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暗纹东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交F_(1)代的荧光PCR鉴定技术的建立
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作者 赵昕 车帅 +4 位作者 王焕 孙侦龙 尤颖哲 柳淑芳 庄志猛 《渔业科学进展》 北大核心 2026年第1期37-47,共11页
暗纹东方鲀(Takifugu obscurus♀)×红鳍东方鲀(T.rubripes♂)的杂交F_(1)代具备双亲诸多优良性状,市场前景较好。但杂交F_(1)代的形态特征与其亲本难以区分,为河鲀种质资源保护和开发利用带来了困扰,迫切需要开发有效的分子鉴定方... 暗纹东方鲀(Takifugu obscurus♀)×红鳍东方鲀(T.rubripes♂)的杂交F_(1)代具备双亲诸多优良性状,市场前景较好。但杂交F_(1)代的形态特征与其亲本难以区分,为河鲀种质资源保护和开发利用带来了困扰,迫切需要开发有效的分子鉴定方法对杂交F_(1)代及其亲本进行精准判别。为实现杂交F_(1)代及其亲本的快速准确鉴定,本研究根据核基因SH3PX3多态性SNP位点,设计荧光PCR扩增引物及探针,优化了荧光PCR参数,建立了暗纹东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交F_(1)代的荧光PCR鉴定方法,并对该方法进行了验证。结果显示:杂交F_(1)代的COI序列与母本暗纹东方鲀的序列相似度为100%,在NJ进化树中聚为一支,无法实现杂交F_(1)代和母本的区分;SH3PX3基因荧光PCR体系最佳退火温度为48℃;荧光PCR扩增后,暗纹东方鲀仅FAM通道有Ct值,ΔCt值大于20,红鳍东方鲀FAM信号通道比HEX通道的Ct值高2~5,杂交F_(1)代的FAM通道与HEX通道的Ct值接近,二者之差小于2;基于上述方法对17份暗纹东方鲀、21份红鳍东方鲀和53份杂交F_(1)代样品进行验证,鉴定准确率为100%。本研究建立的荧光PCR鉴定方法不仅具有结果准确、易判读等优点,还避免了测序等繁琐流程,可实现高通量检测,显著提高了检测效率,为河鲀种质资源鉴定与保护、杂交育种和遗传多样性研究提供了技术支持。 展开更多
关键词 暗纹东方鲀 红鳍东方鲀 杂交F_(1)代 SH3PX3基因 荧光pcr 物种鉴定
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猫疱疹病毒Ⅰ型SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测方法的建立及应用
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作者 刘雅雯 赵广荣 +9 位作者 许丽文 孙亚杰 李双双 刘佳佳 李智杰 张成琪 符建海 张子闯 胡博 白雪 《畜牧与兽医》 北大核心 2026年第1期79-84,共6页
猫疱疹病毒I型(FHV-1)是威胁猫科动物健康的重要传染性疾病,本研究旨在研发一种灵敏、高效的FHV-1检测技术。依据GenBank上FHV-1 US6保守区域的基因序列,设计合成1对针对FHV-1 gD基因的引物,建立了一种SYBR Green I荧光定量PCR的检测方... 猫疱疹病毒I型(FHV-1)是威胁猫科动物健康的重要传染性疾病,本研究旨在研发一种灵敏、高效的FHV-1检测技术。依据GenBank上FHV-1 US6保守区域的基因序列,设计合成1对针对FHV-1 gD基因的引物,建立了一种SYBR Green I荧光定量PCR的检测方法,构建标准曲线后分别验证该方法的特异性、敏感性、重复性,并将其进一步应用于人工感染猫产生的临床样本检测。结果:该特异性引物与猫杯状病毒(FCV)、猫细小病毒(FPV)和猫冠状病毒(FCoV)均未出现交叉反应,检测下限为14.78 copies/μL,组内和组间重复试验的变异系数均低于2%;该方法对临床样本的检出率比常规PCR高出25.46%;通过该方法检测人工感染FHV-1强毒后猫的每日排毒量,结果呈现上升趋势,与临床发病程度相符,猫的脏器病毒载量存在个体差异,但集中在心脏、肺脏、肠道和膀胱中检出。综上,该研究建立的SYBR Green I荧光定量PCR方法对FHV-1具有较好的特异性、灵敏度和重复性,为FHV-1感染的快速诊断以及疾病的防控提供方法支持。 展开更多
关键词 猫疱疹病毒Ⅰ型 荧光定量pcr SYBR GreenⅠ US6基因 猫病毒性鼻气管炎
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荧光定量PCR检测珍珠鸡Tva与ALV-A gp85基因方法的建立及应用
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作者 宁宇航 李喜月 +7 位作者 王扬扬 马晨曦 李鑫鹏 荣晴 何雷 余祖华 丁轲 陈建 《中国家禽》 北大核心 2026年第1期70-78,共9页
