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牛副流感病毒3型Nano-PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 安瑞 侯冠欣 +6 位作者 孙欣艺 郭福强 刘小琛 段文龙 史秋梅 吴同垒 张志强 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第7期77-82,共6页
为了建立一种特异性强、敏感性高、成本相对较低的牛副流感病毒3型(Bovine parainfluenza virus type 3,BPIV3)检测方法,试验基于临床分离株BPIV3 HB-1具有高保守性的HN基因序列设计特异性检测引物,在PCR扩增体系中添加纳米金颗粒(25 nm... 为了建立一种特异性强、敏感性高、成本相对较低的牛副流感病毒3型(Bovine parainfluenza virus type 3,BPIV3)检测方法,试验基于临床分离株BPIV3 HB-1具有高保守性的HN基因序列设计特异性检测引物,在PCR扩增体系中添加纳米金颗粒(25 nmol/L),对纳米金颗粒粒径与剂量、退火温度、引物体积进行优化,建立了BPIV3 Nano-PCR检测方法,对该方法进行特异性和敏感性检测,并采用该方法对58份临床牛鼻腔拭子样本进行检测。结果表明:当10 nm的纳米金颗粒(25 nmol/L)剂量为0.8μL、退火温度为56℃、引物体积为2μL时,扩增效果最佳;采用该方法对可引发牛呼吸道疾病综合征(bovine respiratory disease complex, BRDC)的5种病毒病原体[BPIV3、牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus, BVDV)、牛呼吸道合胞体病毒(Bovine respiratory syncytial virus, BRSV)、牛传染性鼻气管炎病毒(Bovine infectious rhinotracheitis virus, IBRV)、牛冠状病毒(Bovine coronavirus, BCoV)]进行检测,仅BPIV3呈阳性,其他病毒均呈阴性;该方法能检测到的质粒最低拷贝浓度为2.1×10^(2) copies/μL,敏感性是普通PCR检测方法的100倍;该方法临床样本检测结果与实时荧光定量PCR检测方法检测结果的符合率为100%。说明本研究建立的BPIV3 Nano-PCR检测方法特异性强、敏感性高,可用于BPIV3感染初期的快速检测。 展开更多
关键词 牛副流感病毒3型 HN基因 牛呼吸道疾病综合征 Nano-pcr 检测方法
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PCR-SSP技术联合抗人球蛋白卡式法在ABO和RhD血型鉴定困难患者中的应用 被引量:1
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作者 向健 王晶 +1 位作者 王俊 田文武 《中南医学科学杂志》 2024年第6期972-975,共4页
目的探究聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术联合抗人球蛋白卡式法在ABO和RhD血型鉴定困难患者中的应用。方法选取118例ABO与RhD血型鉴定困难患者血型标本,分别应用PCR-SSP技术、抗人球蛋白卡式法分析患者血型情况。结果118例血... 目的探究聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术联合抗人球蛋白卡式法在ABO和RhD血型鉴定困难患者中的应用。方法选取118例ABO与RhD血型鉴定困难患者血型标本,分别应用PCR-SSP技术、抗人球蛋白卡式法分析患者血型情况。结果118例血型鉴定困难者采用抗人球蛋白卡式法联合PCR-SSP技术明确检出ABO血型113例,同时应用PCR-SSP可以确定ABO亚型,5例未检出血型的样品经PCR-SSP测序发现,基因分型分别为BO02、A205O01、A102B01、A201B01、B01B01,分别出现第7外显子640A>G杂合突变、第7外显子1009A>G杂合突变、第3外显子150G>C杂合突变、第6外显子240T>C、第7外显子431G>T杂合突变;采用抗人球蛋白卡式法联合PCR-SSP检出RhD血型114例,未检出的4例进行测序,1例显示为RhD weak D 779A/G突变;3例为RhD weak D type 4.0(包括602C/G、667T/G以及819G/A突变)。结论ABO和RhD血型鉴定困难患者应用PCR-SSP技术联合抗人球蛋白卡式法进行鉴定可以准确鉴定血型,并发现血型具体亚型,保证输血安全。 展开更多
关键词 pcr-SSP技术 抗人球蛋白卡式法 ABO血型 RHD血型 血型鉴定困难
