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题名PARP1受体的结构模拟与作用方式研究
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作者
孙熙哲
任乐
胡百淳
仲烨
刘洋
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机构
沈阳药科大学基于靶点的药物设计与研究教育部重点实验室
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出处
《中国药物化学杂志》
CAS
2024年第1期7-19,共13页
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文摘
目的通过多种分子模拟研究方法,探究PARP1受体的结构及其作用方式,为设计PARP1抑制剂提供理论指导。方法基于PARP1受体的晶体结构,结合分子动力学模拟、动态互相关联矩阵及丙氨酸扫描等方法分析受体-配体作用方式,总结关键氨基酸信息,构建药效团模型,揭示PARP1抑制剂的构效关系。结果与结论PARP1活性结构域的氨基酸高度保守,包括Gly202、Tyr228、Tyr235、Ser243和Tyr246,活性化合物的药效团特征包括一个芳香环、一个氢键受体、一个氢键供体和两个疏水基团,这些PARP1靶点的关键氨基酸和活性化合物的药效团特征可为发现新型PARP1抑制剂提供参考。
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关键词
PARP1
分子动力学
丙氨酸扫描
动态互相关联矩阵
药效团模拟
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Keywords
parpl
molecular dynamics
alanine scanning
dynamic interrelation matrix
pharmacophore simulation
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分类号
R914
[医药卫生—药物化学]
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