研究旨在探讨体内水平下珍珠鸡各组织器官中A亚群禽白血病病毒(ALV-A)组织载量与维生素_(B12)(V_(B12))的含量、Tva基因转录水平之间的关系。试验通过建立检测珍珠鸡ALV-A gp85和Tva基因的荧光定量PCR方法,定量感染ALV-A的珍珠鸡不同组... 研究旨在探讨体内水平下珍珠鸡各组织器官中A亚群禽白血病病毒(ALV-A)组织载量与维生素_(B12)(V_(B12))的含量、Tva基因转录水平之间的关系。试验通过建立检测珍珠鸡ALV-A gp85和Tva基因的荧光定量PCR方法,定量感染ALV-A的珍珠鸡不同组织中ALV-A gp85基因和Tva基因表达水平,并通过ELISA测定珍珠鸡组织中V_(B12)浓度,分析ALV-A gp85表达水平与V_(B12)组织含量和Tva基因表达水平之间的关系。结果显示:研究建立的珍珠鸡Tva基因荧光定量PCR方法灵敏度较常规PCR提升1个数量级(10倍),ALV-A gp85基因检测灵敏度提高2个数量级(100倍),仅靶基因出现特异性扩增且批内及批间变异系数均小于2%,血浆样本ALV-A阳性检出率明显高于PCR和ELISA方法,具有良好的灵敏度、特异性和稳定性。皮尔逊相关性分析显示,珍珠鸡组织器官中V_(B12)浓度与ALV-A gp85转录水平均呈负相关,而ALV-A gp85与Tva基因转录水平整体上符合正相关关系,推测V_(B12)可能通过占据Tva受体干扰ALV-A感染宿主细胞。研究表明,试验成功建立一种定量检测珍珠鸡ALV-A gp85基因和Tva基因的方法,并确定珍珠鸡中V_(B12)组织含量与ALV-A组织载量以及Tva基因表达水平之间的关系,为禽白血病的防控奠定基础。 展开更多
关键词 A亚群禽白血病病毒 TVA gp85 QRT-pcr 珍珠鸡 维生素B_(12)
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3种食源性致病菌SDS-PMA-mRT-qPCR检测方法建立及其在乳品中的应用
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作者 刘霈霖 匙辰鹏 +1 位作者 王雁伟 艾鹏飞 《食品工业科技》 北大核心 2026年第1期311-317,共7页
本研究利用十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)联合叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)预处理样品后,采用多重实时荧光定量PCR(multiple real-time quantitative polymerase chain reaction,m RTqPCR)方法快速、准确检测... 本研究利用十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)联合叠氮溴化丙锭(propidium monoazide,PMA)预处理样品后,采用多重实时荧光定量PCR(multiple real-time quantitative polymerase chain reaction,m RTqPCR)方法快速、准确检测乳制品中沙门氏菌、单增李斯特菌和产志贺毒素大肠埃希氏菌3种食源性致病菌。通过对沙门氏菌中的invA基因、单增李斯特菌中的hly基因和产志贺毒素大肠埃希氏菌中的stx基因的保守序列分别设计特异性引物和探针,建立mRT-qPCR反应体系,探讨PMA预处理消除由死菌造成的检测的假阳性结果,并对检测的特异性、检出限、稳定性以及模拟样品中的检测效果进行了研究。结果表明,PMA结合SDS的预处理能有效排除死菌对mRT-qPCR检测结果的干扰,最佳PMA浓度为20μmol/L;建立的mRT-qPCR方法特异性强,在18株非目标菌的干扰下仅对3种目标菌进行特异性扩增;灵敏度高,3种目标菌的检出限均为10^(2) CFU/mL;稳定性好,不同批次内和批次间的重复性检测的变异系数均小于1%;对不同污染乳品的检测结果与国家标准中的培养法一致,检测周期约7 h。本研究建立的SDS-PMA-mRT-qPCR方法可以实现对沙门氏菌、单增李斯特菌和产志贺毒素大肠埃希氏菌的快速检测,为乳品安全提供技术支持。 展开更多
关键词 多重实时荧光定量pcr(mRT-qpcr) 叠氮溴化丙锭 沙门氏菌 单增李斯特菌 产志贺毒素大肠埃希氏菌
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沙生蜡菊qRT-PCR内参基因筛选与验证
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作者 刘欣欣 赖成霞 +1 位作者 谷玉风 葛风伟 《新疆师范大学学报(自然科学版)》 2026年第1期74-82,共9页
