新月弯孢不同分离物的RAPD及ITS区的PCR-RFLP分析 被引量：11

1

作者 孙广宇 彭友良 +1 位作者 张天宇 李振歧 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第S1期70-70,共1页

新月弯孢(Curvularia lunata)不同分离物之间分生孢子形态常有较大的变异,环境条件对形态的影响也较大,因此种的鉴定常常很困难,种的划分有时有随意性及模糊性.本研究利用RAPD和ITS区的PCR-RFLP技术,对形态学上应归属于C.lunata但是具... 新月弯孢(Curvularia lunata)不同分离物之间分生孢子形态常有较大的变异,环境条件对形态的影响也较大,因此种的鉴定常常很困难,种的划分有时有随意性及模糊性.本研究利用RAPD和ITS区的PCR-RFLP技术,对形态学上应归属于C.lunata但是具有一定变异的15个分离物进行了分析.研究显示C.lunata不同分离物在遗传上具有较大的变异,C.lunata实际上是一个复合种.从树状图上看,供试分离物可以分为4组:组A(包括9个分离物),在形态学上它们具有典型C.lunata分生孢子特征,PDA培养基上不产生或者很少产生气生菌丝;组B(包括一个分离物,该菌株为新月弯孢空气变种,C.lunata var.aeria代表性菌株),它和组A的连锁距离约6.6(相似率15％),显示出它与典型C.lunata巨大的差异性,这一结果与Nakada等用基因组的RFLP分析及Tsuda等根据形态学的观察所得到的结论一致.因此,我们同意Tsu-da等将C.lunata var.aeria提升为种C.aeria的观点;组C(包括一个分离物)和其它分离物的RAPD带型相比,具有较大的差异,连锁距离达到6.7(相似率为13％,分生孢子不似典型的C.lunata分生孢子,PDA上形成大量灰色气生菌丝的菌落;组D(包括4个分离物),它们之间相似性很高,分生孢子为不呈典型的C.lunata分生孢子状,PDA培养基上,可以产生大量的灰色气生菌丝.组C和? 展开更多

关键词 新月弯孢 pcr-relp分析 分离物

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浙江地区不同寄主来源的炭疽菌ITS序列PCR-RFLP多态性分析 被引量：4

2

作者 刘诗胤 邱海萍 +7 位作者 姜华 张震 柴荣耀 毛雪琴 王教瑜 杜新法 王艳丽 孙国昌 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期61-65,共5页

应用核糖体DNA(ribo-somal DNAr,DNA)的ITS(internal transcribed spacer,ITS)区的RFLP序列的多态性,分析32个不同寄主来源的炭疽菌株的遗传多样性。利用ITS1及ITS4通用引物对扩增各菌株的rD-NA的内转录间隔区(ITS1-5.8S-ITS2)获得长约6... 应用核糖体DNA(ribo-somal DNAr,DNA)的ITS(internal transcribed spacer,ITS)区的RFLP序列的多态性,分析32个不同寄主来源的炭疽菌株的遗传多样性。利用ITS1及ITS4通用引物对扩增各菌株的rD-NA的内转录间隔区(ITS1-5.8S-ITS2)获得长约600 bp片段。ITS-RFLP共迁带UPGMA聚类分析的结果表明所有来自不同寄主的炭疽菌菌株(含福建及云南菌株)都以较高的相似系数(>0.60)聚为一类,具有较近的亲缘关系;同时试验中所有酶切位点的综合Gst系数达到0.82,说明不同菌株间的ITS具有丰富的多态性。 展开更多

关键词 炭疽菌 RDNA 内转录间隔区 pcr-relp 亲缘关系

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胆固醇酯转运蛋白基因15外显子D442G突变的检测 被引量：4

3

作者 强宏娟 丁庆 +1 位作者 王卫萍 庄一义 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期76-78,共3页

