期刊文献+
共找到2篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
基于RNA-seq技术的活血化瘀法治疗乳腺癌关键基因的筛选和验证 被引量:7
1
作者 赵利南 赵益 孙有智 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期101-108,共8页
目的:研究活血化瘀治法(the medicine group of promoting blood circulation and removing stasis,PBCRS)对7,12-二甲基苯蒽[7,12-dimethylbenz(a) anthracene,DMBA]诱发性大鼠乳腺癌的抑制作用,及运用转录组测序技术(RNA sequencing,R... 目的:研究活血化瘀治法(the medicine group of promoting blood circulation and removing stasis,PBCRS)对7,12-二甲基苯蒽[7,12-dimethylbenz(a) anthracene,DMBA]诱发性大鼠乳腺癌的抑制作用,及运用转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-seq)和信号网络分析(ingenuity pathway analysis,IPA)软件筛选关键基因和验证。方法:将96只SD大鼠随机分为空白组,DMBA模型组,枸橼酸他莫昔芬(Tamoxifen,TAM)组(1.9 mg·kg^(-1)·d-1),PBCRS高、中、低剂量组(12.96,6.48,3.24 g·kg^(-1)·d-1)。药物干预1周后,除空白组外,采用DMBA诱导大鼠乳腺癌模型(灌服2次,间隔1周,剂量100 mg·kg^(-1))。给药10周后,观察大鼠荷瘤重、荷瘤体积变化,用总RNA提取试剂盒提取总RNA,从DMBA模型组和PBCRS中剂量组各取3个RNA样品进行基因检测,筛选出关键差异基因,用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)验证关键基因。结果:与DMBA模型组比较,PBCRS中剂量组荷瘤重和荷瘤体积均明显降低(P<0.05),PBCRS高、低剂量组荷瘤重和荷瘤体积虽有降低,但与DMBA模型组比较差异均无统计学意义;基于RNA-seq技术及IPA分析软件筛选出果糖1,6二磷酸酶1 (fructose-1,6-bisphosphatase1,FBP1),浦肯野细胞蛋白4(purkinje cell protein 4,PCP4),肌红蛋白(myoglobin,MB) 3个关键基因;与DMBA模型组比较,PBCRS高、中剂量组FBP1 mRNA表达均明显升高(P<0.05),PBCRS低剂量组FBP1 mRNA表达升高,但差异无统计学意义,PBCRS高、中、低剂量组PCP4 mRNA的表达增高,但无统计学差异,PBCRS低剂量组MB mRNA的表达虽降低,差异无统计学意义。结论:PBCRS可能通过干预乳腺癌组织中FBP1的表达,抑制乳腺癌的发生。 展开更多
关键词 乳腺癌 RNA-SEQ 活血化瘀法 果糖1 6二磷酸酶1(FBP1) 浦肯野细胞蛋白4(pcp4) 肌红蛋白(MB)
原文传递
基于GEO数据库、TMT蛋白组学筛选绞股蓝对膀胱癌的蛋白靶点 被引量:2
2
作者 常拓 齐彦爽 +1 位作者 蔺曼 朴香兰 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1331-1338,共8页
绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum)是传统的中药材,对于多种癌症具有显著的疗效。为筛选绞股蓝对膀胱癌的作用靶点,本研究将30只SPF级SD大鼠随机分为模型组、给药组和空白组,通过膀胱灌注N-甲基-N-亚硝基脲(MNU)建立膀胱癌模型并通过相... 绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum)是传统的中药材,对于多种癌症具有显著的疗效。为筛选绞股蓝对膀胱癌的作用靶点,本研究将30只SPF级SD大鼠随机分为模型组、给药组和空白组,通过膀胱灌注N-甲基-N-亚硝基脲(MNU)建立膀胱癌模型并通过相同的方式进行膀胱灌注绞股蓝干预治疗,在第10周进行取材,通过H&E染色病理切片观察各组膀胱内肿瘤情况以明确药效。通过蛋白质组学串联质谱标签(TMT)10重标记法检测各组膀胱组织的蛋白差异表达情况,结合GEO数据库中3组膀胱癌数据集对作用靶点进行筛选。结果显示,绞股蓝反向调节膀胱癌335种蛋白质,其中包括55种上调和280种下调。GEO的3个膀胱癌表达谱中汇集的差异蛋白(DEGs)包含20种上调和50种下调。将GEO中DEGs与TMT蛋白质组学中膀胱癌趋势相同的蛋白进行汇集,结合绞股蓝反向调节数据,总共筛选获得了3个反向调节靶点,其中包括1种下调的靶点CNN1和2种上调的靶点KRT19、PCP4,并通过蛋白免疫印迹法进行验证。本研究结果表明,CNN1、KRT19和PCP4可能是绞股蓝治疗膀胱癌的潜在靶点,绞股蓝可能通过调节CNN1、KRT19和PCP4来抵抗膀胱癌,这为绞股蓝治疗膀胱癌提供分子机制依据。 展开更多
关键词 膀胱癌 绞股蓝 CNN KRT19 pcp4
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部