从沙生蜡菊转录组数据中选择5个管家基因(ACT1、ACT7、CYP、HIS、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR检测候选内参基因在沙生蜡菊不同组织和冻害胁迫下的表达水平,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其稳定性进行评估,筛... 从沙生蜡菊转录组数据中选择5个管家基因(ACT1、ACT7、CYP、HIS、TUB)作为候选内参基因,使用qRT-PCR检测候选内参基因在沙生蜡菊不同组织和冻害胁迫下的表达水平,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder对其稳定性进行评估,筛选合适内参基因。以沙生蜡菊HaWRKY基因作为靶标基因,验证内参基因稳定性。结果表明,HaCYP和HaHIS在沙生蜡菊组织中稳定表达;HaHIS在冻害胁迫后稳定表达;综上所述,HaHIS可作为沙生蜡菊内参基因。本研究获得沙生蜡菊合适内参基因,为沙生蜡菊基因表达分析提供了可靠的技术支持,同时为深入研究其响应冻害分子机制和次生代谢调控奠定了基础。 展开更多
关键词 沙生蜡菊 内参基因 QRT-pcr 基因表达分析
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基于超星学习通的生物技术制药课程PCR专题BOPPPS教学实践
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作者 刘广娜 王晓岩 杨松 《安徽农学通报》 2026年第1期118-121,共4页
为解决生物技术制药课程中PCR技术原理复杂、操作精细导致的教学难题,本文将BOPPPS教学法与超星学习通平台深度融合,构建PCR专题教学模式。该模式遵循引入、目标、前测、参与式学习、后测、总结6个环节逻辑,通过案例驱动、问题导向激发... 为解决生物技术制药课程中PCR技术原理复杂、操作精细导致的教学难题,本文将BOPPPS教学法与超星学习通平台深度融合,构建PCR专题教学模式。该模式遵循引入、目标、前测、参与式学习、后测、总结6个环节逻辑,通过案例驱动、问题导向激发学习兴趣,以精准前测优化教学靶向,依托小组汇报、实验实操、互动讨论强化参与式学习,结合多元化评价保障教学效果。教学实践显示,该模式有效提升了214名学生的PCR理论知识掌握度(基本原理单选题正确率达94.4%)、实验操作规范性及综合素养(团队协作、创新思维);同时促进教师从经验型备课转向精准化设计,教研融合能力明显提升,获得学校督导A级(教学效果优秀)及学生评教97.79分的高度认可。研究表明,BOPPPS教学法与学习通平台的融合应用对生物技术制药课程PCR教学具有显著成效,后续需通过优化时间管理、增设案例研讨、强化个性化支持进一步完善。本文可为多学科交叉的综合性课程教学改革提供参考。 展开更多
关键词 BOPPPS教学法 生物技术制药 pcr 教学设计
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PCR反向点杂交法在产前地中海贫血基因诊断中的应用分析
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作者 李晓红 唐丽萍 《首都食品与医药》 2026年第2期78-80,共3页
目的分析PCR反向点杂交法在地中海贫血基因诊断中的应用效果。方法选取2024年1月-2024年12月到遂宁市中心医院门诊及住院进行地中海贫血基因检验的1851例孕妇作为研究对象,通过PCR反向点杂交法进行检测,分析地中海贫血基因诊断结果。结... 目的分析PCR反向点杂交法在地中海贫血基因诊断中的应用效果。方法选取2024年1月-2024年12月到遂宁市中心医院门诊及住院进行地中海贫血基因检验的1851例孕妇作为研究对象,通过PCR反向点杂交法进行检测,分析地中海贫血基因诊断结果。结果本次筛查共检出106例地贫基因突变体,地贫基因携带率为5.73%,其中α-地贫79例(74.53%),β-地贫27例(25.47%);α-地贫基因突变类型以-α3.7/αα(49.37%)与--SEA/αα(35.44%)为主要异常基因型;β-地贫基因突变类型以β41-42/βN(40.74%)、β17/βN(29.63%)和β654/βN(18.52%)为主要类型。结论遂宁地区α-地贫基因突变携带率高于β-地贫基因突变。α-地贫基因突变类型以-α3.7/αα与--SEA/αα最常见,β-地贫基因突变类型以β41-42/βN、β17/βN和β654/βN最常见。运用PCR反向点杂交法在产前地中海贫血基因诊断中有一定的诊断价值,对临床开展遗传咨询、基因分析以及产前诊断具有重要的参考意义。 展开更多
关键词 pcr反向点杂交法 产前 地中海贫血 基因诊断
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锁环探针荧光定量PCR技术检测结核分枝杆菌耐药性及耐药突变基因的应用研究
