【目的】调查陕西地区猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)的分子流行病学变化趋势,为进一步预防和治疗猪圆环病毒病提供参考。【方法】于2010-2012年采集陕西西安、咸阳、宝鸡、榆林和延安等地区发病猪群中的141份样品。首...【目的】调查陕西地区猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)的分子流行病学变化趋势,为进一步预防和治疗猪圆环病毒病提供参考。【方法】于2010-2012年采集陕西西安、咸阳、宝鸡、榆林和延安等地区发病猪群中的141份样品。首先,采用PCR检测样品中PCV2感染情况;然后,通过基因型特异的PCR,检测PCV2阳性样品中PCV2a和PCV2b亚型的感染情况;最后,扩增、克隆和测序PCV2 ORF2基因编码序列,并通过生物信息学软件统计分析所获得基因序列的进化情况。【结果】141份样品中,117份检测为PCV2阳性,阳性率达82.9%,其中的33份病死猪样品中有32份检测为PCV2阳性。基因型特异的PCR检测结果显示,117份PCV2阳性样品中单感染PCV2b的为59份,单感染PCV2a的为11份,另外47份样品为PCV2a和PCV2b混合感染。对32份病死猪PCV2阳性样品的PCV2 ORF2基因序列进行比对分析,结果表明,12份为PCV2b-1A/1B亚型,16份为PCV2b-1C亚型,4份为PCV2a亚型。对各亚型ORF2氨基酸序列的分析结果表明,氨基酸的变异位点主要存在于8-47,59-101,134-169,180-210这4个区域。【结论】陕西地区猪群PCV2感染严重,并且PCV2b-1A/1B和PCV2b-1C亚型是主要流行毒株,氨基酸变异位点主要存在于Cap蛋白潜在表位区。展开更多
【目的】确定广东某规模化猪场发病猪是否为猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)感染,并评估病毒的遗传特性及其在猪群中的流行情况,为疫病的防控提供科学数据支持。【方法】采用实时荧光定量PCR和ELISA方法对猪场病猪的肾...【目的】确定广东某规模化猪场发病猪是否为猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)感染,并评估病毒的遗传特性及其在猪群中的流行情况,为疫病的防控提供科学数据支持。【方法】采用实时荧光定量PCR和ELISA方法对猪场病猪的肾脏、淋巴结、脾脏等内脏组织及血清样本进行检测分析,并通过PCR扩增PCV2阳性样本的ORF2基因。利用DNAStar软件包中的MegAlign模块对所得ORF2基因序列与GenBank数据库中23株PCV2参考毒株进行相似性比对。运用Mega 7.0软件构建基于ORF2基因序列的遗传进化树,以明确鉴定毒株与参考毒株之间的遗传关系。【结果】流行病学调查、临床症状及病理解剖结果显示,该猪场病猪符合PCV2感染的特征。实时荧光定量PCR检测发现3份样本的Ct值分别为14.42、15.13和16.08,表明病毒载量较高,且PCV2检测结果为阳性。ELISA检测结果显示,不同日龄段猪群中Cap蛋白抗体阳性率介于60%~100%之间,而Rep蛋白抗体阳性率则在0~100%之间,特别是150日龄猪群的2种蛋白抗体阳性率均达到100%,表明PCV2感染强度较高。ORF2基因测序获得了3条序列,分别命名为LZC-2305-1、LZC-2305-2和LZC-2305-3。相似性分析结果显示,这3条序列间具有99.9%~100%的相似性,且与GenBank中的23株PCV2参考毒株序列的相似性为82.3%~99.7%,其中与CZ246序列相似性最高,为99.6%~99.7%。遗传进化树分析进一步证实,本研究获得的3条序列与CZ246序列具有最近的亲缘关系,归属于PCV2的2d分支。【结论】本研究确诊该猪场猪群发生了PCV2d分支的感染。本研究结果不仅为该猪场的PCV2防控提供了科学依据,也为其他规模化猪场的疫病监测与防控提供了参考。展开更多
文摘【目的】确定广东某规模化猪场发病猪是否为猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)感染,并评估病毒的遗传特性及其在猪群中的流行情况,为疫病的防控提供科学数据支持。【方法】采用实时荧光定量PCR和ELISA方法对猪场病猪的肾脏、淋巴结、脾脏等内脏组织及血清样本进行检测分析,并通过PCR扩增PCV2阳性样本的ORF2基因。利用DNAStar软件包中的MegAlign模块对所得ORF2基因序列与GenBank数据库中23株PCV2参考毒株进行相似性比对。运用Mega 7.0软件构建基于ORF2基因序列的遗传进化树,以明确鉴定毒株与参考毒株之间的遗传关系。【结果】流行病学调查、临床症状及病理解剖结果显示,该猪场病猪符合PCV2感染的特征。实时荧光定量PCR检测发现3份样本的Ct值分别为14.42、15.13和16.08,表明病毒载量较高,且PCV2检测结果为阳性。ELISA检测结果显示,不同日龄段猪群中Cap蛋白抗体阳性率介于60%~100%之间,而Rep蛋白抗体阳性率则在0~100%之间,特别是150日龄猪群的2种蛋白抗体阳性率均达到100%,表明PCV2感染强度较高。ORF2基因测序获得了3条序列,分别命名为LZC-2305-1、LZC-2305-2和LZC-2305-3。相似性分析结果显示,这3条序列间具有99.9%~100%的相似性,且与GenBank中的23株PCV2参考毒株序列的相似性为82.3%~99.7%,其中与CZ246序列相似性最高,为99.6%~99.7%。遗传进化树分析进一步证实,本研究获得的3条序列与CZ246序列具有最近的亲缘关系,归属于PCV2的2d分支。【结论】本研究确诊该猪场猪群发生了PCV2d分支的感染。本研究结果不仅为该猪场的PCV2防控提供了科学依据,也为其他规模化猪场的疫病监测与防控提供了参考。
