基于PCR技术的松材线虫分子检测技术研究进展 被引量：1

1

作者 姬党成 金奕亨 熊忠平 《湖北林业科技》 2024年第3期67-73,共7页

松材线虫是世界性检疫对象,并对我国林业造成了严重的危害。由于线虫个体较小且鉴定特征单一,利用传统的形态学鉴定较为困难,因此客观的分子生物学鉴定方法显得尤为重要。本研究总结了近些年主要的松材线虫PCR检测技术及其与拟松材线虫... 松材线虫是世界性检疫对象,并对我国林业造成了严重的危害。由于线虫个体较小且鉴定特征单一,利用传统的形态学鉴定较为困难,因此客观的分子生物学鉴定方法显得尤为重要。本研究总结了近些年主要的松材线虫PCR检测技术及其与拟松材线虫的区别,阐述了常规PCR技术、PCR-PFLPs检测技术、RAPD和SCAR分子标记技术以及荧光PCR技术等各类检测技术的特异性序列、片段大小和应用场景,并探讨了各检测技术的优缺点,为后期研究提供参考。 展开更多

关键词 松材线虫 PCR PFLP RAPD SCAR RT-PCR

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牛亚科5个群体β-Lg基因PCR-RFLP分析 被引量：5

2

作者 武秀香 杨章平 +6 位作者 毛永江 王小龙 瞿冬艳 陈仁金 周里根 王建勇 尹召华 《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期6-9,共4页

应用PCR-PFLP技术,分析荷斯坦奶牛、鲁西黄牛、闽南黄牛、渤海黑牛和青海牦牛5个群体741头个体β-乳球蛋白(β-Lg)基因第4外显子和β-Lg 5′侧翼区2个基因座的多态性。结果表明:前4个群体β-Lg A、B基因频率分别为0.4125/0.5875、0.1419... 应用PCR-PFLP技术,分析荷斯坦奶牛、鲁西黄牛、闽南黄牛、渤海黑牛和青海牦牛5个群体741头个体β-乳球蛋白(β-Lg)基因第4外显子和β-Lg 5′侧翼区2个基因座的多态性。结果表明:前4个群体β-Lg A、B基因频率分别为0.4125/0.5875、0.1419/0.8581、0.0333/0.9667和0.1857/0.8143,β-Lg 5′侧翼区A、B基因频率分别为0.412 5/0.5875、0.7286/0.2714、0.7328/0.2672和0.8637/0.1364;牦牛β-Lg B和E基因频率为0.0732/0.9269,未发现其他等位基因。适合性检验表明:β-Lg第4外显子在荷斯坦奶牛、鲁西黄牛和渤海黑牛3个群体中已达Hardy-Weinberg平衡状态,而闽南黄牛未达到平衡状态;β-Lg 5′侧翼区位点荷斯坦奶牛群体接近平衡,其余群体均已达平衡。群体遗传学分析表明:除闽南黄牛β-Lg 5′侧翼区为低度多态外,2个位点在其余群体内均为中度多态,荷斯坦奶牛这2个位点的杂合度和期望杂合度最高,闽南黄牛最低。提示这一研究成果为开展地方遗传资源保护奠定了基础。 展开更多

关键词 牛 β-Lg基因 pcr-pflp 遗传多态性

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采用PCR-RFLP技术分析中国人HLA-DR5亚型 被引量：4

3

作者 黄立东 陆佩华 +1 位作者 富赛里 周光炎 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1991年第4期202-205,共4页

采用等位特异的限制性内切酶降解经PCR扩增的中国人HLA纯合细胞的DRB基因片段,根据相应的限制性片段长度多态性(PCR-RFLP),可十分快速而准确地从DNA水平区分DR5的两个亚型,并显示属于DRW12亚型的中国人HLA纯合细胞与参考细胞间电泳格局... 采用等位特异的限制性内切酶降解经PCR扩增的中国人HLA纯合细胞的DRB基因片段,根据相应的限制性片段长度多态性(PCR-RFLP),可十分快速而准确地从DNA水平区分DR5的两个亚型,并显示属于DRW12亚型的中国人HLA纯合细胞与参考细胞间电泳格局的差异,提示新的DRW12变异体的存在。该技术不必采用等位或顺序特异的寡核苷酸探针进行杂交,因而无需使用放射性同位素,展示了应用于HLA基因分型的良好前景。 展开更多