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作者 朱秀兰 邓玉玲 +5 位作者 莫丽英 蒲荣 陈凤钻 韦学武 卢雪茹 张帅 《现代检验医学杂志》 2026年第1期111-115,131,共6页
目的分析锁环探针荧光定量PCR技术检测结核分枝杆菌(MTB)耐药性及耐药突变基因的临床应用价值。方法收集2021年1月~2024年5月广东医科大学附属东莞松山湖中心医院165例涂阳肺结核患者痰液标本,均行痰涂片镜检、MTB培养/鉴定、比例法药... 目的分析锁环探针荧光定量PCR技术检测结核分枝杆菌(MTB)耐药性及耐药突变基因的临床应用价值。方法收集2021年1月~2024年5月广东医科大学附属东莞松山湖中心医院165例涂阳肺结核患者痰液标本,均行痰涂片镜检、MTB培养/鉴定、比例法药敏试验及基于锁环探针的荧光定量PCR技术检测利福平(RFP)、异烟肼(INH)耐药性及耐药基因突变位点。以比例法药敏试验结果为参考标准,评价锁环探针荧光定量PCR技术检测耐药MTB的效能。结果经分离培养证实151株为MTB,比例法药敏试验检出RFP耐药36株,INH耐药42株。锁环探针荧光定量PCR技术检出RFP、INH耐药,与比例法药敏试验检测结果差异无统计学意义(χ^(2)=0.018、0.067,均P>0.05)。以药敏试验为参考,锁环探针荧光定量PCR技术检测RFP耐药的敏感度、特异度、准确度分别为91.67%(33/36)、98.26%(113/115)、96.69%(146/151),检测一致性Kappa值为0.895;检测INH耐药的敏感度、特异度、准确度分别为83.33%(35/42)、95.41%(104/109)、92.05%(139/151),检测一致性Kappa值为0.867。锁环探针荧光定量PCR技术检出RFP耐药菌株rpoB基因突变中96.97%为单一位点突变,以531位点突变为主约占57.58%,其次为526位点突变约占27.27%;检出INH耐药菌株katG/INH A基因突变,以katG 315位点突变为主,其中80.56%为katG单一位点突变,16.67%为INH A单一位点突变。结论涂阳肺结核患者应用锁环探针荧光定量PCR技术行痰标本RFP、INH耐药筛查具有较高的诊断效能,可作为临床快速诊断耐药基因位点突变及筛查耐药结核病的补充手段,为临床诊疗提供依据。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 锁环探针 荧光定量pcr技术 利福平 异烟肼 耐药性 耐药基因突变
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布鲁氏菌超快速荧光PCR方法建立与临床应用 被引量:2
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作者 徐振娜 吴志鹏 +9 位作者 洪伟彬 管知深 林其明 莫钻兰 叶毅飞 谢海燕 李敏 朱燕秋 李小军 张险朋 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第3期278-283,共6页
目的 建立布鲁氏菌超快速荧光PCR检测方法,应用于临床样品的快速检测。方法 以外源性重组质粒为内参,选取布鲁氏菌重要毒力因子T4SS分泌系统为靶基因设计引物、探针,建立布鲁氏菌超快速荧光PCR检测方法。评价该方法的灵敏度、特异性、... 目的 建立布鲁氏菌超快速荧光PCR检测方法,应用于临床样品的快速检测。方法 以外源性重组质粒为内参,选取布鲁氏菌重要毒力因子T4SS分泌系统为靶基因设计引物、探针,建立布鲁氏菌超快速荧光PCR检测方法。评价该方法的灵敏度、特异性、重复性,绘制标准曲线,与荧光PCR方法检测临床样品比较符合率。结果 该方法检测时间短,10 min即可完成。标准曲线Y=-3.410 7x+38.357,R^(2)=0.998 5,线性关系良好,最低检测限为10 copies/μL。该方法具有良好的特异性,对布鲁氏菌以外的几个临床常见细菌均无特异性扩增。检测3种浓度的阳性质粒,CV值为0.20%~0.91%,说明该方法具有极好的重复性。与荧光PCR方法同时检测140份临床样品,结果完全一致,符合率100%。结论 本研究建立了一种用时短、特异性强、灵敏度高、重复性好布鲁氏菌超快速荧光PCR检测方法,可用于布鲁氏菌临床检测和疫情紧急排查,对布鲁氏菌早期诊断具有重要意义。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 超快速荧光pcr 外源性内参 实时荧光pcr
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PCR在畜禽疫病诊断上的应用及研究进展 被引量:6
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作者 涂健 祁克宗 潘鑫 《动物医学进展》 CSCD 2004年第3期22-24,共3页