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基于PCR-序列分析法检测浙江省汉族人群HLA-E基因多态性
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作者 董丽娜 何亿镇 +2 位作者 和艳敏 章伟 朱发明 《浙江医学》 CAS 2024年第24期2602-2606,共5页
目的建立并使用PCR-序列分析法分析浙江省汉族人群人类白细胞抗原-E(HLA-E)基因的多态性。方法随机选取2024年2至4月浙江省血液中心获捐的150例血小板献血者的外周血样本,抽提标本基因组DNA并采用PCR法扩增HLA-E基因全长序列,利用Sange... 目的建立并使用PCR-序列分析法分析浙江省汉族人群人类白细胞抗原-E(HLA-E)基因的多态性。方法随机选取2024年2至4月浙江省血液中心获捐的150例血小板献血者的外周血样本,抽提标本基因组DNA并采用PCR法扩增HLA-E基因全长序列,利用Sanger测序分析HLA-E基因的第2~4号外显子序列,采用Assign SBT v4.7.1专业软件确定HLA-E基因型。结果150例浙江省汉族人群外周血标本共检出4种HLA-E基因型,HLA-E*01:01,01:01、HLA-E*01:01,01:03、HLA-E*01:03,01:03、HLA-E*01:03,01:12基因型的频率分别为14.00%、51.33%、32.67%、2.00%;等位基因HLA-E*01:01、HLA-E*01:03、HLA-E*01:12的频率分别为39.67%、59.33%、1.00%。结论PCR-序列分析法以Sanger测序为基础,可实现HLA-E基因分型。浙江省汉族人群HLA-E基因高度保守,多态性较低,仅检出3种HLA-E等位基因。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原-E 基因分型 多态性 pcr-序列分析法
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鸽腺病毒通用型实时荧光PCR检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 陈璐 朱明慧 +8 位作者 丁雨 李阳 亓丽红 房立春 蒋文明 王静静 刘华雷 李建亮 于晓慧 《中国动物检疫》 CAS 2024年第3期89-95,共7页
鸽腺病毒(pigeon adenovirus,PiAdV)是影响鸽产业健康发展的重要病原之一。为实现PiAdV的高通量快速检测,根据GeneBank登录的PiAdV-A种和PiAdV-B种病毒pⅧ基因序列的共同保守区域设计特异性检测引物和探针,经反应条件优化,建立了一种Pi... 鸽腺病毒(pigeon adenovirus,PiAdV)是影响鸽产业健康发展的重要病原之一。为实现PiAdV的高通量快速检测,根据GeneBank登录的PiAdV-A种和PiAdV-B种病毒pⅧ基因序列的共同保守区域设计特异性检测引物和探针,经反应条件优化,建立了一种PiAdV通用型实时荧光PCR检测方法,并对该方法进行了特异性、敏感性、重复性试验。结果显示:该方法的最佳探针浓度为0.2μmol/L,与鸽群其他常见病毒无交叉反应,对PiAdV的最低检测限为56.9 copies/μL,比常规PCR敏感性高100倍,组内和组间重复变异系数均小于1.8%。利用该方法和常规PCR方法对20份疑似PiAdV感染样品进行检测,发现PiAdV通用型实时荧光PCR检测方法的病毒阳性检出率高于常规PCR方法。结果表明,本研究建立的PiAdV通用型实时荧光PCR检测方法特异性强、敏感性高、可靠性好,可用于PiAdV感染的临床检测及流行病学调查。 展开更多
关键词 鸽腺病毒 通用型 实时荧光pcr 检测方法
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O型口蹄疫病毒和塞内卡病毒双重荧光定量RT-PCR检测方法的建立 被引量:10
5
作者 张展 陈信全 +2 位作者 冯国金 黄慧贤 利光辉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期601-607,共7页
