然科学基金项目(81360070)
文摘
为了观察糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌组织中PDE2和PDE3的蛋白含量变化,由腹腔注射STZ制备糖尿病动物模型,利用多道生理信号记录系统记录糖尿病大鼠胃窦平滑肌收缩活动,将发生胃窦平滑肌收缩活动紊乱的大鼠列入糖尿病胃动力障碍模型,再采用免疫组织化学方法观察糖尿病胃动力障碍组大鼠胃窦平滑肌中PDE2和PDE3的分布。结果发现,糖尿病发病胃动力障碍大鼠与正常对照组相比,胃窦平滑肌组织PDE2表达无明显差异,但PDE3表达明显减少(P<0.05)。因此,糖尿病大鼠发生胃动力障碍可能与胃窦平滑肌中PDE3下调有关,糖尿病大鼠胃c GMP-PDE3的改变可能参与胃动力障碍的发生。
关键词
糖尿病
胃动力障碍
PDE2
PDE3
Keywords
diabetes mellitus
gastroparesis
PDE2
PDE3
分类号
R587.1 [医药卫生—内分泌]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析PDE2A基因在消化系统肿瘤预后及免疫浸润的临床意义
张钊熊
韩强
刘树业
《世界华人消化杂志》
CAS
2021
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
磷酸二酯酶2(PDE2)结构及其选择性抑制剂的研究进展
赵新筠
陈喜
湛昌国
《有机化学》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009
3
暂未订购
3
糖尿病胃动力障碍大鼠胃窦平滑肌中PDE2和PDE3蛋白表达变化
金政
张默函
姜京植
朴丽花
蔡英兰
《辽东学院学报（自然科学版）》
CAS
2016
0
暂未订购
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