PCR技术是一门非常实用的分子生物学新技术。其特点在于敏感性强、特异性高。它在兽医临床诊断中尤其适用于那些培养困难和抗原性复杂的细菌的检测鉴定 ;诊断在基因上具有同源相似性的多重病毒感染 ;并应用于研究支原体 ,螺旋体等其它... PCR技术是一门非常实用的分子生物学新技术。其特点在于敏感性强、特异性高。它在兽医临床诊断中尤其适用于那些培养困难和抗原性复杂的细菌的检测鉴定 ;诊断在基因上具有同源相似性的多重病毒感染 ;并应用于研究支原体 ,螺旋体等其它致病微生物引起的疾病。PCR技术敏感性极高 ,因此在实际操作中容易出现假阳性现象 ,同时存在产物不易纯化 ,操作步骤繁琐、耗时较多等缺陷 ,针对这些问题 ,最近出现了固相 PCR、PCR-EL ISA液相杂交技术、实时 Taq Man-PCR技术、PCR基因芯片、DNA芯片 ,这些 PCR技术新的进展有效的克服了 PCR技术的不足。随着研究的深入 ,未来PCR技术将会作为实验室常规的检测技术广泛应用于诊断病原、肿瘤细胞监测、基因表达。 展开更多
关键词 pcr技术 畜禽 疫病诊断 固相pcr pcr—ELISA液相杂交技术 实时TaqMan—pcr技术 pcr基因芯片 DNA芯片
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聚合酶链式反应(PCR)技术研究新进展 被引量:12
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作者 曹雪雁 张晓东 +1 位作者 樊春海 胡钧 《自然科学进展》 北大核心 2007年第5期580-585,共6页
聚合酶链式反应(PCR)在生命科学的研究领域已经得到了广泛的应用.文中对PCR技术的一些最新进展进行了简要的综述,其中包括定量PCR、纳米PCR、PCR芯片、原位PCR和免疫PCR的原理和应用.
关键词 定量pcr 纳米pcr pcr芯片 原位pcr 免疫pcr
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PCR技术的新进展 被引量:8
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作者 赵琦 李宾 周慧 《生命的化学》 CAS CSCD 2002年第3期288-289,共2页
PCR是用于在体外快速酶促扩增特定DNA片段的技术,本文对PCR技术的一些新方法进行了简要综述,包括易错PCR、DNA shuffilng、原位PCR、电子PCR、固相PCR和PCR芯片。
关键词 易错pcr DNA SHUFFLING 原位pcr 电子pcr 固相pcr pcr芯片
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荧光定量PCR与逆转录PCR检测HCV RNA的比较分析 被引量:8
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作者 张英哲 金仁顺 +1 位作者 朴东明 沈哲式 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2005年第11期1349-1350,共2页
目的:用荧光定量PCR(FQ—PCR)和逆转录PCR(RT—PCR)法检测抗-HCV阳性血清中的HCVRNA,探讨两种方法检测结果的临床意义.方法:抗-HCV阳性血清样本1062份,其中481份用RT-PCR法检测,465份用FQ-PCR法检测,另有116份同时用两种PCR法检测.结果... 目的:用荧光定量PCR(FQ—PCR)和逆转录PCR(RT—PCR)法检测抗-HCV阳性血清中的HCVRNA,探讨两种方法检测结果的临床意义.方法:抗-HCV阳性血清样本1062份,其中481份用RT-PCR法检测,465份用FQ-PCR法检测,另有116份同时用两种PCR法检测.结果:RT—PCR法检测HCVRNA的阳性率为49.90%(240/481),FQ-PCR法的阳性率为62.58%(291/465),两种方法的阳性率有显著性差异(P<0.001).同时用两种方法检测116份,RT—PCR法阳性率为49.14%(57/116),FQ—PCR法阳性率为65.52%(76/116),也有显著性差异(P<0.05).FQ-PCR法检测的40份阴性中RT-PCR法检测出4例HCVRNA阳性.结论:FQ—PCR检测HCVRNA比RT-PCR特异性高,但RT—PCR的敏感性较FQ—PCR高,部分FQ—PCR检测的阴性结果不能排除HCVRNA阳性的可能性. 展开更多
关键词 荧光定量pcr 逆转录 比较分析 FQ-pcr检测 pcr法检测 FQ-pcr HCVRNA HCV阳性血清 抗-HCV阳性 RT-pcr 显著性差异 阳性率 血清样本 临床意义 检测结果 阴性结果 特异性 敏感性 可能性
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数字PCR技术在HBV DNA定量检测中的应用