为建立O型口蹄疫病毒(FMDV-O)和塞内卡病毒(SVV)快速鉴别检测方法,本实验根据FMDV-O VP2基因序列和SVV P3基因序列,采用Primer Express3.0软件分别设计引物与探针,并经各反应条件的优化初步建立了可同时鉴别检测FMDV-O和SVV的双重荧光定... 为建立O型口蹄疫病毒(FMDV-O)和塞内卡病毒(SVV)快速鉴别检测方法,本实验根据FMDV-O VP2基因序列和SVV P3基因序列,采用Primer Express3.0软件分别设计引物与探针,并经各反应条件的优化初步建立了可同时鉴别检测FMDV-O和SVV的双重荧光定量RT-PCR方法。利用该方法检测临床常见猪病毒,结果显示可同时检测出FMDV-O和SVV核酸,且与猪水泡性口炎病毒(VSV)、猪水疱病毒(SVDV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪细小病毒(PPV)、A型口蹄疫病毒(FMDV-A)、A-1型口蹄疫病毒(FMDVA-1)核酸均无交叉反应,并可检测到FMDV-O PanAsia株、cathay株、Ind-2001株和Mya-98株等主要流行株,特异性强;该方法对含FMDV-O和SVV拼接质粒标准品的最低检测限为7.17×10^(2)拷贝/μL,敏感性高;利用该方法检测了同一时间和不同时间提取的3种不同浓度的质粒标准品,结果显示批内和批间重复性试验Ct值的变异系数均小于3%,重复性好。利用本实验所建立的方法对30份临床样品进行检测,结果与各病毒单一荧光定量RT-PCR检测结果一致。本研究建立的FMDV-O和SVV双重荧光定量RT-PCR方法能够快速准确的鉴别检测FMDV-O和SVV,为口岸检疫的快速通关提供了技术手段。 展开更多
关键词 O型口蹄疫病毒 塞内卡病毒 双重RT-qpcr方法 P3基因 VP2基因
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大肠杆菌ERIC-PCR分子分型方法的建立及其初步应用 被引量:13
6
作者 张辉 杨振泉 +2 位作者 赵隽 魏瑞成 王冉 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第5期1098-1103,共6页
为建立高效、敏感的肠杆菌科基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)的分子分型方法,该研究提取大肠杆菌基因组DNA,以此为模板建立和优化ERIC-PCR分型体系,并采用ERIC-PCR方法对62株大肠杆菌进行分子分型和遗传相似性统计分析。结果显示从... 为建立高效、敏感的肠杆菌科基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)的分子分型方法,该研究提取大肠杆菌基因组DNA,以此为模板建立和优化ERIC-PCR分型体系,并采用ERIC-PCR方法对62株大肠杆菌进行分子分型和遗传相似性统计分析。结果显示从提取的大肠杆菌基因组中能够扩增到2~8条DNA片段,且大部分片段在100 bp至2 000 bp之间。通过4因素3水平正交试验,建立了较为稳定的ERIC-PCR分型方法。利用ERIC-PCR方法可将62株菌分为20型,其中以A型为优势菌群。遗传相似性结果表明,各菌株之间遗传相似性有较大的变化,但部分菌株高度同源。聚类分析表明,ERIC-PCR的分辨率系数为0.937,具有较高的分辨能力。表明应用ERIC-PCR分型技术在分子水平上对大肠杆菌进行鉴别和分型,具有简便和分辨力高等优点,能够对病原进行溯源分析,在大肠杆菌的分子流行病学研究中具有广泛的应用前景。 展开更多
关键词 大肠杆菌 ERIC-pcr 分子分型
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猪IL-4、IL-6和IL-10 SYBR Green Ⅰ real-time PCR检测方法的建立及应用 被引量:11
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作者 施开创 李焕荣 +2 位作者 杨汉春 郭鑫 盖新娜 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期102-107,共6页
为探讨PRRSV感染后机体的体液免疫应答、从分子水平深入研究PRRSV的免疫机制,本研究针对Th2型细胞因子IL-4、IL-6、IL-10以及看家基因β-actin的基因序列分别设计一对特异性引物,构建含有各自引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建... 为探讨PRRSV感染后机体的体液免疫应答、从分子水平深入研究PRRSV的免疫机制,本研究针对Th2型细胞因子IL-4、IL-6、IL-10以及看家基因β-actin的基因序列分别设计一对特异性引物,构建含有各自引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测IL-4、IL-6、IL-10及β-actin的SYBR Green Ⅰ real-time PCR方法。该方法线性关系好,各种细胞因子及β-actin标准曲线的相关系数均达到0.997以上;敏感性高,初始模板的检出下限均达到1×101copies/μL;特异性强,扩增产物形成单一的特异性熔解峰;重复性好,组内与组间的变异系数均小于3%。应用所建立的方法对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染仔猪外周血单个核细胞(PBMC)中IL-4、IL-6和IL-10mRNA的表达水平进行了检测。结果表明,本研究建立的real-timePCR检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好,可以用于猪Th2型细胞因子的检测及定量分析。 展开更多