应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)的方法检测 110例脑动脉粥样硬化患者胆固醇酯转运蛋白 (CETP)基因 15外显子D44 2G错义突变。首先用聚合酶链反应特异性扩增包含人CETP基因 15外显子第 15 0 6位碱基的基因序列 ,... 应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析 (PCR RFLP)的方法检测 110例脑动脉粥样硬化患者胆固醇酯转运蛋白 (CETP)基因 15外显子D44 2G错义突变。首先用聚合酶链反应特异性扩增包含人CETP基因 15外显子第 15 0 6位碱基的基因序列 ,扩增产物用限制性内切酶MspⅠ酶切 ,聚丙烯酰胺凝胶电泳后分析结果。 110例脑动脉粥样硬化患者中发现 4例杂合突变 ,突变率 3 6 % ,与对照组 4%比较无明显差异。该方法简单、快速、准确 ,适合于一般实验室开展及大规模人群调查。 展开更多

关键词 胆固醇酯 转运蛋白 脑动脉硬化 pcr-relp

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天麻rDNA ITS区的PCR-RFLP分析 被引量：2

4

作者 谢渊 张小蕾 +2 位作者 李毅 张婷 单可人 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2008年第3期501-503,共3页

对来源于贵州大方(DF)、黎平(LP)、台江(TJ)、雷山(LS)、乌当(WD)及云南(YN)的鲜品天麻进行核糖体DNA内转录间隔区(ITS)的PCR扩增,并用限制性内切酶BamHI、HincⅡ、HeaⅢ进行酶切分析的结果显示,天麻ITS区长度约为750bp,PCR产物经HeaⅢ... 对来源于贵州大方(DF)、黎平(LP)、台江(TJ)、雷山(LS)、乌当(WD)及云南(YN)的鲜品天麻进行核糖体DNA内转录间隔区(ITS)的PCR扩增,并用限制性内切酶BamHI、HincⅡ、HeaⅢ进行酶切分析的结果显示,天麻ITS区长度约为750bp,PCR产物经HeaⅢ酶切后YN、DF和WD株的RFLP图谱基上一致,TJ2、LP和LS株的RFLP图谱基本上一致,而TJ1株则显著不同;经BamHI酶切后,LP、TJ和LS株的RFLP图谱相同,除DF3外,YN、DF1、DF2和WD株的RFLP图谱基本上一致;经HincⅡ酶切后,除DF3和TJ1 RFLP的图谱显著不同外,其余样本RFLP图谱均表现一致。表明天麻的遗传变异特征与其地域分布有一定的联系。 展开更多

关键词 天麻 内转录间隔区 pcr-relp

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错配PCR-RFLP检测乙型肝炎病毒X基因/C基因启动子变异 被引量：5

5

作者 王战会 侯金林 +3 位作者 陈金军 冯筱榕 梁炽森 骆抗先 《第一军医大学学报》 CSCD 1997年第3期173-175,共3页

设计错配PCR-限制性片段长度多态性分析（PCR－RFLP）检测中国HBV每株C基因启动子（BCP）区第2个AT丰富区的一对点突变；核苷酸（nt）1762的碱基由A→T和1764的碱基由G→A变异。结果发现在32例慢性HBV感染者中BCP变异者有10例，总检出率... 设计错配PCR-限制性片段长度多态性分析（PCR－RFLP）检测中国HBV每株C基因启动子（BCP）区第2个AT丰富区的一对点突变；核苷酸（nt）1762的碱基由A→T和1764的碱基由G→A变异。结果发现在32例慢性HBV感染者中BCP变异者有10例，总检出率为31．2％．提示在我国HBV毒株BCP区这一联合点突变较常见．PCR－RFLP技术与序列分析结合，对于研究这一新发现的热点变异与临床的关系具有重要的实用价值． 展开更多

关键词 乙型肝炎 病毒 基因变异 pcr-relp 检测

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PCR-RFLP技术在环境地球化学研究中的应用及展望 被引量：5