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作者 朱嫦琳 周志荣 李启欣 《分子诊断与治疗杂志》 2025年第5期791-794,共4页
目的探讨微滴式数字PCR(ddPCR)技术在乙型肝炎病毒(HBV)DNA定量检测中的应用价值。方法收集2021年2月至7月佛山市第一人民医院疑似HBV感染的患者血液样本共132例作为病例组,收集同期体检人群血液样本共50例作为体检组,应用ddPCR、qPCR... 目的探讨微滴式数字PCR(ddPCR)技术在乙型肝炎病毒(HBV)DNA定量检测中的应用价值。方法收集2021年2月至7月佛山市第一人民医院疑似HBV感染的患者血液样本共132例作为病例组,收集同期体检人群血液样本共50例作为体检组,应用ddPCR、qPCR分别检测血样中HBV DNA含量,比较两种方法对HBV DNA的检测性能及对隐匿性HBV感染(OBI)的检出能力。结果ddPCR对HBV DNA的检出率高于qPCR,差异有统计学意义(χ^(2)=31.285,P<0.05)。ddPCR与qPCR方法对HBV DNA定量检测结果呈正相关,且相关性良好(r=0.74,P<0.05)。两种方法同时检测为阳性占29.1%,同时阴性占42.9%,两种方法的一致性中等(κ=0.468,P<0.05)。对两种方法检测不一致的样本,采用高敏HBV DNA方法检测,ddPCR(+)qPCR(-)的50例检测结果均为阳性(100.0%),而ddPCR(-)qPCR(+)的1例检测结果为阴性,与ddPCR结果完全一致。ddPCR对OBI的检出率为15.5%(11/71),qPCR对OBI的检出率仅为1.4%(1/71),两种方法对OBI的检出率差异有统计学意义(χ^(2)=9.103,P<0.05)。结论采用ddPCR方法检测血清HBV DNA能极大提高灵敏度和检出率,有利于临床HBV感染的早期诊断及OBI的检出。 展开更多
关键词 微滴式数字pcr 实时荧光定量pcr 乙型肝炎病毒DNA 隐匿性乙型肝炎
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禽源鹦鹉热衣原体三种PCR检测方法的建立与比较
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作者 钟海涛 何成伟 +9 位作者 刘禄 陈月妃 龙建明 陈美池 谢斯玉 王梦迪 邓雅宇 韦天超 韦平 黄鉴妮 《广西畜牧兽医》 2025年第4期145-151,共7页
为建立禽源鹦鹉热衣原体临床快速、准确的诊断方法,本研究针对禽源鹦鹉热衣原体外膜蛋白A(outer membrane protein A,OmpA)基因的保守区域设计特异性引物,建立了普通PCR、套式PCR和qPCR三种检测方法。通过对比三种检测方法的特异性、灵... 为建立禽源鹦鹉热衣原体临床快速、准确的诊断方法,本研究针对禽源鹦鹉热衣原体外膜蛋白A(outer membrane protein A,OmpA)基因的保守区域设计特异性引物,建立了普通PCR、套式PCR和qPCR三种检测方法。通过对比三种检测方法的特异性、灵敏性、重复性以及临床样品的阳性检出率,发现三种PCR检测方法的重复性均良好,组内与组间变异系数低;与其它常见家禽病原体无交叉反应,特异性较强;建立的qPCR检测方法灵敏性较高,最低检测限度为1.20×101拷贝/μL,分别比套式PCR和普通PCR的灵敏性高10倍和100倍;对72份临床样品进行平行检测,普通PCR、套式PCR和qPCR的阳性样品检出率分别为4.16%(3/72)、48.61%(35/72)和61.11%(44/72)。因此,通过对比三种PCR检测方法,发现qPCR检测方法更适用于禽源鹦鹉热衣原体的临床快速准确诊断和流行病学调查。 展开更多
关键词 禽源鹦鹉热衣原体 普通pcr 套式pcr qpcr
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PCR技术在食品工程安全检测中的应用研究 被引量:1
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作者 葛玲 《现代食品》 2025年第10期176-178,共3页
聚合酶链式反应(PCR)技术已广泛应用于食品安全检测领域。实时荧光定量PCR通过荧光探针标记及信号采集系统对乳制品中黄曲霉毒素进行定量检测,检出限低至0.1μg·kg^(-1);多重PCR技术实现了肉制品中瘦肉精、沙丁胺醇等多种违禁物质... 聚合酶链式反应(PCR)技术已广泛应用于食品安全检测领域。实时荧光定量PCR通过荧光探针标记及信号采集系统对乳制品中黄曲霉毒素进行定量检测,检出限低至0.1μg·kg^(-1);多重PCR技术实现了肉制品中瘦肉精、沙丁胺醇等多种违禁物质的同步检测,检测时间缩短至4 h;数字PCR技术在转基因成分检测中采用微滴反应体系,实现了转基因大豆中目的基因的绝对定量。系统分析比较了3种PCR技术的检测特点与应用效果,成功应用于200份市售食品样品的安全检测,检测准确率达98%以上。 展开更多