关键词 HLA-DR pcr-pflp 限制性内切酶

暂未订购

糖单孢菌16SrDNA的PCR-RFLP分析 被引量：8

4

作者 吕志堂 刘志恒 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期567-572,共6页

PCR RFLP分析适用于种和种间水平的多相分类研究。文章对PCR RFLP方法应用于糖单孢菌属分类的具体方法进行了探讨 ;报道了一组适于糖单孢菌属PCR RFLP分析的限制性内切酶 ,并用这组酶对 6株糖单孢菌属分离株进行了研究 ,进一步探讨了实... PCR RFLP分析适用于种和种间水平的多相分类研究。文章对PCR RFLP方法应用于糖单孢菌属分类的具体方法进行了探讨 ;报道了一组适于糖单孢菌属PCR RFLP分析的限制性内切酶 ,并用这组酶对 6株糖单孢菌属分离株进行了研究 ,进一步探讨了实验菌株在该属的分类地位。同时指出了PCR RFLP方法应用中应注意的问题。 展开更多

关键词 糖单孢菌属 16SrDNA pcr-pflp分析

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猪MBF1基因的多态性及与生产性状的关联分析 被引量：1

5

作者 武华玉 程碧军 +5 位作者 乔木 刘贵生 吴俊静 李良华 彭先文 梅书棋 《湖北农业科学》 2016年第23期6192-6194,6287,共4页

分离克隆了猪MBF1基因第4外显子的序列,测序发现在18 bp处存在T/C突变,引起Taq I酶切多态。利用PCR-RFLP方法对国内外4个猪种MBF1基因第4外显子的多态性进行分析发现,在国外猪种中等位基因T的的频率占优势;在中国猪种中C等位基因的频率... 分离克隆了猪MBF1基因第4外显子的序列,测序发现在18 bp处存在T/C突变,引起Taq I酶切多态。利用PCR-RFLP方法对国内外4个猪种MBF1基因第4外显子的多态性进行分析发现,在国外猪种中等位基因T的的频率占优势;在中国猪种中C等位基因的频率占优势;在437头大梅F2代资源家系中进行性状关联分析发现该多态与瘦肉率、板油重、肩部背膘厚、眼肌高、眼肌宽、眼肌面积显著相关(P<0.05)。 展开更多

关键词 猪MBF1基因 pcr-pflp 多态性 性状关联分析

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适于PCR-RFLP分析的吊兰DNA提取

6

作者 杨柯金 陶爱丽 +2 位作者 高宛莉 蒋文文 徐晶晶 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第6期58-59,共2页

为了提取适合于PCR-RFLP分析的高质量的吊兰DNA,采用改良CTAB法提取了南阳市常见的宽叶吊兰、金边吊兰、金心吊兰的基因组DNA。通过测D260nm/D280nm检测了所得DNA的纯度及浓度。以所得3种吊兰DNA为模板,以植物中常用的通用引物trnH-trn... 为了提取适合于PCR-RFLP分析的高质量的吊兰DNA,采用改良CTAB法提取了南阳市常见的宽叶吊兰、金边吊兰、金心吊兰的基因组DNA。通过测D260nm/D280nm检测了所得DNA的纯度及浓度。以所得3种吊兰DNA为模板,以植物中常用的通用引物trnH-trnK扩增了3种吊兰叶绿体中的基因及基因间隔区,并把所扩增的PCR产物用限制性内切酶Sau3AⅠ进行了酶切。结果表明,用该方法获得的吊兰DNA纯度高,D260nm/D280nm多在1.7～1.9之间,且电泳条带清晰,无拖尾,无降解,用作模板能扩增出目标产物,适合于吊兰的PCR-RFLP分析。 展开更多

关键词 吊兰 DNA提取 pcr-pflp

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两种白茅根聚合酶链式反应法-限制性片段长度多态性分析鉴别方法的研究 被引量：7

7

作者 朱晓燕 黄韵璇 +3 位作者 黄昌杰 蓝永锋 侯惠婵 陈伟盛 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第18期1486-1490,共5页

目的从分子水平鉴别2种不同性状的白茅根。方法采用植物通用DNA条形码ITS1、ITS2、psb A-trnH、rbc L和mat K对30份白茅根样品的序列进行比较研究,分析2种不同性状白茅根的多个位点差异。结果 30批白茅根的psb A-trnH、rbc L和mat K基... 目的从分子水平鉴别2种不同性状的白茅根。方法采用植物通用DNA条形码ITS1、ITS2、psb A-trnH、rbc L和mat K对30份白茅根样品的序列进行比较研究,分析2种不同性状白茅根的多个位点差异。结果 30批白茅根的psb A-trnH、rbc L和mat K基因序列无位点差异,ITS1序列含3个关键差异位点,ITS2序列含1个关键差异位点,且ITS2序列上的关键差异位点可被限制性内切酶Hpy CH4Ⅲ识别。结论 ITS1和ITS2序列可作为2种不同性状白茅根鉴别用的DNA条形码序列,且利用ITS2序列上可被限制性内切酶Hpy CH4Ⅲ识别的关键差异位点可建立2种不同性状白茅根的PCR-PFLP鉴别方法。 展开更多