关键词 TH2型细胞因子 荧光定量pcr 检测方法
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绵羊IFN-γ和IL-2基因SYBR GreenⅠreal-time PCR检测方法的建立及应用 被引量:5
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作者 张冰冰 赵魁 +6 位作者 宋德光 臧德跃 王栋 贺文琦 陈克研 王改丽 高丰 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1146-1150,共5页
为探讨传染性脓疱病毒感染后机体的细胞免疫应答,从分子水平对传染性脓疱病毒的免疫机制进行了深入探讨。首先针对Th1型细胞因子IFN-γ、IL-2以及管家基因GAPDH的mRNA序列分别设计了1对特异性引物,扩增相应的基因片段并构建含有相应基... 为探讨传染性脓疱病毒感染后机体的细胞免疫应答,从分子水平对传染性脓疱病毒的免疫机制进行了深入探讨。首先针对Th1型细胞因子IFN-γ、IL-2以及管家基因GAPDH的mRNA序列分别设计了1对特异性引物,扩增相应的基因片段并构建含有相应基因序列的重组质粒,以所构建的重组质粒作为阳性标准品,建立了用于IFN-γ、IL-2及GAPDH检测的SYBR GreenⅠreal-time PCR方法。该方法线性关系良好,IFN-γ、IL-2和GAPDH标准曲线的相关系数均达0.99以上;敏感性高,初始模板的检出下限均达1×103copies/μL;特异性强,扩增产物形成单一的特异性融解峰;重复性好,组内与组间的变异系数均小于3%。应用该方法对传染性脓疱病毒感染羔羊外周血白细胞中的IFN-γ、IL-2 mRNA的表达水平进行了检测。结果表明,建立的real-time PCR检测方法具有灵敏度高、特异性强、重复性好等优点,可用于绵羊Th1型细胞因子的检测及定量分析。 展开更多
关键词 羔羊 TH1型细胞因子 荧光定量聚合酶链反应 检测方法
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猪圆环病毒2型不对称PCR检测方法的建立 被引量:4
9
作者 杨泽晓 韩雪清 +4 位作者 王印 姚学萍 杨增岐 张彦明 汪开毓 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2011年第2期1-5,共5页
为研究制备单链DNA的方法,根据GenBank已发表的PCV-2全基因组序列,设计合成2条特异性引物和1条通用引物,通过pGM-T-PCV-2重组质粒的构建、引物浓度优化、单链PCR产物的杂交测序鉴定,以及敏感性和特异性试验,对PCV-2不对称PCR方法进行了... 为研究制备单链DNA的方法,根据GenBank已发表的PCV-2全基因组序列,设计合成2条特异性引物和1条通用引物,通过pGM-T-PCV-2重组质粒的构建、引物浓度优化、单链PCR产物的杂交测序鉴定,以及敏感性和特异性试验,对PCV-2不对称PCR方法进行了研究。结果显示,上、下游引物用量比为20∶1~40∶1时,可明显扩增出457 bp大小的单链和双链特异性目的片段,不对称PCR敏感性和对称PCR相一致,CSFV、PRV、PPV核酸扩增均为阴性,具有良好的特异性和敏感性。PCV-2不对称PCR方法的建立,为基因芯片制备的相关研究奠定了基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 不对称pcr 方法建立
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猪圆环病毒3型PCR检测方法的建立与Cap基因序列分析 被引量:5
10
作者 朱小甫 吴旭锦 +3 位作者 熊忙利 张文娟 尹宝英 邢蕾 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2022年第1期84-90,共7页
