After the policy adjustment,China no longer carries out COVID-19 PCR testing for all people,and antigen testing has become the main way to detect and manage infectious sources.We developed a dynamic model to evaluate ...After the policy adjustment,China no longer carries out COVID-19 PCR testing for all people,and antigen testing has become the main way to detect and manage infectious sources.We developed a dynamic model to evaluate and compare the effects between PCR and antigen testing for controlling the pandemic.Due to the increase of contact degree,the peak reduction effect of PCR testing in population is lower than that of antigen testing.Even if it was only 20%of people isolated at home after antigen testing,the peak of the epidemic could be reduced by 9.46%.If the proportion of antigen testing is further increased to 80%,the peak of the pandemic can be reduced by 31.41%.Antigen testing performed better effects in school(reduction proportion 29.27%)and community(29.34%)than in workplace(27.75%).Therefore,we recommend that antigen testing in the popu-lation should be encouraged during the pandemic,and home isolation of infected persons should be advocated,especially in crowded places.To improve the availability of antigen,the testing proportion should be further enhanced.展开更多
目的建立炭疽芽孢杆菌的微滴式数字聚合酶链式反应(Droplet digital PCR,ddPCR)方法对炭疽芽孢杆菌实验室活动污染的定量评估提供技术支持。方法以炭疽芽孢杆菌pXO1质粒编码保护性抗原pagA基因为靶序列,优化微滴数字PCR方法的反应条件,...目的建立炭疽芽孢杆菌的微滴式数字聚合酶链式反应(Droplet digital PCR,ddPCR)方法对炭疽芽孢杆菌实验室活动污染的定量评估提供技术支持。方法以炭疽芽孢杆菌pXO1质粒编码保护性抗原pagA基因为靶序列,优化微滴数字PCR方法的反应条件,建立实验室微环境中炭疽芽孢杆菌核酸定量方法;对比微滴式数字PCR方法和平板计数法的定量评估效果,分析ddPCR的灵敏性、特异性和重复性。结果建立的ddPCR方法最佳引物和探针终浓度分别为900nmol·L^(-1)和250nmol·L^(-1),最佳退火温度为60℃,最佳升降温速度为1℃/s,本方法的最低检测下限为1.12copies·μL^(-1),未发现与常见疫病存在交叉反应,重复性试验的变异系数小于5%。结论本研究中建立的炭疽芽孢杆菌的微滴数字PCR方法敏感性高、特异性强、重复性好,为疫情监测、流行病学调查和实验室污染微环境检测提供重要技术。展开更多
A型牛轮状病毒(BRV-A)是引起牛腹泻的重要病原之一,对养牛业危害最大。为建立一种针对BRV-A的快速、高通量、低成本检测方法,根据BRV-A的VP6基因保守区设计特异性引物,建立了检测BRV-A的SYBR Green I RT-qPCR方法。该方法对浓度梯度为4....A型牛轮状病毒(BRV-A)是引起牛腹泻的重要病原之一,对养牛业危害最大。为建立一种针对BRV-A的快速、高通量、低成本检测方法,根据BRV-A的VP6基因保守区设计特异性引物,建立了检测BRV-A的SYBR Green I RT-qPCR方法。该方法对浓度梯度为4.41×10^(8)~4.41×10^(2) copies/μL质粒标准品的扩增Ct值与拷贝数浓度呈良好的线性关系,熔解曲线为单峰;与其他引起牛腹泻的常见病原无交叉反应,最低检测限为4.41×10^(1) copies/μL,批内、批间重复性试验Ct值变异系数均低于1%;对临床粪便样品的阳性检出率高于地方标准中的PCR方法,且检测结果符合性较好。综上,本研究建立的BRV-A SYBR Green I RT-qPCR检测方法灵敏、特异、稳定,且操作简单、成本低,为临床样品的大规模BRV-A检测及其感染的早期诊断提供了技术支撑。展开更多
文摘【目的】早发性肌无力综合征(early onset muscle weakness syndrome,MW)是新近发现的一种荷斯坦牛遗传缺陷,患病犊牛表现为出生后趴卧不起、后肢肌肉萎缩等,其遗传机制与L型钙通道蛋白α1S亚基编码基因CACNA1S的单碱基突变相关。本研究旨在建立该遗传缺陷的分子检测方法,并探究其在国内荷斯坦牛群体中的扩散情况。【方法】基于MW致病位点特异性DNA序列,设计扩增阻滞突变系统-聚合酶链式反应(ARMS-PCR)检测引物,对317份荷斯坦牛冻精和毛囊样本进行MW遗传缺陷基因筛查,通过Sanger测序对ARMS-PCR检测结果进行验证,并利用系谱数据追溯MW突变源头。【结果】ARMS-PCR检出MW携带者21头,携带率为6.62%(21/317),未发现缺陷基因纯合子,提示该突变为隐性纯合致死。Sanger测序与ARMS-PCR所得基因型完全一致,证明该技术具有高度准确性。系谱追溯表明,MW携带者的遗传来源可追溯至1984年出生的荷斯坦公牛Southwind Bell of Bar-Lee。【结论】MW遗传缺陷已在中国荷斯坦牛群体中扩散且携带率较高,建议牧场应尽早开展MW遗传缺陷基因检测和风险评估,采取科学的选种选配措施以减少遗传缺陷导致的经济损失。
基金supported by the National Key Research and Development Program of China (2021YFC2301604)Guiding projects of Science and Technology Program in Fujian Province (2019D014).