关键词 白茅根 DNA条形码 位点差异 聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性

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基于ITS2条形码鉴别南大青叶的PCR-RFLP研究 被引量：6

8

作者 黄韵璇 朱晓燕 +1 位作者 侯惠婵 陈伟盛 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第20期6350-6356,共7页

目的建立南大青叶马蓝Baphicacanthus cusia的分子鉴别方法。方法分析36批马蓝及其混伪品的ITS2和psbAtrnH基因序列信息,根据关键差异位点建立相应的聚合酶链式反应法-限制性片段长度多态性分析(polymerase chain reactionrestriction f... 目的建立南大青叶马蓝Baphicacanthus cusia的分子鉴别方法。方法分析36批马蓝及其混伪品的ITS2和psbAtrnH基因序列信息,根据关键差异位点建立相应的聚合酶链式反应法-限制性片段长度多态性分析(polymerase chain reactionrestriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)鉴别方法,并考察该方法的专属性和耐用性。结果马蓝的psbA-trnH基因序列与其混伪品的无明显位点差异,ITS2基因序列具有明显的种间差异,其中1个关键差异位点可被限制性内切酶Sma I识别和酶切,以此建立的PCR-RFLP鉴别方法符合《中国药典》2020年版四部中专属性和耐用性的要求。结论建立了有效鉴别南大青叶的PCR-RFLP方法,且该方法适用于基原物种为马蓝的其他中药材鉴别。 展开更多

关键词 马蓝 大青 DNA条形码 PCR-RFLP ITS2

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唐山汉族CYP11B2-344T/C基因多态性与冠心病的相关性

9

作者 赵红 马艳艳 +3 位作者 顾定伟 刘艳军 孙占京 王虹璎 《中国煤炭工业医学杂志》 2018年第3期234-239,共6页

目的观察唐山地区汉族醛固酮合成酶基因CYP11B2-344T/C多态性与冠心病的相关性。方法采用病例对照研究方法,选取2012年3月—2014年2月华北理工大学附属医院心内科连续收治的诊断为冠心病及胸痛待查患者,采用定量冠状动脉造影(QCA)方法... 目的观察唐山地区汉族醛固酮合成酶基因CYP11B2-344T/C多态性与冠心病的相关性。方法采用病例对照研究方法,选取2012年3月—2014年2月华北理工大学附属医院心内科连续收治的诊断为冠心病及胸痛待查患者,采用定量冠状动脉造影(QCA)方法观察冠状动脉狭窄程度,任一支冠脉血管狭窄≥50%者为冠心病组,任一支冠脉血管狭窄<50%或无明显狭窄者为对照组,记录临床资料,多聚酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-PFLP)检测醛固酮合成酶CYP11B2-344T/C位点基因型。结果(1)冠心病组与对照组比较,TT、TC、CC三种基因型频率分别为45.2%、45.2%、9.6%vs.54.0%、36.7%、9.3%,TC+CC基因型频率分别为54.8%vs.46.0%,T、C等位基因频率分别为67.8%vs.72.3%、32.7%vs.27.7%,差异均无统计学意义(χ~2=1.129,P=0.209;χ~2=2.907,P=0.099;χ~2=3.382,P=0.037)。(2)冠脉多支病变组与单支病变组比较,TT、TC、CC三种基因型频分别为42.4%、46.1%、11.5%vs.47.8%、44.8%、7.5%,TC+CC基因型频率分别为57.6%vs.52.2%。T、C等位基因频率分别为65.5%vs.70.1%、34.5%vs.29.9%,差异均无统计学意义(χ~2=1.082,P=0.582;χ~2=0.551,P=0.469;χ~2=0.947,P=0.384)。结论唐山汉族CYP11B2-344T/C基因多态性与冠心病未见明显相关性。 展开更多

关键词 冠心病 CYP11B2-344T/C基因多态性 聚合酶链反应-限制性片断长度多态性

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不同品种猪解耦联蛋白基因3’调控区的遗传变异 被引量：19

10

作者 方美英 赵兴波 +2 位作者 吴常信 方美英 李宁 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第13期1010-1012,共3页