建立一种检测PCV3流行毒株感染的PCR方法,并分析Cap基因序列变异情况,为PCV3流行病学调查提供技术支持。根据GenBank中公开的PCV3全基因序列,分别设计了质粒构建引物和检测引物,通过构建阳性质粒、灵敏度试验、特异性试验、临床样品检... 建立一种检测PCV3流行毒株感染的PCR方法,并分析Cap基因序列变异情况,为PCV3流行病学调查提供技术支持。根据GenBank中公开的PCV3全基因序列,分别设计了质粒构建引物和检测引物,通过构建阳性质粒、灵敏度试验、特异性试验、临床样品检测试验以及测序分析,建立PCR检测方法。结果显示:建立的PCR方法检测的极限为50 copies/μL,以PRRSV、CSFV、PEDV、PRV、PPV、PCV-2的cDNA/DNA作为模板,用该方法扩增结果均为阴性,表明建立的方法特异性良好;应用该方法检测了285份样品,阳性39份,阳性率为13.7%。Cap基因序列分析显示,20株比对序列核苷酸同源性为87.1%~100%,SXSL1702与SXXA1812同源性为87.1%,在基因进化树中SXSL1702单独构成一个分支,提示SXSL1702株Cap基因与其他毒株有较大差异。成功建立了检测PCV3感染的PCR方法,为进一步流行病学调查和生物学特性研究奠定了基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 pcr检测方法 流行病学 Cap基因 序列分析
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鸭腺病毒3型Hexon基因的克隆及SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法的建立 被引量:4
11
作者 陈翠腾 万春和 +6 位作者 程龙飞 傅光华 施少华 刘荣昌 陈珍 朱春华 黄瑜 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1104-1112,共9页
鸭腺病毒3型(duck adenovirus type 3,DAdV-3)是近年来我国新发鸭源禽腺病毒。本试验根据NCBI数据库中DAdV-3 Hexon基因特征,设计特异性引物,获得番鸭源DAdV-3福建株(命名为W1FJ株)Hexon基因全长,明确其分子特征,并基于此建立检测DAdV-3... 鸭腺病毒3型(duck adenovirus type 3,DAdV-3)是近年来我国新发鸭源禽腺病毒。本试验根据NCBI数据库中DAdV-3 Hexon基因特征,设计特异性引物,获得番鸭源DAdV-3福建株(命名为W1FJ株)Hexon基因全长,明确其分子特征,并基于此建立检测DAdV-3的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。结果表明,克隆的W1FJ株Hexon基因全长为2 814 bp,编码937个氨基酸,和DAdV-3(CH-GD-12-2014株)核苷酸同源性为100%,但和鸭源禽腺病毒B型(也称鸭腺病毒2型,DAdV-2,GR株)核苷酸同源性仅为76.6%。Hexon蛋白遗传进化分析表明,W1FJ株和CH-GD-12-2014株在遗传进化上形成一个独立的分支,与鸭源禽腺病毒B型和鹅源禽腺病毒A型(goose aviadenovirus A)在遗传进化上明显不同,建议将其命名为鸭源禽腺病毒C型(duck aviadenovirus C)。建立的检测DAdV-3的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法,灵敏度高,最低检测限为61拷贝/μL;特异性强,和鸭群常见传染病病原均无交叉反应,扩增产物的熔解曲线只出现1个特异性单峰,Tm值为(81.48±0.25)℃;重复性好,组内和组间重复试验变异系数分别为0.49%~1.64%和0.67%~2.40%。本试验为DAdV-3的科学分类和后续开展DAdV-3感染的流行病学调查及致病机理研究奠定基础。 展开更多
关键词 鸭腺病毒3型 Hexon基因 SYBR GreenⅠ实时荧光定量pcr方法
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禽流感病毒通用型及H5亚型套式荧光RT-PCR检测方法研究 被引量:4
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作者 杨素 廖秀云 +4 位作者 廖明 沙才华 徐海聂 曹伟胜 陈伟生 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第3期165-171,共7页
将套式PCR与荧光RT-PCR技术相结合,叠加这两种技术在敏感性和特异性方面的优势,建立敏感性高于常规荧光RT-PCR的套式荧光RT-PCR检测方法。从GenBank下载禽流感病毒NP基因和HA基因序列,通过比对选取较为保守的片段,设计AIV通用型及H5亚... 将套式PCR与荧光RT-PCR技术相结合,叠加这两种技术在敏感性和特异性方面的优势,建立敏感性高于常规荧光RT-PCR的套式荧光RT-PCR检测方法。从GenBank下载禽流感病毒NP基因和HA基因序列,通过比对选取较为保守的片段,设计AIV通用型及H5亚型套式荧光RT-PCR引物和TaqMan探针;利用体外转录技术制备阳性对照,构建目的片段重组质粒;经反应体系和反应条件的优化,建立套式荧光RT-PCR检测方法。试验结果表明,该方法可特异性地检测禽流感病毒及H5亚型AIV,在30份鱼类养殖水样中检测到19份阳性样品,具有较高的敏感性和良好的特异性;具有高通量、快速的特点,可对大批量样品同时进行检测,试验耗时仅需5h,是自然环境样品中极微量禽流感病毒检测的好方法。 展开更多