6

作者 梁小兵 万国江 黄荣贵 《地质地球化学》 CSCD 2001年第1期94-98,共5页

PCR—RFLP技术为环境地球化学提供了一种新的研究方法和实验设计的新的思维方式。该方法具有所需样品量低、快速简便及特征性强等优点 ,可广泛应用于物质的生物地球化学循环、环境过程的生物作用、生物多样性及有机物源判断等方面的研... PCR—RFLP技术为环境地球化学提供了一种新的研究方法和实验设计的新的思维方式。该方法具有所需样品量低、快速简便及特征性强等优点 ,可广泛应用于物质的生物地球化学循环、环境过程的生物作用、生物多样性及有机物源判断等方面的研究。利用PCR—RFLP技术 ,以环境中存在的 16SrRNA为对象 ,对环境生物的研究已广泛开展并取得了许多成果。展望未来研究成果 ,将会在海洋及湖泊沉积物等自然环境中发现更多的、新的微生物种类 ;将进一步阐明生物作用和物质循环的机理和过程 ; 展开更多

关键词 pcr-relp技术 环境地球化学 生物 沉积物 有机物源

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用PCR-RFLP技术鉴别猪的氟烷基因型 被引量：1

7

作者 郭雁君 罗安治 +2 位作者 陈继华 肖艳玲 季永诚 《四川农业大学学报》 CSCD 1999年第1期54-57,共4页

用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ技术对乐山市种畜场长白猪选育基础群的氟烷基因型进行了检测，查清了Ｈａｌｎ基因在该群体中的分布，Ｈａｌｎ基因的频率为１８０５６％。同时对影响ＰＣＲ的几个主要因素进行了初步研究。

关键词 猪 pcr-relp技术 氟烷基因 鉴别

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HBV耐拉米夫定多聚酶基因变异检测方法的建立

8

作者 张伟三 丁静娟 门晓燕 《现代实用医学》 2002年第7期346-348,共3页

目的　建立一种简便、准确、实用的乙型肝炎病毒 (HBV)耐拉米夫定多聚酶基因变异检测方法。　方法　根据已公布的HBVDNA序列 ,在HBV多聚酶基因区设计并合成了两对寡核苷酸引物 ,其中一只为错配引物 ;应用巢式错配聚合酶链反应 (PCR)特... 目的　建立一种简便、准确、实用的乙型肝炎病毒 (HBV)耐拉米夫定多聚酶基因变异检测方法。　方法　根据已公布的HBVDNA序列 ,在HBV多聚酶基因区设计并合成了两对寡核苷酸引物 ,其中一只为错配引物 ;应用巢式错配聚合酶链反应 (PCR)特异性扩增含有HBV多聚酶基因YMDD基序的片段 ,扩增产物用限制性内切酶 (NdeⅠ )酶切 ,琼脂糖凝胶电泳 ,观察酶切后目的片段的限制性片段长度多态性 (RFLP)图谱。部分标本进行DNA测序。　结果　 (1)所建立的巢式错配PCR RFLP法 ,从DNA提取到酶切后电泳分析仅需要 11小时 ;灵敏度高 ,可以检测到 10 3 copies/ml的HBVDNA ;特异性强 ,结果准确 ,经DNA测序证实。 (2 )检测 2 0例长期服用拉米夫定的慢性乙型肝炎患者的系列血清 ,发现YMDD变异者 (45 % ) 9例 ,YMDD野毒株者 (5 5 % ) 11例 ,表明该法可有效地鉴别HBVYMDD野毒株与变异株。　结论　本实验所建立的用于检测HBV耐拉米夫定多聚酶基因变异的巢式错配PCR RFLP方法简单、敏感、特异 ,适用于一般实验室及大规模的人群调查。 展开更多

关键词 HBVJ 拉米夫定 多聚酶基因 耐药性 基因变异 巢式错配pcr-relp

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黔邵花猪氟烷基因序列多态性分析 被引量：2

9

作者 陈良 陈告 +5 位作者 王水莲 邓炜 邱小燕 钟丽凡 伍桓君 吴亚琴 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第20期39-42,47,共5页