对猪UCP3基因3’调控区进行了克隆测序,通过序列比对分析发现长白猪、内江猪、民猪和二花脸猪存在15个碱基位点的多态,利用PCR-RFLP分析长白猪、大白猪、内江猪、民猪、二花脸猪及梅山猪存在连续的9个多态位点,经X2检验发现二花脸猪与... 对猪UCP3基因3’调控区进行了克隆测序,通过序列比对分析发现长白猪、内江猪、民猪和二花脸猪存在15个碱基位点的多态,利用PCR-RFLP分析长白猪、大白猪、内江猪、民猪、二花脸猪及梅山猪存在连续的9个多态位点,经X2检验发现二花脸猪与长白猪、大白猪、内江猪和民猪差异极显著,与梅山猪差异显著,梅山猪与长白猪、民猪差异显著,提示太湖猪具有独特的种质特性. 展开更多

关键词 3′调控区 遗传变异 猪 解耦联蛋白基因 基因克隆 pcr-pflp 基因定位 种质特性

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中国汉族两群体HLA-DQA1基因的遗传构成及有关15群体DQA1基因频率的比较分析 被引量：9

11

作者 潘星华 陆建荣 +4 位作者 刘杰 张克雄 朱定良 谈家桢 庚镇城 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第4期276-279,共4页

以HLA基因的PCR-RFLP分型方法研究了哈尔滨地区(Hans-H,71例)和上海地区(Hans-S,98例)两个汉族群体HLA-DQA1座位的遗传多态性。共检出8种等位基因。两群体均以DQA1*0301频率最高,而*0401最低(哈尔滨群体未检出),频率分布符合Hardy-Weinb... 以HLA基因的PCR-RFLP分型方法研究了哈尔滨地区(Hans-H,71例)和上海地区(Hans-S,98例)两个汉族群体HLA-DQA1座位的遗传多态性。共检出8种等位基因。两群体均以DQA1*0301频率最高,而*0401最低(哈尔滨群体未检出),频率分布符合Hardy-Weinberg平衡。综合分析华人12群体及日本人、高加索人和尼格鲁人等3群体的HLA-DQA1的基因频率显示:卡方总体检验Hans-H及Hans-S与北方华人其它4群体(除维族)间相互无显著差异(P>0.05)),但逐项检验群体间多存在一个至几个基因频率的显著差异(P<0.05～0.001)。总体检验北方华人6群体(包括Hans-S)与南方5群体间均有显著差异(P<0.05～0.001),但满族与南方汉人3群体总体检验无显著差异(P>0.05),而维族与北方华人6群体则有显著差异(P<0.05～0.001)。另外,华人与异族间总体均有非常显著差异(P<0.001),但相对而言,华人(尤其是北方人)与日本人最为接近,华人与高加索人相似性较大,与尼格鲁人差异最大,而高加索人与尼格鲁人差异也较小。并对上述结果进行了讨论。 展开更多

关键词 pcr-pflp分型 HLA-DQA1 遗传多态性 汉族群体

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HBV基因型与慢性乙型肝炎疾病谱的关系 被引量：7

12

作者 阎丽 侯金林 +1 位作者 孙剑 林裕龙 《中国医师杂志》 CAS 2004年第10期1347-1348,共2页

目的　探讨乙型肝炎病毒 (HBV)基因型与慢性乙型肝炎疾病谱相关性。方法　用S基因聚合酶链式反应 -限制片段长度多态性 (PCR -RFLP)的基因型分型方法对广东地区HBV感染者中无症状携带者 (AsC)组 80例和肝硬化组 (LC) 12 0例血清标本分... 目的　探讨乙型肝炎病毒 (HBV)基因型与慢性乙型肝炎疾病谱相关性。方法　用S基因聚合酶链式反应 -限制片段长度多态性 (PCR -RFLP)的基因型分型方法对广东地区HBV感染者中无症状携带者 (AsC)组 80例和肝硬化组 (LC) 12 0例血清标本分型 ,比较两组基因型分布的异同。结果　基因型在AsC组分布 :B型 45 0 % ( 3 7/ 80 ) ;C型 3 3 75 % ( 2 6/ 80 ) ;D基因型 2 1 2 5 % ( 17/80 ) ;LC组HBV基因型分布B型 3 2 5 % ( 3 9/ 12 0 ) ;C型 65 8% ( 79/ 12 0 ) ;D基因型 1 6% ( 2 / 12 0 )。广州地区未发现A、E和F基因型 ,基因型在两组中的分布均与e抗原状态无显著性差异 (P >0 0 5 ) ;ASC与LC组两组间基因型的分布有显著性差异 ( χ2 =3 1 92 4,P=0 0 0 0 )。结论　可初步认为广东地区HBV感染者以B和C型为优势基因型 ,AsC组中以B型为优势基因型 ,感染HBVD基因型病情轻 ,感染HBVC基因型病情更易于加重。 展开更多

关键词 HBV基因型 ASC 疾病谱 慢性乙型肝炎 LC 病情 HBV感染 优势 结论 广东地区

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