关键词 禽流感病毒 通用型 H5亚型 套式荧光RT—pcr 检测方法
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猪圆环病毒3型套式PCR检测方法的建立及应用 被引量:5
13
作者 杨永宁 任宜家 申禄昌 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第2期60-62,65,共4页
为了建立一种准确、快速检测猪圆环病毒3型(PCV-3)的方法,试验根据GenBank中PCV-3基因序列设计合成了内、外两对引物,建立了套式PCR方法,并检验了该方法的特异性、敏感性、重复性,同时用该方法对124份临床疑似病料进行检测。结果表明:... 为了建立一种准确、快速检测猪圆环病毒3型(PCV-3)的方法,试验根据GenBank中PCV-3基因序列设计合成了内、外两对引物,建立了套式PCR方法,并检验了该方法的特异性、敏感性、重复性,同时用该方法对124份临床疑似病料进行检测。结果表明:用建立的套式PCR方法检测PCV-2、PRV、PPV、PRRSV、CSFV、TGEV、PEDV,均为阴性,外引物PCR扩增的检测灵敏度为17 ng DNA,内引物PCR扩增的检测灵敏度为0. 17 ng DNA。用该方法检测124份临床病料样品,外引物共检测出阳性样品22份,内引物共检测出阳性样品28份,青海省部分地区PCV-3的感染率达22. 58%(28/124)。说明该套式PCR具有良好的特异性、敏感性、重复性和临床适用性,可以用于临床病料中低含量PCV-3的快速检测。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 套式pcr 检测方法 特异性 敏感性 应用
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多重实时PCR用于高危型人乳头瘤病毒感染检测的价值 被引量:6
14
作者 陈海雁 刘红军 +1 位作者 罗锦彬 徐伟帆 《国际检验医学杂志》 CAS 2013年第11期1395-1396,共2页
目的探讨多重实时PCR技术的应用对高危型人乳头瘤病毒感染检测的临床意义。方法选择疑似HPV感染和宫颈病变的病例178例,分别应用多重实时PCR检测法与HC2检测法检测高危型HPV及其亚型的感染情况。结果多重实时PCR检测法与HC2检测法用于... 目的探讨多重实时PCR技术的应用对高危型人乳头瘤病毒感染检测的临床意义。方法选择疑似HPV感染和宫颈病变的病例178例,分别应用多重实时PCR检测法与HC2检测法检测高危型HPV及其亚型的感染情况。结果多重实时PCR检测法与HC2检测法用于高危型HPV的检测,差异无统计学意义(P>0.05),表明两种检测方法在检测效能上相近;两种检测方法中,低度鳞状上皮内病变(LSIL)、高度鳞状上皮内病变(HSIL)与鳞状细胞癌的阳性率均高于宫颈炎与湿疣,差异有统计学意义(P<0.05)。结论多重实时PCR法适用于大规模筛查和高危型HPV持续感染的监测。 展开更多
关键词 多重实时pcr HC2法 高危型人乳头瘤病毒 宫颈癌
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实时荧光定量PCR技术的实验研究 被引量:20
15
作者 袁继红 《现代农业科技》 2010年第13期20-22,共3页
实时荧光定量PCR技术是在普通PCR定性技术基础上发展起来的核酸定量技术,已广泛应用于不同研究领域。论述了荧光定量PCR技术的基本原理、主要类型和定量实验方法,探讨了实验条件的控制、影响因素和优化实验结果的方法。
关键词 荧光定量pcr技术 原理 主要类型 定量方法 优化
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PCV4 PCR检测方法的建立及河南地区PCV4的遗传进化分析 被引量:19
16
作者 田润博 徐通 +4 位作者 侯承尧 赵宇 郑兰兰 刘芳 陈红英 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期54-59,共6页
猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国湖南省患有猪呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征的猪群中首次发现。为进一步了解该病毒在河南地区的流行和遗传演化情况,本研究根据GenBank中PCV4 Cap基因序列,设计了1对特异性引物,经反应条件优化,... 猪圆环病毒4型(PCV4)于2019年在我国湖南省患有猪呼吸道疾病、腹泻及皮炎肾病综合征的猪群中首次发现。为进一步了解该病毒在河南地区的流行和遗传演化情况,本研究根据GenBank中PCV4 Cap基因序列,设计了1对特异性引物,经反应条件优化,建立了检测PCV4的PCR方法。特异性试验结果显示,该方法仅对PCV4能扩增出约400 bp的目的条带,对PCV2、PCV3、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪伪狂犬病病毒、猪流行性腹泻病毒、猪细小病毒、猪瘟病毒、大肠杆菌、沙门氏菌及阴性对照均无该目的条带;对PCV4质粒标准品的检测限为54.8拷贝/μL;对来自不同地区的3份PCV4肺组织样品DNA于不同时间分别重复扩增3次,结果一致且均为阳性。表明该PCR方法具有良好的特异性,敏感性和重复性。采用该方法对河南省部分地区16个猪场137份组织样品进行检测,结果显示,PCV4阳性率为13.87%(19/137),有7个地区为PCV4阳性,且猪场阳性率为43.75%(7/16),表明PCV4已在河南地区流行。对PCV4的部分Cap基因进行克隆、测序及遗传进化分析。结果显示,成功克隆2份PCV4阳性样品的部分Cap基因(命名为XX和LY),与GenBank中PCV4参考株(PCV4 HNU-AHZ-2019)相应基因的同源性分别为99.2%和98.4%。Cap基因的系统发育分析显示,XX和LY与PCV4 HNU-AHZ-2019株相应基因同属于一个独特的分支,而与其他圆环病毒属相应基因处于不同的分支,表明XX和LY与PCV4 HNU-AHZ-2019株相应基因亲缘关系较近。本研究为PCV4感染的早期监测和该病的防控提供了有力的技术支持。 展开更多
关键词 猪圆环病毒4型 pcr 检测方法 遗传进化分析
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猪圆环病毒3型PCR诊断方法的建立 被引量:6
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作者 郑庆礼 李春燕 +2 位作者 林在纲 许丽惠 王全溪 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1517-1521,共5页
根据NCBI中PCV3的基因组序列,设计了1对特异性引物,并对PCR的反应体系和反应条件进行优化,同时进行特异性和敏感性试验,最后应用所建立的PCR方法检测了临床送检的22份病料。结果显示,建立的PCR方法的最佳反应条件为总体积25 L,退火温度5... 根据NCBI中PCV3的基因组序列,设计了1对特异性引物,并对PCR的反应体系和反应条件进行优化,同时进行特异性和敏感性试验,最后应用所建立的PCR方法检测了临床送检的22份病料。结果显示,建立的PCR方法的最佳反应条件为总体积25 L,退火温度56℃,模板DNA量3 L(l ng/m L),进行35个循环。该PCR能特异地扩增出目的片段,长度约为381 bp。测序结果表明,PCR扩增产物正确。该PCR反应特异性强,只能扩增PCV3阳性样品,且能扩增的最低模板量为1×10-4ng/m L。用该PCR对送检的22份病料进行PCV3检测,结果阳性率为13.6%。可见,本研究建立的PCR方法特异、敏感,可用于PCV3的快速检测。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 聚合酶链式反应 诊断方法
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猪流行性腹泻病毒G1/G2型RT-PCR鉴别诊断方法的建立及应用 被引量:3
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作者 王若木 孙连静 +6 位作者 赵硕 钟莲 袁婷婷 陈樱 韦祖樟 黄伟坚 欧阳康 《动物医学进展》 北大核心 2020年第6期38-41,共4页
为建立一种快速鉴别猪流行性腹泻病毒(PEDV)G1型/G2型感染的RT-PCR方法,基于PEDV的S基因和E基因序列分别设计了PEDV的分型引物和鉴别引物,经过敏感性试验、重复性试验等一系列反应条件的优化,成功建立了鉴别PEDV G1/G2型感染的双重RT-PC... 为建立一种快速鉴别猪流行性腹泻病毒(PEDV)G1型/G2型感染的RT-PCR方法,基于PEDV的S基因和E基因序列分别设计了PEDV的分型引物和鉴别引物,经过敏感性试验、重复性试验等一系列反应条件的优化,成功建立了鉴别PEDV G1/G2型感染的双重RT-PCR方法;通过目的片段的数量来判断PEDV的感染类型,其中,PEDV G1型感染可扩增得到一条目的片段(249 bp),G2型感染扩增得到两条目的片段(840 bp和249 bp)。利用该方法对采自广西不同地区的92份临床样品进行检测,结果显示,阳性样品55份,其中,G2型样品53份,G1型样品2份。结果表明该方法操作简易,具有良好的敏感性和特异性,能快速鉴别PEDV G1/G2型的感染。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 G1型 G2型 反转录-聚合酶链反应 鉴别方法