为了确定黔邵花猪氟烷基因(Haln)的基因型,试验采集了15头黔邵花猪和25头杂交F1代(黔邵花猪♀×土猪♂)的肌肉或带毛囊的颈部鬃毛共40份样品,进行Haln基因特定片段的PCR扩增和限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)鉴定,对部... 为了确定黔邵花猪氟烷基因(Haln)的基因型,试验采集了15头黔邵花猪和25头杂交F1代(黔邵花猪♀×土猪♂)的肌肉或带毛囊的颈部鬃毛共40份样品,进行Haln基因特定片段的PCR扩增和限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)鉴定,对部分Haln基因特定片段测序,然后将3条黔邵花猪与6条不同品种(系)猪(民猪、藏香猪、二花脸、大约克夏、杜洛克、挪威长白猪)的Haln基因相同区域序列进行比对分析。结果表明:黔邵花猪及其杂F1代HalNHalN型和HalN基因频率均是100%,与其他6条不同品种(系)的Haln基因部分序列比对发现有17个单碱基差异,3条黔邵花猪序列Haln基因序列中6个位点发生突变,第17外显子完整且未见C1843T突变。说明黔邵花猪具有独特的种质特性和良好的抗应激能力,有必要进行合理开发和利用。 展开更多

关键词 黔邵花猪 Haln pcr-relp 基因频率 多态性分析

原文传递

Ⅱ型糖尿病患者瘦素受体基因变异与肥胖及高血压的相关性研究 被引量：13

10

作者 谢平 张稷 +2 位作者 邓振霞 汪圣强 许岚 《中国优生与遗传杂志》 2002年第6期34-35,共2页

目的　探讨Ⅱ型糖尿病患者瘦素受体基因Gln2 2 3Arg变异与肥胖及高血压之间的相关性。方法　采用PCR -RELP方法分析了 1 84例无锡地区Ⅱ型糖尿病患者及 86例正常对照组Gln2 2 3Arg变异频率的分布情况。结果　 (1 )整个被检测的Ⅱ型糖尿... 目的　探讨Ⅱ型糖尿病患者瘦素受体基因Gln2 2 3Arg变异与肥胖及高血压之间的相关性。方法　采用PCR -RELP方法分析了 1 84例无锡地区Ⅱ型糖尿病患者及 86例正常对照组Gln2 2 3Arg变异频率的分布情况。结果　 (1 )整个被检测的Ⅱ型糖尿病人群中Gln2 2 3Arg变异频率与正常对照组比较经统计学处理没有显著性差异 ;(2 )Ⅱ型糖尿病患者中的正常体重组A、G等位基因的分布频率与超重组分布频率的比较亦无显著性差异 ;(3)在Ⅱ型糖尿病患者中高血压组和非高血压组之间存在非常显著的A、G等位基因的分布频率差异 (P值 <0 0 0 5)。 展开更多

关键词 基因变异 瘦素受体基因 Ⅱ型糖尿病 肥胖 高血压 pcr-relp

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几株具有杀虫特异性的苏云金芽胞杆菌菌株的生物活性及杀虫蛋白基因型的鉴定 被引量：5

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作者 李青 刘华梅 +3 位作者 丁咏梅 陈振民 宋福平 张杰 《现代农业科学》 2009年第4期9-11,18,共4页

通过在全国各地采集的土壤、腐殖质、水体固形物、动物排泄物,采用醋酸钠-硫酸庆大霉素培养基分离获得多样性的苏云金芽胞杆菌(Bt)菌株,利用cry基因的PCR-RELP鉴定体系对菌株进行基因分析,并用SDS-PAGE方法获得高晶体含量的菌株,用生物... 通过在全国各地采集的土壤、腐殖质、水体固形物、动物排泄物,采用醋酸钠-硫酸庆大霉素培养基分离获得多样性的苏云金芽胞杆菌(Bt)菌株,利用cry基因的PCR-RELP鉴定体系对菌株进行基因分析,并用SDS-PAGE方法获得高晶体含量的菌株,用生物测定方法筛选对不同靶标昆虫高毒力的菌株,现已分别获得对甜菜娥、斜纹夜娥、松毛虫、茶树害虫茶尺蠖、水稻螟虫、榆蓝叶甲高效的Bt天然菌株。通过对Bt生物多样性的研究,针对不同害虫,有目的选择不同特色Bt菌株用于防治,或有防效菌株交互使用,达到最佳防治目标或延缓害虫抗性。 展开更多

关键词 苏云金芽胞杆菌 生物测定 pcr-relp 生物多样性

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