关键词 pcr技术 食品安全检测 荧光定量 多重pcr 数字pcr
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基于微滴数字PCR的巨细胞病毒gH分型检测可行性评估及应用
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作者 张琼 黄琼 李伟 《中国科技期刊数据库 医药》 2025年第1期144-149,共6页
探讨应用微滴数字PCR(ddPCR)进行巨细胞病毒(CMV)包膜糖蛋白H(gH)分型检测的可行性。方法 以标准株AD169和Towne为研究对象,荧光定量PCR (RT-PCR)检测为对照,进行ddPCR的敏感性、特异性、结果一致性和结果变异性检测。收集CMV特异性抗体... 探讨应用微滴数字PCR(ddPCR)进行巨细胞病毒(CMV)包膜糖蛋白H(gH)分型检测的可行性。方法 以标准株AD169和Towne为研究对象,荧光定量PCR (RT-PCR)检测为对照,进行ddPCR的敏感性、特异性、结果一致性和结果变异性检测。收集CMV特异性抗体G(CMV-IgG)阳性,肝功能异常的婴儿尿液样本采用ddPCR进行临床CMV gH分型检测。结果 ddPCR检测的结果一致性、结果变异性和检测特异性与RT-PCR一致,ddPCR敏感性较RT-PCR高。临床样本ddPCR检测结果为:gH1型41例,gH2型23例,gH1/2型11例,与RT-PCR分型结果一致率86.67%(65/75)。对于分型结果一致的65个样本,RT-PCR和ddPCR检测浓度有较好的一致性。依据ddPCR分型结果进行临床指标分析发现,相较于gH2型,gH1型CMV感染更易促进血清丙氨酸氨基转移酶水平升高[(33/41)比(13/23),χ2=4.927,P=0.026]。结论 ddPCR可用于检测尿液中CMV gH分型情况,具有更好的敏感性。 展开更多
关键词 巨细胞病毒 包膜糖蛋白H 微滴数字pcr 荧光定量pcr
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11种致牛腹泻病原的一步法多重PCR/RT-PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 金美君 胡云皓 +8 位作者 辛凌翔 刘燕 潘瑶 王秀丽 赵浩然 汤承 陈曦 李锦铨 朱良全 《微生物学通报》 北大核心 2025年第1期383-396,共14页
【背景】单病原或多病原混合感染导致的牛腹泻综合征严重制约养牛业发展,病原快速准确诊断是防控该病的重要前提。【目的】建立11种致牛腹泻的细菌或病毒的一步法多重PCR/RT-PCR检测方法,实现快速诊断病原。【方法】通过文献检索调查了... 【背景】单病原或多病原混合感染导致的牛腹泻综合征严重制约养牛业发展,病原快速准确诊断是防控该病的重要前提。【目的】建立11种致牛腹泻的细菌或病毒的一步法多重PCR/RT-PCR检测方法,实现快速诊断病原。【方法】通过文献检索调查了引起牛腹泻病的主要病原及其高覆盖率的引物,选择以产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens)α-toxin、肠道沙门氏菌(Salmonella enterica)inv A、大肠杆菌(Escherichia coli)K99、牛肠道病毒(bovine enterovirus,BEV)5′-UTR、牛星状病毒(bovine astrovirus,BAstV)ORF1a、牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRoV)VP6、牛嵴病毒(bovine kobuvirus,BKoV)D4、牛诺如病毒(bovine norovirus,BNoV)ORF1、牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCoV)N、牛环曲病毒(bovine torovirus,BToV)N、牛病毒性腹泻黏膜病病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)5′-UTR为靶标序列的引物,通过温度梯度PCR及单一控制变量法优化退火温度、引物浓度、循环数,建立11种病原的多重PCR/RT-PCR检测方法,对该方法进行特异性、灵敏度和重复性评价,并应用该方法进行临床样品检测。【结果】最佳退火温度为54.4℃,C.perfringens、S.enterica、E.coli、BEV、BAstV、BRoV、BKoV、BNoV、BCoV、BToV和BVDV对应基因片段最优引物浓度分别为0.20、0.25、0.25、0.20、0.25、0.25、0.35、0.50、0.25、0.25、0.30μmol/L,最优循环数为35个循环。