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猪圆环病毒3型和4型TaqMan双重实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 殷冬冬 王洁茹 +7 位作者 尹磊 沈学怀 戴银 赵瑞宏 侯宏艳 胡晓苗 王桂军 潘孝成 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第6期979-984,共6页
为了建立一种快速检测猪圆环病毒3型(PCV3)和4型(PCV4)的TaqMan双重实时荧光定量PCR检测方法,根据Gen Bank已登录的PCV3和PCV4基因保守序列设计特异性引物和TaqMan探针,经优化各反应条件,构建标准曲线,分析其敏感性、特异性和重复性,并... 为了建立一种快速检测猪圆环病毒3型(PCV3)和4型(PCV4)的TaqMan双重实时荧光定量PCR检测方法,根据Gen Bank已登录的PCV3和PCV4基因保守序列设计特异性引物和TaqMan探针,经优化各反应条件,构建标准曲线,分析其敏感性、特异性和重复性,并利用建立的荧光定量PCR方法对采自安徽省的临床样品进行检测,与普通PCR方法进行一致性评价。结果显示,PCV3的标准曲线为Y=–3.534 6 logX+41.11(R^(2)=1.00),PCV4的标准曲线为Y=–3.382 5 logX+40.67(R^(2)=1.00)。PCV3和PCV4的检测限分别为49.5和27.1 copies·μL^(-1)。对猪圆环病毒1型(PCV1)和2型(PCV2)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪瘟病毒(CSFV)、伪狂犬病毒(PRV)及猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)无特异性扩增,组内和组间变异系数均<1%。临床样品检测结果显示,PCV3阳性检出率为40.8%,PCV4阳性检出率为20.4%,混合感染率为19.0%。建立了灵敏、特异,可同时快速、准确鉴别PCV3和PCV4的TaqMan双重实时荧光定量PCR检测方法,为PCV3和PCV4的检测和监测提供技术支撑。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3型 猪圆环病毒4型 TAQMAN 实时荧光定量pcr
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猪伪狂犬病病毒野毒和猪圆环病毒3型双重PCR检测方法的建立 被引量:5
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作者 赵宇 崔建涛 +4 位作者 田润博 韩昊莹 郑慧华 刘芳 陈红英 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期9-13,共5页
为了能够同时检测和鉴别猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)和猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)。本研究参考GenBank中公布的PRV gE基因和PCV3基因组序列,且基于PRV gE和PCV3 Rep基因的保守区域,利用Primer 5.0引物... 为了能够同时检测和鉴别猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)和猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)。本研究参考GenBank中公布的PRV gE基因和PCV3基因组序列,且基于PRV gE和PCV3 Rep基因的保守区域,利用Primer 5.0引物设计软件设计了2对特异性引物,随后对其扩增条件进行优化,建立了能够同时检测PRV和PCV3的双重PCR检测方法。该方法可以同时扩增PRV的429 bp和PCV3的344 bp特异性片段,而对猪圆环病毒2型、猪细小病毒、猪瘟病毒、猪繁殖障碍与呼吸综合征病毒、猪流行性腹泻病毒基因组扩增结果均为阴性。PRV和PCV3的最低检测值分别为502.0和91.2 copies/μL。结果表明该方法具有良好的特异性和灵敏性。本试验建立了能够同时快速检测PRV和PCV3,且具有高度特异性和灵敏性的双重PCR检测方法,为PRV和PCV3的检测提供技术支持。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒 猪圆环病毒3型 双重pcr检测方法
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