文摘After the policy adjustment,China no longer carries out COVID-19 PCR testing for all people,and antigen testing has become the main way to detect and manage infectious sources.We developed a dynamic model to evaluate and compare the effects between PCR and antigen testing for controlling the pandemic.Due to the increase of contact degree,the peak reduction effect of PCR testing in population is lower than that of antigen testing.Even if it was only 20%of people isolated at home after antigen testing,the peak of the epidemic could be reduced by 9.46%.If the proportion of antigen testing is further increased to 80%,the peak of the pandemic can be reduced by 31.41%.Antigen testing performed better effects in school(reduction proportion 29.27%)and community(29.34%)than in workplace(27.75%).Therefore,we recommend that antigen testing in the popu-lation should be encouraged during the pandemic,and home isolation of infected persons should be advocated,especially in crowded places.To improve the availability of antigen,the testing proportion should be further enhanced.
文摘目的建立炭疽芽孢杆菌的微滴式数字聚合酶链式反应(Droplet digital PCR,ddPCR)方法对炭疽芽孢杆菌实验室活动污染的定量评估提供技术支持。方法以炭疽芽孢杆菌pXO1质粒编码保护性抗原pagA基因为靶序列,优化微滴数字PCR方法的反应条件,建立实验室微环境中炭疽芽孢杆菌核酸定量方法;对比微滴式数字PCR方法和平板计数法的定量评估效果,分析ddPCR的灵敏性、特异性和重复性。结果建立的ddPCR方法最佳引物和探针终浓度分别为900nmol·L^(-1)和250nmol·L^(-1),最佳退火温度为60℃,最佳升降温速度为1℃/s,本方法的最低检测下限为1.12copies·μL^(-1),未发现与常见疫病存在交叉反应,重复性试验的变异系数小于5%。结论本研究中建立的炭疽芽孢杆菌的微滴数字PCR方法敏感性高、特异性强、重复性好,为疫情监测、流行病学调查和实验室污染微环境检测提供重要技术。
文摘A型牛轮状病毒(BRV-A)是引起牛腹泻的重要病原之一,对养牛业危害最大。为建立一种针对BRV-A的快速、高通量、低成本检测方法,根据BRV-A的VP6基因保守区设计特异性引物,建立了检测BRV-A的SYBR Green I RT-qPCR方法。该方法对浓度梯度为4.41×10^(8)~4.41×10^(2) copies/μL质粒标准品的扩增Ct值与拷贝数浓度呈良好的线性关系,熔解曲线为单峰;与其他引起牛腹泻的常见病原无交叉反应,最低检测限为4.41×10^(1) copies/μL,批内、批间重复性试验Ct值变异系数均低于1%;对临床粪便样品的阳性检出率高于地方标准中的PCR方法,且检测结果符合性较好。综上,本研究建立的BRV-A SYBR Green I RT-qPCR检测方法灵敏、特异、稳定,且操作简单、成本低,为临床样品的大规模BRV-A检测及其感染的早期诊断提供了技术支撑。