该方法特异性强,仅对靶标病原检测为阳性,对溶血性曼氏杆菌(Mansiella haemolyticus)、化脓链球菌(Streptococcus pyogenes)、牛支原体(Mycoplasma bovine)分离株等病原检测均为阴性;敏感性高,对重组质粒标准品最低检出限依次为7.5×10^(3)、7.5×10^(4)、7.5×10^(3)、7.5×10^(1)、7.5×10^(4)、7.5×10^(2)、7.5×10^(3)、7.5×10^(2)、7.5×10^(2)、7.5×10^(4)、7.5×10^(3)copies/μL;重复性好,批间与批内试验均一致。用该方法检测江苏地区临床样品490份,结果显示,BEV、BAstV、BRoV、BKoV、BNoV、BCoV、BToV、BVDV阳性率分别0.61%、0.41%、0.61%、0.21%、27.14%、3.27%、0.21%、1.02%。通过单重PCR对该多重PCR临床样品检测结果进行重复验证,结果显示符合率为100%。随机挑选50个检测为阳性的PCR产物进行测序验证,结果均为相应病原的基因片段。【结论】建立一种同时检测11种牛腹泻主要病原的一步法多重PCR/RT-PCR检测方法。 展开更多
关键词 腹泻 细菌 病毒 多重pcr RT-pcr
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猪丁型冠状病毒微滴式数字PCR定量检测方法的建立 被引量:1
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作者 刘影 周建浩 +8 位作者 王东方 谢彩华 王淑娟 马震原 柴茂 杨海波 赵雪丽 王翠 闫若潜 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第3期369-374,共6页
为建立一种检测猪丁型冠状病毒的微滴式数字PCR定量方法,选择猪丁型冠状病毒M基因作为靶基因,设计并合成1组引物对和探针,并对反应体系及退火温度进行优化。结果显示:所建立的微滴式数字PCR定量方法检测猪丁型冠状病毒M基因的最低限为1.... 为建立一种检测猪丁型冠状病毒的微滴式数字PCR定量方法,选择猪丁型冠状病毒M基因作为靶基因,设计并合成1组引物对和探针,并对反应体系及退火温度进行优化。结果显示:所建立的微滴式数字PCR定量方法检测猪丁型冠状病毒M基因的最低限为1.37 copies/μL,当模板浓度为10^(0)~10^(4)copies/μL范围内与检测值具有良好的线性关系(R^(2)>0.99);检测的批内、批间变异系数为0.63%~4.63%,均低于5%,检测10种猪常见疫病病原(PEDV、PRV、TGEV、SADS-CoV、PoRV、PPV、PRRSV、PCV2、CSFV、FMDV-O、FMDV-A)核酸均为阴性;对130份临床样品进行猪丁型冠状病毒检测,微滴式数字PCR方法敏感性高于行业标准推荐的荧光PCR方法。本研究成功建立了一种特异性强、灵敏度高、重复性好的猪丁型冠状病毒微滴式数字PCR定量检测方法,为猪丁型冠状病毒的早期检测、定量诊断以及疫病净化提供技术保障。 展开更多
关键词 猪丁型冠状病毒 微滴式数字pcr 荧光定量pcr
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定量PCR与传统RT-PCR检测HCV RNA的比较研究 被引量:1
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作者 刘堂兵 《中华临床医学杂志》 2006年第11期7-8,共2页
目的用荧光定量PCR(FQ-PCR)和逆转录PCR(RT-PCR)法检测抗-HCV阳性血清中的HCVRNA,探讨两种方法检测结果的临床意义。方法抗-HCV阳性血清样本1062份,其中481份用RT-PCR法检测,465份用FQ-PCR法检测,另有116份同时用两种PCR法检测... 目的用荧光定量PCR(FQ-PCR)和逆转录PCR(RT-PCR)法检测抗-HCV阳性血清中的HCVRNA,探讨两种方法检测结果的临床意义。方法抗-HCV阳性血清样本1062份,其中481份用RT-PCR法检测,465份用FQ-PCR法检测,另有116份同时用两种PCR法检测。结果RT-PCR法检测HCV RNA的阳性率为49.90%(240/481),FQ-PCR法的阳性率为62.58%(291/465),两种方法的阳性率有显著性差异(P〈0.001)。同时用两种方法检测116份,RT-PCR法阳性率为49.14%(57/116),FQ-PCR法阳性率为65.52%(76/116),也有显著性差异(P〈0.05)。FQ-PCR法检测的40份阴性中RT-PCR法检测出4例HCVRNA阳性。结论FQ-PCR检测HCVRNA比RT-PCR特异性高.但RT-PCR的敏感性较FQ-PCR高,部分FQ-PCR检测的阴性结果不能排除HCV RNA阳性的可能性。 展开更多
关键词 RT-pcr检测 HCVRNA阳性 定量pcr FQ-pcr检测 FQ-pcr pcr法检测 HCV阳性血清 抗-HCV阳性
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