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正丙醇对浑浊红球菌PD630影响的代谢组学分析 被引量:1
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作者 楚美云 张林尚 +4 位作者 娄文勇 宗敏华 唐语谦 徐晓飞 杨继国 《食品与机械》 北大核心 2020年第1期50-55,共6页
采用超高效液相色谱串联三重四级杆飞行时间质谱法(UPLC-Tnple-TOF/MS)对正丙醇存在条件下浑浊红球菌PD630体内的代谢物进行非靶标代谢组学分析。然后对其进行多元统计分析,识别差异代谢物。研究结果显示,在48 h试验组与对照组的差异代... 采用超高效液相色谱串联三重四级杆飞行时间质谱法(UPLC-Tnple-TOF/MS)对正丙醇存在条件下浑浊红球菌PD630体内的代谢物进行非靶标代谢组学分析。然后对其进行多元统计分析,识别差异代谢物。研究结果显示,在48 h试验组与对照组的差异代谢物共有54种,在72 h差异代谢物有61种,主要体现在短肽减少和鳞脂的不饱和度增加。同时丙酰;辅酶A(CoA)显著性增加(P<0.001),且通过气相色谱测脂肪酸组成时发现奇数碳脂肪酸的含量从32.91%提高到79.66%,提升了2.4倍。说明正丙醇对脂肪酸的合成途径影响较大。 展开更多
关键词 正丙醇 浑浊红球菌pd630 代谢组学 代谢物
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6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶在产油细菌浑浊红球菌PD630脂质积累中的作用 被引量:2
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作者 张冬冬 赵利娜 +2 位作者 昝新艺 唐鑫 宋元达 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期61-68,共8页
产油微生物脂质合成的过程已基本清晰:乙酰辅酶A和还原力NADPH在脂肪酸合酶(FAS)的作用下合成脂肪酸。产油微生物菌体内主要有苹果酸酶(ME)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)、6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6PGDH)和异柠檬酸脱氢酶(ICDH)为其脂质... 产油微生物脂质合成的过程已基本清晰:乙酰辅酶A和还原力NADPH在脂肪酸合酶(FAS)的作用下合成脂肪酸。产油微生物菌体内主要有苹果酸酶(ME)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)、6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6PGDH)和异柠檬酸脱氢酶(ICDH)为其脂质合成提供所需还原力NADPH。为了研究6PGDH在浑浊红球菌PD630(Rhodococcus opacus PD630)脂质积累中的作用,作者将编码氧化磷酸戊糖路径(oxPPP)中6PGDH的基因gnd在R. opacus PD630中过表达。结果表明,与对照菌株相比较,过表达gnd的重组菌株总脂肪酸含量提高了20%~30%,且6PGDH酶活力和gnd的转录水平也显著提高。由此可见,6PGDH在R. opacus PD630脂质合成中具有重要的作用,能为其提供所需的还原力NADPH,以促进其脂质的积累。 展开更多
关键词 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶 脂质生物合成 NADPH 产油微生物 浑浊红球菌pd630
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浑浊红球菌LPD06283蛋白的生物信息学分析 被引量:2
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作者 马学婧 白静 +5 位作者 韩靖轩 柏潇萌 韩然 李泊颖 郝雅如 张兆英 《饲料研究》 CAS 北大核心 2023年第3期82-87,共6页
试验旨在探究浑浊红球菌PD630 (Rhodococcus opacus PD630) LPD06283蛋白的结构与功能。采用生物信息学方法对LPD06283蛋白的理化性质、亲水性、疏水性、双性α螺旋、同源性、信号肽、跨膜区、二级结构、结构域、三级结构、磷酸化修饰... 试验旨在探究浑浊红球菌PD630 (Rhodococcus opacus PD630) LPD06283蛋白的结构与功能。采用生物信息学方法对LPD06283蛋白的理化性质、亲水性、疏水性、双性α螺旋、同源性、信号肽、跨膜区、二级结构、结构域、三级结构、磷酸化修饰位点、相互作用蛋白质进行研究。结果显示,LPD06283蛋白是一种稳定酸性亲水蛋白,N端疏水区形成双性α螺旋,与红球菌RHA1 (Rhodococcus jostii RHA1) MLDS蛋白的亲缘关系较近,无信号肽和跨膜区;LPD06283蛋白的二级结构由α螺旋(81.88%)、β转角(3.62%)和无规则卷曲(14.49%)构成,N端存在一个载脂蛋白结构域,三级结构采用综合法预测得到且质量较高;LPD06283蛋白含有19个磷酸化位点,相互作用最强的蛋白质是XRE家族DNA结合蛋白。研究表明,LPD06283蛋白可能参与浑浊红球菌的脂质代谢,可作为微生物油脂研发的潜在靶标。 展开更多
关键词 LPD06283蛋白 浑浊红球菌pd630 微生物油脂 蛋白结构 生物信息学分析
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Enhancing odd-chain fatty acid biosynthesis in R.opacus via black bean protein hydrolysate-mediated metabolic reprogramming
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作者 Kun Liu Zhaojun Zheng Yuanfa Liu 《Food Bioscience》 2026年第3期386-398,共13页
OCFA production from Rhodococcus opacus PD630(R.opacus),which is a natural oleaginous bacterium,is limited by propionyl-CoA availability despite its potential for biofuel,nutritional,and pharmaceutical applications.Th... OCFA production from Rhodococcus opacus PD630(R.opacus),which is a natural oleaginous bacterium,is limited by propionyl-CoA availability despite its potential for biofuel,nutritional,and pharmaceutical applications.This study investigated the effects of enzymatically hydrolyzed black bean protein hydrolysates(BBPHs)as an alternative nitrogen source to stimulate OCFA biosynthesis.Among six hydrolysates,BBPH hydrolyzed by bromelain,flavourzym and Neutrase®markedly enhanced cell growth and lipid accumulation,achieving a 3-fold increase in OCFA content and elevating OCFA proportion to 30.78±0.97%of total fatty acids.The OCFA content has reached 1368.98±157.08 mg/L in BBPH-N.Metabolomic and lipidomic analyses revealed that BBPH supplementation significantly increased intracellular propionyl-CoA levels(750.29±45.00 ng/mg,compared with the 476.70±36.71 ng/mg of CN group),and modulated succinyl-CoA abundance,suggesting activation of the methyl malonyl-CoA pathway.A total of 69 OCFA-containing triglycerides and 17 diglycerides were identified,with TG 54:1(TG 17:0_19:0_18:1)emerging as a common lipid marker across BBPH supplementations.Moreover,BBPH hydrolyzed by Neutrase®enhanced the accumulation of C17-series fatty acids and improved nitrogen assimilation efficiency,as indicated by higher biomass and supernatant protein concentrations.Collectively,these results demonstrate that BBPH can reprogram carbon-nitrogen metabolism in R.opacus,promoting propionyl-CoA-derived OCFA synthesis.This work highlights a green and economically viable approach to microbial lipid production using agro-industrial byproducts,contributing to the advancement of circular bioeconomy strategies. 展开更多
关键词 R.opacus pd630 Black bean peptide hydrolysates Odd chain fatty acid content Co-cultivation
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